ARID1A

редактировать
ARID1A
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы ARID1A, B120, BAF250, BAF250a, BM029, C1orf4, ELD, MRD14, OSA1, P270, SMARCF1, hELD, hOSA1, CSS2, AT-богатый домен взаимодействия 1A
Внешние идентификаторыOMIM: 603024 MGI: 1935147 HomoloGene: 21216 GeneCards: ARID1A
Расположение гена (человек)
Chr. Хромосома 1 (человек)
Группа 1p36.11Начало26,693,236 bp
Конец26,782,104 bp
паттерн экспрессии РНК




Дополнительные данные эталонного выражения
Orthologs
SpeciesHumanMouse
Entrez

8289

93760

Ensembl

ENSG00000117713

ENSMUSG00000007880

UniProt

O14497

A2BH40

RefSeq (мРНК)

NM_139135
NM_006015
NM_018450

NM_001080819
NM_24630Seq (белок) RefSeq (белок) RefSeq NP_006006
NP_624361

NP_001074288
NP_001349999

Местоположение (UCSC)Chr 1: 26,69 - 26,78 МБ Chr 4: 133,68 - 133,76 МБ
PubMed поиск
Викиданные
Vi ew / Edit Human View / Edit Mouse

AT-богатый интерактивный домен, содержащий белок 1A- это белок, который у человека кодируется геном ARID1A .

Содержание

  • 1 Функция
  • 2 Клиническая значимость
  • 3 Исследования
  • 4 Взаимодействия
  • 5 Ссылки
  • 6 Дополнительная литература
  • 7 Внешние ссылки

Функция

ARID1A является членом семейства SWI / SNF, члены которого обладают активностью геликазы и АТФазы и, как полагают, регулируют транскрипцию определенных генов, изменяя структура хроматина вокруг этих генов. Кодируемый белок является частью большого АТФ-зависимого комплекса ремоделирования хроматина SWI / SNF, который необходим для активации транскрипции генов, обычно репрессированных хроматином. Он имеет как минимум два консервативных домена, которые могут быть важны для его функции. Во-первых, он имеет домен ARID, который представляет собой ДНК-связывающий домен, который может специфически связываться с богатой AT последовательностью ДНК, которая, как известно, распознается комплексом SWI / SNF в бета-глобин локус. Во-вторых, С-конец белка может стимулировать активацию транскрипции, зависимую от глюкокортикоидного рецептора. Считается, что белок, кодируемый этим геном, придает специфичность комплексу SWI / SNF и может привлекать комплекс к своим мишеням посредством взаимодействий белок-ДНК или белок-белок. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.

Клиническое значение

Этот ген обычно мутировал при раке желудка, светлоклеточной карциноме яичников и рак поджелудочной железы. При раке молочной железы отдаленные метастазы приобретают инактивационные мутации в ARID1A, которые не наблюдаются в первичной опухоли, а снижение экспрессии ARID1A придает устойчивость к различным лекарствам, таким как трастузумаб и ингибиторы mTOR. Эти результаты служат объяснением того, почему в опухолях накапливаются мутации ARID1A.

Исследования

Отсутствие этого гена / белка, похоже, защищает крыс от некоторых типов повреждения печени.

Взаимодействия

Было показано, что ARID1A взаимодействует с SMARCB1 и SMARCA4.

Ссылки

Дополнительная литература

Внешние ссылки

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, которая находится в общественном достоянии.

Последняя правка сделана 2021-06-09 02:01:45
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте