Протоонкоген тирозин-протеинкиназа Src

SRC
Доступные структуры PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB Список кодов идентификаторов PDB 1A07, 1A08, 1A09, 1A1A, 1A1B, 1A1C, 1A1E, 1FMK, 1HCS, 1HCT, 1KSW, 1O41, 1O42, 1O43, 1O44, 1O45, 1O46, 1O47, 1O48, 1O49, 1O4A, 1O4B, 1O4C, 1O4D, 1O4E, 1O4F, 1O4G, 1O4H, 1O4I, 1O4J, 1O4K, 1O4L, 1O4M, 1O4N, 1O4O, 1O4P, 1O4Q, 1O4R, 1SHD, 1Y57, 1YI6, 1YOJ, 1YOL, 1YOM, 2BDF, 2H8H, 3VRO, 3ZMP, 3ZMQ, 4F59, 4F5A, 4F5B, 4HXJ, 4K11, 4MXO, 4MXX, 4MXY, 4MXZ
Идентификаторы
Псевдонимы	SRC, ASV, SRC1, c-p60 -Src, протоонкоген SRC, нерецепторная тирозинкиназа, THC6
Внешние идентификаторы	OMIM: 190090 MGI: 98397 HomoloGene : 21120 GeneCards : SRC
Номер EC	2.7.10.2
Местоположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек) Полоса 20q11.23 Начало 37,344,685 bp Конец 37,406,050 bp
Расположение гена ( Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь) Группа 2 H1 | 2 78,35 см Начало 157,418,444 bp Конец 157,471,862 bp
Экспрессия РНК паттерн .. Дополнительные справочные данные по экспрессии
Онтология генов Молекулярная функция •Связывание с ионным каналом. •Связывание с доменом белка. •Макромолекулярный комплекс GO: 0032403 связывание. •связывание домена SH2. •активность киназы. •связывание рецептора. •связывание рецептора эстрогена. •связывание АТФ. •активность протеинкиназы. •рецептор инсулина b. •немембранная активность протеинтирозинкиназы. •связывание киназы. •связывание гема. •связывание фермента. •трансферазная активность. •связывание рецептора эфрина. •связывание каркасного белка. •связывание интегрина. •GO: 0001948 связывание белка. •связывание протеинкиназы. •связывание молекул клеточной адгезии. •связывание протеинкиназы C. •связывание рецептора гормона. •связывание нуклеотидов. •связывание рецептора фактора роста. •связывание фосфопротеина. •активность протеинтирозинкиназы. •связывание с С-концом протеина. •связывание убиквитина протеин-лигазы. •связывание кадгерина. •связывание коннексина. •активность фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфат-3-киназы. Клеточная компонент •цитоплазма. •цитозоль. •мембрана. •внешний компонент цитоплазматической стороны плазматической мембраны. •волнистая мембрана. •митохондрия. •перинуклеарная область цитоплазмы. •кавеола. •проекция нейрона. •цитоскелет. •ядро ​​клетки. •лизосома. •внеклеточная экзосома. •поздняя эндосома. •клетка мембрана. •актиновая нить. •GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность. •внутренняя мембрана митохондрий. •подосомы. •нуклеоплазма. •глутаматергический синапс. •постсинаптическая специализация, внутриклеточный компонент. Биологический процесс •ответ на минералокортикоид. •отрицательная регуляция поддержания теломер посредством теломеразы. •ответ на интерлейкин-1. •положительная регуляция активности MAP-киназы. •положительная регуляция канонического пути передачи сигналов Wnt. •отрицательная регуляция теломеразы активность. •клеточный ответ на стимул прогестерона. •регуляция внутриклеточного пути передачи сигналов рецептора эстрогена. •сборка стрессовых волокон. •позитивная регуляция активности протеин-серин / треонинкиназы. •активация тромбоцитов. •позитивная регуляция гладких мышц миграция клеток. •фосфорилирование белков. •регуляция проницаемости сосудов. •сигнальный путь рецептора фактора роста эндотелия сосудов. •положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2. •регуляция сборки подосом. •клеточный цикл. •субстрат, зависимое от адгезии распространение клеток. •развитие остеокластов. •клеточная пролиферация. •трансформирующий путь передачи сигнала рецептора бета-фактора роста. •клеточный ответ на гипоксию. •клеточный ответ на трансформирующий стимул фактора роста бета. •отрицательная регуляция гомоолигомеризации белков. •положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B. •позитивная регуляция морфогенеза ламеллиподиума. •сигнальный путь рецептора эпидермального фактора роста. •ветвление, вовлеченное в молочную железу морфогенез протока. •сигнальный путь рецептора Fc-гамма, участвующий в фагоцитозе. •отрицательная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути. •положительная регуляция секреции цитокинов. •отрицательная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути. •ответ на механический стимул. •ответ на вирус. •положительная регуляция миграции эпителиальных клеток. •сборка сигнального комплекса. •стимулирующий лектин С-типа сигнальный путь рецептора. •позитивная регуляция сигнального пути рецептора тромбоцитарного фактора. •оогенез. •позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная. •регуляция миграции эпителиальных клеток. •ответ на уровни питательных веществ. •положительная регуляция процесса биосинтеза ДНК. •клеточный ответ на стимул инсулина. •аутофосфорилирование. •GO: 0022415 вирусный процесс. •отрицательная регуляция сборки очаговой адгезии. •ответ на кислый pH. •ответ на жирную кислоту. •регуляция сборки клеточной проекции. •фосфорилирование. •процесс иммунной системы. •негативная регуляция митохондриальной деполяризации. •позитивная регуляция активации интегрина. •негативная регуляция апоптотического процесса. •клеточный ответ на тромбоцитарный стимул фактора роста. •положительная регуляция сборки подосом. •положительная регуляция процесса метаболизма глюкозы. •трансцитоз. •клеточный ответ на напряжение сдвига жидкости. •ответ на электрический стресс mulus. •положительная регуляция транспорта белков. •развитие матки. •дестабилизация белков. •регуляция межклеточной адгезии. •аутофосфорилирование пептидилтирозина. •опосредованный интегрином сигнальный путь. •положительная регуляция инсулина сигнальный путь рецептора. •сигнальный путь рецептора прогестерона. •отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная. •организация адгезивных соединений. •отрицательная регуляция аноикиса. •ответа на перекись водорода. •миграция лейкоцитов. •активация активности протеинкиназы B. •отрицательная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе. •GO: 0007243 внутриклеточная трансдукция сигнала. •регуляция транспорта от ранней эндосомы к поздней эндосоме. •путь передачи сигнала рецептора эфрина. •Костимуляция Т-клеток. •GO: 0010740 положительная регуляция передачи внутриклеточного сигнала. •регуляция кавеолин-опосредованного эндоцитоза. •регуляция клеточного цикла. •позитивная регуляция pho активность сфатидилинозитол-3-киназы. •клеточный ответ на активные формы кислорода. •клеточный ответ на стимул пептидного гормона. •положительная регуляция экспрессии гена. •клеточный ответ на жирные кислоты. •регуляция пролиферации клеток. •ангиотензин -активированный сигнальный путь, участвующий в сердечном процессе. •фосфорилирование пептидил-серина. •позитивная регуляция аутофосфорилирования белков. •позитивная регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы. •позитивная регуляция апоптотического процесса. •передний мозг развитие. •регуляция связывания белка. •клеточный ответ на липополисахарид. •регуляция резорбции костей. •миграция клеток. •ответ на лекарственное средство. •передача сигнала. •положительная регуляция клеточной адгезии. •клетка адгезия. •позитивная регуляция процессинга белка. •врожденная иммунная система. •позитивная регуляция фосфорилирования пептидил-тирозина. •сигнальный путь рецептора нейротрофина TRK. •позитивный регулятор активация передачи сигнала, опосредованной малой GTPase. •резорбция кости. •развитие центральной нервной системы. •положительная регуляция локализации белка в ядре. •сигнальный путь рецептора тромбоцитарного фактора роста. •сигнальный путь ERBB2. •внутриклеточный сигнальный путь рецептора эстрогена. •управление аксоном. •макроаутофагия. •фосфорилирование пептидил-тирозина. •проникновение бактерии в клетку-хозяин. •адгезия между клетками. •рост первичных фолликулов яичника. •положительная регуляция яичников развитие фолликулов. •сигнальный путь трансмембранного рецептора, протеинтирозинкиназы. •положительная регуляция передачи сигналов фосфатидилинозитол-3-киназой. •дифференцировка клеток. •фосфорилирование фосфатидилинозитола. •регуляция постсинаптической регуляции активности рецепторов нейротрансмиттеров. •мембранная активность протеинтирозинкиназы. •сигнальный путь рецептора, сопряженного с G-белком. •клеточный ответ на перекись водорода. •положительный рег. бета-сигнальный путь рецептора фактора роста тромбоцитов. •odontogenesis. Источники: Amigo / QuickGO
Orthologs
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6714	20779
Ensembl	ENSG00000197122	ENSMUSG00000027646
UniProt	P12931	P05480
RefSeq (mRNA) <54_198>NM_

протоонкогенная тирозин-протеинкиназа Src, также известный как протоонкоген c-Src или просто c-Src (клеточный Src; (произносится как «sarc», сокращенно от саркома ), представляет собой белок нерецепторной тирозинкиназы, который у человека кодируется геном SRC . Он принадлежит к семейству киназ семейства Src и аналогичен гену v-Src (вирусный Src) вируса саркомы Рауса. Он включает домен SH2, домен SH3 и домен тирозинкиназы. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.

c-Src фосфорилирует специфические тирозиновые остатки в других тирозинкиназы. Он играет роль в регуляции эмбрионального развития и роста клеток. Предполагается, что повышенный уровень активности c-Src связан с прогрессированием рака за счет стимулирования других сигналов. Мутации в c-Src могут быть вовлечены в злокачественное прогрессирование рака толстой кишки. c-Src не следует путать с CSK (C-терминальная киназа Src), ферментом, который фосфорилирует c-Src на его C-конце и дает отрицательный результат. регуляция ферментативной активности Src.

c-Src был первоначально открыт американскими учеными Дж. Майкл Бишоп и Гарольд Э. Вармус, за что они были удостоены Нобелевской премии по физиологии и медицине 1989 года .

• 1 Discovery
• 2 Структура
• 3 Функция
• 4 Роль в развитии рака
  • 4.1 Рак толстой кишки
  • 4.2 Рак груди
  • 4.3 Рак предстательной железы
• 5 В качестве мишени для лекарства
• 6 Взаимодействия
  • 6.1 Выживаемость
  • 6.2 Ангиогенез
  • 6.3 Распространение
  • 6.4 Подвижность
• 7 Дополнительные изображения
• 8 Ссылки
• 9 Внешние ссылки

В 1979 году J. Майкл Бишоп и Гарольд Э. Вармус обнаружили, что нормальные цыплята обладают геном, который структурно тесно связан с v-Src. Нормальный клеточный ген был назван c-src (cell-src). Это открытие изменило нынешнее представление о раке с модели, в которой рак вызывается чужеродным веществом (вирусным геном), на модель, в которой ген, обычно присутствующий в клетке, может вызывать рак. Считается, что в какой-то момент наследственный вирус по ошибке включил ген c-Src своего клеточного хозяина. В конце концов, этот нормальный ген мутировал в аномально функционирующий онкоген внутри вируса саркомы Рауса. Как только онкоген переносится обратно в курицу, это может привести к раку.

В состав киназ семейства Src входят 9 членов: c-Src, Yes, Fyn, Fgr, Lyn, Blk, Hck и Lck. Экспрессия этих членов семейства Src не одинакова во всех тканях и типах клеток. Src, Fyn и Yes экспрессируются повсеместно во всех типах клеток, в то время как другие обычно обнаруживаются в гематопоэтических клетках.

c-Src состоит из 6 функциональных областей: домен 4 гомологии Src (домен SH4), уникальный регион, домен SH3, домен SH2, каталитический домен и короткий регуляторный хвост. Когда Src неактивен, фосфорилированная тирозиновая группа в положении 527 взаимодействует с доменом SH2, что помогает домену SH3 взаимодействовать с доменом гибкого линкера и тем самым удерживает неактивную единицу прочно связанной. Активация c-Src вызывает дефосфорилирование тирозина 527. Это вызывает дальнодействующую аллостерию через динамику домена белка, вызывая дестабилизацию структуры, что приводит к открытию домены SH3, SH2 и киназы и аутофосфорилирование остатка тирозина 416.

Аутофосфорилирование Y416, а также фосфорилирование выбранных субстратов Src усиливается за счет димеризации c-Src. Димеризация c-Src опосредуется взаимодействием миристоилированной N-концевой области одного партнера и киназного домена другого партнера. Во взаимодействии участвуют как присоединенная к N-концу миристиновая кислота, так и пептидные последовательности уникальной области. Учитывая универсальность, присущую этой изначально неупорядоченной области, ее многосайтовое фосфорилирование и ее дивергенция в пределах семейства, уникальный домен, вероятно, функционирует как центральный сигнальный узел, контролирующий большую часть ферментативной активности и уникальные функции киназ семейства Src.

c-Src может активироваться многими трансмембранными белками, которые включают: рецепторы адгезии, рецепторные тирозинкиназы, рецепторы, сопряженные с G-белком и рецепторы цитокинов. В большинстве исследований изучаются рецепторные тирозинкиназы, и примерами их являются путь рецептора фактора роста тромбоцитов (PDGFR) и рецептор эпидермального фактора роста (EGFR).

Src содержит по крайней мере три гибких белковых домена, которые в сочетании с миристоилированием могут опосредовать прикрепление к мембранам и определять субклеточную локализацию.

Этот протоонкоген может играть роль в регуляции эмбрионального развития и роста клеток.

Когда src активирован, он способствует выживанию, ангиогенезу, пролиферации и путям инвазии. Он также регулирует ангиогенные факторы и проницаемость сосудов после очаговой церебральной ишемии-реперфузии и регулирует активность матриксной металлопротеиназы-9 после внутримозгового кровоизлияния.

Активация пути c-Src имеет наблюдается примерно в 50% опухолей толстой кишки, печени, легких, молочной железы и поджелудочной железы. Поскольку активация c-Src приводит к стимулированию путей выживания, ангиогенеза, пролиферации и инвазии, наблюдается аберрантный рост опухолей при раке. Общий механизм заключается в том, что существуют генетические мутации, которые приводят к повышенной активности или сверхэкспрессии c-Src, что приводит к постоянной активации c-Src.

Рак толстой кишки

Активность c-Src лучше всего охарактеризована при раке толстой кишки. Исследователи показали, что экспрессия Src в предраковых полипах в 5-8 раз выше, чем в нормальной слизистой оболочке. Также было показано, что повышенные уровни c-Src коррелируют с поздними стадиями опухоли, размером опухоли и метастатическим потенциалом опухолей.

Рак молочной железы

EGFR активирует c-Src в то время как EGF также увеличивает активность c-Src. Кроме того, сверхэкспрессия c-Src увеличивает ответ EGFR-опосредованных процессов. Таким образом, как EGFR, так и c-Src усиливают эффекты друг друга. Повышенные уровни экспрессии c-Src были обнаружены в тканях рака груди человека по сравнению с нормальными тканями.

Избыточная экспрессия рецептора 2 эпидермального фактора роста человека (HER2), также известного как erbB2, коррелирует с худшим прогнозом для груди рак. Таким образом, c-Src играет ключевую роль в опухолевой прогрессии рака груди.

Рак простаты

Члены киназ семейства Src Src, Lyn и Fgr высоко экспрессируются в злокачественных клетках простаты по сравнению с нормальными клетками простаты. Когда первичные клетки предстательной железы обрабатываются KRX-123, который является ингибитором Lyn, клетки in vitro снижают пролиферацию, миграцию и инвазивный потенциал. Таким образом, использование ингибитора тирозинкиназы - это возможный способ уменьшить прогрессирование рака простаты.

Для терапевтического использования был разработан ряд ингибиторов тирозинкиназы, нацеленных на тирозинкиназу c-Src (а также родственные тирозинкиназы). Одним из примечательных примеров является дазатиниб, который был одобрен для лечения хронического миелоидного лейкоза (CML) и острого лимфоцитарного лейкоза (ALL) с положительной филадельфийской хромосомой (PH +). Дазатиниб также проходит клинические испытания для использования при неходжкинской лимфоме, метастатическом раке груди и раке простаты. Другие препараты-ингибиторы тирозинкиназы, которые проходят клинические испытания, включают босутиниб, бафетиниб, AZD-0530, XL1-999, KX01 и XL228.

Src (ген), как было показано, взаимодействует со следующими сигнальными путями:

Выживание

• PI3K
• Akt
• IKK
• NFkB
• Каспаза 9

Ангиогенез

• STAT3
• p38 MAPK
• VEGF
• IL-8

пролиферация

• Shc
• Grb2 / SOS
• Ras
• Raf
• MEK1 / MEK2
• Erk1 / 2

Подвижность

• FAK
• p190Rho / GAP
• Паксиллин
• p130CAS
• RhoA
• JNK
• c-jun
• MLCK
• Миозин

Обзор путей передачи сигнала, участвующих в апоптозе.

l. i. p. i. d. -. b. i. n. d. i. n. g. P. h. o. s. p. h. o. s. e. r. i. n. e. P. h. o. s. p. h. o. s. e. r. i. n. e. SH3 S. p. l. i. c. i. n. g.. v. a. r. i. a. n. t. SH2 V. a. r. i. a. n. t. P. h. o. s. p. h. o. t. y. r. o. s. i. n. e.. h. y. d. r. o. p. h. o. b. i. c.. b. i. n. d. i. n. g.. p. o. c. k. e. t. V. a. r. i. a. n. t. Тирозинкиназа A. c. t. i. v. e.. s. i. t. e.. S. H. 3. /. S. H. 2.. d. o. m. a. i. n.. i. n. t. e. r. f. a. c. e.. A. T. P. P. r. o. t. o. n.. a. c. c. e. p. t. o. r. a. c. t. i. v. a. t. i. o. n.. l. o. o. p.. P. h. o. s. p. h. o. t. y. r. o. s. i. n. e. S. -. n. i. t. r. o. s. o. c. y. s. t. e. i. n. e.. P. h. o. s. p. h. o. t. h. r. e. o. n. i. n. e. P. h. o. s. p. h. o. t. y. r. o. s. i. n. e. P. h. o. s. p. h. o. t. y. r. o. s. i. n. e. P. S. /. P. T. /. P. S.. (. C. D. K. 5.). P. h. o. s. p. h. o. t. y. r.. F. A. K. 2. /. a. u. t. o. s. w. a. p. p. e. d.. d. i. m. e. r. /. p. e. p. t. i. d. e.. b. i. n. d. a. u. t. o. i. n. h. i. b. i. t. o. r. y.. p. T. y. r. . . . . . . . . . . . Верхний ряд: область бета-цепи Водородная связь спиральная область Список характеристик белков сайт 2 2 липид-связывающий сайт 17 17 фосфосерин сайт 35 35 Фосфосерин сайт 69 69 Фосфосерин сайт 74 74 Фосфотреонин сайт 75 75 фосфосерин; по CDK5 области 87 93 области бета-цепи области 88 143 SH3 сайт 88 88 интерфейс замененного димера [связывание полипептида] сайт 93 93 сайт связывания пептидного лиганда [связывание полипептида] область 99 102 область бета-цепи область 110 114 Область бета-цепей область 117 117 Вариант сплайсинга область 118 126 область бета-цепи область 127 129 Связанный водородом виток область 132 136 Бета-цепь область 137 139 Спиральная область область 140 142 Бета-цепь область 146 148 Спиральная область область 147 247 SH2 область 152 154 Область бета-цепи сайт 158 158 аутоингибиторный сайт [связывание полипептида] сайт 158 158 карман связывания фосфотирозина [связывание полипептида] область 158 165 Спиральная область область 167 170 Бета-цепь область 174 179 Область бета-цепи область 176 176 Вариант область 181 183 Область бета-цепи область 187 195 Область бета-цепи сайт 187 187 Фосфотирозин (по сходству) область 196 198 Водородная связь область 199 209 область бета-цепи сайт 205 205 гидрофобный связывающий карман [связывание полипептида] область 211 213 Область бета-цепи область 215 218 Область бета-цепи область 221 225 Область бета-нити область 226 233 Спиральная область область 237 237 Вариант область 240 242 область бета-нити область 256 259 Область бета-нити область 267 269 Спиральная область регион 270 519 Тирозинкиназа регион 270 278 Бета- область цепи сайт 276 276 Активный сайт (связывание АТФ) область 283 289 Область бета-цепи сайт 290 290 Интерфейс домена SH3 / SH2 [связывание полипептида] область 290 292 Водородная связь область 293 299 Рег. Бета-нити ион сайт 298 298 ATP область 302 304 Водородная связь витка , область 307 319 Спиральная область область 328 332 Область бета-цепи область 334 336 Область бета-цепи область 338 341 Область бета-нити область 349 353 Спиральная область область 355 358 Спиральная область область 363 382 Спиральная область участок 389 389 Акцептор протонов область 392 394 Спиральная область область 395 397 Область бета-нити область 399 401 Спиральная область область 403 405 область бета-цепи сайт 406 406 активация петля (А-петля) область 410 413 спиральная область область 417 420 спиральная область сайт 419 419 фосфотирозин; автокатализом; альтернативный сайт 419 419 фосфотирозин; по FAK2; альтернативный (по сходству) область 423 426 водородная связь область 429 431 Спиральная область область 434 439 Спиральная область участок 439 439 Фосфотирозин область 444 459 Спиральная область область 460 462 Водородная связь витка область 471 479 Винтовая область область 492 501 Спиральная область сайт 501 501 S-нитрозоцистеин (по сходству) область 506 508 Спиральная область сайт 511 511 фосфотреонин область 512 520 Винтовая область область 521 523 Водородный виток сайт 522 522 фосфотирозин сайт 530 530 фосфотирозин; от CSK

• src + Gene в Национальной медицинской библиотеке США Медицинские предметные заголовки (MeSH)
• src-Family + Kinases в Национальной медицинской библиотеке США Medical Subject Headings (MeSH)
• Proteopedia SRC - интерактивная 3D-модель структуры SRC
• Vega geneview
• Src Информация со ссылками в шлюзе миграции ячеек
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P12931 (протоонкогенная тирозин-протеинкиназа Src) в PDBe-KB.