Войти
| AT-hook | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| структура решения комплекса второго домена привязки dna человеческого hmg-i (y), связанного с додекамером ДНК, содержащим сайт prdii промотора интерферона-бета, ЯМР, 35 структур | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | AT_hook | ||||||||
| Pfam | PF02178 | ||||||||
| InterPro | IPR017956 | ||||||||
| SMART | AT_hook | ||||||||
| SCOPe | 2eze / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
АТ-крючокпредставляет собой ДНК-связывающий мотив, присутствующий во многих белках, включая группа высокой подвижности (HMG) белки, ДНК-связывающие белки из растений и белок hBRG1, центральная АТФаза человек переключение / неферментирующий сахарозу (SWI / SNF) ремоделирование комплекс.
Этот мотив состоит из консервативной палиндромной коровой последовательности пролин - аргинин - глицин - аргинин - пролин, хотя некоторые АТ-крючки содержат только один пролин в основной последовательности. АТ-крючки также включают переменное количество положительно заряженных остатков лизина и аргинина по обе стороны от основной последовательности. АТ-крючок связывается с малой бороздкой ДНК, богатой аденином - тимином (AT), отсюда и AT в названии. Остальная часть названия происходит от предсказанного аспарагина / аспартата «крючка» в самых первых АТ-крючках, о которых сообщалось в 1990 году. В 1997 году были определены структурные исследования с использованием ЯМР. что связанный с ДНК АТ-крючок принял форму полумесяца или крючка вокруг малой бороздки целевой цепи ДНК (на фото справа). Белки HMGA содержат три АТ-крючка, хотя некоторые белки содержат до 30. Оптимальными последовательностями связывания для АТ-крючковых белков являются повторы формы (ATAA) n или (TATT) n , хотя оптимальными последовательностями связывания для основной последовательности АТ-крючка являются AAAT и AATT.
