Войти
Страны с подтвержденными случаями бета-варианта по состоянию на 25 июня 2021 г. Легенда: 1000+ подтвержденных последовательностей 250–999 подтвержденных последовательностей 100–249 подтвержденных последовательностей 10–99 подтвержденных последовательностей 2–9 подтвержденных последовательностей 1 подтвержденная последовательность Нет или данные отсутствуют Бета варианта, также известный как линиджная B.1.351, является вариантом из SARS-COV-2, вирус, который вызывает COVID-19. Один из нескольких вариантов SARS-CoV-2, который, как считается, имеет особое значение, он был впервые обнаружен в столичном районе Нельсона Манделы провинции Восточный Кейп в Южной Африке в октябре 2020 года, о чем 18 декабря сообщило министерство здравоохранения страны. 2020. Филогеографический анализ предполагает, что этот вариант появился в районе залива Нельсона Манделы в июле или августе 2020 года.
Всемирная организация здравоохранения назвала вариант, как вариант беты, а не заменять научное название, но в качестве названия для общественности обычно ссылаются. ВОЗ считает это вариантом беспокойства.
Аминокислотные мутации бета-варианта SARS-CoV-2 нанесены на карту генома SARS-CoV-2 с акцентом на Спайка.
| Ген | Нуклеотид | Аминокислота |
|---|---|---|
| ORF1ab | C1059T | T265I |
| G5230T | K1655N | |
| C8660T | H2799Y | |
| C8964T | S2900L | |
| A10323G | K3353R | |
| G13843T | D4527Y | |
| C14408T 1 | P4715L | |
| C17999T | T5912I | |
| Шип | C21614T | L18F |
| A21801C | D80A | |
| A22206G | D215G | |
| G22299T | R246I | |
| G22813T | K417N | |
| G23012A | E484K | |
| A23063T | N501Y | |
| A23403G 1 | D614G | |
| G23664T | A701V | |
| ORF3a | G25563T | Q57H |
| C25904T | S171L | |
| E | C26456T | P71L |
| N | C28887T | T205I |
| Сноска: 1 Представлено в родительской линии B.1. Источник: Тегалли и др. (2020), дополнительный рисунок S8 | ||
Особый интерес представляют три мутации в области шипа генома линии B.1.351:
и еще пять шиповых мутаций, которые пока вызывают меньшее беспокойство:
Помимо области шипа, он также несет: делецию K1655N, SGF 3675-3677, P71L и T205I.
Ученые отметили, что этот вариант может легче прикрепляться к клеткам человека из-за трех мутаций в рецептор-связывающем домене (RBD) в спайковом гликопротеине вируса: N501Y (изменение с аспарагина (N) на тирозин (Y) в положение аминокислоты 501), K417N и E484K. Две из этих мутаций, E484K и N501Y, находятся в рецептор-связывающем мотиве (RBM) рецептор-связывающего домена (RBD).
Мутация N501Y также была обнаружена в Великобритании. Две мутации, обнаруженные в бета-варианте, E484K и K417N, не встречаются в альфа-варианте. Кроме того, Beta не имеет мутации 69-70del, обнаруженной в другом варианте.
4 января 2021 года британская газета The Telegraph сообщила, что оксфордский иммунолог сэр Джон Белл считает, что существует «большой вопросительный знак» по поводу потенциальной устойчивости нового южноафриканского варианта к вакцинам COVID-19, вызывая опасения, что вакцины могут не сработать с этой целью. вариантный штамм. В тот же день Шабир Мадхи, профессор вакцинологии из Университета Витватерсранда, прокомментировал CBS News, что «не факт», что новый бета-вариант (вариант 501.V2) сможет избежать вакцинации, но что он должен считается, что они «не могут иметь полную эффективность». Саймон Кларк, адъюнкт-профессор клеточной микробиологии в Университете Рединга, назвал дополнительные мутации к белку-шипу в бета-версии важным фактором, поскольку они «могут сделать вирус менее восприимчивым к иммунному ответу, вызываемому вакцинами».. Лоуренс Янг, вирусолог из Уорикского университета, также отметил, что множественные спайковые мутации этого варианта «могут привести к некоторому уходу от иммунной защиты».
Сообщалось, что изменение аминокислоты E484K, мутация рецептор-связывающего домена (RBD), «связано с ускользанием от нейтрализующих антител», что может отрицательно повлиять на эффективность вакцин против COVID, зависимых от спайк-белка. Спайковая мутация E484K была связана со случаем повторного заражения бета-вариантом SARS-CoV-2 в Бразилии, который, по мнению исследователей, был первым подобным случаем повторного заражения, связанного с этой мутацией. Возможность изменения антигенности была названа «мутацией ускользания» от моноклонального антитела, способного нейтрализовать варианты шипованного белка SARS-CoV-2. Это говорит о том, что существующие вакцины можно и нужно обновлять, чтобы противодействовать новым штаммам, не прибегая к поэтапным испытаниям.
В январе компания Johnson amp; Johnson, которая проводила испытания своей вакцины Janssen (Ad26.COV2.S) в Южной Африке, сообщила, что уровень защиты от умеренной или тяжелой инфекции COVID-19 составил 72% в США, но 64% в США. ЮАР.
17 февраля 2021 года компания Pfizer объявила, что активность нейтрализации была снижена на две трети для бета-варианта, при этом воздерживаясь от заявлений об эффективности вакцины в предотвращении заболеваний, вызванных этим вариантом.
16 марта 2021 года Управление по надзору за продуктами медицинского назначения Южной Африки (SAHPRA) одобрило вакцину Pfizer-BioNTech (BNT162b2) для раздела 21 «Разрешение на использование в чрезвычайных ситуациях».
Вакцина Pfizer – BioNTech 1 апреля 2021 г. в обновленной информации об испытании вакцины в Южной Африке говорилось, что вакцина на данный момент была эффективна на 100% (т. Е. Вакцинированные участники не видели случаев заболевания), причем шесть из девяти инфекций в контрольной группе плацебо были бета-вариантом (линия B)..1.351). Однако девять дней спустя израильское исследование показало, что этот вариант присутствовал даже у людей, получивших обе вакцины, и его распространенность непропорционально, в восемь раз больше среди вакцинированных людей по сравнению с дикими штаммами.
5 мая 2021 года письмо, в котором подведены итоги Катарской национальной исследовательской группы по вакцинации против COVID-19, показало, что эффективность против инфекции составляет 75%, при этом ни одного случая тяжелого заболевания.
6 февраля 2021 года газета The Financial Times сообщила, что предварительные данные исследования, проведенного Университетом Витватерсранда в Южной Африке совместно с Оксфордским университетом, продемонстрировали снижение эффективности вакцины Oxford – AstraZeneca COVID-19 (AZD1222) против бета-варианта. Исследование показало, что при размере выборки в 2000 вакцина AZD1222 обеспечивала только «минимальную защиту» во всех случаях COVID-19, кроме самых тяжелых.
7 февраля 2021 года правительство Южной Африки приостановило запланированное развертывание около 1 миллиона доз вакцины, пока они изучили данные и ожидали совета относительно дальнейших действий. Впоследствии правительство Южной Африки отменило использование вакцины, продав ее поставки другим африканским странам, и переключило свою программу вакцинации на вакцину Janssen COVID-19.
В июле 2021 года, после увеличения заболеваемости бета-вирусом во Франции, Великобритания - основной пользователь вакцины AstraZeneca - ввела дополнительные ограничения для людей, путешествующих в Великобританию из Франции. Однако, как указала французский политик и врач Вероник Триле-Ленуар, во Франции заболеваемость находится на территории Реюньона в Индийском океане.
Другие африканские страны начали развертывание BBIBP-CorV от Sinopharm, а Марокко, Египет, Сейшельские острова и Зимбабве начали массовое развертывание. На данный момент вакцина оказалась устойчивой к бета-варианту, как это было продемонстрировано в Зимбабве. 2 февраля 2021 года в препринте было объявлено, что активность по нейтрализации была снижена в 1,6 раза для бета-варианта.
В феврале Moderna сообщила, что нынешняя вакцина ( мРНК-1273 ) вырабатывала только шестую часть антител в ответ на южноафриканский вариант по сравнению с исходным вирусом. Они начали испытания новой вакцины против бета-варианта.
Южноафриканское агентство по контролю за продуктами медицинского назначения (SAHPRA) подтвердило, что оно получило документацию на вакцину, разработанную Институтом Гамалея в России.
Sputnik V (Gam-COVID-Vac) - одна из трех вакцин против Covid во всем мире с эффективностью более 90% в симптоматических случаях. Было обнаружено, что он был немного менее эффективным, но работал лучше, чем его конкуренты. [1] Было обнаружено трехкратное снижение ВНК по сравнению с бета-вариантом. [2] [3]
CoronaVac еще не одобрен для использования Управлением по продуктам здравоохранения Южной Африки (SAHPRA). На данный момент Sinovac предложил поставить в Южную Африку 5 миллионов доз вакцины.
Коваксин оказался эффективным против бета-варианта, хотя и с трехкратным снижением нейтрализации.
Информация о вакцине CoviVac еще не поступила в правительство Южной Африки.
Информация о вакцине EpiVacCorona еще не была доставлена правительству Южной Африки.
Информация о вакцине ZF2001 находится в процессе доставки правительству Южной Африки.
Исследование вакцины NVX-CoV2373 Novavax показало эффективность 60% (для ВИЧ-отрицательных участников) в Южной Африке по сравнению с эффективностью 90% в Великобритании.
BioVac институт, поддерживаемого государство Южной Африки вакцины компания, планирует использовать сделку он выиграл для производства коронавируса вакцин. Контракт с американской основой ImmunityBio Inc в настоящее время проводит фазы 1 испытания вакцины с их вакцинами hAd5 в Соединенных Штатах и Южной Африке.
ImmunityBio и BioVac планируют распространять вакцины по всей Южной Африке и Африке.
Исследователи и официальные лица сообщили, что распространенность этого варианта была выше среди молодых людей без основных заболеваний и в таких случаях чаще вызывала серьезные заболевания, чем другие варианты. Департамент здравоохранения Южной Африки также указал, что этот вариант может быть движущей силой второй волны пандемии COVID-19 в стране, поскольку этот вариант распространяется быстрее, чем другие более ранние варианты вируса.
| Кейсы по странам (обновлено 21 июля 2021 г.) GISAID | ||
|---|---|---|
| Страна | Подтвержденные случаи [заболевания | Дата сбора |
| Ангола | 401 | 22 апреля 2021 г. |
| Аргентина | 1 | 24 апреля 2021 г. |
| Аруба | 4 | 10 апреля 2021 г. |
| Австралия | 73 | 28 июня 2021 г. |
| Австрия | 260 | 8 июня 2021 г. |
| Бахрейн | 1 | 9 апреля 2021 г. |
| Бангладеш | 56 | 16 июня 2021 г. |
| Бельгия | 1,075 | 14 июня 2021 г. |
| Босния и Герцеговина | 1 | 11 февраля 2021 г. |
| Ботсвана | 342 | 27 июня 2021 г. |
| Бразилия | 6 | 5 апреля 2021 г. |
| Бруней | 1 | 20 января 2021 г. |
| Болгария | 2 | 9 июня 2021 г. |
| Камбоджа | 1 | 31 мая 2021 г. |
| Камерун | 9 | 1 марта 2021 г. |
| Канада | 860 | 21 июня 2021 г. |
| Чили | 4 | 22 мая 2021 г. |
| Китай | 89 | 4 июня 2021 г. |
| Колумбия | 1 | 13 апреля 2021 г. |
| Коста-Рика | 12 | 4 мая 2021 г. |
| Берег Слоновой Кости | 1 | 6 марта 2021 г. |
| Хорватия | 41 год | |
| Чехия | 71 | 10 июня 2021 г. |
| Демократическая Республика Конго | 30 | 20 апреля 2021 г. |
| Дания | 121 | 29 июня 2021 г. |
| Джибути | 22 | 9 апреля 2021 г. |
| Экваториальная Гвинея | 43 год | 1 апреля 2021 г. |
| Эстония | 37 | 23 апреля 2021 г. |
| Эсватини | 26 | 23 марта 2021 г. |
| Финляндия | 1,123 | 21 мая 2021 г. |
| Франция | 2 149 | 23 июня 2021 г. |
| Французская Гвиана | 2 | 7 апреля 2021 г. |
| Габон | 4 | 21 февраля 2021 г. |
| Грузия | 1 | 23 мая 2021 г. |
| Германия | 2,231 | 19 июня 2021 г. |
| Гана | 17 | 8 апреля 2021 г. |
| Греция | 19 | 29 апреля 2021 г. |
| Гваделупа | 4 | 25 мая 2021 г. |
| Гуам | 3 | 28 апреля 2021 г. |
| Гвинея-Бисау | 1 | 1 февраля 2021 г. |
| Индия | 208 | 14 июня 2021 г. |
| Индонезия | 10 | 2 июня 2021 г. |
| Иран | 2 | 3 апреля 2021 г. |
| Ирак | 1 | 26 февраля 2021 г. |
| Ирландия | 69 | 19 апреля 2021 г. |
| Израиль | 240 | 28 мая 2021 г. |
| Италия | 69 | 1 июня 2021 г. |
| Япония | 89 | 13 июня 2021 г. |
| Иордания | 2 | 18 апреля 2021 г. |
| Кения | 178 | 31 мая 2021 г. |
| Кувейт | 1 | 21 июня 2021 г. |
| Латвия | 9 | 13 мая 2021 г. |
| Лесото | 14 | 18 января 2021 г. |
| Литва | 11 | 9 апреля 2021 г. |
| Люксембург | 744 | 22 мая 2021 г. |
| Малави | 312 | 16 апреля 2021 г. |
| Малайзия | 161 | 10 июня 2021 г. |
| Мальта | 3 | 1 июня 2021 г. |
| Мартиника | 2 | 28 апреля 2021 г. |
| Маврикий | 7 | 12 марта 2021 г. |
| Майотта | 32 | 31 января 2021 г. |
| Мексика | 20 | 16 мая 2021 г. |
| Мозамбик | 328 | 22 апреля 2021 г. |
| Намибия | 9 | |
| Нидерланды | 693 | 27 мая 2021 г. |
| Новая Зеландия | 31 год | 25 июня 2021 г. |
| Северная Македония | 1 | 10 марта 2021 г. |
| Норвегия | 362 | 11 июня 2021 г. |
| Пакистан | 35 год | 5 июня 2021 г. |
| Панама | 2 | 12 января 2021 г. |
| Филиппины | 1,213 | 8 апреля 2021 г. |
| Польша | 45 | 7 июня 2021 г. |
| Португалия | 99 | 2 июня 2021 г. |
| Катар | 650 | 18 мая 2021 г. |
| Воссоединение | 400 | 19 июня 2021 г. |
| Румыния | 7 | 26 мая 2021 г. |
| Россия | 23 | 12 июня 2021 г. |
| Руанда | 39 | 15 июня 2021 г. |
| Саудовская Аравия | 3 | 15 апреля 2021 г. |
| Сингапур | 100 | 25 июня 2021 г. |
| Синт-Мартен | 1 | 24 марта 2021 г. |
| Словакия | 31 год | 27 мая 2021 г. |
| Словения | 31 год | 6 апреля 2021 г. |
| Сомали | 1 | |
| Южная Африка | 6 154 | 21 июня 2021 г. |
| Южная Корея | 19 | 17 апреля 2021 г. |
| южный Судан | 3 | 24 апреля 2021 г. |
| Испания | 588 | 18 июня 2021 г. |
| Шри-Ланка | 4 | 26 марта 2021 г. |
| Суринам | 5 | 31 марта 2021 г. |
| Швеция | 2,322 | 17 июня 2021 г. |
| Швейцария | 225 | 22 июня 2021 г. |
| Тайвань | 3 | 26 апреля 2021 г. |
| Таиланд | 40 | 25 мая 2021 г. |
| Идти | 2 | 5 февраля 2021 г. |
| Тунис | 1 | 24 апреля 2021 г. |
| Турция | 912 | 24 мая 2021 г. |
| Уганда | 13 | 2 апреля 2021 г. |
| Объединенные Арабские Эмираты | 6 | 27 апреля 2021 г. |
| Объединенное Королевство | 812 | 24 июня 2021 г. |
| Соединенные Штаты Америки | 2,454 | 28 июня 2021 г. |
| Замбия | 161 | 28 апреля 2021 г. |
| Зимбабве | 331 | 26 февраля 2021 г. |
| Мир (103 страны) | Итого: 28380 | Всего на 21 июля 2021 г. |
Группа геномиков, возглавляемая исследовательской платформой KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform ( KRISP ) в университете KwaZulu-Natal, обнаружила новый вариант. Это было обнаружено путем секвенирования всего генома. Несколько геномных последовательностей этой линии были внесены в базу данных последовательностей GISAID.
23 декабря министр здравоохранения Великобритании Мэтт Хэнкок объявил, что два человека, которые приехали из Южной Африки в Великобританию, были инфицированы бета-вариантом (вариант 501.V2). 28 декабря вариант был обнаружен у двух человек в Швейцарии и у одного в Финляндии. 29 декабря штамм был обнаружен у посетителя из Южной Африки в Японии и у одного иностранного путешественника в Квинсленде, Австралия. 30 декабря вариант был обнаружен в Замбии. 31 декабря он был также обнаружен во Франции у пассажира, возвращавшегося из ЮАР. 2 января 2021 года первый случай этого варианта был выявлен в Южной Корее. Австрия сообщила о своем первом случае этого варианта, а также о четырех случаях варианта « Альфа» 4 января. Республика Ботсвана также обнаружен первый случай на 4 января. Китайская Народная Республика сообщила о первом случае этого варианта в южной провинции Гуандун на 6 января.
8 января 2021 года Ирландия сообщила об обнаружении 3 случаев заболевания, все из которых были связаны с поездками из Южной Африки. В тот же день из Бразилии был зарегистрирован случай повторного заражения новым вариантом у женщины, переболевшей COVID-19, и это первое подобное повторное заражение, зарегистрированное в мире. Канада сообщила о первом случае этого варианта в Альберте 9 января, а Израиль сообщил о четырех случаях, все из которых были завезены людьми, путешествующими из Южной Африки. Новая Зеландия сообщила о первом случае этого варианта 10 января. 12 января Германия сообщила об обнаружении мутации у шести человек из трех разных домохозяйств. В тот же день сообщалось, что в Соединенном Королевстве зарегистрировано 29 случаев заболевания, о двух из которых сообщалось ранее. На следующий день Бельгия сообщила о первом случае у человека из Западной Фландрии, который не путешествовал, Израиль сообщил о еще четырех случаях, а Тайвань сообщил о первом случае у мужчины из свази в возрасте 30 лет, у которого 1 января был положительный результат на COVID-19..
14 января Германия обнаружила еще один случай, а на следующий день Канада сообщила о втором случае мутации, обнаруженной в канадской провинции Британская Колумбия. В тот же день в Германии был зарегистрирован еще один случай. Дания и Реюньон сообщили о своих первых случаях заболевания 16 января, поскольку Израиль обнаружил еще четыре случая. 17 января Израиль сообщил о еще четырех случаях, в результате чего общее количество случаев этого варианта достигло 20. Еще о двух случаях было зарегистрировано в Нидерландах 18 января, в результате чего общее количество случаев в стране достигло трех. Гана сообщила о первом случае этого варианта 19 января. 23 января в Панаме был обнаружен первый случай штамма у человека из Зимбабве, приехавшего из Южной Африки. Также 23 января Бельгия сообщила как минимум о 15 случаях этого варианта в Остенде, а 6 случаев были подтверждены на Коморских островах. 26 января Ирландия сообщила о выявлении еще 6 случаев заболевания. Соединенные Штаты сообщили о первых случаях этого варианта 28 января 2021 года в штате Южная Каролина. 27 января Израиль сообщил о еще трех случаях, которые были первыми случаями этого варианта из образцов, которые были собраны в общине случайным образом, без указания источника инфекции. Предварительные данные, представленные Африканским Центром контроля заболеваний 29 января, показали, что этот вариант достиг Ганы. 31 января Израиль сообщил о своем первом случае повторного заражения новым вариантом от мужчины, который вернулся из Турции.
1 февраля 2021 года Государственный секретарь Соединенного Королевства по вопросам здравоохранения и социальной защиты сообщил о случайном обнаружении 11 случаев этого варианта, не связанного с международными поездками. В тот же день канадская провинция Онтарио сообщила о первом случае этого варианта в регионе Пил с аналогичным отсутствием истории путешествий и контактов с кем-либо, кто недавно был за границей. 8 февраля Ирландия сообщила о выявлении еще 2 случаев заболевания.
8 февраля 2021 года в Австрии была зафиксирована самая крупная на сегодняшний день вспышка бета-варианта в Европе. Посредством секвенирования было выявлено в общей сложности 293 подтвержденных случая и 200 подозреваемых случаев, большинство из них с большой вероятностью будет подтверждено. Все случаи были обнаружены в регионе Тироль, где почти 9% положительных результатов ПЦР-тестов были идентифицированы как бета-вариант путем секвенирования. Число активных случаев оценивалось примерно в 140. После недели публичных обсуждений и политического давления по поводу возможного карантина Тироля правительство Австрии воздержалось от изоляции проблемных районов, вместо этого сделав формальный призыв сократить движение въезд и выезд из Тироля. региона и отправляйтесь на тестирование после посещения Тироля. Официальные лица Тироля заявили о своем намерении ослабить правила изоляции в Тироле в соответствии с остальной частью Австрии.
22 февраля министерство здравоохранения Израиля заявило, что этот вариант был генетически секвенирован чуть менее чем в 1% из 3000 образцов в общинах. Позже Израиль сообщил о 444 случаях этого варианта, что сделало его самым высоким показателем инфицирования в мире за пределами Южной Африки. 25 февраля Ирландия сообщила об обнаружении еще 4 случаев заболевания. К концу февраля в Турции было 49 случаев бета-варианта.
3 марта 2021 года на Филиппинах были подтверждены первые 6 новых случаев южноафриканского варианта: 3 пациента из Пасая не путешествовали, а 3 - из Катара и ОАЭ. 5 марта 2021 года Румыния сообщила о первых двух случаях южноафриканского варианта от двух пациентов в Бухаресте и Питешти.
23 марта 2021 года Литва подтвердила первые 2 новых случая заболевания южноафриканским штаммом: 1 в Каунасском уезде и 1 в Вильнюсе. Есть еще 10 предполагаемых случаев этого. Зараженные заявили, что никуда не ездили. 26 марта было подтверждено еще 3 случая, что означает, что вирус успешно распространяется внутри.
1 апреля 2021 года в Малайзии были зарегистрированы первые случаи заболевания южноафриканским вариантом. Министерство здравоохранения сообщило о двух случаях, предположительно произошедших из кластера Джалан Лима, с участием сотрудника международного аэропорта Куала-Лумпур (KLIA), при этом другие зарегистрированные случаи редко были выявлены в Селангоре. По состоянию на 1 апреля сообщается о девяти случаях, связанных с этим вариантом. К 2 мая в результате отслеживания контактов было выявлено в общей сложности 48 случаев, по крайней мере, в 5 кластерах, 20 из которых были обнаружены в двух кластерах в Пераке и Келантане.
На 12 апреля 2021 года в Турции было зарегистрировано 285 случаев заболевания в 11 провинциях.
