Комиссионный номер фермента (номер ЕС ) является числовым Схема классификации для ферментов, основанная на химических реакциях, которые они катализируют. В системе номенклатуры ферментов каждый номер EC связан с рекомендуемым названием для соответствующего фермента.
Строго говоря, числа ЕС не указывают на ферменты, а на реакции, катализируемые ферментами. Если разные ферменты (например, из разных организмов) катализируют одну и ту же реакцию, то они получают одинаковый номер ЕС. Кроме того, посредством конвергентной эволюции совершенно разные белковые складки могут катализировать идентичную реакцию, и поэтому им будет присвоен идентичный номер EC (они называются негомологичными изофункциональными ферментами, или NISE). Напротив, идентификаторы UniProt однозначно определяют белок по его аминокислотной последовательности.
Каждый код фермента состоит из букв «EC», за которыми следуют четыре числа, разделенных точками. Эти числа представляют собой более точную классификацию фермента. Существуют предварительные номера EC, и в четвертой (порядковой) цифре имеется буква n (например, EC 3.5.1.n3).
Например, трипептидные аминопептидазы имеют код «EC 3.4.11.4», компоненты которого указывают на следующие группы ферментов:
Класс | Катализируемая реакция | Типичная реакция | Пример (ы) фермента с тривиальным названием |
---|---|---|---|
EC 1. Оксидоредуктазы | Для катализа реакций окисления / восстановления; перенос атомов H и O или электронов от одного вещества к другому | AH + B → A + BH (восстановленный ). A + O → AO (окисленная ) | дегидрогеназа, оксидаза |
EC 2. трансферазы | Перенос функциональной группы от одного вещества к другому. быть метил-, ацил-, амино- или фосфатной группой | AB + C → A + BC | Трансаминаза, киназа |
EC 3. Гидролазы | Образование двух продуктов из субстрата посредством гидролиза | AB + H 2 O → AOH + BH | липаза, амилаза, пептидаза, фосфатаза |
EC 4. Лиаза | Негидролитическое добавление или удаление групп с субстратов. Связи CC, CN, CO или CS могут быть расщеплены | RCOCOOH → RCOH + CO 2 или [X-A + BY] → [A = B + XY] | декарбоксилаза |
EC 5. изомеразы | внутримолекулярная перегруппировка, т.е. изомеризация изменения в одной молекуле | ABC → BCA | Изомераза, мутаза |
EC 6. Лигазы | Соединение вместе две молекулы путем синтеза новых связей CO, CS, CN или CC с одновременным разрушением АТФ | X + Y + ATP → XY + ADP + P i | Синтетаза |
EC 7. Транслоказы | Катализируют движение ионов или молекул через мембраны или их разделение внутри мембран | Транспортер |
Сходство между ферментативными реакциями (EC ) можно рассчитать с использованием изменений связей, реакционных центров или показателей субструктуры (EC-BLAST ).
Схема номенклатуры ферментов была разработана, начиная с 1955 года, когда Международный конгресс биохимиков в Брюссель учредил Комиссию по ферментам. Первая версия была опубликована в 1961 году. Текущее шестое издание, опубликованное Международным союзом биохимии и молекулярной биологии в 1992 году, содержит 3196 различных ферментов. Приложения 1-4 были опубликованы в 1993–1999 годах. Последующие дополнения были опубликованы в электронном виде на веб-сайте Номенклатурного комитета Международного союза биохимии и молекулярной биологии. В августе 2018 года Комиссия по ферментам реорганизовала номенклатуру, добавив категорию EC 7 верхнего уровня, описывающую транслоказы.
![]() | Викиданные имеют свойство: |