Список онтологий OBO Foundry

редактировать

Статья со списком Википедии

Это список онтологий, которые являются частью OBO Foundry по состоянию на январь 2020 г.

Онтологии OBO Foundry

Заголовок	Префикс	Описание	Официальная страница
Онтология агрономии	AGRO	Онтология концепций, относящихся к агрономическим экспериментам.	[1]
Онтология основных экологических объектов	ECOCORE	Онтология экологических объектов.	[2]
Онтология анатомической сущности	AEO	Онтология анатомических структур, которые расширяют CARO, общую справочную онтологию анатомии.	[3]
Онтология устойчивости к антибиотикам	ARO	Онтология генов и мутаций устойчивости к антибиотикам.	[4]
Структурированный словарь Apollo	APOLLO-SV	Онтология для обеспечения взаимодействия моделей эпидемий и прикладного программного обеспечения общественного здравоохранения.	. [5]
Онтология фенотипа аскомицетов	APO	Структурированный контролируемый словарь фенотипов грибов Ascomycete.	[6]
Базовая формальная онтология	BFO	Онтология верхнего уровня, на которой построены онтологии OBO Foundry.	. [7]
Онтология геномики бета-клеток	BCGO	Онтология приложения, созданная для геномных исследований бета-клеток.	[8]
Онтология биологических коллекций	BCO	Онтология данных о биоразнообразии.	. [9]
Онтология методов биологической визуализации	FBBI	Онтология для методов, задействованных в биомедицинской визуализации, включая подготовку и получение.	[10]
Биологическая пространственная онтология	BSPO	Онтология для представления пространственных концепций, используемых в биологии.	[11]
BRENDA ткань / источник ферментов	BTO	Онтология источника ферментов.	[12]
С. Онтология разработки elegans (см. WormBase )	WBLS	Онтология разработки Caenorhabditis elegans.	[13]
Онтология общей анатомии C. elegans (см. WormBase )	WBBT	Онтология анатомии Caenorhabditis elegans.	[14]
фенотип C. elegans (см. WormBase )	WBPHENOTYPE	Онтология фенотипов Caenorhabditis elegans.	[15]
Онтология сердечно-сосудистых заболеваний	CVDO	Онтология концепций, связанных с сердечно-сосудистыми заболеваниями.	[16]. [17]
Онтология клеточной линии	CLO	Онтология для описания клеточной линии.	[18]. [19]
Онтология клетки	CL	Онтология для типов клеток метазоан .	[20]. [21]
Химические объекты биологических Интерес	CHEBI	Онтология низкомолекулярных образований, представляющих биологический интерес.	[22]
Химическая информационная онтология	CHEMINF	Онтология для используемых дескрипторов i n баз хемоинформатики.	[23]. [24]
Онтология химических методов	CHMO	Онтология методов, используемых в химических экспериментах.	[25]
Clinical LABoratory Ontology	LABO	Онтология рецептов и отчетов в клинических лабораториях.	[26]
Онтология клинических измерений	CMO	Онтология для классификации клинических измерений на экспериментальных животных.	[27]
Справочная онтология общей анатомии	CARO	Онтология для улучшения взаимодействия между онтологиями анатомии для различных организмов.	. [28]
Онтология сравнительного анализа данных	CDAO	Онтология концепций и отношений, относящихся к эволюционному сравнительному анализу, например филогенетические деревья.	[29]. [30]
Онтология достоверной информации	ИТ-директор	Онтология для описания достоверной информации в аннотациях последовательностей.	[31]
Онтология ролей участника	CRO	Онтология для различных ролей, лежащих в основе научно-исследовательской статьи.	[32]. [33]
Онтология гребневиков	CTENO	Анатомическая онтология и онтология развития для гребневиков (гребенчатые желе).	[34]
Анатомия Dictyostelium discoideum	DDANAT	Структурированный контролируемый словарь анатомии слизистой плесени Dictyostelium discoideum	[35]
Dictyostelium discoideum онтология фенотипа	DDPHENO	Онтология фенотипов слизи-плесени Dictyostelium discoideum.	[36]
Развитие дрозофил	FBDV	Онтология разработка Drosophila melanogaster.	[37]
Макроанатомия дрозофил	FBBT	Онтология анатомии Drosophila melanogaster.	[38]
Онтология фенотипа дрозофилы	FBCV	Онтология общих фенотипов дрозофилы.	[39]
Онтология доказательств взаимодействия наркотиков и взаимодействия и взаимодействия наркотиков	DIDEO	Онтология доказательств взаимодействия наркотиков и лекарств.	[40]
	ECO	Онтология типов свидетельств, используемых для поддержки научных заявлений.	. [41]
онтология ресурсов Eagle-i	ERO	Онтология исследовательского оборудования, протоколов и расходных материалов.	[42] [43]
Онтология эмоций	MFOEM	Онтология эмоций, настроений и других видов чувств.	[44]
Онтология окружающей среды	ENVO	Онтология характеристик окружающей среды и местообитаний.	. [45]
Онтология экспериментальных условий	XCO	Онтология для различных условий, в которых проводятся экспериментальные измерения.	[46]
Онтология воздействия	EXO	Онтология для описания воздействия факторов окружающей среды (таких как сигаретный дым ), которые могут повлиять на клинические исходы.	. [47]
Онтология фенотипа делящихся дрожжей	FYPO	Онтология фенотипов делящихся дрожжей.	[48]. [49]
Флора Онтология фенотипа	FLOPO	Онтология признаков и фенотипов цветковых растений.	[50]
Управляемый FlyBase словарь	FBCV	An онтология для поддержки проекта FlyBase.	[51]
Пищевая онтология	FOODON	Онтология для представления сущностей, которые играют роль еды или связаны с пищевыми продуктами.	[52]
Базовая модель онтологии анатомии (подмножество)	FMAO	Подмножество Базовой модели онтологии анатомии.	[53]
Онтология анатомии грибов	FAO	Онтология анатомии грибов.	[54]
Газетир	ГАЗ	Онтология, которая действует как географический словарь (географический словарь).	[55]
Онтология гена	GO	Онтология для описания функции генов и генных продуктов.	[56]. [57]
Онтология геномной эпидемиологии	GENEPIO	Онтология патогенов пищевого происхождения и связанных с ними вспышек.	[58].
Онтология генотипа	GENO	Онтология для генотипов и связанных с ними фенотипов и заболеваний.	[59]
Онтология географических объектов	GEO	Онтология географических объектов.	[60]
Онтология именования гликанов	GNOME	Онтология для гликанов, основанная на GlyTouCan.	[61]
Онтология гомологии	HOM	Онтология концепций, относящихся к гомологии.	[62]
Онтология человеческого происхождения	HANCESTRO	Онтология концепций предков, используемая в каталоге NHGRI-EBI опубликованных полногеномных исследований ассоциаций.	[63]
Стадии развития человека	HSAPDV	Онтология этапов жизни человека.	[64]
Онтология болезней человека	DO	Онтология для описания болезней человека.	[65]
Онтология фенотипа человека	HPO	Онтология фенотипов человека при наследственных и ненаследственных заболеваниях.	[66]. [67]
Управляемый словарь реагентов для сшивания и дериватизации HUPO-PSI	PSI-MS	Онтология реагентов, используемых для массового сшивания молекул спектрометрические эксперименты.	[68]
Онтология анатомии перепончатокрылых	HAO	Онтология анатомии перепончатокрылых (пчелы, осы и муравьи).	[69]
Онтология гипертонии	HTN	Онтология клинических данных о гипертонии.	[70]
Онтология инфекционных заболеваний	IDO	Набор онтологий, связанных с инфекционными заболеваниями.	[71]
Онтология информационных артефактов	IAO	Онтология информационных объектов.	. [72]
Онтология информированного согласия	ICO	Онтология концепций, связанных с информированным согласием, таких как формы и политики.	. [73]
Онтология интегративных и конъюгативных элементов	ICEO	Онтология бактериальных интегративных и конъюгативных элементов (ICE).	[74]
Онтология сети взаимодействия	ИНО	Онтология взаимодействий ген-ген.	. [75]
Онтология малярии	IDOMAL	Онтология концепций, связанных с малярией.	. [76]
Онтология питающих мышц млекопитающих	MFMO	Онтология для мышц млекопитающих, которые играют роль в пищевом поведении.	[77]
Онтология фенотипа млекопитающих	MP	Стандартные термины для аннотирования фенотипических данных млекопитающих.	[78]
Онтология масс-спектрометрии	MI	Онтология концепций для описания масс-спектрометрии в контексте протеомики.	[79]
Онтология метода измерения	MMO	Онтология методов клинических и лабораторных измерений.	[80]
Стадии развития Медака	OlatDv	Онтология стадий жизни рыбы медака.	[81]
Онтология психических заболеваний	MFOMD	Онтология для психических заболеваний.	. [82]
Онтология психического функционирования	MFO	Онтология для концепций, связанных умственному функционированию.	[83]. [84]
Онтология ограничения MHC	MRO	Онтология ограничения главного комплекса гистосовместимости (MHC) в экспериментах.	[85]
Онтология MIAPA	MIAPA	Онтология филогенетических данных.	[86]
Онтология микробных условий	MCO	Онтология микробных условий роста.	[87]
Онтология минимальной информации PDDI	MPIO	Онтология минимальной информации для описания взаимодействия лекарств.	[88]
Словарь, контролируемый молекулярными взаимодействиями	MI	Онтология концепций, связанных с изучением белок-белковых взаимодействий.	[89]
Онтология болезни Мондо	MONDO	Онтология для интеграции информации о болезни.	[90]
Онтология макроанатомии комаров (VectorBase )	TGMA	Онтология анатомии комаров.	[91]
Взрослых мышей онтология анатомии	EMAPA	Онтология взрослой анатомии мыши (Mus).	[92]
Этапы развития мыши	MmusDv	Онтология стадий жизни мыши (Mus).	[93]
Общая анатомия и развитие мыши, приуроченная	EMAP	Онтология анатомических структур мыши (Mus musculus).	[94]
Онтология патологии мыши	MPATH	An онтология фенотипов патологии мышей.	[95]
Название Реакция Онтология	RXNO	Онтология органических реакций в органическом синтезе.	[96]
Организационная классификация NCBI	NCBITaxon	Онтологическое представление NCBI таксономии организмов.	[97]
Онтология нейроповедения	NBO	Онтология поведенческих фенотипов животных.	[98]
NOMEN - Номенклатурная онтология для биологических имен	NOMEN	Онтология правил номенклатуры для биологических имен.	[99]
Онтология некодирующей РНК	NCRO	Онтология для функции некодирующей РНК.	[100]
Онтологизированный MIABIS	OMIABIS	Онтологическая версия MIABIS (минимальная информация о совместном использовании данных BIobank).	[101]
Онтология для биобанков	OBIB	Онтология для концепций, связанных с биобанками.	[102].
Онтология для биомедицинских исследований	OBI	Онтология, которая описывает биологические процессы, клеточные компоненты и молекулярные функции в живых организмах.	[103]
Онтология для общей медицины	OGMS	Онтология для общих аспектов медицины с упором на рак.	[104]
Онтология жизненного цикла паразита	OPL	Справочная онтология для стадий жизненного цикла паразита.	[105]
Онтология нежелательных явлений	OAE	Онтология нежелательных явлений схем приема лекарств.	[106]
Онтология кровеносных систем членистоногих	OARCS	Онтология кровеносных систем членистоногих.	[107]
Онтология биологической и клинической статистики	OBCS	Онтология для описания статистических инструментов и методов, используемых в биомедицинских исследованиях.	[108]
Онтология биологических атрибутов	OBA	Онтология биологических признаков.	[109]
Онтология связанных с медициной социальных объектов	OMRSE	Онтология объектов (ролей и организаций), связанных со здравоохранением.	[110]. [111]
Онтология микробных фенотипов	OMP	Онтология фенотипов микроорганизмов.	[112]
Онтология организационных структур травмоцентров и травматологических систем	OOSTT	Онтология организационных структур травматологических центров и систем травм.	[113]
Онтология точной медицины и исследований	OPMI	Онтология концепций, связанных с точной медициной.	[114]
Онтология точной медицины Прокариотические фенотипические и метаболические признаки	MICRO	Онтология прокариотических фенотипических и метаболических признаков.	[115]
Онтология секвенирования РНК	ORNASEQ	Онтология для аннотирования экспериментов секвенирования РНК.	[116]
Онтология нежелательных явлений вакцин	OVAE	Онтология нежелательных явлений вакцин.	[117]. [118]
Онтология фенотипа взаимодействия патогена-хозяина	PHIPO	Онтология фенотипов, которые возникают во взаимодействиях патоген-хозяин.	[119]
Онтология передачи патогенов	TRANS	Онтология процессов передачи болезней n.	[120]
Онтология пути	PW	Онтология для аннотирования генных продуктов для путей.	[121]
Онтология отображения сводки по производительности	PSDO	Онтология для концепций, связанных с информацией о производительности для команд и организаций.	[122]
Онтология фенотипа и признаков	FOBI	FOBI (Онтология пищевых биомаркеров) - это онтология для представления данных о потреблении пищи и связывания их с метаболом данные.	[123]
Онтология планарии	ПЛАНА	Онтология анатомии и стадий развития планарии (.)	[124]
Онтология фенотипа планарии	PLANP	Онтология фенотипов планарий (.)	[125]
Онтология экспериментальных условий растений	PECO	Онтология концепций связанные с экспериментами по биологии растений.	[126]
Онтология растений	PO	Онтология и ресурс базы данных, который связывает свойства растений с данными геномики.	[127]
Онтология фенологии растений	PPO	Онтология для описания циклических феноменов растений.	[128]
Онтология признаков растений	TO	Онтология фенотипических признаков растений.	[129]
Стадии развития Platynereis	PDUMDV	Онтология жизненных стадий кольчатых червей Platynereis dumerilii.	[130]
Население и сообщество Онтология	PCO	Онтология для описания групп взаимодействующих организмов.	. [131]
Онтология Porifera	PORO	Онтология анатомии губок (Porifera )	[132]
Модификация белка	MOD	Онтология химических модификаций белков	[133]
Онтология белка	PRO	Онтологическое представление связанных с белками сущностей	[134]
Онтология линий крыс	RS	Онтология лабораторных линий крыс.	[135]
Онтология отношений	RO	Онтология отношений между терминами в онтологиях.	[136]
Онтология информации о научных доказательствах и происхождении	SEPIO	Онтология происхождения научные заявления и подтверждающие доказательства.	[137]
Типы последовательностей и онтология функций	SO	Онтология для аннотации последовательностей.	[138]
Онтология программного обеспечения	SWO	Онтология для описания программных приложений с акцентом на инструменты биоинформатики.	[139]
Spid er Ontology	SPD	Онтология анатомии и поведения пауков, а также продуктов, полученных от пауков.	[140]
Онтология симптомов	SYMP	Онтология симптомов заболевания.	[141]
Словарь таксономических рангов	TAXRANK	Онтология таксономические ранги по систематике.	[142]
Онтология таксономии костистости	TTO	Онтология таксономии костистых рыб.	[143]
Онтология использования данных	DUO	Онтология для условий использования данных.	[144]
Онтология лекарств	ДРОН	Онтология для лекарств продуктов.	[145]
Онтология генов и геномов	OGG	Онтология генов и геномов биологических организмов.	[146]
Онтология здоровья полости рта и заболеваний	OHD	Онтология содержания записей о здоровье зубов.	[147]
Онтология рецептов лекарств	PDRO	Онтология концепций, связанных с назначением лекарств.	[148]
Онтология статистических методов	STATO	Онтология статистических методов, таких как тесты и экспериментальные планы.	[149]
Онтология анатомии клещей	TADS	Онтология анатомии семейств клещей Ixodidae и Argasidae.	[150]
Онтология многовидовой анатомии Uberon	UBERON	Интегративная межвидовая онтология анатомических терминов.	[151]
Онтология унифицированного фенотипа (uPheno)	UPHENO	Онтология для унифицированных фенотипических описаний.	[152]
Онтология единиц измерения	UO	Онтология метрических единиц, связанная с онтологией PATO.	[153]
Онтология информированного согласия на вакцинацию	VICO	Онтология клинического информированного согласия сосредоточена на процедурах вакцинации.	[154]
Онтология вакцины	ВО	Онтология концепций, относящихся к вакцинам и вакцинации.	[155]
Онтология таксономии позвоночных	VTO	Онтология таксономии позвоночных.	[156]
Онтология признаков позвоночных	VT	Онтология признаков, охватывающих позвоночных	[157]
Онтология VEuPathDB	EUPATH	Онтология для поддержки ресурса Эукариотический патоген, хост и векторный геномика.	[158]
Онтология анатомии Xenopus	XAO	Онтология анатомии африканской когтистой лягушки (Xenopus laevis ).	. [159]
Онтология фенотипа Xenopus	XPO	Онтология фенотипов анатомических, клеточных и генных функций у африканских когтистых лягушек (Xenopus laevis ).	[160]
Анатомия и онтология развития рыбок данио	ZFA	Онтология анатомии и развития рыбок данио (Danio rerio ).	[161]
Онтология стадий развития рыбок данио	ZFS	Онтология стадий развития рыбок данио (Danio rerio ).	[162]
Онтология экспериментальных условий на рыбках данио	ZECO	Онтология экспериментальных условий, используемых в исследованиях рыбок данио и описанная в ZFIN.	[163]
Онтология фенотипа рыбок данио	ZP	Онтология фенотипов рыбок данио (Danio rerio ).	[164]

Ссылки