SARS-CoV-2 линия B.1.617

редактировать

Линия B.1.617 является линией SARS-CoV-2, вируса, вызывающего COVID-19. Впервые он привлек международное внимание в конце марта 2021 года после того, как недавно созданный INSACOG провел секвенирование генома на положительных образцах в различных штатах Индии. Анализ образцов из Махараштры показал, что по сравнению с декабрем 2020 года увеличилась доля образцов с мутациями E484Q и L452R. Линия B.1.617 позже была названа СМИ двойным мутантом.

В соответствии с номенклатурой PANGO линия B.1.617 имеет три подлинии :

  • B.1.617.1 (вариант Каппа), впервые обнаружен в Индии в декабре 2020 г.
  • B.1.617.2 (вариант Дельта), впервые обнаружен в Индии в конце 2020 г.
  • B.1.617.3, впервые наблюдается в январе 2021 г.

Мутации

Белок-шип SARS-CoV-2

Вот некоторые из распространенных мутаций, присутствующих в шиповатом белке линии B.1.617. Не все подлинии B.1.617 имеют одни и те же мутации:

  • L452R. Замещение в положении 452, A лейцина -До- аргинин замещение, Конферах сильнее сродство белка шипа для ACE2 рецептора и снижение способности распознавания иммунной системы. Эти мутации, взятые по отдельности, не уникальны для данного варианта; скорее, их одновременное появление. Эта мутация присутствует во всех трех подлиниях B.1.617.
  • T478K. Замещение в положении 478, A треонин -До- лизина замещение, можно найти только в линиджной B.1.617.2.
  • E484Q. Замещение в положении 484, А кислоты глутаминовой -До- глутамина замещение, совещается линия B.1.617 сильнее, связывающий потенциал человеческого ACE2 рецептора, а также лучшую способность иммунной системы уйти от хозяев по сравнению с другими вариантами. Эта мутация отсутствует в геноме B.1.617.2.
  • D614G. Замещение в положении 614, не давал аспарагиновой кислоты -До- глицина замещения, используется совместно с другими высоко трансмиссивных клонов, как B.1.1.7, B.1.351 и P.1.
  • P681R. Замещение в положении 681, A пролин -До- аргинин замены, которые, по мнению William A. Haseltine, могут повысить уровень клеточного инфекционность варианта «путь облегчения расщепления белка - предшественника S к активной конфигурации S1 / S2». Эта мутация присутствует во всех трех подлиниях B.1.617.

История

Согласно одному источнику, первая последовательность генома B.1.617 была отправлена ​​в GISAID осенью 2020 года. Команда PANGO, занимавшаяся ручной обработкой филогенетического дерева SARS-CoV-2, отметила, что самая ранняя последовательность датируется 7 декабря 2020 года. Они предложили новое обозначение для варианта, содержащего мутации в шиповом белке, включая G142D, L452R, E484Q, D614G, P681R среди других, и этому варианту была присвоена линия PANGO B.1.617 1 апреля 2021 г. Они пересмотрели филогенетическое дерево, включив в него три сублинии B.1.617 21 апреля 2021 г., после того, как заметили, что не все последовательности генома назначаются инструментом PANGOLIN. содержит тот же набор мутаций.

До середины апреля 2021 года Индия представила наибольшее количество геномов B.1.617, за ней по частоте следуют Великобритания и США. Основываясь на информации о геноме, линия B.1.617 была впервые обнаружена в Великобритании 22 февраля 2021 года и в США 23 февраля 2021 года.

После обнаружения 77 случаев линии B.1.617 в Великобритании в середине апреля 2021 года Служба общественного здравоохранения Англии обозначила эту линию как исследуемый вариант. Менее чем через два месяца вариант Дельта станет доминирующим вариантом в Великобритании, и исследователи заявят, что ранние данные свидетельствуют о том, что может быть повышенный риск госпитализации для Дельта по сравнению с ранее доминировавшим вариантом Альфа.

использованная литература

Последняя правка сделана 2023-04-21 09:50:44
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте