Эпсилон вариант, также известный как CAL.20C и со ссылкой на два PanGo линий B.1.427 и B.1.429, является одним из вариантов по SARS-COV-2, вирус, который вызывает COVID-19. Впервые он был обнаружен в Калифорнии, США, в июле 2020 года.
С июля 2021 года Эпсилон больше не рассматривается ВОЗ как вариант, представляющий интерес.
Вариант имеет пять определяющих мутаций (I4205V и D1183Y в гене ORF1ab и S13I, W152C, L452R в S-гене белка-шипа ), из которых L452R (ранее также обнаруженный в других неродственных клонах) вызывал особую озабоченность.. B.1.429, возможно, более передается, чем предыдущие варианты, распространяющиеся на местном уровне, но для подтверждения этого необходимы дальнейшие исследования. Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC) перечислили B.1.429 и связанный с ним B.1.427 как « варианты, вызывающие беспокойство », и цитируют препринт, в котором говорится, что они демонстрируют ~ 20% увеличение вирусной передачи, что у них есть " Значительное влияние на нейтрализацию некоторых, но не всех терапевтических средств, получивших разрешение на экстренное использование (EUA) Управления по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов (FDA) для лечения или профилактики COVID-19, и что они умеренно снижают нейтрализацию плазмой, собранной люди, которые ранее были инфицированы этим вирусом или получили вакцину против вируса. В мае 2021 года Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) дала этому варианту новое название «вариант Эпсилон».
Аминокислотные мутации варианта SARS-CoV-2 Epsilon нанесены на карту генома SARS-CoV-2 с акцентом на спайке.
Часть серии о |
COVID-19 пандемия |
---|
|
Лента новостей 2019 г. 2020 г. 2021 г. |
Локации По стране и территории Транспортным способом |
Международный ответ |
Медицинский ответ |
Варианты |
Экономические последствия и рецессия
По стране |
Воздействия
|
COVID-19 портал |
|
Эпсилон (CAL.20C) впервые был обнаружен в июле 2020 года исследователями Медицинского центра Сидарс-Синай, Калифорния, в одном из 1230 образцов вируса, собранных в округе Лос-Анджелес с начала эпидемии COVID-19. Он не был обнаружен снова до сентября, когда он снова появился среди образцов в Калифорнии, но численность оставалась очень низкой до ноября. В ноябре 2020 года на вариант Эпсилон приходилось 36 процентов проб, собранных в Cedars-Sinai Medical Center, а к январю 2021 года на вариант Эпсилон приходилось 50 процентов проб. В совместном пресс - релизе Калифорнийского университета, Сан - Франциско, штат Калифорния департамента здравоохранения и департамента округа Санта - Клара общественного здравоохранения, было объявлено, что вариант был также обнаружен в нескольких округах в Северной Калифорнии. С ноября по декабрь 2020 года частота этого варианта в секвенированных случаях из Северной Калифорнии выросла с 3% до 25%. В препринте CAL.20C описывается как принадлежащий к кладе 20C Nextstrain и составляющий примерно 36% образцов, в то время как новый вариант из клады 20G составляет около 24% образцов в исследовании, сосредоточенном на Южной Калифорнии. Однако обратите внимание, что в США в целом по состоянию на январь 2021 года преобладает клада 20G. После увеличения количества Epsilon в Калифорнии, этот вариант был обнаружен с разной частотой в большинстве штатов США. Небольшие количества были обнаружены в других странах Северной Америки, а также в Европе, Азии и Австралии. По данным GISAID, по состоянию на июль 2021 года вариант Эпсилон был обнаружен в 45 странах. После первоначального увеличения его частота резко упала с февраля 2021 года, поскольку он уступал более распространенному варианту Alpha. В апреле Эпсилон оставался относительно частым в некоторых частях северной Калифорнии, но он практически исчез с юга штата и так и не смог закрепиться где-либо еще; только 3,2% всех случаев в США были эпсилонами, тогда как к тому времени более двух третей были альфа.
Кейсы по странам (обновлено по состоянию на 1 июля 2021 г.) GISAID | ||
---|---|---|
Страна | Подтвержденные случаи [заболевания | Последний зарегистрированный случай |
Соединенные Штаты Америки | 50 723 | 23 июня 2021 г. |
Мексика | 474 | 8 июня 2021 г. |
Канада | 326 | 07 мая 2021 |
Южная Корея | 103 | 26 апреля 2021 г. |
Аруба | 57 год | 24 апреля 2021 г. |
Дания | 37 | 22 марта 2021 г. |
Чили | 30 | 07 июня 2021 г. |
Аргентина | 28 год | 12 мая 2021 г. |
Объединенное Королевство | 21 год | 10 мая 2021 г. |
Япония | 20 | 16 апреля 2021 г. |
Австралия | 20 | 12 апреля 2021 г. |
Коста-Рика | 12 | 05 мая 2021 |
Германия | 10 | 8 июня 2021 г. |
Израиль | 10 | 25 февраля 2021 г. |
Гуам | 8 | 27 марта 2021 г. |
Тайвань | 8 | 31 января 2021 г. |
Гватемала | 7 | |
Франция | 7 | 01 марта 2021 г. |
Ирландия | 7 | 28 апреля 2021 г. |
Нидерланды | 5 | 10 марта 2021 г. |
Испания | 5 | 3 июня 2021 г. |
Новая Зеландия | 4 | 28 декабря 2020 г. |
Сингапур | 4 | 27 марта 2021 г. |
Швейцария | 4 | 01 марта 2021 г. |
Камерун | 3 | 05 февраля 2021 г. |
Гваделупа | 3 | 30 января 2021 г. |
Норвегия | 3 | 12 апреля 2021 г. |
Камбоджа | 2 | 20 января 2021 г. |
Финляндия | 2 | 06 февраля 2021 |
Италия | 2 | 11 февраля 2021 г. |
Перу | 2 | 24 февраля 2021 г. |
Швеция | 2 | 28 января 2021 г. |
Турция | 2 | 11 февраля 2021 г. |
Острова Теркс и Кайкос | 2 | 22 марта 2021 г. |
Колумбия | 2 | 8 января 2021 г. |
Ангилья | 1 | 19 марта 2021 г. |
Антигуа и Барбуда | 1 | 24 апреля 2021 г. |
Барбадос | 1 | 12 апреля 2021 г. |
Бельгия | 1 | 18 января 2021 г. |
Британские Виргинские острова | 1 | 07 января 2021 г. |
Кюрасао | 1 | 19 марта 2021 г. |
Индия | 1 | 02 марта 2021 |
Северная Македония | 1 | 26 января 2021 г. |
Северные Марианские острова | 1 | 16 января 2021 г. |
Синт-Мартен | 1 | 16 февраля 2021 г. |
Доминиканская Республика | 1 | |
Мир (46 стран) | Итого: 51 966 | Всего на 1 июля 2021 г. |