Часть серии о |
COVID-19 пандемия |
---|
|
Лента новостей 2019 г. 2020 г. 2021 г. |
Локации По стране и территории Транспортным способом |
Международный ответ |
Медицинский ответ |
Варианты |
Экономические последствия и рецессия
По стране |
Воздействия
|
COVID-19 портал |
|
Theta варианта, также известный как линиджная Р.3, является одним из вариантов в SARS-CoV-2, вирус, который вызывает COVID-19. Впервые этот вариант был обнаружен на Филиппинах 18 февраля 2021 года, когда две вызывающие озабоченность мутации были обнаружены в Центральных Висайских островах. Он был обнаружен в Японии 12 марта 2021 года, когда путешественник из Филиппин прибыл в международный аэропорт Нарита в Токио.
Он отличается от тех, что впервые были обнаружены в Соединенном Королевстве, Южной Африке и Бразилии, и считается, что он представляет аналогичную угрозу. Этот вариант более устойчив к нейтрализующим антителам, в том числе полученным в результате вакцинации, как, например, южноафриканский и бразильский варианты.
Согласно упрощенной схеме именования, предложенной Всемирной организацией здравоохранения, P.3 был обозначен как вариант Theta и считается вариантом, представляющим интерес (VOI), но еще не вызывающим озабоченность вариантом.
С июля 2021 года Тета больше не рассматривается ВОЗ как вариант интереса.
17 марта 2021 года Общественное здравоохранение Англии (PHE) назвало Lineage P.3 VUI-21MAR-02.
1 июня 2021 года Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) назвала линию P.3 тета-вариантом.
Аминокислотные мутации варианта SARS-CoV-2 Theta нанесены на карту генома SARS-CoV-2 с акцентом на спайке.
Во всех образцах наблюдали в общей сложности 14 замен аминокислот (отмечены красным ниже), включая семь мутаций шипового белка. Среди мутаций шипового белка четыре ранее были связаны с вызывающими озабоченность линиями (например, E484K, N501Y, D614G и P681H), в то время как три дополнительных замены наблюдались в направлении C-концевой области белка (например, E1092K, H1101Y и V1176F). Интересно, что единственная аминокислотная замена на N-конце ORF8 (т.е. K2Q) также была обнаружена во всех образцах. Три другие мутации были замечены в 32 из 33 образцов (отмечены зеленым), включая делецию трех аминокислот в положениях 141–143 белка-шипа. Наконец, во всех случаях были обнаружены пять синонимичных мутаций (отмечены серым цветом)..
Ген | Аминокислота |
---|---|
ORF1ab | F924F |
D1554G | |
S2433S | |
L3201P | |
D3681E | |
N3928N | |
L3930F | |
P4715L | |
A5692V | |
S | LGV141_143del |
E484K | |
N501Y | |
G593G | |
D614G | |
P681H | |
S875S | |
E1092K | |
H1101Y | |
V1176F | |
ORF8 | K2Q |
N | R203K |
G204R |
Ген | Аминокислота |
---|---|
ORF1a | D1554G |
S2625F | |
D2980N | |
L3201P | |
D3681E | |
L3930F | |
ORF1b | P314L |
L1203F | |
A1291V | |
S | LGV141_143del |
E484K | |
N501Y | |
G593G | |
D614G | |
P681H | |
S875S | |
E1092K | |
H1101Y | |
V1176F | |
ORF8 | K2Q |
N | R203K |
G204R |
18 февраля 2021 года Департамент здравоохранения на Филиппинах подтвердил обнаружение двух мутаций COVID-19 в Центральной Visayas после образцов от пациентов были отправлены пройти секвенирование генома. Позднее мутации были названы E484K и N501Y и были обнаружены в 37 из 50 образцов, причем обе мутации одновременно встречались в 29 из них. Официальных названий вариантов не было, и полная последовательность еще не была определена.
12 марта 2021 года Япония обнаружила вариант у путешественника с Филиппин.
13 марта 2021 года Министерство здравоохранения подтвердило, что мутации представляют собой новый вариант, который был обозначен как линия P.3. В тот же день он также подтвердил свой первый случай линии передачи P.1 в стране. Хотя линии P.1 и P.3 происходят от одной и той же линии B.1.1.28, департамент заявил, что влияние линии P.3 на эффективность и трансмиссивность вакцины еще предстоит установить.
17 марта 2021 г. Великобритания подтвердила свои первые два случая, в которых Служба здравоохранения Англии (PHE) назвала их VUI-21MAR-02.
30 апреля 2021 года Малайзия выявила 8 случаев линии передачи P.3 в Сараваке.
Страна | Подтвержденные случаи [заболевания | |||
---|---|---|---|---|
ЯЩЕР | outbreak.info | Регенерон | Другие источники | |
Филиппины | 248 | 298 | 298 | 461 |
Соединенные Штаты | 17 | 17 | 17 | |
Германия | 11 | 11 | 11 | |
Малайзия | 10 | 10 | 10 | 13 |
Объединенное Королевство | 9 | 9 | 9 | 10 |
Япония | 7 | 8 | 8 | |
Нидерланды | 7 | 7 | 7 | 4 |
Канада | 5 | 5 | 5 | |
Австралия | 3 | 4 | 4 | |
Бельгия | 3 | 3 | 3 | |
Китай | 3 | 14 | 18 | |
Гуам | 3 | 3 | 3 | |
Новая Зеландия | 3 | 3 | 3 | |
Норвегия | 3 | 3 | 3 | |
Сингапур | 3 | 3 | 3 | |
Ангола | 2 | 2 | 2 | |
Южная Корея | 2 | 2 | 2 | |
Швеция | 2 | 2 | 2 | |
Финляндия | 1 | 1 | 1 | |
Италия | - | - | 1 | |
Общий: | 342 | 405 | 410 | 488 |