Ядерный антиген пролиферирующих клеток

редактировать
PCNA
1axc tricolor.png
Доступные структуры
PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы PCNA, ATLD2, ядерный антиген пролиферирующих клеток
Внешние идентификаторыOMIM: 176740 MGI: 97503 HomoloGene: 1945 Генные карты: PCNA
Расположение гена (человек)
Хромосома 20 (человек)
Chr. Хромосома 20 (человек)
Хромосома 20 (человек) Геномное расположение для PCNA Геномное расположение для PCNA
Полоса 20p12.3Начать5,114,953 bp
Конец5,126,626 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PCNA 201202 в fs.png
Дополнительные справочные данные по экспрессии
Orthologs
SpeciesHumanMouse
Entrez

5111

18538

Ensembl

ENSG00000132646

ENSMUSG00000027342

UniProt

P12004

P17918

RefSeq (мРНК)

NM_182649. NM_002592

NM_011045

<37251>NP_011045

RefSeq (белок) NP_872590

NP_035175

Местоположение (UCSC)Chr 20: 5,11 - 5,13 Мб н / дPubMed поискВикиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши
Крио-ЭМ структура связанного с ДНК процессивного комплекса PolD – PCNA

Ядерный антиген пролиферирующей клетки (PCNA ) представляет собой зажим для ДНК который действует как фактор процессивности для ДНК-полимеразы δ в эукариотических клетках и необходим для репликации. PCNA является гомотримером и достигает своей процессивности путем окружения ДНК, где он действует как каркас для набора белков, участвующих в репликации ДНК, репарации ДНК, ремоделировании хроматина и эпигенетике.

Многие белки взаимодействуют с PCNA через два известных PCNA-взаимодействующих мотива. PCNA-взаимодействующий пептидный бокс (PIP) box и AlkB гомолог 2 PCNA-взаимодействующий мотив (APIM). Белки, связывающиеся с PCNA через PIP-бокс, в основном участвуют в репликации ДНК, тогда как белки, связывающиеся с PCNA через APIM, в основном важны в контексте генотоксического стресса.

Содержание
  • 1 Функция
  • 2 Экспрессия в ядре во время Синтез ДНК
  • 3 Роль в репарации ДНК
  • 4 PCNA-связывающие белки
  • 5 Взаимодействия
  • 6 Использование
  • 7 См. Также
  • 8 Ссылки
  • 9 Дополнительная литература
  • 10 Внешние links
Функция

Белок, кодируемый этим геном, находится в ядре и является кофактором дельта ДНК-полимеразы. Кодируемый белок действует как гомотример и помогает увеличить процессивность синтеза ведущей цепи во время репликации ДНК. В ответ на повреждение ДНК этот белок убиквитинируется и участвует в RAD6-зависимом пути репарации ДНК. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок. Псевдогены этого гена были описаны на хромосоме 4 и на хромосоме X.

Экспрессия в ядре во время синтеза ДНК

PCNA первоначально была идентифицирована как антиген, который экспрессируется в ядрах клеток во время фазы синтеза ДНК клеточного цикла. Часть белка секвенировали, и эту последовательность использовали для выделения клона кДНК. PCNA помогает удерживать ДНК-полимеразу эпсилон (Pol ε ) с ДНК. PCNA прикрепляется к ДНК под действием фактора репликации C (RFC), который является гетеропентамерным членом класса AAA + АТФаз. Экспрессия PCNA находится под контролем E2F комплексов, содержащих фактор транскрипции.

Роль в репарации ДНК

Так как ДНК-полимераза эпсилон участвует в ресинтезе вырезанных поврежденных цепей ДНК во время репарации ДНК, PCNA важна как для синтеза ДНК, так и для репарации ДНК.

PCNA также участвует в известном пути устойчивости к повреждению ДНК. как пострепликационная репарация (PRR). В PRR существует два суб-пути: (1) путь трансформации, который осуществляется специализированными ДНК-полимеразами, которые способны включать поврежденные основания ДНК в свои активные центры (в отличие от нормальной репликативной полимеразы, которая останавливается) и, следовательно, обход повреждения, и (2) предлагаемый путь «переключения шаблона», который, как полагают, включает обход повреждения путем привлечения механизма гомологичной рекомбинации. PCNA имеет решающее значение для активации этих путей и выбора того, какой путь используется клеткой. PCNA подвергается посттрансляционной модификации под действием убиквитина. Моноубиквитин лизина номер 164 на PCNA активирует путь синтеза трансфузии. Считается, что удлинение этого моно-убиквитина неканонической лизин-63-связанной полиубиквитиновой цепью на PCNA активирует путь переключения матрицы. Более того, сумоилирование (с помощью небольшого убиквитин-подобного модификатора, SUMO) PCNA лизина-164 (и в меньшей степени лизина-127) ингибирует путь переключения матрицы. Этот антагонистический эффект возникает из-за того, что сумоилированная PCNA рекрутирует ДНК-геликазу, называемую Srs2, которая играет роль в разрушении нуклеопротеиновых филаментов Rad51, необходимых для инициации гомологичной рекомбинации.

PCNA-связывающие белки

PCNA взаимодействуют со многими белками.

Взаимодействия

Было показано, что PCNA взаимодействует с:

Белки, взаимодействующие с PCNA через APIM, включают гомолог 2 человеческого AlkB, TFIIS-L, TFII-I, Rad51B, XPA, ZRANB3 и FBH1.

Можно использовать

Антитела против ядерного антигена пролиферирующих клеток (PCNA) или моноклональное антитело, называемое Ki-67. для классификации различных новообразований, например астроцитома. Они могут иметь значение диагностическое и прогностическое. Визуализацию ядерного распределения PCNA (посредством мечения антител) можно использовать для различения ранней, средней и поздней S фазы клеточного цикла. Однако важным ограничением антител является то, что клетки необходимо фиксировать, что приводит к возможным артефактам.

С другой стороны, изучение динамики репликации и репарации в живых клетках можно проводить, вводя трансляционные слияния PCNA. Чтобы исключить необходимость трансфекции и обойти проблему трудно трансфицируемых и / или короткоживущих клеток, можно использовать проницаемые для клеток маркеры репликации и / или репарации. Эти пептиды обладают явным преимуществом, заключающимся в том, что их можно использовать in situ в живой ткани и даже отличать клетки, подвергающиеся репликации, от клеток, подвергающихся репарации.

PCNA является потенциальной терапевтической мишенью в терапии рака.

См. Также
Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-06-02 08:04:46
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте