HDAC1

HDAC1
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4BKX, 5ICN
Идентификаторы
Псевдонимы	HDAC1, GON-10, HD1, RPD3, RPD3L1, гистондеацетилаза 1, KDAC1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601241 MGI: 108086 HomoloGene: 68426 GenCards : HDAC1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек) Полоса 1p35.2-p35.1 Начало 32,292,083 bp Конец 32,333,635 bp
Расположение гена (мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь) Полоса 4 D2.2 | 4 63,26 см Начало 129,516,104 bp Конец 129,542,713 bp
Экспрессия РНК паттерн Дополнительные данные эталонной экспрессии
Генная онтология Молекулярная функция •GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II. •НАД-зависимая активность гистондеацетилазы (специфическая для H3-K14). •GO: 0001106 активность корепрессора транскрипции. •РНК-полимераза II связывание фактора транскрипции. •гистондеацетилазная активность. •связывание с N-концом белка. •GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающий фактор транскрипции.. •активность протеиндеацетилазы. •связывание гистондеацетилазы. •активация связывания фактора транскрипции. •связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции. •связывание NF-kappaB. •активность деацетилазы. •GO: 0001948 связывание белка. •РНК-полимераза II репрессирует связывание фактора транскрипции. •связывание нуклеосомной ДНК. •связывание фермента. •репрессирует связывание фактора транскрипции. •активность гидролазы. •связывание ДНК, специфичное для последовательности основного промотора. •связывание p53. •связывание с фактором транскрипции. •связывание с коровой промоторной последовательностью РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности ДНК. •связывание с ДНК. •связывание с хроматином. •связывание с ассоциированным по Круппелю бокс-доменом. •связывание с E-боксом. •промотор-специфический хроматин привязка. Клеточный компонент •цитоплазма. •комплекс NuRD. •цитозоль. •комплекс гистондеацетилазы. •комплекс Sin3. •нуклеоплазма. •ядерный хроматин. •ядро ​​клетки. •хроматин. •гетерохроматин. •регулятор транскрипции комплекс. •комплекс репрессора транскрипции. •макромолекулярный комплекс. •тело нейронной клетки. •Комплекс типа Sin3. Биологический процесс •формирование плакоды волосяного фолликула. •дифференцировка эпидермальных клеток. •ремоделирование хроматина. •регуляция транскрипции, ДНК-шаблон. •ритмический процесс. •негативная регуляция сигнального пути рецептора андрогенов. •морфогенез эмбрионального пальца. •позитивная регуляция процесса биосинтеза рецептора. •негативная регуляция апоптотического процесса. •кровь коагуляция. •негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II. •развитие век в глазе камерного типа. •циркадная регуляция экспрессии генов. •негативная регуляция экспрессии генов. •АТФ-зависимое ремоделирование хроматина. •положительное регулирование транскрипция, ДНК-шаблон. •одонтогенез дентинсодержащего зуба. •деацетилирование белков. •деацетилирование гистона H4. •образование грибовидных сосочков. •негативная регуляция дифференцировки миотрубок. •GO: 0022415 вирусный процесс. •деацетилирование гистонов. •отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt. •позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II. •транскрипция, ДНК-шаблонная. •регуляция передачи сигнала медиатором класса p53. •зависимый от метилирования хроматин подавление. •сборки комплекса бета-катенин-TCF. •ковалентная модификация хроматина. •организация хроматина. •позитивная регуляция пролиферации клеток. •негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон. •деацетилирование гистона H3. •регуляция дифференцировки мегакариоцитов. •Дункан Кийге. •развитие энтодермы. •циркадный ритм. •развитие гиппокампа. •дифференцировка нейронов. •негативная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB. •позитивная регуляция дифференцировки олигодендроцитов. •регуляция активности эндопептидазы. •регуляция клиренса бета-амилоида. •негативная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути. Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3065	433759
Ensembl	ENSG00000116478	ENSMUSG00000028800
UniProt	Q13547	O09106
RefSeq (мРНК)	NM_004964	NM_008228
RefSeq (белок)	NP_004955	NP_032254
Местоположение (UCSC)	Chr 1: 32,29 - 32,33 Мб	Chr 4: 129,52 - 129,54 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

гистоновая деацетилаза 1 (HDAC1 ) представляет собой фермент, который у человека кодируется геном HDAC1 .

• 1 Функция
• 2 Модельные организмы
• 3 Взаимодействия
• 4 См. Также
• 5 Ссылки
• 6 Дополнительная литература
• 7 Внешние ссылки

Ацетилирование и деацетилирование гистонов, катализируемое мульти Комплексы убунитов играют ключевую роль в регуляции экспрессии гена эукариот. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству гистондеацетилазы / acuc / apha и является компонентом комплекса гистондеацетилазы. Он также взаимодействует с белком-супрессором опухоли ретинобластомы, и этот комплекс является ключевым элементом в контроле пролиферации и дифференцировки клеток. Вместе с ассоциированным с метастазами белком-2 MTA2 он деацетилирует p53 и модулирует его действие на рост клеток и апоптоз.

Модельных организмов были использованы в исследовании функции HDAC1. Условная линия нокаутных мышей, названная Hdac1, была создана в рамках программы International Knockout Mouse Consortium - проекта высокопроизводительного мутагенеза для создания и распространения животных моделей болезней среди заинтересованных ученых. в Институте Сэнгера Wellcome Trust. Самцы и самки животных подвергались стандартизированному фенотипическому скринингу для определения эффектов делеции. Было проведено двадцать пять тестов и выявлено два фенотипа. Во время беременности было идентифицировано уменьшенное количество гомозиготных мутантных эмбрионов, и ни один из них не выжил до отъема. Остальные тесты были проведены на гетерозиготных мутантных взрослых мышах, и у этих животных не наблюдалось значительных отклонений от нормы.

Было показано, что HDAC1 взаимодействует с:

• рецептором андрогенов,
• BCL6,
• BTG2,
• BUB1B,
• BUB1,
• BUB3,
• CBFA2T3,
• CDC20,
• CDH1,
• CHD3,
• CHD4,
• COUP-TFII,
• CTBP1,
• DDX17,
• DDX5,
• DNMT3A,
• DNMT3L,
• Связанный со смертью белок 6,
• EED,
• EVI1,
• EZH2,
• FKBP3,
• GATA1,
• HMG20B,
• HSPA4,
• HUS1,
• гистондеацетилаза 2,
• гомеобоксовый белок TGIF1,
• фактор клетки-хозяина C1,
• IFRD1,
• IKZF1,
• ING1,
• MBD3,
• MIER1,
• MLL,
• MTA1,
• MTA2,
• Mad1,
• Mdm2,
• Метил-CpG-связывающий домен, белок 2,
• Матери против декапентаплегического гомолога 2,
• MyoD,
• NFKB1,
• Корепрессор ядерного рецептора 2,
• P21,
• PCNA,
• PHF21A,
• Prohibitin,
• Белок промиелоцитарного лейкоза,
• RAD9A,
• RBBP4,
• RBBP7,
• RCOR1,
• RELA,
• RFC1,
• белок ретинобластомы,
• ретинобласт ома-подобный белок 1,
• ретинобластомоподобный белок 2,
• SAP30,
• SATB1,
• SIN3A,
• SIN3B,
• SPEN,
• SUDS3,
• SUV39H1,
• фактор транскрипции Sp1,
• TOP2A,
• TOP2B и
• Цинковый палец и белок 16, содержащий домен BTB.

• Гистондеацетилаза
• Ингибитор гистондеацетилазы

• белок HDAC1 +, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Медицинские предметные рубрики (MeSH)