IDH2

редактировать
IDH2
Доступные конструкции
PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы IDH2, D2HGA2, ICD-M, IDH, IDHM, IDP, IDPM, mNADP-IDH, изоцитратдегидрогеназа (NADP (+)) 2, митохондрии, изоцитратдегидрогеназа (NADP (+)) 2
Внешние идентификаторы OMIM: 147650 MGI: 96414 HomoloGene: 37590 Генные карты : IDH2
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человек)
Chr. Хромосома 15 (человек)
Хромосома 15 (человек) Геномное расположение IDH2 Геномное расположение IDH2
Группа 15q26.1 Начало 90 083 045 п.н.
Конец 90 102 504 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE IDH2 210045 в формате fs.png PBB GE IDH2 210046 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
Виды Человек Мышь
Entrez

3418

269951

Ансамбль

ENSG00000182054

ENSMUSG00000030541

UniProt

P48735

P54071

RefSeq (мРНК)

NM_002168 NM_001289910 NM_001290114

NM_173011

RefSeq (белок)

NP_001276839 NP_001277043 NP_002159

NP_766599

Расположение (UCSC) Chr 15: 90.08 - 90.1 Мб Chr 7: 80.09 - 80.12 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Изоцитратдегидрогеназы [НАДФ], митохондриальный представляет собой фермент, который у человека кодируется IDH2 геном.

Изоцитратдегидрогеназ являются ферменты, которые катализируют окислительное декарбоксилирование от изоцитрата до 2-оксоглутарата. Эти ферменты принадлежат к двум различным подклассам, один из которых использует НАД (+) в качестве акцептора электронов, а другой - НАДФ (+). Сообщалось о пяти изоцитратдегидрогеназах: о трех НАД (+) -зависимых изоцитратдегидрогеназах, которые локализуются в митохондриальном матриксе, и о двух НАДФ (+) -зависимых изоцитратдегидрогеназах, одна из которых является митохондриальной, а другая преимущественно цитозольной. Каждый НАДФ (+) - зависимый изозим является гомодимером. Белок, кодируемый геном IDH2, представляет собой НАДФ (+) - зависимую изоцитратдегидрогеназу, обнаруженную в митохондриях. Он играет роль в промежуточном метаболизме и производстве энергии. Этот белок может тесно связываться или взаимодействовать с комплексом пируватдегидрогеназы. Соматические мозаики мутации этого гена также были найдены, связанные с болезнью Ollier и синдромом маффуччи.

Содержание
  • 1 Структура
  • 2 Функция
  • 3 Клиническое значение
  • 4 В качестве мишени для лекарства
  • 5 Интерактивная карта проезда
  • 6 Ссылки
  • 7 Дальнейшее чтение
  • 8 Внешние ссылки
Структура

Изоцитратдегидрогеназа состоит из 3 субъединиц, регулируется аллостерически и требует интегрированного иона Mg 2+ или Mn 2+. Митохондриальная форма IDH, как и большинство изоформ, представляет собой гомодимер, в котором две идентичные субъединицы мономера образуют одну единицу. Структура Mycobacterium tuberculosis IDH-1, связанная с НАДФН и Mn 2+, была решена с помощью рентгеновской кристаллографии. Это гомодимер, в котором каждая субъединица имеет складку Россмана и общую верхнюю область взаимосвязанных β-листов. Mtb IDH-1 наиболее структурно похож на мутантную IDH человека по R132H, обнаруженную в некоторых глиобластомах. Подобно человеческому R132H ICDH, Mtb ICDH-1 также катализирует образование α-гидроксиглутарата.

Функция

Изоцитратдегидрогеназа - это пищеварительный фермент, который используется в цикле лимонной кислоты. Его основная функция - катализировать окислительное декарбоксилирование изоцитрата до альфа-кетоглутарата. Регуляция изоцитратдегидрогеназы человека до конца не изучена, однако известно, что НАДФ и Са2 + связываются в активном сайте с образованием трех различных конформаций. Эти конформации образуются в активном центре и выглядят следующим образом: петля образуется в неактивном ферменте, частично распутанная альфа-спираль в полуоткрытой форме и альфа-спираль в активной форме.

Клиническое значение

Митохондриальная форма IDH2 коррелирует со многими заболеваниями. Мутации в IDH2 связаны с 2-гидроксиглутаровой ацидурией, состоянием, которое вызывает прогрессирующее повреждение мозга. Основные типы этого расстройства называются D-2-гидроксиглутаровая ацидурия (D-2-HGA), L-2-гидроксиглутаровая ацидурия (L-2-HGA) и комбинированная D, L-2-гидроксиглутаровая ацидурия (D, L -2-HGA). Основными особенностями D-2-HGA являются задержка развития, судороги, слабый мышечный тонус ( гипотония ) и аномалии в большей части мозга ( головной мозг ), которая контролирует многие важные функции, такие как движение мышц, речь, зрение и т. Д. мышление, эмоции и память. Исследователи описали два подтипа D-2-HGA, тип I и тип II. Эти два подтипа различаются по своей генетической причине и типу наследования, хотя они также имеют некоторые различия в признаках и симптомах. Тип II, как правило, начинается раньше и часто вызывает более серьезные проблемы со здоровьем, чем тип I. Тип II также может быть связан с ослабленным и увеличенным сердцем ( кардиомиопатия ), что обычно не встречается при типе I. L-2-HGA, особенно влияет на область мозга, называемую мозжечком, которая участвует в координации движений. В результате у многих людей возникают проблемы с равновесием и координацией мышц ( атаксия ). Дополнительные особенности L-2-HGA могут включать задержку развития, судороги, трудности с речью и необычно большую голову ( макроцефалия ). Обычно признаки и симптомы этого расстройства проявляются в младенчестве или раннем детстве. Расстройство со временем ухудшается, что обычно приводит к тяжелой инвалидности в раннем взрослом возрасте. Комбинированный D, L-2-HGA вызывает серьезные аномалии мозга, которые проявляются в раннем младенчестве. У заболевших младенцев наблюдаются тяжелые судороги, слабый мышечный тонус (гипотония), проблемы с дыханием и кормлением. Обычно они доживают до младенчества или раннего детства.

Мутации в гене IDH2, наряду с мутациями в гене IDH1, также сильно коррелируют с развитием глиомы, острого миелоидного лейкоза (AML), хондросаркомы, внутрипеченочной холангиокарциномы (ICC) и рака ангиоиммунобластной Т-клеточной лимфомы. Они также вызывают D-2-hydroxyglutaric ацидурия и Ollier и маффуччи синдромов. Мутации IDH2 могут способствовать продлению выживания раковых клеток глиомы и ICC, но не клеток AML. Причина этого неизвестна. Миссенс-мутации в активном центре этих IDH2 вызывают неоэнзиматическую реакцию, при которой НАДФН восстанавливает αKG до D-2-гидроксиглутарата, который накапливается и приводит к ингибированию деградации индуцируемого гипоксией фактора 1α (HIF1α) (ингибирование пролил- гидроксилаза ), а также изменения эпигенетики и гомеостаза внеклеточного матрикса. Такие мутации также подразумевают меньшую способность продуцировать НАДФН. Опухоли различных типов тканей с мутациями IDH1 / 2 демонстрируют улучшенный ответ на лучевую и химиотерапию.

Ингибиторы неоморфной активности мутантов IDH1 и IDH2 в настоящее время проходят фазу I / II клинических испытаний как для солидных опухолей, так и для опухолей крови. Поскольку IDH1 и IDH2 представляют собой ключевые ферменты в цикле трикарбоновой кислоты (TCA), мутации оказывают значительное влияние на промежуточный метаболизм. Утрата некоторой метаболической активности дикого типа является важным, потенциально вредным и терапевтически используемым последствием онкогенных мутаций IDH и требует продолжения исследований в будущем.

Как мишень для наркотиков

Лекарства, нацеленные на мутировавшие формы IDH2, включают:

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи.

[[Файл: TCACycle_WP78 go to article go to article go to article go to article go to HMDB go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to HMDB go to article go to article go to HMDB go to article go to article go to HMDB go to article go to article go to HMDB go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to WikiPathways go to article go to article go to article go to article [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] TCACycle_WP78 go to article go to article go to article go to article go to HMDB go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to HMDB go to article go to article go to HMDB go to article go to article go to HMDB go to article go to article go to HMDB go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to WikiPathways go to article go to article go to article go to article | {{{bSize}}} px | alt = Редактирование цикла TCA ]] Цикл TCA править
Рекомендации
дальнейшее чтение
внешние ссылки
  • Issoria lathonia.jpg Биологический портал
Последняя правка сделана 2023-04-04 03:22:29
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте