Винкулин

редактировать
VCL
Белка VCL PDB 1qkr.png
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы VCL, CMD1W, CMH15, HEL114, MV, Mvinculin
Внешние идентификаторыOMIM: 193065 MGI: 98927 HomoloGene: 7594 Генные карты: VCL
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человека)
Chr. Хромосома 10 (человек)
Хромосома 10 (человека) Геномное расположение VCL Геномное расположение VCL
Полоса 10q22.2Начало73,995,193 bp
Конец74,121,363 bp
Экспрессия РНК паттерн
PBB GE VCL 200930 s at fs.png .. PBB GE VCL 200931 s в fs.png
Дополнительные эталонные данные по экспрессии
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

7414

22330

Ensembl

ENSG00000035403

ENSMUSG00000021823

UniProt

P18206

Q64727

RefSeq (mRNA)

RefSeq (mRNA) NM_003373. NM_014000

NM_009502

RefSeq (белок)

NP_003364. NP_054706

NP_033528

Местоположение (UCSC)Chr 10: 74 - 74,12 Мб Chr 14 : 20.93 - 21.03 Мб PubMed поискВикиданные
V iew / Edit Human View / Edit Mouse
Винкулин - это глобулярный белок размером примерно 115 x 85 x 65 ангстрем в линейном измерении.

В клетках млекопитающих винкулин представляет собой белок мембранно-цитоскелета. в бляшках фокальной адгезии, который участвует в связывании адгезионных молекул интегрина с актином цитоскелетом. Винкулин представляет собой белок цитоскелета, связанный с соединениями клетка-клетка и клетка-матрица, где, как полагают, он функционирует как один из нескольких взаимодействующих белков, участвующих в прикреплении F-актина к мембране.

Обнаруженная независимо Бенни Гейгером и Китом Берриджем, его последовательность на 20% -30% аналогична α- катенину, который выполняет аналогичную функцию.

Связывание поочередно с талином или α-актинином, форма винкулина и, как следствие, его связывающие свойства изменяются. Ген винкулина существует в виде единственной копии и, по-видимому, не близок к тому, чтобы брать на себя функции в его отсутствие. Его вариант сплайсинга метавинкулин (см. Ниже) также нуждается в винкулине для гетеродимеризации и работы зависимым образом.

Содержание
  • 1 Структура
  • 2 Механизм и функция
  • 3 Активация
  • 4 Сайт связывания
  • 5 Варианты сплайсинга
  • 6 Взаимодействия
  • 7 Ссылки
  • 8 Дополнительная литература
  • 9 Внешние ссылки
Структура

Винкулин представляет собой белок цитоскелета массой 117 кДа с 1066 аминокислотами. Белок содержит кислый N-концевой домен и основной C-концевой домен, разделенные средним сегментом, обогащенным пролином. Винкулин состоит из глобулярного головного домена, который содержит сайты связывания талина и α-актинина, а также сайт фосфорилирования тирозина, тогда как хвостовая область содержит сайты связывания для F-актина, паксиллина и липидов..

По сути, имеется N-концевая головка из 835 аминокислот, которая разделена на четыре домена. Он связан с С-концевым хвостом с линкерной областью.

Недавнее открытие трехмерной структуры проливает свет на то, как этот белок адаптирует свою форму для выполнения множества функций. Например, винкулин может контролировать подвижность клетки, просто изменяя ее форму с активной на неактивную. В «неактивном» состоянии винкулин характеризуется взаимодействием между его головным и хвостовым доменами. И при преобразовании в «активную» форму, например, когда талин запускает связывание, внутримолекулярное взаимодействие между хвостом и головой прерывается. Другими словами, когда сайты связывания талина (VBS) α-спиралей связываются со структурой спирального пучка в головном домене винкулина, инициируется «преобразование спирального пучка», которое приводит к реорганизации α-спиралей (α1- α- 4), в результате чего получилась совершенно новая пятиспиральная структура пучка. Эта функция также распространяется на раковые клетки и регулирует их перемещение и распространение рака на другие части тела.

Механизм и функция

Распространение и перемещение клеток происходит в процессе связывания рецепторов интегрина на поверхности клетки с адгезионными молекулами внеклеточного матрикса. Винкулин связан с очаговой адгезией и адгезионными соединениями, которые представляют собой комплексы, образующие ядра актиновых филаментов и сшивающих агентов между внешней средой, плазматической мембраной и актиновым цитоскелетом. Комплекс очаговых спаек состоит из нескольких белков, таких как винкулин, α-актинин, паксиллин и талин, на внутриклеточной поверхности плазматической мембраны.

Говоря более конкретно, амино-конец винкулина связывается с талином, который, в свою очередь, связывается с β-интегринами, а карбокси-конец связывается с актином, фосфолипидами и гомодимерами, образующими паксиллин. Связывание винкулина с талином и актином регулируется полифосфоинозитидами и ингибируется кислыми фосфолипидами. Затем комплекс служит для закрепления актиновых нитей на мембране и, таким образом, помогает усилить силу, действующую на талин в очаговых адгезиях.

Потеря винкулина влияет на множество клеточных функций; он нарушает образование комплекса и предотвращает адгезию и распространение клеток. Отсутствие белка демонстрирует уменьшение распространения клеток, сопровождающееся уменьшением образования стрессовых волокон, образованием меньшего количества фокальных спаек и ингибированием роста ламеллиподий. Было обнаружено, что клетки, дефицитные по винкулину, имеют ростовые конусы, которые продвигаются медленнее, а также филоподии и ламеллипоиды, которые менее стабильны, чем клетки дикого типа. На основании исследований было высказано предположение, что недостаток винкулина может снизить адгезию клеток за счет ингибирования сборки очаговой адгезии и предотвращения полимеризации актина. С другой стороны, сверхэкспрессия винкулина может восстанавливать адгезию и распространение, способствуя привлечению цитоскелетных белков к фокальному адгезионному комплексу в месте связывания интегрина. Способность винкулина взаимодействовать с интегринами цитоскелета при очаговой адгезии, по-видимому, имеет решающее значение для контроля механики цитоскелета, распространения клеток и образования ламеллиподий. Таким образом, винкулин, по-видимому, играет ключевую роль в контроле формы, основываясь на его способности модулировать структуру и функцию фокальной адгезии.

Активация

Винкулин находится в равновесии между активным и неактивным состояниями. Активное состояние запускается после привязки к назначенному партнеру. Эти изменения происходят, когда винкулин взаимодействует с очагами адгезии, с которыми он связывается. Когда винкулин находится в неактивной форме, белок сохраняется в цитоплазме, в отличие от точек фокальной адгезии, связанных из активного состояния. Считается, что молекула талин является основным инициатором активации винкулина из-за ее присутствия в фокальных комплексах. Комбинаторная модель винкулина утверждает, что либо α-актинин, либо талин может активировать винкулин либо отдельно, либо с помощью PIP2 или актина. Эта активация происходит путем разделения соединения голова-хвост внутри неактивного винкулина.

Сайт связывания
VBS
PDB 1rkc EBI.jpg голова винкулина человека (1-258) в комплексе с сайтом связывания винкулина 3 талина (остатки 1944 г.) -1969)
Идентификаторы
СимволVBS
Pfam PF08913
InterPro IPR015009

Винкулин сайты связывания преимущественно обнаруживаются в талине и талин-подобных молекулах, обеспечивая связывание винкулина в талин, стабилизируя опосредованные интегрином соединения клеточного матрикса. Талин, в свою очередь, связывает интегрины с актином цитоскелетом. Консенсусная последовательность для сайтов связывания винкулина представляет собой LxxAAxxVAxxVxxLIxxA с предсказанием вторичной структуры четырех амфипатических спиралей. гидрофобные остатки, которые определяют VBS, сами по себе «замаскированы» и скрыты в сердцевине серии спиральных пучков, составляющих стержень талина.

Варианты сращивания

Гладкие мышцы и скелетные мышцы (и, вероятно, в меньшей степени в сердечной мышце ) в их хорошо- дифференцированных (сократительное) состояние коэкспрессирует (вместе с винкулином) вариант сплайсинга, несущий дополнительный экзон в 3'-кодирующей области, таким образом кодируя более длинную изоформу мета винкулин (мета VCL) с молекулярной массой ~ 150 кД - белок, о существовании которого известно с 1980-х годов. Трансляция дополнительного экзона вызывает вставку, содержащую от 68 до 79 аминокислот, между спиралями I и II в С-концевом хвостовом домене. Мутации в области вставки коррелируют с наследственной идиопатической дилатационной кардиомиопатией.

Длина вставки в метавинкулине составляет 68 AA у млекопитающих и 79 у лягушек. Сравнивали последовательности метавинкулина от свиньи, человека, курицы и лягушки и обнаружили, что вставка является двудольной: первая часть вариабельна, а вторая высококонсервативна. Обе изоформы винкулина совместно локализуются в мышечных адгезивных структурах, таких как плотные бляшки в гладких мышцах, интеркалированные диски в кардиомиоцитах и костамерах в скелетных мышцах. Хвостовой домен метавинкулина имеет меньшее сродство к голове по сравнению с хвостовым винкулином. В случае метавинкулина разворачивание С-концевой гидрофобной шпильочной петли хвостового домена нарушается отрицательными зарядами 68-аминокислотной вставки, таким образом, требуется активированная фосфолипидом обычная изоформа винкулина для полной активации молекулы метавинкулина.

Взаимодействия

Винкулин взаимодействует с:

в случаях Избыточный бактериальный рост в тонком кишечнике, представленный как СРК симптомы, выявлено, что антитела против CdtB влияют на функцию винкулина, которая необходима для моторики кишечника.

Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P18206 (Human Винкулин) в PDBe-KB.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q64727 (Винкулин мышиный) в PDBe-KB.
Последняя правка сделана 2021-06-18 14:04:10
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте