Список методов исследования в биологии

редактировать
Это динамический список, который, возможно, никогда не сможет удовлетворить определенные стандарты полноты. Вы можете помочь, добавив недостающие элементы из надежных источников.

Этот перечень методов исследования в биологии является индексом статей о научно - исследовательских методологиях, используемых в различных отраслях по биологии.

СОДЕРЖАНИЕ
  • 1 Дизайн и анализ исследования
    • 1.1 Дизайн исследования
    • 1.2 Графики и диаграммы
    • 1.3 Статистический анализ
  • 2 Лабораторные методы
  • 3 Полевые техники
  • 4 Вычислительные инструменты
    • 4.1 Математические модели
    • 4.2 Алгоритмы
  • 5 ссылки
  • 6 Внешние ссылки
Дизайн и анализ исследования

Дизайн исследования

Дизайн исследования Утилита Возможный анализ
Межгрупповой дизайн Эксперимент, в котором две или более групп испытуемых одновременно тестируются с помощью разных факторов тестирования. T-критерий Стьюдента, дисперсионный анализ, U-критерий Манна – Уитни
Дизайн повторных мероприятий План исследования, который включает в себя несколько измерений одной и той же переменной, выполненных на одних и тех же или подобранных предметах либо в разных условиях, либо в течение двух или более периодов времени. Соединенный т-тест, тест Уилкоксона ранга

Графики и диаграммы

Анализ Утилита Ветвь
Кривые доза-реакция График показывает, что величина реакции в качестве организма, как функция воздействия (или дозы ) до стимула или стрессора ( как правило, химические ) после определенного времени экспозиции Физиология
Электроэнцефалограмма График показывает, что колебания напряжения в результате ионного тока в пределах нейронов в головном мозге Неврология
ЭКГ График зависимости напряжения от времени электрической активности сердца с помощью электродов, помещенных на кожу Физиология
Манхэттенский сюжет Используется для отображения данных с большим количеством точек данных, многие из которых имеют ненулевую амплитуду, и с распределением более высоких значений. График обычно используется в полногеномных ассоциативных исследованиях (GWAS) для отображения значимых SNP. Генетика
Таблица родословной Используется для отображения фенотипов определенного гена или организма и его предков от одного поколения к другому, чаще всего у людей, выставочных собак и скаковых лошадей. Генетика
Филогенетическое дерево Используется для демонстрации эволюционных отношений между различными биологическими видами или другими объектами на основе сходства и различий в их физических или генетических характеристиках. Систематика, эволюционная биология
Пирамида населения Используется для иллюстрации распределения населения (обычно страны или региона мира) по возрастным группам и полу; он обычно образует форму пирамиды, когда население растет Экология населения
Площадь Пеннета Используется для прогнозирования генотипов конкретного эксперимента по скрещиванию или селекции. Генетика

Статистический анализ

Анализ Утилита Тип
Дисперсионный анализ Набор статистических моделей и связанных с ними процедур оценки (таких как «вариации» между группами), используемых для анализа различий между средними значениями. Статистическая модель
Критерий хи-квадрат Тест статистическая гипотеза, которая действительна для выполнения при тестовой статистики хи-квадрат распределены по нулевой гипотезе, в частности, хи-квадрат тест Пирсона и его варианты Статистическая проверка гипотез
U-критерий Манна – Уитни Статистический тест гипотезы о нулевой гипотезе, что для случайно выбранных значений X и Y из двух популяций, вероятность X будучи больше, чем Y равна вероятности Y составляет больше, чем  X Непараметрическая статистика
T-критерий Стьюдента Любое испытание статистической гипотезы, в котором тестовая статистика следует Стьюдент т -распределение при нулевой гипотезе Параметрическая статистика
Лабораторные методы
Метод Утилита ветви
Электрофорез в агарозном геле Используется для разделения смешанной популяции макромолекул, таких как ДНК или белки, в матрице агарозы, одном из двух основных компонентов агара. Биохимия, Молекулярная биология, Генетика
Модель Животного Используется для исследования болезней и расстройств у человека. Некоторые животные могут иметь черты человека, такие как мыши, в то время как другие могут иметь черты, которые идеально подходят для исследований, например гигантский аксон кальмара. Биохимия, нейробиология, физиология
Биологическая абляция Используется для удаления биологической структуры или функциональности Генетика, физиология
Визуализация кальция Используется для оптического измерения статуса ионов кальция (Ca 2+) в изолированной клетке, ткани или среде. Физиология
Изоляция клеток Процесс отделения отдельных живых клеток от твердого блока ткани или клеточной суспензии. Клеточная биология
Центрифугирование Использование центробежной силы для отделения частиц от раствора в соответствии с их размером, формой, плотностью, средней вязкостью и скоростью ротора. Клеточная биология, Биохимия
Редактирование генов CRISPR Используется для модификации геномов живых организмов на основе упрощенной версии бактериальной системы противовирусной защиты CRISPR - Cas9. Молекулярная биология
Секвенатор ДНК Используется для автоматизации процесса секвенирования ДНК Генетика, Молекулярная биология
Иммуноферментный анализ (ИФА) Используется для обнаружения присутствия лиганда (обычно белка) в жидком образце с использованием антител, направленных против измеряемого белка. Биохимия, Молекулярная биология
Джин нокаут Используется для вывода из строя одного из генов организма («выбивания» из организма). Молекулярная биология, генетика
Иммуноокрашивание Используется метод на основе антител для обнаружения определенного белка в образце Молекулярная биология, Биохимия
Внутриклеточная запись Используется для измерения напряжения на клеточной мембране. Неврология, электрофизиология
Микрочип Анализ (тесты) больших количеств биологического материала с использованием высокопроизводительного скрининга миниатюрных, мультиплексных и параллельных методов обработки и обнаружения Генетика, Молекулярная биология
Матрица микроэлектродов Устройства, которые содержат несколько (от десятков до тысяч) микроэлектродов, через которые принимаются или передаются нейронные сигналы, по сути служащие нейронными интерфейсами, которые соединяют нейроны с электронными схемами. Неврология
Микроскоп Используется для исследования объектов, которые слишком малы, чтобы их можно было увидеть невооруженным глазом. Клеточная биология
Молекулярное клонирование Используется для сборки рекомбинантных молекул ДНК и управления их репликацией в организмах-хозяевах. Молекулярная биология
Нозерн-блот Используется для изучения экспрессии генов путем обнаружения РНК (или выделенной мРНК ) в образце. Молекулярная биология
Оптогенетика Использует свет для управления нейронами, которые были генетически модифицированы для экспрессии светочувствительных ионных каналов. Неврология
Осциллограф Используется для графического отображения изменяющихся напряжений сигналов, обычно в виде откалиброванного двухмерного графика одного или нескольких сигналов в зависимости от времени. Неврология, физиология
Бумажная хроматография Используется для отделения окрашенных химикатов или веществ. Молекулярная биология
Патч зажим Используется для изучения ионных токов в отдельных изолированных живых клетках, участках тканей или участках клеточной мембраны. Электрофизиология, неврология
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) Используется для быстрого создания от миллионов до миллиардов копий (полных или частичных копий) определенного образца ДНК, что позволяет ученым брать очень небольшой образец ДНК и усиливать его (или его часть) до достаточно большого количества для изучения. деталь Генетика, Молекулярная биология
Перенос ядра соматической клетки Используется для создания жизнеспособного эмбриона из клетки тела и яйцеклетки. Биология развития
Саузерн-блот Используется для обнаружения конкретной последовательности ДНК в образцах ДНК Молекулярная биология
Тестовый крест Используется для определения того, является ли человек гомозиготным или гетерозиготным доминантным Генетика
Зажим напряжения Используется для измерения ионных токов через мембраны возбудимых клеток, таких как нейроны, при поддержании мембранного напряжения на заданном уровне. Физиология, неврология
Вестерн-блоттинг Используемый аналитический метод в молекулярной биологии и иммуногенетике для обнаружения специфических белков в образце гомогената или экстракта ткани. Молекулярная биология
Рентгеновская кристаллография Используется для определения атомной и молекулярной структуры кристалла, в котором кристаллическая структура вызывает пучок падающих рентгеновских лучей, чтобы преломлять во многих конкретных направлений Структурная биология
Полевые техники
Метод Утилита ветви
Выборка расстояния Используется для оценки плотности и / или обилие из популяций Экология
Отметить и отбить Используется для оценки размера популяции животных, когда нецелесообразно подсчитывать каждую особь. Экология
Вычислительные инструменты

Математические модели

Модель Утилита ветви
Экспоненциальная интеграция и огонь Описывает компактные и вычислительно эффективные нелинейные модели нейронов с импульсами с одной или двумя переменными. Неврология
Модель ФитцХью – Нагумо Описывает прототип возбудимой системы (например, нейрон ) Неврология
Принцип Харди – Вайнберга Утверждает, что частоты аллелей и генотипов в популяции будут оставаться постоянными от поколения к поколению в отсутствие других эволюционных влияний. Генетика, эволюционная биология
Модель Ходжкина – Хаксли Описывает, как потенциалы действия в нейронах инициируются и распространяются. Неврология
Модель бесконечных сайтов Позволяет рассчитывать гетерозиготность или генетическое разнообразие в конечной популяции и оценивать генетические расстояния между интересующими популяциями. Эволюционная биология
Логистический рост Описывает рост популяции как экспоненциальный, за которым следует снижение прироста, ограниченный пропускной способностью из-за давления окружающей среды. Экология
Уравнения Лотки – Вольтерра Опишите динамику из биологических систем, в которых два вид взаимодействует, один в качестве хищника, а другие как добыча Экология
Процесс Морана Стохастический процесс, описывающий конечные совокупности Генетика
Взаимосвязь видов и ареалов описывает взаимосвязь между площадью среды обитания или частью среды обитания и количеством видов, встречающихся в этой области. Экология

Алгоритмы

Алгоритм Утилита ветви
Эволюционный алгоритм Использует механизмы, вдохновленные биологической эволюцией. Кандидатское решение к задаче оптимизации играет роль особей в популяции, а функция пригодности определяет качество решений. Неврология
использованная литература
внешние ссылки
Последняя правка сделана 2023-03-29 01:03:53
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте