HMGA2

редактировать
HMGA2
Идентификаторы
Псевдонимы HMGA2, BABL, HMGI-C, HMGIC, LIPO, STQTL9, AT-hook 2 группы высокой мобильности
Внешние идентификаторыOMIM: 600698 HomoloGene : 136767 Генные карты: HMGA2
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человека)
Chr. Хромосома 12 (человек)
Хромосома 12 (человека) Расположение генома для HMGA2 Расположение генома для HMGA2
Полоса 12q14.3Начало65,824,131 bp
Конец65,966,295 bp
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

8091

н / д

Ensembl

ENSG00000149948

н / д

UniProt

P52926

н / д

RefSeq (мРНК)

н / д

RefSeq (белок) 286>NP_001287847. NP_001287848. NP_001317119. NP_003474. NP_003475

н / д

Местоположение (UCSC)Chr 12: 65,82 - 65,97 Мб н / дPubMed поискн / дWikidata
Просмотр / редактирование человека

Высокомобильная группа AT-hook 2, также известная как HMGA2, белок , который у человека кодируется геном HMGA2 .

Содержание

  • 1 Функция
  • 2 Регулирование с помощью let-7
  • 3 Клиническая значимость
    • 3.1 Связь с раком
    • 3.2 Характерные мутации при раке с высоким уровнем HMGA2
    • 3.3 ERCC1
    • 3.4 Иммунопреципитация хроматина
    • 3.5 Негомологичное присоединение концов к репарации ДНК
    • 3.6 Путь эксцизионной репарации оснований
  • 4 Взаимодействия
  • 5 См. также
  • 6 Ссылки
  • 7 Дополнительная литература
  • 8 Внешние ссылки

Функция

Этот ген кодирует белок, принадлежащий к не гистоновой хромосомной группе высокой мобильности (HMG) семейство белков. Белки HMG действуют как архитектурные факторы и являются важными компонентами энхансом. Этот белок содержит структурные ДНК-связывающие домены и может действовать как фактор регуляции транскрипции. Идентификация делеции, амплификации и перестройки этого гена, которые связаны с липомами, предполагает их роль в адипогенезе и мезенхимальной дифференцировке. Исследование нокаута гена у аналога на мышах продемонстрировало, что этот ген участвует в индуцированном диетой ожирении. Были охарактеризованы альтернативные варианты сплайсинга транскрипции, кодирующие различные изоформы.

Экспрессия HMGA2 в тканях взрослых обычно связана с образованием как злокачественных, так и доброкачественных опухолей, а также с некоторыми характерными мутациями, способствующими развитию рака. Гомологичные белки с высококонсервативными последовательностями обнаружены у других видов млекопитающих, включая лабораторных мышей (Mus musculus ).

HMGA2 содержит три основных ДНК-связывающих домена (АТ-крючки ), которые заставляют белок связываться с аденином - тимином (AT) -богатые участки ядерной ДНК. HMGA2 непосредственно не способствует или не ингибирует транскрипцию каких-либо генов, но изменяет структуру ДНК и способствует сборке белковых комплексов, которые действительно регулируют транскрипцию генов. За некоторыми исключениями, HMGA2 экспрессируется у людей только на раннем этапе развития и снижается до неопределяемых или почти неопределяемых уровней транскрипции во взрослых тканях. microRNA let-7 в значительной степени ответственна за эту зависимую от времени регуляцию HMGA2. Очевидная функция HMGA2 в пролиферации и дифференцировке клеток во время развития подтверждается наблюдением, что мыши с мутантными генами HMGA2 необычно малы (), и полногеномными исследованиями ассоциации, связывающими HMGA2-ассоциированные SNP к изменению роста человека.

Регулирование с помощью let-7

Let-7 подавляет продукцию специфических белков посредством комплементарного связывания с их мРНК стенограммы. Транскрипт зрелой мРНК HMGA2 содержит семь участков, комплементарных или почти комплементарных let-7 в его 3'-нетранслируемой области (UTR). Экспрессия Let-7 очень низкая на раннем этапе развития человека, что совпадает с наибольшей транскрипцией HMGA2. Зависящее от времени падение экспрессии HMGA2 вызвано повышением экспрессии let-7.

Клиническая значимость

Связь с раком

Повышенная экспрессия HMGA2 обнаружена в различные виды рака человека, но точный механизм, с помощью которого HMGA2 способствует образованию рака, неизвестен. Те же мутации, которые приводят к аденомам гипофиза у мышей, могут быть обнаружены при аналогичных раковых заболеваниях у людей. Его присутствие связано с плохим прогнозом для пациента, но также с сенсибилизацией раковых клеток к определенным формам лечения рака. Если быть точным, злокачественные опухоли с высоким содержанием HMGA2 демонстрируют аномально сильный ответ на двухцепочечные разрывы ДНК, вызванные лучевой терапией и некоторыми формами химиотерапии. Искусственное добавление HMGA2 к некоторым формам рака, не реагирующим на повреждение ДНК, заставляет их вместо этого реагировать на лечение, хотя механизм, с помощью которого возникает это явление, также не изучен. Однако экспрессия HMGA2 также связана с повышенной частотой метастазирования при раке груди, а также с метастазированием и рецидивом плоскоклеточной карциномы. Эти свойства являются причиной плохих прогнозов пациентов. Как и в случае с эффектами HMGA2 на реакцию на радиацию и химиотерапию, механизм, с помощью которого HMGA2 вызывает эти эффекты, неизвестен.

Характерные мутации при раке с высоким содержанием HMGA2

Очень частое обнаружение при высоком уровне HMGA2 рак - это недостаточное выражение let-7. Это неудивительно, учитывая естественную роль let-7 в регуляции HMGA2. Тем не менее, многие виды рака обнаруживаются с нормальным уровнем let-7, а также высоким уровнем HMGA2. Многие из этих видов рака экспрессируют нормальный белок HMGA2, но транскрипт зрелой мРНК усечен, в нем отсутствует часть 3'UTR, которая содержит критические комплементарные области let-7. Без них let-7 не может связываться с мРНК HMGA2 и, следовательно, не может ее репрессировать. Усеченные мРНК могут возникать в результате хромосомной транслокации, которая приводит к потере части гена HMGA2.

ERCC1

Сверхэкспрессия HMGA2 может играть роль в частой репрессии ERCC1 в раки. MiRNA let-7a обычно репрессирует ген HMGA2, и в нормальных тканях взрослого человека белок HMGA2 почти не присутствует. (См. Также предшественник микроРНК Let-7.) Уменьшение или отсутствие миРНК let-7a обеспечивает высокую экспрессию белка HMGA2. Как показано Borrmann et al., HMGA2 нацелен на и модифицирует архитектуру хроматина в гене ERCC1, снижая его экспрессию. Эти авторы отметили, что репрессия ERCC1 (с помощью HGMA2) может уменьшить репарацию ДНК, что приводит к повышенной нестабильности генома.

Экспрессия белка ERCC1 снижена или отсутствует в 84–100% колоректальных раковых опухолях человека. Экспрессия белка ERCC1 также была снижена на мышиной модели рака толстой кишки, связанной с диетой. Однако, как указано в статье ERCC1, два других эпигенетических механизма репрессии ERCC1 также могут играть роль в снижении экспрессии ERCC1 (промотор метилирование ДНК и микроРНК репрессии).

Иммунопреципитация хроматина

Полногеномный анализ генов-мишеней HMGA2 был выполнен с помощью иммунопреципитации хроматина в клеточной линии желудка с сверхэкспрессией HMGA2, и 1366 генов были идентифицированы как потенциальные мишени. Пути, которые они идентифицировали как связанные с прогрессированием злокачественной неоплазии, были: adherens junction путь, MAPK сигнальный путь, Wnt сигнальный путь, p53 сигнальный путь. путь, VEGF сигнальный путь, сигнальный путь Notch и сигнальный путь TGF beta.

Негомологичное соединение концов репарация ДНК

Li и другие. показали, что сверхэкспрессия HMGA2 задерживает высвобождение ДНК-PKcs (необходимого для негомологичного соединения концов репарации ДНК) из участков двухцепочечного разрыва. Сверхэкспрессии только HMGA2 было достаточно для индукции хромосомных аберраций, что является признаком недостаточности NHEJ-опосредованной репарации ДНК. Эти свойства указывают на то, что HMGA2 способствует нестабильности генома и туморогенезу.

Основное эксцизионное восстановление путь

Summer et al. обнаружили, что белок HGMA2 может эффективно расщеплять ДНК, содержащую апуриновые / апиримидиновые (AP) сайты (AP-лиаза). Кроме того, этот белок также обладает связанной 5’-дезоксирибозилфосфат (dRP) лиазной активностью. Они продемонстрировали взаимодействие между человеческой AP-эндонуклеазой 1 и HMGA2 в раковых клетках, указывая на то, что HMGA2 может быть включен в клеточный аппарат эксцизионной репарации оснований (BER). Повышенная экспрессия HMGA2 увеличивала BER и позволяла клеткам с повышенным HMGA2 быть устойчивыми к гидроксимочевине, химиотерапевтическому агенту для солидных опухолей.

Взаимодействия

HMGA2, как было показано, взаимодействует с PIAS3 и NFKB1.

Транспорт HMGA2 в ядро ​​опосредуется посредством взаимодействия его второй AT-ловушки и importin-α2.

См. также

Ссылки

Дополнительная литература

Внешние ссылки

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, которая находится в общественном достоянии.

Последняя правка сделана 2021-05-22 08:57:17
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте