WT1

редактировать
Ген фактора транскрипции, участвующий в мочеполовой системе
WT1
Белок WT1 PDB 1xf7.png
Доступные структуры
PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы WT1, AEWS-GUD, NPHS4, WAGR, WIT-2, WT33, опухоль Вильмса 1, фактор транскрипции WT1
Внешние идентификаторыOMIM: 607102 MGI: 98968 HomoloGene: 11536 Карты генов: WT1
Местоположение гена (человек)
Хромосома 11 (человека)
Chr. Хромосома 11 (человек)
Хромосома 11 (человека) Местоположение генома для WT1 Местоположение генома для WT1
Полоса 11p13Начало32,387,775 bp
Конец32,435,564 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE WT1 206067 s в fs.png .. PBB GE WT1 216953 s at fs.png
Дополнительная ссылка exp данные
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

7490

22431

Ensembl

ENSG00000184937

ENSMUSG00000016458

UniProt

P19544. Q6PI38

P22561 <388RNA RefSe

NM_144783

RefSeq (белок) <40300>NP_44 NP_001185481. NP_077742. NP_077744.

NP_001354783. NP_000369.3. NP_001185480.1. NP_001185481.1. NP_077742.2. NP_077744.3 NP_077744.3 394>Местоположение (UCSC)

Chr 11: 32,39 - 32,44 Мб Chr 2: 105,13 - 105,17 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / Edit Mouse

Опухолевый белок Вильмса - это белок, который у человека кодируется геном WT1 на хромосоме 11p.

Содержание
  • 1 Функция
  • 2 Структура
  • 3 Клиническая значимость
    • 3.1 В качестве лекарственной мишени
    • 3.2 Мониторинг заболевания
  • 4 Взаимодействия
  • 5 Редактирование РНК
    • 5.1 Тип редактирования
    • 5.2 Эффекты редактирования
  • 6 Экспериментальные модели
  • 7 Ссылки
  • 8 Дополнительная литература
  • 9 Внешние ссылки
Функция

Этот ген кодирует фактор транскрипции, который содержит четыре мотива цинкового пальца в C-конец и пролин / глутамин -богатый ДНК-связывающий домен на N-конце. Он играет важную роль в нормальном развитии мочеполовой системы, и он мутирует в подгруппе пациентов с опухолью Вильмса, тезкой гена. Множественные варианты транскриптов, полученные в результате альтернативного сплайсинга двух кодирующих экзонов, хорошо охарактеризованы. Имеются также доказательства использования сайта инициации трансляции, отличного от AUG (CUG), перед первым AUG и внутри него, что приводит к дополнительным изоформам.

Структура
WT1
Идентификаторы
СимволWT1
Pfam PF02165
InterPro IPR000976

Ген WT1 продукт демонстрирует сходство с цинковыми пальцами у млекопитающих рост регулирует белок 1 ранней реакции роста (EGR1 ) и (EGR2 ) белки.

Клиническое значение

Мутации Вилмса опухолевый супрессор ген1 (WT1) связаны с эмбриональным злокачественным новообразованием почки, поражающим примерно 1-9 из 100000 младенцев. Встречается как в спорадической, так и в наследственной формах. Инактивация WT1 вызывает опухоль Вильмса и синдром Дениса-Драша (DDS), что приводит к нефропатии и генитальным аномалиям. Было обнаружено, что белок WT1 связывает множество клеточных факторов, например p53, известный супрессор опухолей. Несмотря на название, мутация WT1 обнаруживается только примерно в 5-10% случаев опухоли Вильмса. Некоторые другие гены, связанные с этим заболеванием: BRCA2 и GPC3

WT1 мутированы взаимоисключающим образом с TET2, IDH1. и IDH2 в остром миелоидном лейкозе. TET2 может быть задействован WT1 в своих генах-мишенях и активирует гены-мишени WT1 путем преобразования 5mC в остатки 5hmC на промоторах генов, что представляет собой важную особенность нового регуляторного пути WIT, связанного с развитием AML.

Сериновая протеаза HtrA2 связывается с WT1 и расщепляет WT1 во многих сайтах после обработки цитотоксическими препаратами.

Используя иммуногистохимию, белок WT1 можно продемонстрировать в ядра клеток 75% мезотелиом и 93% серозных карцином яичников, а также доброкачественных мезотелия и маточных труб эпителий. Это позволяет отличать эти опухоли от других подобных видов рака, таких как аденокарцинома. Однако антитела к белку WT1 также часто перекрестно реагируют с цитоплазматическими белками в различных доброкачественных и злокачественных клетках, так что только ядерное окрашивание может считаться диагностическим.

Мутация в WT1 вызывает предрасположенность к грыжам.

В качестве лекарственной мишени

WT1 был оценен Национальным институтом рака (NCI) как цель номер 1 для иммунотерапии рака.

A вакцина, которая индуцирует приобретенный иммунный ответ против WT1, проходит клинические испытания для различных видов рака. Т-клеточная терапия (TCR-T) также проходит клинические испытания на лейкоз.

Мониторинг заболевания

Ген WT1 сверхэкспрессируется в случае гематологических злокачественных новообразований. Этот факт широко используется для мониторинга заболевания - оценки успеха лечения, а также для проверки рецидива или ремиссии после лечения. Предпочтительно количественная полимеразная цепная реакция (qPCR ) используется для установления уровней экспрессии WT1. Повышение уровня экспрессии WT1 в значительной степени связано с прогрессированием заболевания и рецидивами пролиферативного расстройства. WT1 в качестве маркера используется в качестве «золотого стандарта» для мониторинга острого миелоидного лейкоза, однако других гематологических злокачественных новообразований, таких как хронический миелоидный лейкоз или миелопролиферативный синдром может проявляться сверхэкспрессией WT1, и в определенных случаях мониторинг WT1 может использоваться даже у пациентов с диагнозом этих типов рака.

Взаимодействия

WT1 имеет показано, что взаимодействует с TET2, U2AF2, PAWR, UBE2I и WTAP. В сочетании с Cited2 активирует WT1 стероидогенный фактор 1

редактирование РНК

Имеются некоторые доказательства наличия мРНК WT1 человека. Как и в случае альтернативного сплайсинга, редактирование РНК гена увеличивает количество изоформ этого белка.

Редактирование тканеспецифично и регулируется в процессе развития. Установлено, что редактирование ограничено семенниками и почками у крыс. Было обнаружено, что редактирование этого генного продукта происходит у мышей и крыс, а также у людей.

Тип редактирования

Сайт редактирования находится в позиции нуклеотида 839, обнаруженной в экзоне 6 гена. Это вызывает изменение кодона с кодона пролина (CCC) на кодон лейцина (CUC)

Тип редактирования - уридин на цитидин (U на C Изменение основания. Считается, что реакция редактирования представляет собой амидирование уридина, который превращает его в цитидин. Релевантность этого редактирования неизвестна, как и фермент, ответственный за это редактирование. Область, в которой происходит редактирование, как и в других сайтах редактирования, например Редактирование мРНК ApoB является консервативным. Мыши, крысы и люди имеют консервативные последовательности, фланкирующие сайт редактирования, состоящие из 10 нуклеотидов до сайта редактирования и четырех после сайта.

Эффекты редактирования

Результаты редактирования РНК в переводимой альтернативной аминокислоте. Изменения в аминокислоте происходят в области, идентифицированной как домен, участвующий в функции активации транскрипции.

Было показано, что редактирование снижает репрессивную регуляцию транскрипции генов, способствующих росту, in vitro по сравнению с нередактируемым белком. Хотя физиологическая роль редактирования еще не определена, были высказаны предположения, что редактирование может играть роль в патогенезе опухоли Вильмса.

Экспериментальные модели

гена WT1 также можно найти в геном мышей . Модель мыши с нокаутом WT1 демонстрирует симптомы, соответствующие патофизиологии человека. У мышей наблюдались дефекты урогенитального тракта, аналогичные случаям пациентов, когда передача сигналов WT1 была нарушена. У мышей отсутствовали киндеи, поскольку их развитие не удавалось на эмбриональных стадиях. Это говорит о том, что WT1 безусловно необходим для правильного формирования и развития почки.

Кроме того, у мышей с нокаутом WT1 отсутствовали некоторые типы железы, такие как гонады или надпочечники. Эффект от нокаута был также хорошо виден на сердце и кровообращение - несколько аномалий, касающихся сердца и диафрагмы., а также были описаны проблемы с отеком и лимфообращением. Из-за этих дефектов мышь умерла, даже не родившись.

Мышиная модель также используется для изучения некоторых специфических нарушений, связанных с экспрессией WT1, таких как острый миелоидный лейкоз. < To examine the expression levels and localisation of WT1, a mouse model using WT1-GFP (зеленый флуоресцентный белок) был произведен нокаут. Эта модель показала, что WT1 значительно сверхэкспрессируется в лейкозных клетках по сравнению с отсутствием или незначительной экспрессией в нормальных нетрансформированных клетках из костного мозга, либо гемопоэтических стволовых клетках, либо гемопоэтические предшественники и предшественники.

Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-06-20 05:33:45
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru