DNMT3L

редактировать

DNMT3L

Доступные структуры

Поиск ортолога: PDBe RCSB

Список идентификаторов PDB-кодов
2PV0, 2PVC, 2QRV, 4U7P, 4U7T

Идентификаторы

Псевдонимы

DNMT3L, ДНК-метилтрансфераза 3, например

Внешние идентификаторы

OMIM: 606588 MGI: 1859287 HomoloGene : 8362 GeneCards : DNMT3L

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 21 (человек)

Полоса	21q22.3	Начало	44,246,339 bp
Полоса	21q22.3	Конец	44,262,216 bp

Расположение гена (мышь)

Chr.	Хромосома 10 (мышь)

Группа	10 C1 \| 10 39,72 см	Начало	78,041,947 bp
Группа	10 C1 \| 10 39,72 см	Конец	78,063,622 bp

Экспрессия РНК паттерн

Дополнительные справочные данные по экспрессии

Онтология гена
Молекулярная функция	•связывание с ферментом. •GO: 0010576 активность регулятора фермента. •GO: 0010577 активность активатора фермента. •GO: 0001948 связывание с белками. •связывание с ионами металлов. •GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II.
Клеточный компонент	•цитозоль. •ядро клетки. •ESC / E (Z) комплекс.
Биологический процесс	•регуляция экспрессии генов с помощью генетического импринтинга. •метилирование ДНК. •GO: 0048552 регуляция каталитической активности. •негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон. •GO: 0048554 положительная регуляция каталитической активности. •мужской мейоз I. •сперматогенез. •дифференцировка клеток. •метилирование ДНК по цитозину. •метилирование ДНК, участвующее в генерации гамет. •стволовые клетки дифференциация. •негативная регуляция метилирования ДНК. •позитивная регуляция метилирования ДНК. •Дункан Кийдж.
Источники: Amig o / QuickGO

Orthologs

Species

Human

Mouse

Entrez


29947


54427

Ensembl


ENSG00000142182


ENSMUSG00000000730

UniProt


Q9UJW3


Q9CWR8

RefSeq (мРНК)


NM_013369. NM_175867

NM_001081695. NM_001284197. NM_001284198 <12001909>NM_001284198 <120027519>NM_001284198 <120027519>NM_001284198 <1200190>NM4

RefSeq (белок)


NP_037501. NP_787063

NP_001075164. NP_001271126. NP_001271127. NP_001271128. NP_001271129

NP_062321 <20C>Расположение 21: 44,25 - 44,26 Мб

Chr 10: 78,04 - 78,06 Мб

PubMed поиск

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

ДНК (цитозин-5) -метилтрансфераза 3-подобный представляет собой фермент, который у человека кодируется геном DNMT3L .

Содержание

1 Функция
2 Взаимодействия
3 Ссылки
4 Дополнительная литература

Функция

CpG-метилирование - это эпигенетическая модификация, которая важна для эмбрионального развития, импринтинга и инактивации Х-хромосомы. Исследования на мышах показали, что метилирование ДНК необходимо для развития млекопитающих. Этот ген кодирует ядерный белок, похожий на ДНК-метилтрансферазы. Считается, что этот белок не функционирует как ДНК-метилтрансфераза, поскольку он не содержит аминокислотных остатков, необходимых для активности метилтрансферазы. Однако этот белок действительно стимулирует метилирование de novo ДНК цитозинметилтрансферазой 3 альфа, и считается, что он необходим для создания материнских геномных отпечатков. Этот белок также опосредует репрессию транскрипции через взаимодействие с гистондеацетилазой 1. Альтернативный сплайсинг приводит к двум вариантам транскрипта. Описан дополнительный вариант сплайсинга, но его биологическая достоверность не определена.

Взаимодействия

Было показано, что DNMT3L взаимодействует с HDAC1.

Ссылки

Дополнительная литература

Последняя правка сделана 2021-05-16 09:18:43

Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).

Обратная связь: support@alphapedia.ru

Соглашение

О проекте