ПКМ2

редактировать
ПКМ
Белок PKM2 PDB 1a49.png
Доступные конструкции
PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы PKM, CTHBP, HEL-S-30, OIP3, PK3, PKM2, TCB, THBP1, пируваткиназа, мышца, пируваткиназа M1 / ​​2, p58
Внешние идентификаторы OMIM : 179050 MGI : 97591 HomoloGene : 37650 GeneCards : ПКМ
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Entrez

5315

18746

Ансамбль

ENSG00000067225

ENSMUSG00000032294

UniProt

P14618

P52480

RefSeq (мРНК)

NM_001253883 NM_011099

RefSeq (белок)
Расположение (UCSC) Chr 15: 72,2 - 72,23 Мб Chr 9: 59.66 - 59.68 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Изоферменты пируваткиназы M1 / ​​M2 (PKM1 / M2), также известные как мышечный изофермент пируваткиназы (PKM), пируваткиназа типа K, цитозольный белок, связывающий гормон щитовидной железы (CTHBP), белок, связывающий гормон щитовидной железы 1 (THBP1), или опа -interacting белок 3 (OIP3), представляет собой фермент, который у человека кодируется PKM2 гена.

PKM2 является изоферментом из гликолитического фермента пируваткиназы. В зависимости от различных метаболических функций тканей экспрессируются разные изоферменты пируваткиназы. PKM2 экспрессируется в некоторых дифференцированных тканях, таких как легкие, жировая ткань, сетчатка и островки поджелудочной железы, а также во всех клетках с высокой скоростью синтеза нуклеиновых кислот, таких как нормальные пролиферирующие клетки, эмбриональные клетки и особенно опухолевые клетки.

СОДЕРЖАНИЕ
  • 1 Структура
  • 2 Функция
  • 3 Локализация
    • 3.1 Ткань
    • 3.2 Сотовая связь
    • 3.3 Субклеточный
  • 4 Клиническое значение
    • 4.1 Бифункциональная роль в опухолях
    • 4.2 Естественные мутации и канцерогенез
    • 4.3 Нормативные цепи
    • 4.4 Бактериальный патогенез
  • 5 Интерактивная карта проезда
  • 6 См. Также
  • 7 ссылки
  • 8 Внешние ссылки
Состав

Ген PKM кодирует два изофермента: PKM1 и PKM2. М-ген состоит из 12 экзонов и 11 интронов. PKM1 и PKM2 представляют собой разные продукты сплайсинга M-гена (экзон 9 для PKM1 и экзон 10 для PKM2) и отличаются только 23 аминокислотами в пределах 56-аминокислотного участка (аминокислотные остатки 378-434) на их карбоксиконце.

Функция

Пируваткиназы катализируют последний шаг в пределах гликолиза, де - фосфорилирование из фосфоенолпируваты в пируват, и отвечают за чистую АТФ производства в гликолитической последовательности. В отличие от митохондриального дыхания, регенерация энергии пируваткиназой не зависит от поступления кислорода и позволяет органам выжить в условиях гипоксии, часто встречающихся в солидных опухолях.

Участие этого фермента в различных путях, межбелковых взаимодействиях и ядерном транспорте предполагает его способность выполнять множественные негликолитические функции с различными последствиями, хотя многомерная роль этого белка еще полностью не исследована. Однако была показана функциональная роль в ангиогенезе так называемого процесса образования кровеносных сосудов посредством взаимодействия и регуляции Jmjd8.

Локализация

Ткань

Изофермент PKM1 экспрессируется в органах, которые сильно зависят от высокой скорости регенерации энергии, таких как мышцы и мозг.

Сотовый

PKM2 - это фермент пируваткиназа M2 (PKM2) и коактиватор транскрипции  STAT1, ответственный за индукцию экспрессии белка PDL-1 и его регуляцию в опухолевых и иммунных клетках. В производстве лактата требуется повышенная регуляция PKM2, и это приводит к его вкладу в воспалительную реакцию, повреждение органов и септическую смерть. Как следствие, удаление PKM2 из миелоидных клеток, введение анти-PD-L1 или добавление рекомбинантного интерлейкина - 1 (ИЛ-7) облегчает микробный клиренс, ингибирует апоптоз Т-клеток, снижает полиорганную дисфункцию и снижает гибель мышей с дефицитом Bmal1.

Субклеточный

PKM2 представляет собой цитозольный фермент, который связан с другими гликолитическими ферментами, например, гексокиназой, глицеральдегид-3-P-дегидрогеназой, фосфоглицераткиназой, фосфоглицеромутазой, энолазой и лактатдегидрогеназой в составе так называемого комплекса гликолитических ферментов.

Однако PKM2 содержит индуцируемый сигнал ядерной локализации в своем C-концевом домене. Роль PKM2 в ядре сложна, поскольку описаны пролиферативные, но также и проапоптотические стимулы. С одной стороны, было обнаружено, что ядерная PKM2 участвует в фосфорилировании гистона 1 путем прямого переноса фосфата с PEP на гистон 1. С другой стороны, ядерная транслокация PKM2, индуцированная аналогом соматостатина, H 2 O 2 или УФ-светом. был связан с независимой от каспаз запрограммированной гибелью клеток.

Клиническое значение

Бифункциональная роль в опухолях

PKM2 экспрессируется в большинстве опухолей человека. Первоначально обсуждалось переключение с экспрессии PKM1 на PKM2 во время туморогенеза. Эти выводы, однако, были результатом неправильной интерпретации вестерн-блоттинга, в которых использовались мышечные мышцы, экспрессирующие PKM1, в качестве единственной нераковой ткани. В клинических образцах рака может быть подтверждена только повышающая регуляция PKM2, но не специфичность рака.

В отличие от близко гомологичного PKM1, который всегда находится в высокоактивной тетрамерной форме и который не регулируется аллостерически, PKM2 может существовать в тетрамерной форме, но также и в димерной форме. Тетрамерная форма PKM2 имеет высокое сродство к субстрату фосфоенолпируваты (PEP), а также обладает высокой активностью при физиологических концентрациях PEP. Когда PKM2 находится в основном в высокоактивной тетрамерной форме, что имеет место в дифференцированных тканях и большинстве нормальных пролиферирующих клеток, глюкоза превращается в пируват под действием энергии. Между тем димерная форма PKM2 характеризуется низким сродством к субстрату PEP и почти неактивна при физиологических концентрациях PEP. Когда PKM2 находится в основном в менее активной димерной форме, что имеет место в опухолевых клетках, все промежуточные гликолитические промежуточные соединения выше пируваткиназы накапливаются и направляются в синтетические процессы, которые ответвляются от гликолитических промежуточных продуктов, таких как нуклеиновые кислоты, фосфолипиды и амино. кислотный синтез. Нуклеиновые кислоты, фосфолипиды и аминокислоты являются важными строительными блоками клетки, в которых очень нуждаются высокопролиферирующие клетки, такие как опухолевые клетки.

Из-за ключевого положения пируваткиназы в гликолизе соотношение тетрамер: димер PKM2 определяет, будут ли атомы углерода глюкозы превращаться в пируват и лактат при производстве энергии (тетрамерная форма) или направляться в синтетические процессы (димерная форма). Однако, даже если активность PKM2 низкая, что приводит к отвлечению промежуточных продуктов выше по течению в синтетические процессы, пируват и лактат все равно будут производиться с использованием атомов углерода из глюкозы и других метаболитов через 86 путей, минуя пируваткиназу. Эти пути обхода пируваткиназы отличаются от путей, участвующих в глюконеогенезе. Интересно, что многие пути обхода пируваткиназы используют метаболиты, которые проходят через митохондрии, что подчеркивает важность митохондрий в метаболизме рака независимо от окислительного фосфорилирования.

В опухолевых клетках PKM2 находится в основном в димерной форме и поэтому был назван опухолью M2-PK. Количественное определение опухоли M2-PK в плазме и кале является инструментом для раннего выявления опухолей и последующих исследований во время терапии. Димеризация PKM2 в опухолевых клетках индуцируется прямым взаимодействием PKM2 с различными онкобелками (pp60v-src, HPV-16 E7 и A-Raf). Физиологическая функция взаимодействия между PKM2 и HERC1, а также между PKM2 и PKCdelta неизвестна). Из-за важной роли PKM2 в аэробном гликолизе (эффект Варбурга), который является доминирующим метаболическим путем, используемым раковыми клетками. Его преодоление на этом пути в макрофагах может привести к лучшему результату экспериментального сепсиса. Таким образом, PKM2 является регулятором индуцированной LPS и опухолью экспрессии PD-L1 на макрофагах и дендритных клетках, а также опухолевых клетках.

Однако соотношение тетрамер: димер PKM2 не является стационарным. Высокие уровни гликолитического промежуточного фруктозо-1,6-бисфосфата вызывают повторную ассоциацию димерной формы PKM2 с тетрамерной формой. Как следствие, глюкоза превращается в пируват и лактат с производством энергии до тех пор, пока уровень фруктозо-1,6-бисфосфата не упадет ниже критического значения, чтобы позволить диссоциацию до димерной формы. Эта регуляция называется метаболической бюджетной системой. Другой активатор PKM2 - аминокислота серин. Гормон щитовидной железы 3,3´, 5-трийоди-L-тиронин ( T3 ) связывается с мономерной формой PKM2 и препятствует ее ассоциации с тетрамерной формой.

В опухолевых клетках повышенная скорость производства лактата в присутствии кислорода называется эффектом Варбурга. Генетические манипуляции с раковыми клетками таким образом, чтобы они производили взрослую PKM1 вместо PKM2, обращают эффект Варбурга и снижают скорость роста этих модифицированных раковых клеток. Соответственно, котрансфекция клеток NIH 3T3 с помощью gag-A-Raf и мутанта PKM2 с мертвой киназой уменьшала количество колоний, тогда как котрансфекция с помощью gag-A-Raf и PKM2 дикого типа приводила к удвоению образования фокуса.

Было обнаружено, что димерная форма PKM2 проявляет протеинкиназную активность в опухолевых клетках. Он способен связываться и фосфорилировать гистон H3 хроматина в раковых клетках, тем самым играя роль в регуляции экспрессии генов. Эта модификация гистона H3 и связанное с этим участие в регуляции экспрессии генов могут быть причиной пролиферации опухолевых клеток.

Активность пируваткиназы PKM2 может быть усилена SAICAR (сукциниламиноимидазолкарбоксамид рибозо-5'-фосфат), промежуточным звеном в биосинтезе пуринов. В раковых клетках голодание по глюкозе приводит к повышению уровней SAICAR и последующей стимуляции активности пируваткиназы PKM2. Это позволяет завершить гликолитический путь производства пирувата и, следовательно, выжить в условиях депривации глюкозы. Кроме того, избыток SAICAR может изменять абсорбцию глюкозы и производство лактата в раковых клетках. Однако было показано, что связывание SAICAR также в достаточной степени стимулирует протеинкиназную активность PKM2 в опухолевых клетках. В свою очередь, комплекс SAICAR-PKM2 потенциально может фосфорилировать ряд других протеинкиназ, используя PEP в качестве донора фосфата. Многие из этих белков способствуют регуляции пролиферации раковых клеток. В частности, PKM2 может быть компонентом передачи сигналов митоген-активируемой протеинкиназы (MAPK), которая связана с повышенной пролиферацией клеток при неправильном функционировании. Это обеспечивает потенциальную связь между активированным SAICAR PKM2 и ростом раковых клеток.

Естественные мутации и канцерогенез

Две миссенс-мутации, H391Y и K422R, PKM2 были обнаружены в клетках пациентов с синдромом Блума, склонных к развитию рака. Результаты показывают, что, несмотря на наличие мутаций в межсубъединичном контактном домене, мутантные белки K422R и H391Y сохранили свою гомотетрамерную структуру, аналогичную белку дикого типа, но показали потерю активности на 75 и 20% соответственно. H391Y показал 6-кратное увеличение сродства к своему субстрату фосфоенолпирувата и вел себя как неаллостерический белок с нарушенным кооперативным связыванием. Однако у K422R сродство к фосфоенолпирувату значительно потеряно. В отличие от K422R, H391Y продемонстрировал повышенную термическую стабильность, стабильность в диапазоне значений pH, меньший эффект аллостерического ингибитора Phe и устойчивость к структурным изменениям при связывании активатора (фруктозо-1,6-бисфосфат) и ингибитора (Phe). Оба мутанта показали небольшой сдвиг оптимума pH с 7,4 до 7,0. Совместная экспрессия гомотетрамерного PKM2 дикого типа и мутанта PKM2 в клеточной среде, приводящая к взаимодействию между ними на уровне мономера, была дополнительно подтверждена экспериментами in vitro. Перекрестное мономерное взаимодействие значительно изменяет олигомерное состояние PKM2, способствуя димеризации и гетеротетрамеризации. Исследование in silico предоставило дополнительную поддержку, показав, что гетероолигомеризация была энергетически выгодной. Гетероолигомерные популяции PKM2 показали измененную активность и сродство, и их экспрессия привела к увеличению скорости роста Escherichia coli, а также клеток млекопитающих, наряду с увеличением скорости полиплоидии. Известно, что эти особенности важны для прогрессирования опухоли.

Кроме того, клетки, стабильно экспрессирующие экзогенный дикий или мутантный PKM2 (K422R или H391Y) или совместно экспрессирующие как дикий, так и мутантный (PKM2-K422R или PKM2-H391Y), оценивали на метаболизм рака и канцерогенный потенциал. Клетки, коэкспрессирующие PKM2 и мутантные (K422R или H391Y), показали значительно агрессивный метаболизм рака по сравнению с клетками, экспрессирующими либо дикую, либо мутантную PKM2 независимо. Аналогичная тенденция наблюдалась в отношении окислительной выносливости, канцерогенного потенциала, клеточной пролиферации и роста опухоли. Эти наблюдения указывают на доминирующий негативный характер этих мутаций. Примечательно, что коэкспрессирующие клетки PKM2-H391Y показали максимальное влияние на все изученные параметры. Такое доминирующее негативное нарушение функции PKM2 в развитии опухоли неизвестно; также впервые свидетельствует о возможной предрасположенности пациентов с BS с нарушенной активностью PKM2 к раку и о важности изучения генетических вариаций PKM2 в будущем для понимания их значимости при раке в целом.

Нормативные схемы

Для раковых клеток характерно перепрограммирование энергетического обмена. За последнее десятилетие понимание метаболических изменений, которые происходят при раке, резко возросло, и существует большой интерес к нацеливанию на метаболизм для лечения рака. PKM2 играет ключевую роль в модуляции метаболизма глюкозы для поддержки пролиферации клеток. PKM2, как и другие изоформы PK, катализирует последний этап выработки энергии в гликолизе, но уникален по своей способности регулироваться. PKM2 регулируется на нескольких клеточных уровнях, включая экспрессию генов, альтернативный сплайсинг и посттрансляционную модификацию. Кроме того, PKM2 регулируется ключевыми промежуточными продуктами метаболизма и взаимодействует с более чем двадцатью различными белками. Следовательно, этот изофермент является важным регулятором гликолиза и дополнительными функциями в других новых ролях, которые недавно появились. Недавние данные показывают, что вмешательство в сложную регуляторную сеть PKM2 имеет серьезные последствия для пролиферации опухолевых клеток, указывая на потенциал этого фермента в качестве мишени для терапии опухолей.

Бактериальный патогенез

Было обнаружено, что в дрожжевой двугибридной системе гонококковые белки Opa взаимодействуют с PKM2. Результаты предполагают, что прямое молекулярное взаимодействие с метаболическим ферментом хозяина PKM2 необходимо для приобретения пирувата, а также для роста и выживания гонококков.

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи.

[[Файл: Гликолиз go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to WikiPathways go to article go to Entrez go to article [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] [[]] Гликолиз go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to article go to WikiPathways go to article go to Entrez go to article | alt = Гликолиз и глюконеогенез править ]] Гликолиз и глюконеогенез править
Смотрите также
использованная литература
внешние ссылки
Последняя правка сделана 2024-01-11 05:04:34
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте