Ген домашнего хозяйства

редактировать
Эта статья посвящена общей теме генов домашнего хозяйства. Список генов домашнего хозяйства, которые следует использовать в качестве эталонных стандартов, см. В разделе эталонные гены.

В области молекулярной биологии, гены домашнего хозяйства, как правило, конститутивные гены, которые необходимы для поддержания основной клеточной функции, и выраженные во всех клетках организма при нормальных и патофизиологических условиях. Хотя некоторые гены домашнего хозяйства экспрессируются с относительно постоянной скоростью в большинстве непатологических ситуаций, экспрессия других генов домашнего хозяйства может варьироваться в зависимости от условий эксперимента.

Происхождение термина «ген домашнего хозяйства» остается неясным. В литературе 1976 года этот термин использовался для описания тРНК и рРНК. В экспериментальных целях экспрессия одного или нескольких генов домашнего хозяйства используется в качестве точки отсчета для анализа уровней экспрессии других генов. Ключевым критерием использования гена домашнего хозяйства таким образом является то, что выбранный ген домашнего хозяйства равномерно экспрессируется с низкой дисперсией как в контрольных, так и в экспериментальных условиях. Проверка генов домашнего хозяйства должна выполняться перед их использованием в экспериментах по экспрессии генов, таких как ОТ-ПЦР. Недавно была разработана веб-база данных домашних генов и эталонных генов / транскриптов человека и мышей, названная Атлас служебных и эталонных транскриптов (Атлас HRT), чтобы предложить обновленный список генов домашнего хозяйства и надежных эталонных генов / транскриптов-кандидатов для данных RT-qPCR. нормализация. Доступ к этой базе данных можно получить по адресу http://www.housekeeping.unicamp.br.

СОДЕРЖАНИЕ

  • 1 Регулирование гена домашнего хозяйства
  • 2 Общие гены домашнего хозяйства у людей
    • 2.1 Экспрессия гена
      • 2.1.1 Факторы транскрипции
        • 2.1.1.1 Репрессоры
      • 2.1.2 Сплайсинг РНК
      • 2.1.3 Коэффициенты перевода
        • 2.1.3.1 синтез тРНК
        • 2.1.3.2 РНК-связывающий белок
      • 2.1.4 Рибосомные белки
      • 2.1.5 Митохондриальные рибосомные белки
      • 2.1.6 РНК-полимераза
      • 2.1.7 Обработка белков
      • 2.1.8 Белки теплового шока
      • 2.1.9 Гистон
      • 2.1.10 Клеточный цикл
      • 2.1.11 Апоптоз
      • 2.1.12 онкогенов
      • 2.1.13 Восстановление / репликация ДНК
    • 2.2 Метаболизм
      • 2.2.1 Углеводный обмен
      • 2.2.2 Цикл лимонной кислоты
      • 2.2.3 Липидный обмен
      • 2.2.4 Аминокислотный метаболизм
      • 2.2.5 НАДН-дегидрогеназа
      • 2.2.6 Цитохром С оксидаза
      • 2.2.7 АТФаза
      • 2.2.8 Лизосома
      • 2.2.9 Протеасома
      • 2.2.10 Рибонуклеаза
      • 2.2.11 Тиоредуктаза
    • 2.3 Структурный
      • 2.3.1 Цитоскелет
      • 2.3.2 Синтез органелл
      • 2.3.3 Митохондрия
    • 2.4 Поверхность
      • 2.4.1 Адгезия клеток
      • 2.4.2 Каналы и транспортеры
      • 2.4.3 Рецепторы
      • 2.4.4 Распознавание HLA / иммуноглобулина / клеток
    • 2.5 Киназы / передача сигналов
      • 2.5.1 Факторы роста
      • 2.5.2 Фактор некроза тканей
      • 2.5.3 Казеиновая киназа
    • 2.6 Разное
      • 2.6.1 Open_reading_frame
      • 2.6.2 Сперма / Яички
  • 3 См. Также
  • 4 ссылки
  • 5 Внешние ссылки

Генная регуляция домашнего хозяйства

Гены домашнего хозяйства составляют большинство активных генов в геноме, и их экспрессия, очевидно, жизненно важна для выживания. Уровни экспрессии генов домашнего хозяйства точно настроены для удовлетворения метаболических потребностей в различных тканях. Биохимические исследования инициации транскрипции промоторов генов домашнего хозяйства были трудными, отчасти из-за менее охарактеризованных мотивов промоторов и процесса инициации транскрипции.

Промоторы генов домашнего хозяйства человека обычно лишены TATA- бокса, имеют высокое содержание GC и высокую частоту CpG- островков. У дрозофилы, где промотор- специфические CpG-острова отсутствуют, промоторы генов домашнего хозяйства содержат элементы ДНК, такие как DRE, E-box или DPE. Сайты начала транскрипции генов домашнего хозяйства могут охватывать область размером около 100 п.н., тогда как сайты начала транскрипции генов, регулируемых развитием, обычно сосредоточены в узкой области. Мало что известно о том, как устанавливается дисперсная инициация транскрипции гена домашнего хозяйства. Существуют факторы транскрипции, которые специфически обогащаются промоторами генов домашнего хозяйства и регулируют их. Более того, промоторы домашнего хозяйства регулируются энхансерами домашнего хозяйства, но не регулируются энхансерами развития.

Общие гены домашнего хозяйства у людей

Ниже приводится неполный список «генов домашнего хозяйства». Более полный и обновленный список см. В базе данных HRT Atlas, составленной Bidossessi W. Hounkpe et al. База данных была построена путем анализа более 12000 наборов данных RNA-seq человека и мыши.

Экспрессия гена

Факторы транскрипции

Белок, связывающий регулирующий элемент стерола
  • ATF1 NM_005171
  • ATF2 NM_001880
  • ATF4 Активирующий фактор транскрипции 4 NM_001675
  • ATF6 NM_007348
  • ATF7 NM_001206682
  • ATF7IP NM_018179
  • BTF3 NM_001207 Базовый фактор транскрипции 3 человека (Homo sapiens)
  • E2F4 Homo sapiens Фактор транскрипции E2F 4, связывание p107 / p130 (E2F4), мРНК
  • ERH (ген) Энхансер рудиментарного гомолога дрозофилы (который, в свою очередь, является первым ферментативным этапом в синтезе пиримидина. Регулируется MITF)
  • HMGB1 Групповой блок с высокой подвижностью связывает ДНК
  • ILF2 Фактор связывания интерлейкина-усилителя 2 человека (Homo sapiens), 45 кДа (ILF2), мРНК
  • IER2, ранее называвшийся ETR101 « Протеин немедленного раннего развития»?
  • JUND Homo sapiens jun D протоонкоген (JUND), мРНК
  • TCEB2 Elongin Matheo er rar
Репрессоры
  • PUF60 Homo sapiens, репрессор, взаимодействующий с белком, связывающимся со слиянием (SIAHBP1), транскрипт

Сплайсинг РНК

Малые ядерные рибонуклеопротеин-ассоциированные белки B и B '
  • BAT1 он же DDX39B
  • HNRPD Homo sapiens гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин D (AU-богатый элемент РНК
  • HNRPK Homo sapiens гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин K (HNRPK), транскрипт
  • PABPN1 поли (A) связывающий белок, ядерный 1
  • Фактор сплайсинга SRSF3, богатый аргинином / серином

Коэффициенты перевода

синтез тРНК
  • AARS NM_001605 аланил-тРНК синтетаза
  • AARS2 NM_020745 аланил-тРНК синтетаза 2, митохондриальная
  • AARSD1 NM_001261434 домен аланил-тРНК синтетазы, содержащий 1
  • CARS NM_001751 цистеинил-тРНК синтетаза
  • CARS2 NM_024537 цистеинил-тРНК синтетаза 2, митохондриальная (предположительно)
  • DARS NM_001349 аспартил-тРНК синтетаза
  • DARS2 NM_018122 аспартил-тРНК синтетаза 2, митохондриальная
  • EARS2 NM_001083614 глутамил-тРНК синтетаза 2, митохондриальная
  • FARS2 NM_006567 фенилаланил-тРНК синтетаза 2, митохондриальная
  • FARSA NM_004461 фенилаланил-тРНК синтетаза, альфа-субъединица
  • FARSB NM_005687 фенилаланил-тРНК синтетаза, бета-субъединица
  • GARS NM_002047 глицил-тРНК синтетаза
  • HARS NM_002109 гистидил-тРНК синтетаза
  • HARS2 NM_012208 гистидил-тРНК синтетаза 2, митохондриальная
  • IARS NM_002161 изолейцил-тРНК синтетаза
  • IARS2 NM_018060 изолейцил-тРНК синтетаза 2, митохондриальная
  • KARS NM_005548 лизил-тРНК синтетаза (KARS) человека (Homo sapiens), мРНК
  • LARS2 NM_015340 изолейцил-тРНК синтетаза 2, митохондриальная
  • MARS NM_004990 метионил-тРНК синтетаза
  • MARS2 NM_138395 метионил-тРНК синтетаза 2, митохондриальная
  • NARS NM_004539 аспарагинил-тРНК синтетаза
  • NARS2 NM_024678 аспарагинил-тРНК синтетаза 2, митохондриальная (предположительно)
  • QARS NM_005051 глутамил-тРНК синтетаза
  • RARS NM_002884 аргинил-тРНК синтетаза
  • RARS2 NM_020320 аргинил-тРНК синтетаза 2, митохондриальная
  • SARS NM_006513 Серил-тРНК синтетаза (SARS), мРНК человека (Homo sapiens).
  • TARS NM_152295 треонил-тРНК синтетазы
  • VARS2 NM_020442 валил-тРНК синтетаза 2, митохондриальная
  • WARS2 NM_015836 триптофанил тРНК синтетаза 2, митохондриальная
  • YARS NM_003680 Тирозил-тРНК синтетаза (YARS) человека (Homo sapiens), мРНК
  • YARS2 NM_001040436 Тирозил-тРНК синтетаза (YARS), мРНК митохондрий человека (Homo sapiens)
РНК-связывающий белок

Рибосомные белки

RPS19BP1

Митохондриальные рибосомные белки

РНК-полимераза

Обработка белков

  • PPID Пептидил-пролил цис-транс-изомераза D
  • PPIE Пептидил-пролил цис-транс-изомераза E
  • УОМФ Пептидил-пролил - цис-транс - изомеразу F
  • PPIG Пептидил-пролил цис-транс-изомераза G
  • PPIH Циклофилин H
  • CANX Calnexin. Сворачивание гликопротеинов в эндоплазматическом ретикулуме
  • CAPN1 калпаин субъединица
  • CAPN7
  • CAPNS1 субъединица протеазы кальпаина
  • NACA Комплексный альфа-полипептид, связанный с возникающим полипептидом
  • NACA2
  • PFDN2 Prefoldin 2
  • PFDN4 Prefoldin 4
  • PFDN5 Prefoldin 5
  • PFDN6 Prefoldin 6
  • SNX2 Сортировочный нексин 2
  • SNX3 Сортировочный нексин 3
  • SNX4 Сортировочный нексин 4
  • SNX5 Сортировочный нексин 5
  • SNX6 Сортировочный нексин 6
  • SNX9 Сортировочный нексин 9
  • SNX12 Сортировочный нексин 12
  • SNX13 Сортировочный нексин 13
  • SNX17 Сортировочный нексин 17
  • SNX18 Сортировочный нексин 18
  • SNX19 Сортировочный нексин 19
  • SNX25 Сортировочный нексин 25
  • SSR1 Транслокон-ассоциированный белок TRAPA. Транслокация белков в ER
  • SSR2 Транслокон-ассоциированный белок TRAPB. Транслокация белков в ER
  • SSR3 Транслокон-ассоциированный белок TRAPG. Транслокация белков в ER
  • SUMO1 Нацеливание на белок
  • SUMO3 Нацеливание на белок

Белки теплового шока

Гистон

Клеточный цикл

В отношении некоторых из этих белков функции существенно перекрываются. В частности, гены, связанные с Rho, важны для переноса ядер (то есть митоза), а также для мобильности вдоль цитоскелета в целом. Эти гены представляют особый интерес для исследований рака.

  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHGDIA
  • ARHGEF10L Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов 10L
  • ARHGEF11 Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов 11
  • ARHGEF40 Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов 40
  • ARHGEF7 Фактор обмена генов гуаниновых нуклеотидов 7
  • RAB10 NM_016131 Малые GTPases Rab являются ключевыми регуляторами внутриклеточного мембранного транспорта, от образования транспортных пузырьков до их слияния с мембранами.
  • RAB11A NM_004663
  • RAB11B NM_004218
  • RAB14 NM_016322
  • RAB18 NM_021252
  • RAB1A NM_004161 RAB1A, член семейства онкогенов RAS (RAB1A), мРНК, Homo sapiens
  • RAB1B NM_030981
  • RAB21 NM_014999
  • RAB22A NM_020673
  • RAB2A NM_002858
  • RAB2B NM_001163380
  • RAB3GAP1 NM_012233
  • RAB3GAP2 NM_012414
  • RAB40C NM_021168
  • RAB4A NM_004578
  • RAB5A NM_004162
  • RAB5B NM_002865
  • RAB5C NM_004583
  • RAB6A NM_002868
  • RAB7A NM_004637
  • RAB9A NM_004251
  • RABEP1 NM_004703
  • РАБЕПК НМ_005833
  • RABGEF1 NM_014504
  • RABGGTA NM_004581
  • RABGGTB NM_004582
  • CENPB Центромерный белок B
  • CTBP1 Центромерный белок T
  • CCNB1IP1 NM_021178 Убиквитин-протеинлигаза Е3. Модулирует уровни циклина B и участвует в регуляции прохождения клеточного цикла через фазу G2.
  • CCNDBP1 NM_012142 Может отрицательно регулировать развитие клеточного цикла
  • CCNG1 NM_004060 Может играть роль в регулировании роста
  • CCNH NM_001239 Участвует в контроле клеточного цикла и транскрипции РНК с помощью РНК-полимеразы II. Его экспрессия и активность постоянны на протяжении клеточного цикла.
  • CCNK NM_001099402 Регуляторная субъединица циклин-зависимых киназ, которая опосредует фосфорилирование большой субъединицы РНК-полимеразы II
  • CCNL1 NM_020307 Регулятор транскрипции, который участвует в регуляции процесса сплайсинга пре-мРНК
  • CCNL2 NM_030937 Регулятор транскрипции, который участвует в регуляции процесса сплайсинга пре-мРНК. Также модулирует экспрессию критического фактора апоптоза, приводящего к апоптозу клеток.
  • CCNY NM_145012 Положительная регуляторная субъединица циклинзависимых киназ CDK14 / PFTK1 и CDK16. Действует как регулятор клеточного цикла сигнального пути Wnt во время фазы G2 / M
  • PPP1CA NM_002708 Протеиновая фосфатаза, которая связывается с более чем 200 регуляторными белками с образованием высокоспецифичных холоферментов, дефосфорилирующих сотни биологических мишеней
  • PPP1CC NM_002710
  • PPP1R10 NM_002714
  • PPP1R11 NM_021959 Протеиновая фосфатаза 1, регуляторная (ингибиторная) субъединица 11 (PPP1R11) человека (Homo sapiens),
  • PPP1R15B NM_032833
  • PPP1R37 NM_019121
  • PPP1R7 NM_002712
  • PPP1R8 NM_002713
  • PPP2CA NM_002715
  • PPP2CB NM_001009552
  • PPP2R1A NM_014225 Отрицательный регулятор роста и деления клеток Homo sapiens протеинфосфатаза 2 (ранее 2A), регуляторная субъединица A (PR 65),
  • PPP2R2A NM_002717
  • PPP2R2D NM_018461
  • PPP2R3C NM_017917
  • PPP2R4 NM_021131
  • PPP2R5A NM_006243
  • PPP2R5B NM_006244
  • PPP2R5C NM_002719
  • PPP2R5D NM_006245
  • PPP2R5E NM_006246
  • PPP4C NM_002720
  • PPP4R1 NM_005134
  • PPP4R2 NM_174907
  • PPP5C NM_006247
  • PPP6C NM_002721
  • PPP6R2 NM_014678
  • PPP6R3 NM_018312
  • RAD1Homo sapiens ингибитор рибонуклеазы / ангиогенина (RNH), мРНК
  • RAD17 NM_002869 Необходим для устойчивого роста клеток, поддержания хромосомной стабильности и ATR-зависимой активации контрольных точек при повреждении ДНК
  • RAD23B NM_002873
  • RAD50 NM_005732
  • RAD51C NM_002874
  • IST1 (находится к центральной линии деления делящихся клеток)

Апоптоз

  • DAD1 Защитник от клеточной смерти
  • DAP3 Участвует в опосредовании гибели клеток, вызванной гамма-интерфероном.
  • DAXX, ассоциированный со смертью белок 6

Онкогены

Ремонт / репликация ДНК

  • MCM3AP, возможно, примаз
  • XRCC5 NM_021141 Ku80
  • XRCC6 NM_001469 Аутоантиген щитовидной железы человека (Homo sapiens): одноцепочечная ДНК-зависимая АТФ-зависимая геликаза. Участвует в транслокации хромосом.

Метаболизм

  • PRKAG1 определяет уровень энергии и инактивирует HMGCoA-редуктазу и ацетил-CoA-карбоксилазу
  • PRKAA1 NM_006251 Каталитическая субъединица AMP-активируемой протеинкиназы (AMPK), сенсорной протеинкиназы, которая играет ключевую роль в регулировании клеточного энергетического метаболизма
  • PRKAB1 NM_006253 Некаталитическая субъединица AMP-активируемой протеинкиназы (AMPK), протеинкиназы, сенсорной энергии, которая играет ключевую роль в регулировании клеточного энергетического метаболизма
  • PRKACA NM_002730 Фосфорилирует большое количество субстратов в цитоплазме и ядре.
  • PRKAG1 NM_002733 протеинкиназа Homo sapiens, активированная AMP, некаталитическая субъединица гамма 1 (PRKAG1), мРНК
  • PRKAR1A NM_002734 Регуляторная субъединица цАМФ-зависимых протеинкиназ, участвующих в передаче сигналов цАМФ в клетках
  • PRKRIP1 NM_024653 Связывает двухцепочечную РНК. Подавляет активность киназы EIF2AK2 (по сходству).

Углеводный обмен

Цикл лимонной кислоты

  • SDHA NM_004168 Субъединица А сукцинатдегидрогеназы
  • SDHAF2 NM_017841
  • SDHB NM_002973 Субъединица железо-серного белка (IP) сукцинатдегидрогеназы (SDH), которая участвует в комплексе II митохондриальной цепи переноса электронов и отвечает за перенос электронов от сукцината к убихинону (кофермент Q)
  • SDHC NM_003000 Заякоренная в мембране субъединица сукцинатдегидрогеназы (SDH), которая участвует в комплексе II митохондриальной цепи переноса электронов и отвечает за перенос электронов от сукцината к убихинону (кофермент Q).
  • SDHD NM_003001

Липидный обмен

  • HADHA Трехфункциональная белковая субъединица альфа

Аминокислотный метаболизм

  • COMT Катехол-О-метилтрансфераза)

НАДН-дегидрогеназа

Цитохром с оксидаза

(Обратите внимание, что COX1, COX2 и COX3 кодируются митохондриями)

  • COX4I1 001861
  • COX5B NM_001862
  • COX6B1 NM_001863
  • COX6C NM_004374
  • COX7A2 NM_001865 Полипептид 2 (печень) (COX7A2) субъединицы VIIa цитохром с оксидазы человека (Homo sapiens),
  • COX7A2L NM_004718
  • COX7C NM_001867
  • COX8
  • COX8A NM_004074 Субъединица VIII цитохром с оксидазы (COX8) человека sapiens, ядерный ген, кодирующий
  • COX11 NM_004375
  • COX14 NM_032901
  • COX15 NM_004376
  • COX16 NM_016468
  • COX19 NM_001031617
  • COX20 NM_198076
  • CYC1 цитохром c-1 (CYC1) человека ( Homo sapiens)
  • UQCC NM_018244 Требуется для сборки комплекса убихинол-цитохром с редуктаза (комплекс III митохондриальной дыхательной цепи или комплекс цитохрома b-c1)
  • UQCR10 NM_013387
  • UQCR11 NM_006830 Субъединица (UQCR) убихинол-цитохром с редуктазы (6,4 кД) человека (Homo sapiens), мРНК
  • UQCRB NM_006294
  • UQCRC1 NM_003365 Угловой белок I убихинол-цитохром с редуктазы (UQCRC1), мРНК человека (Homo sapiens)
  • UQCRC2 NM_003366
  • UQCRHL NM_001089591
  • UQCRQ NM_014402 Низкомолекулярный убихинон-связывающий белок (9,5 кД) (QP-C) человека (Homo sapiens), мРНК

АТФаза

  • ATP2C1 NM_014382
  • ATP5A1 NM_004046 Homo sapiens АТФ-синтаза, транспорт H +, митохондриальный комплекс F1, альфа
  • ATP5B NM_001686
  • ATP5C1 NM_005174
  • ATP5D NM_001687 Homo sapiens АТФ-синтаза, транспорт H +, митохондриальный комплекс F1, дельта
  • ATP5F1 NM_001688
  • ATP5G2 NM_005176
  • ATP5G3 NM_001689 Homo sapiens АТФ-синтаза, транспорт H +, митохондриальный комплекс F0, субъединица c
  • ATP5H NM_006356 Homo sapiens АТФ-синтаза, транспорт H +, митохондриальный комплекс F0, субъединица d
  • ATP5J NM_001685
  • ATP5J2 NM_004889 Homo sapiens АТФ-синтаза, транспорт H +, митохондриальный комплекс F0, субъединица f,
  • ATP5J2-PTCD1 NM_001198879
  • ATP5L NM_006476
  • ATP5O NM_001697 Homo sapiens АТФ-синтаза, транспорт H +, митохондриальный комплекс F1, субъединица O
  • ATP5S NM_015684
  • ATP5SL NM_018035
  • ATP6AP1 NM_001183 Homo sapiens АТФаза, транспорт H +, лизосомно взаимодействующий белок 1 (ATP6IP1),
  • ATP6V0A2 NM_012463
  • ATP6V0B NM_004047 Homo sapiens АТФаза, H + транспортная, лизосомальная 21 кДа, субъединица V0 c (ATP6V0B),
  • ATP6V0C NM_001694 Homo sapiens ATPase, H + транспортная, лизосомная 16 кДа, субъединица V0 c (ATP6V0C),
  • ATP6V0D1 NM_004691
  • ATP6V0E1 NM_003945
  • ATP6V1C1 NM_001695
  • ATP6V1D NM_015994
  • ATP6V1E1 NM_001696 Homo sapiens АТФаза, транспортирующая H +, лизосомная 31 кДа, изоформа 1 субъединицы E V1
  • ATP6V1F NM_004231 Homo sapiens АТФаза, H + транспортная, лизосомальная 14 кДа, субъединица F V1 (ATP6V1F),
  • ATP6V1G1 NM_004888 Homo sapiens АТФаза, транспортирующая H +, лизосомальная 13 кДа, изоформа 1 субъединицы G V1
  • ATP6V1H NM_015941
  • ATPAF2 NM_145691
  • ATPIF1 NM_016311

Лизосома

  • CTSD может разрушать инсулин в гепатоцитах
  • CSTB Может защитить клетку от утечки лизосом
  • ЛАМПА1
  • ЛАМПА2
  • M6PR

Протеасома

  • ПСМА1 NM_002786
  • ПСМА2 NM_002787
  • ПСМА3 NM_002788
  • PSMA4 NM_002789
  • ПСМА5 NM_002790
  • PSMA6 NM_002791
  • PSMA7 NM_002792 Субъединица протеасомы (просома, макропаин) человека, альфа-тип, 7 (PSMA7),
  • PSMB1 NM_002793 Субъединица протеасомы (просома, макропаин), бета-тип, 1 (PSMB1), мРНК человека (Homo sapiens)
  • PSMB2 NM_002794 Субъединица протеасомы (просома, макропаин), бета-тип, 2 (PSMB2), мРНК человека (Homo sapiens)
  • PSMB3 NM_002795
  • PSMB4 NM_002796 Субъединица протеасомы (просома, макропаин), бета-тип, 4 (PSMB4), мРНК человека (Homo sapiens)
  • PSMB5 NM_002797
  • PSMB6 NM_002798
  • PSMB7 NM_002799 Субъединица протеасомы (просома, макропаин), бета-тип, 7 (PSMB7), мРНК человека (Homo sapiens)
  • PSMC2 NM_002803
  • PSMC3 NM_002804
  • PSMC4 NM_006503
  • PSMC5 NM_002805
  • PSMC6 NM_002806
  • ПСМД1 NM_002807
  • PSMD10 NM_002814
  • PSMD11 NM_002815 Протеасома (просома, макропаин), субъединица 26S, не АТФаза, Homo sapiens, 11
  • PSMD12 NM_002816
  • PSMD13 NM_002817
  • PSMD14 NM_005805
  • ПСМД2 NM_002808
  • ПСМД3 NM_002809
  • ПСМД4 NM_002810
  • PSMD5 NM_005047
  • PSMD6 NM_014814
  • PSMD7 NM_002811
  • PSMD8 NM_002812 Протеасома (просома, макропаин), субъединица 26S, не-АТФаза, 8 (PSMD8) человека человека,
  • PSMD9 NM_002813
  • PSME2 NM_002818 субъединица 2 активатора протеасомы (просома, макропаин) (бета PA28) человека (Homo sapiens)
  • PSME3 NM_005789
  • PSMF1 NM_006814
  • ПСМГ2 NM_020232
  • ПСМГ3 NM_032302
  • ПСМГ4 NM_001128591
  • UBA1 NM_003334 Убиквитин-активирующий фермент E1 человека (Homo sapiens) (температура A1S9T и BN75).
  • UBA2 NM_005499
  • UBA3 NM_003968
  • UBA5 NM_024818
  • UBA52 NM_003333
  • UBAC2 NM_177967
  • UBALD1 NM_145253
  • УБАП1 NM_016525
  • UBAP2L NM_014847
  • UBB NM_018955 Убиквитин B (UBB), мРНК человека (Homo sapiens)
  • UBC NM_021009 Убиквитин C (UBC), мРНК человека (Homo sapiens)
  • UBE2A NM_003336
  • UBE2B NM_003337
  • UBE2D2 NM_003339 Убиквитин-конъюгированный фермент E2D 2 (гомолог UBC4 / 5, дрожжи) человека (Homo sapiens)
  • UBE2D3 NM_003340
  • UBE2D4 NM_015983
  • UBE2E1 NM_003341
  • UBE2E2 NM_152653
  • UBE2E3 NM_006357
  • UBE2F NM_080678
  • UBE2G2 NM_003343
  • UBE2H NM_003344
  • UBE2I NM_003345 Убиквитин-конъюгированный фермент E2I (гомолог UBC9, дрожжи) (UBE2I) человека (Homo sapiens),
  • UBE2J1 NM_016021
  • UBE2J2 NM_058167
  • УБЭ2К NM_005339
  • UBE2L3 NM_003347
  • UBE2M NM_003969 Убиквитин-конъюгированный фермент E2M (гомолог UBC12, дрожжи) (UBE2M) человека (Homo sapiens),
  • UBE2N NM_003348
  • UBE2NL NM_001012989
  • UBE2Q1 NM_017582
  • UBE2R2 NM_017811
  • UBE2V1 NM_021988
  • UBE2V2 NM_003350
  • UBE2W NM_018299
  • UBE2Z NM_023079
  • UBE3A NM_000462
  • UBE3B NM_130466
  • UBE3C NM_014671
  • UBE4A NM_004788
  • UBE4B NM_006048
  • USP10 NM_005153
  • USP14 NM_005151
  • USP16 NM_006447
  • USP19 NM_006677
  • USP22 NM_015276
  • USP25 NM_013396
  • USP27X NM_001145073
  • USP33 NM_015017
  • USP38 NM_032557
  • USP39 NM_006590
  • USP4 NM_003363
  • USP47 NM_017944
  • USP5 NM_003481
  • USP7 NM_003470
  • USP8 NM_005154
  • USP9X NM_001039590

Рибонуклеаза

  • Ингибитор РНГ-рибонуклеазы

Тиоредуктаза

Структурные

Цитоскелет

Синтез органелл

Специализированная форма клеточной сигнализации

Митохондрия

  • MTX2

Поверхность

Клеточная адгезия

Каналы и транспортеры

  • ABCB10 NM_012089
  • ABCB7 NM_004299
  • ABCD3 NM_002857
  • ABCE1 NM_002939
  • ABCF1 NM_001090
  • ABCF2 NM_005692
  • ABCF3 NM_018358
  • CALM1 Кальмодулин захватывает ионы кальция
  • MFSD11 NM_024311 похож на MSFD10, также известный как TETRAN, или белок, подобный переносчику тетрациклина
  • MFSD12 NM_174983
  • MFSD3 NM_138431
  • MFSD5 NM_032889
  • SLC15A4 NM_145648
  • SLC20A1 NM_005415
  • SLC25A11 митохондриальный носитель оксоглутарата / малата
  • SLC25A26 NM_173471
  • SLC25A28 NM_031212
  • SLC25A3 NM_002635
  • SLC25A32 NM_030780
  • SLC25A38 NM_017875
  • SLC25A39 NM_016016
  • SLC25A44 NM_014655
  • SLC25A46 NM_138773
  • SLC25A5 NM_001152
  • SLC27A4 NM_005094
  • SLC30A1 NM_021194
  • SLC30A5 NM_022902
  • SLC30A9 NM_006345
  • SLC35A2 NM_005660
  • SLC35A4 NM_080670
  • SLC35B1 NM_005827
  • SLC35B2 NM_178148
  • SLC35C2 NM_015945
  • SLC35E1 NM_024881
  • SLC35E3 NM_018656
  • SLC35F5 NM_025181
  • SLC38A2 NM_018976
  • SLC39A1 NM_014437
  • SLC39A3 NM_144564
  • SLC39A7 NM_006979
  • SLC41A3 NM_017836
  • SLC46A3 NM_181785
  • SLC48A1 NM_017842

Рецепторы

HLA / иммуноглобулин / распознавание клеток

Киназы / сигнализация

Факторы роста

Фактор некроза тканей

  • CD40 ранее TNFRSF5

Казеин киназа

Разное

  • ALAS1 Аминолевулиновая кислота синтаза типа 1 (тип 2 - эритроидный и связан с порфирией)
  • ARHGEF2 Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов
  • ARMET нейротрофический фактор, происходящий из мезэнцефалических астроцитов
  • AES- концевой энхансер расщепления
  • BECN1 участвует в аутофагии и сотрудничает с PI3K
  • BUD31 ранее расшифровка материнской G10
  • Креатинкиназа CKB (резервуар АТФ)
  • Цитидиндезаминаза под вопросом: совсем не присутствует в очень высоких уровнях
  • CPNE1
  • ENSA (ген)
  • FTH1 Тяжелая цепь ферритина
  • Везикулярный трафик GDI2 rab / ras
  • GUK1 Гуанилаткиназа переносит фосфат с АТФ на GMP
  • HPRT Гипоксантин-гуанинфосфорибозилтрансфераза
  • IFITM1 индуцируется интерфероном, трансмембранным белком
  • JTB (ген) Скачок точки останова транслокации
  • MMPL2
  • NME2 (ранее NM23B) Нуклеозиддифосфаткиназа
  • НЕТ НЕТ
  • P4HB
  • Пероксиредоксин PRDX1 (восстанавливает пероксиды)
  • ПТМА Протимозин
  • RPA2 связывает ДНК во время репликации, чтобы она не распрямлялась
  • Сульфатная конъюгация SULT1A3 (примечание: SULT1C цитируется в более ранней литературе как повсеместный, но это может быть примером использования разных тегов для обозначения общей области двух близкородственных генов. достаточно специфичен, чтобы действительно отличать одного члена генного семейства от другого)
  • SYNGR2 Синаптогирин (может участвовать в транслокации везикул)
  • Tetratricopeptide, TTC1 небольшая глутамина богатых tetratricopeptide

Open_reading_frame

Сперма / Яички

Хотя эта страница посвящена генам, которые должны экспрессироваться повсеместно, этот раздел предназначен для генов, текущее название которых отражает их относительную активацию в семенниках.

Смотрите также

использованная литература

внешние ссылки

Последняя правка сделана 2024-01-10 02:41:47
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте