Эпигеном

редактировать

эпигеном состоит из записи химических изменений белков ДНК и гистонов организма; эти изменения могут передаваться потомству организма через многонитевое эпигенетическое наследование между поколениями. Изменения в эпигеноме могут приводить к изменениям структуры хроматина и изменению функции генома.

эпигенома

Эпигеном участвует в регуляции экспрессии генов, развития, дифференцировки тканей, и подавление переносных элементов. В отличие от основного генома, который остается в значительной степени статичным внутри человека, эпигеном может динамически изменяться в зависимости от условий окружающей среды.

Содержание

  • 1 Рак
  • 2 Исследовательские проекты эпигенома
  • 3 Проект эпигеномики Roadmap
  • 4 См. Также
  • 5 Ссылки
  • 6 Внешние ссылки

Рак

Эпигенетика в настоящее время является активной темой в раковых исследованиях. Человеческие опухоли претерпевают серьезное нарушение паттернов метилирования ДНК и модификации гистона. Аберрантный эпигенетический ландшафт раковой клетки характеризуется глобальным геномным гипометилированием, CpG-островом гиперметилированием промотора опухолевых супрессоров генов, измененным гистоновым кодом для критических генов. и глобальная потеря моноацетилированного и триметилированного гистона H4.

Исследовательские проекты эпигенома

В качестве прелюдии к потенциальному проекту эпигенома человека экспериментальный проект эпигенома человека направлен на выявление и каталогизацию положений переменных метилирования (MVP) в геноме человека. Достижения в технологии секвенирования теперь позволяют анализировать эпигеномные состояния всего генома с помощью нескольких молекулярных методологий. Для исследования эпигенома были созданы или предложены микро- и наноразмерные устройства.

Международные усилия по анализу эталонных эпигеномов начались в 2010 году в форме Международного консорциума эпигенома человека (IHEC). Члены IHEC стремятся создать не менее 1000 эталонных (базовых) эпигеномов человека из различных типов нормальных и связанных с заболеванием человеческих типов клеток.

Проект эпигеномики дорожной карты

Одна цель дорожной карты NIH Проект «Эпигеномика» предназначен для создания эталонных эпигеномов человека из нормальных, здоровых людей из большого количества клеточных линий, первичных клеток и первичных тканей. Данные, полученные в рамках проекта, которые можно просматривать и загружать из Атласа эпигенома человека, делятся на пять типов, которые анализируют различные аспекты эпигенома и результаты эпигеномных состояний (например, экспрессию генов):

  1. Модификации гистонов - Секвенирование иммунопреципитации хроматина (ChIP-Seq ) идентифицирует полные геномные модели модификаций гистонов с использованием антител против этих модификаций.
  2. Метилирование ДНК - весь геном Бисульфит-Seq, бисульфит-последовательность с пониженной репрезентативностью (RRBS), секвенирование иммунопреципитации метилированной ДНК (MeDIP-Seq ) и чувствительное к метилированию секвенирование рестрикционного фермента (MRE-Seq) идентифицируют метилирование ДНК
  3. Доступность хроматинаСайты гиперчувствительности к ДНКазе I При секвенировании (ДНКаза-Seq ) используется фермент ДНКаза I для обнаружения открытых участков генома с разными уровнями разрешения до уровня пар оснований. или доступные области в геноме.
  4. Экспрессия генаRNA-Seq и expre массивы ssion идентифицируют уровни экспрессии или гены, кодирующие белок.
  5. Экспрессия малой РНК - smRNA-Seq определяет экспрессию малой некодирующей РНК, в первую очередь миРНК.

Контрольные эпигеномы для здоровые люди будут способствовать достижению второй цели проекта «Эпигеномика дорожной карты», которая заключается в изучении эпигеномных различий, возникающих при таких болезненных состояниях, как болезнь Альцгеймера.

См. также

Ссылки

Внешние ссылки

Последняя правка сделана 2021-05-19 12:12:53
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте