HDAC9

HDAC9
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список id кодов PDB 1TQE
Идентификаторы
Псевдонимы	HDAC9, HD7, HD7b, HD9, HDAC, HDAC7, HDAC7B, HDAC9B, HDAC9FL, HDRP, MITR, гистондеацетилаза 9
Внешние идентификаторы	OMIM: 606543 MGI: 1931221 HomoloGene: 128578 Генные карты: HDAC9
Местоположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек) полоса 7p21. 1 Начало 18 086 949 bp Конец 19 002 416 bp
Расположение гена (мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь) Полоса 12 | 12 A3 Начало 34,047,580 bp Конец 34,917,095 bp
Онтология генов Молекулярная функция •NAD-зависимый гистон активность деацетилазы (специфическая для H3-K14). •GO: 0001106 tr корепрессорная активность. •активность гистондеацетилазы. •активность протеиндеацетилазы. •связывание фактора транскрипции. •связывание гистондеацетилазы. •связывание иона металла. •GO: 0001948 связывание белка. •подавление связывания фактора транскрипции. •гидролазная активность. •связывание протеинкиназы C. •гистондеацетилазная активность (специфическая для H4-K16). клеточный компонент •цитоплазма. •гистондеацетилазный комплекс. •комплекс регулятора транскрипции. •нуклеоплазма. •ядро клетки. •комплекс гистон-метилтрансферазы. Биологический процесс •деацетилирование гистона H3. •деацетилирование пептидил-лизина. •регуляция транскрипции, ДНК-шаблон. •положительная регуляция миграции клеток, участвующих в прорастании ангиогенеза. •ответ на амфетамин. •негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II. •регуляция дифференцировки поперечно-полосатых мышечных клеток. •транскрипция, ДНК-шаблон. •активация В-клеток. •развитие сердца. •гистон H4 de ацетилирование. •дифференцировка нейронов. •клеточный ответ на инсулиновый стимул. •регуляция развития волокон скелетных мышц. •дифференцировка В-клеток. •воспалительный ответ. •негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная. •организация хроматина. •деацетилирование гистона. •гомеостаз холестерина. •отрицательная регуляция секреции цитокинов. •отрицательная регуляция активности липопротеинлипазы. •деацетилирование гистона H4-K16. Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9734	79221
Ensembl	ENSG00000048052	ENSMUSG00000004698
UniProt	Q9UKV	Q99N13
RefSeq (мРНК)	NM_001204144. NM_001204145. NM_001204146. NM_001204147. NM_001204148. NM_014707 <31790>NM_014707 <31790>NM_014707 <31790>NM_014707 <31790>NM_01458440 НМ_178425. НМ_001321868. НМ_001321869. НМ_001321870. НМ_001321871. НМ_001321872. НМ_001321873. НМ_001321874. НМ_0013218002321397>НМ_0013218002397 1877. NM_001321878. NM_001321879. NM_001321884. NM_001321885. NM_001321886. NM_001321887. NM_001321888. NM_001321889_NM_001321888. NM_001321889_441321888. NM_001321889_44700190_NM_001321889 <44100100_100_NM_001321889 <44100190_NM_001321889_4470090>419>NM_001321895. NM_001321896. NM_001321897. NM_001321898. NM_001321899. NM_001321900. NM_001321901. NM_001321902	NM1029001. NM_001321902	NM104_00128>NM_001321902	NM104_00128. NP_001191074. NP_001191075. NP_001191076. NP_001191077. NP_001308797. NP_001308798. NP_001308799. NP_001308800 <439_300_00460170 NP_001308800 <439_300400470110 NP_004301804398_004301804301804301804401301>NP_001308805. NP_001308806. NP_001308807. NP_001308808. NP_001308813. NP_001308814. NP_001308815. NP_001308816 <19881301000 NP881301 NP881000 NP881000 NP881000 NP881000 NP881000 NP881301 NP4301NP_001308816 <4691700 NP4400>NP_001308816. NP4400_001. NP_001308823. NP_001308824. NP_001308825. NP_001308826. NP_001308827. NP_001308828. NP_001308829. NP_001308830. NP_00130>NP_001308830. NP_00130>NP_00130 55522. NP_478056. NP_848510. NP_848512	NP_001258315. NP_077038
Местоположение (UCSC)	Chr 7: 18.09 - 19 Мб	Chr 12: 34.05 - 34.92 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

гистондеацетилаза 9 - это фермент, который у людей кодируется HDAC9 ген.

• 1 Функция
• 2 Взаимодействия
• 3 См. Также
• 4 Ссылки
• 5 Дополнительная литература
• 6 Внешние ссылки

Гистоны играют решающую роль в регуляции транскрипции, прогрессии клеточного цикла и событиях развития. Ацетилирование / деацетилирование гистонов изменяет структуру хромосом и влияет на доступ факторов транскрипции к ДНК. Белок, кодируемый этим геном, имеет гомологию последовательностей с членами семейства гистондеацетилаз. Этот ген ортологичен генам MITR Xenopus и мыши. В белке MITR отсутствует каталитический домен гистондеацетилазы. Он подавляет активность MEF2 за счет привлечения многокомпонентных комплексов корепрессоров, которые включают CtBP и HDAC. Этот кодируемый белок может играть роль в гемопоэзе. Для этого гена были описаны множественные транскрипты с альтернативным сплайсингом, но полноразмерная природа некоторых из них не была определена.

Было показано, что HDAC9 взаимодействует с:

• IKK1,
• IKK2,
• CBX5,
• HDAC3,
• BTG2,
• Фактор-энхансер, специфичный для миоцитов 2A
• Корепрессор ядерного рецептора 1,
• SIN3A и
• SUV39H1.

• Гистоновая деацетилаза

• белок HDAC9 +, + человеческий в Национальной библиотеке США of Medicine Медицинские предметные заголовки (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, которая находится в общественном достоянии.