Гаплогруппа C-M130

редактировать

Гаплогруппа C
Возможное время происхождения	53000 лет назад [1]
Возможное место происхождения	Юго-Западная Азия, Юго-Восточная Азия или Средняя Азия
Предок	CF
Потомки	C1 F3393 / Z1426 (ранее CxC3). C2 (ранее C3 *) M217
Определение мутаций	M130 / RPS4Y 711, P184, P255, P260

Гаплогруппа C является основной Y- хромосома гаплогруппа, определяемая UEP M130 / RPS4Y 711, P184, P255 и P260, которые все мутации SNP. Это одна из двух основных ветвей гаплогруппы CF наряду с гаплогруппой F. Гаплогруппа C встречается у древних народов на всех континентах, кроме Африки, и является преобладающей гаплогруппой Y-ДНК среди мужчин, принадлежащих ко многим народам, коренным народом Восточной Азии, Центральной Азии, Сибири., Северная Америка и Австралия, а также древние и современные народы в Европе, Леванте и Японии. Гаплогруппа также встречается с умеренной или низкой частотой среди многих современных популяций Юго-Восточной Азии, Южной Азии и Юго-Западной Азии.

В дополнение к основным парагруппа C *, эта гаплогруппа теперь имеет две основные ветви: C1 (F3393 / Z1426; ранее CxC3, т.е. старый C1, старый C2, старый C4, старый C5 и старый C6) и C2 (M217; бывший C3).

Содержание

1 Происхождение
2 Структура
3 Распространение
4 Филогенетика
- 4.1 Филогенетическая история
  - 4.1.1 Научные публикации
5 Известные члены
6 См. Также
- 6.1 Генетика
- 6.2 Субклады Y-ДНК C
- 6.3 Дерево позвоночника Y-ДНК
7 Ссылки
8 Внешние ссылки

Происхождение

Предполагаемый корень миграции гаплогруппы C

Гаплогруппа C-M130, по-видимому, возникла вскоре после того, как мутация SNP M168 произошла впервые, в результате чего появилась современная гаплогруппа CT, из которой гаплогруппа CF, и, в свою очередь, гаплогруппа C, производная. Вероятно, это было не менее 60 000 лет назад.

Гаплогруппа C-M130 наиболее часто встречается среди коренных популяций Казахстана, Монголии, Дальнего Востока России, Полинезия, Австралия и с умеренной частотой в Корее и маньчжурах. Таким образом, предполагается, что гаплогруппа C-M130 возникла или прошла самый длительный период эволюции в регионе Центральной Азии или в прибрежных регионах Юго-Западной Азии. Предполагается, что его распространение в Восточной Азии началось примерно 40 000 лет назад.

Считается, что самцы, несущие C-M130, мигрировали в Америку около 6000-8000 лет назад и были перенесены народами, говорящими на на-дене, на северо-западном побережье Тихого океана Северной Америки.

Азия также является районом, в котором сосредоточена гаплогруппа D-M174. Тем не менее, D-M174 более тесно связан с гаплогруппой E, чем с C-M130, и географическое распределение гаплогрупп C-M130 и D-M174 полностью и совершенно различно, при этом различные подтипы гаплогруппы C-M130 встречаются с высокой частотой среди современные казахи и монголы а также некоторые коренные народы Америки, маньчжуры. Он также встречается со средней частотой у корейцев, коренных жителей Дальнего Востока, австралийских аборигенов и с умеренной частотой в других частях Азии и Океании, включая Юго-Восток. Азия. Носители гаплогруппы C у древних людей дзёмон Японии и европейцев эпохи палеолита и неолита носили C1a, C1b и C1a2. Принимая во внимание, что гаплогруппа D часто встречается только у тибетцев, японцев и жителей Андаманских островов, и не была обнаружена ни в Индии, ни у коренных жителей Америки или Океании.

Согласно Сакитани и др., гаплогруппа C-M130 возникла в Западной Азии и распространилась оттуда в другие части Евразии и в части Австралии. Предполагается, что C-M130 был обнаружен у кроманьонцев охотников-собирателей, а также в древних образцах Западной и Юго-Западной Азии.

Структура

C * (M130 / Page51 / RPS4Y711, M216)

C1 (F3393)
- C1a (CTS11043)
  - C1a1 (M8)
    - C1a1a (P121)
      - C1a1a1 (CTS9336)
        C1a1a1a (CTS6678) Япония, Южная Корея (Сеул)
        C1a1a1b (Z1356) Япония
      - C1a1a2 (Z45460) Китай (Ляонин)
  - C1a2 (ранее C6) - (V20)
    - C1a2a (V182)
      - C1a2a1 (V222)
      - C1a2a2 (Z29329)
    - C1a2b (Z38888)
- C1b (F1370)
  - C1b1 (K281)
    - C1b1a (B66 / Z16458)
      - C1b1a1 (ранее C5) - (M356)
      - C1b1a2 (B65)
  - C1b2 (B477 / Z31885)
    - C1b2a (ранее C2) - (M38)
      - C1b2a1 (M208)
        C1b2a1a (P33)
        C1b2a1b (P54)
    - C1b2b (ранее C4) - (M347)
      - C1b2b1 (M210)
C2 (ранее C3) - (M217)
- C2a (M93)
- C2b (L1373 / F1396)
  - C2b1
    - C2b1a
      - C2b1a1
        C2b1a1a (P39)
      - C2b1a2 (ранее C3c) - (M48)
- C2c (C-F1067)
  - C2c1 (F2613 / Z1338)
    - C2c1a (Z1300)
      - C2c1a1
        C2c1a1a
        C2c1a1a1 (M407)
Другие, нетаксономизированные субклады :
- C-P343 : вне C1a1 (M8), C1b2a (M38), C1b1a1 (ранее C5; M356), C1b2b (ранее C4; M347) и C2 (бывший C3; M217), но его связь с другими ветвями еще не проверена.
- C-P55 : вне C1b2a (M38), но его связь с другими ветвями еще не проверена, и;

(Вышеупомянутая филогенетическая структура субкладов гаплогруппы C-M130 основана на дереве ISOGG 2015, дереве YCC 2008 и последующих опубликованных исследованиях.)

Распространение

Прогнозируемое пространственное частотное распределение для гаплогруппы C в Восточной Азии.

Распространение гаплогруппы C-M130 обычно ограничено популяциями Сибири, некоторых частей Восточной Азии, Океании и Америки. Из-за огромного возраста гаплогруппы C, многочисленные вторичные мутации успели накопиться, и были идентифицированы многие регионально важные подветвления гаплогруппы C-M130.

До 46% австралийских аборигенов несли либо базальный C * (C-M130 *), C1b2b * (C-M347 *) или C1b2b1 (C-M210), до контакта с европейцами и значительной иммиграции европейцев, согласно исследованию 2015 года, проведенному Nagle et al. То есть 20,0% Y-хромосом 657 современных людей, прежде чем 56% этих образцов были исключены как «некоренные». C-M130 *, по-видимому, до колонизации носили до 2,7% самцов аборигенов; 43% имели C-M347, который не был обнаружен за пределами Австралии. Другие гаплогруппы австралийских аборигенов похожи на папуасов или других негритосов (гаплогруппа S-M230 и M-P256 ).

Низкие уровни C-M130 * переносятся мужчинами:

из Индийский субконтинент, Шри-Ланка и Юго-Восточная Азия, и;
в Европе среди мужчин с фамилией Ллах, происходящее из Гарроча, Каталония, Испания (но не мужчины с такой же фамилией из других регионов).

Базальный C1a * (CTS11043) был обнаружен у европейцев верхнего палеолита (ориньяк ), GoyetQ116-1 и Pestera Muerii2.

C1b был обнаружен в доисторических останках, датируемых 34000 лет назад, найденных в России и известная как «Костенки 14 ".

Гаплогруппа C2 (M217) - самая многочисленная и широко рассредоточенная линия передачи C - которая, как полагают, возникла в Юго-Западе / Центральной Азии и распространилась оттуда в Северную Азию и Америку. C-M217 простирается в продольном направлении от Центральная Европа и Турция, народа вайю из Колумбии и Венесуэлы, а также в широтном направлении от Атабаски народы Аляски до Вьетнама до Малайского архипелага. В низких концентрациях обнаружен в Восточной Европе, где он может быть наследием вторжений / миграций гуннов, тюрков и / или монголов в средние века. На особо высоких частотах встречается у бурят, дауров, хазарейцев, ительменов, калмыков, коряков., маньчжуры, монголы, орокены и сибы, с умеренным распространением среди других тунгусских народов, корейцы, айны, нивхи, алтайцы, тувинцы, узбеки, Хань Китая, Туцзя, Хани и Хуэй. Самые высокие частоты гаплогруппы C-M217 обнаружены среди населения Монголии и Дальнего Востока России, где это модальная гаплогруппа. Гаплогруппа C-M217 - единственная разновидность гаплогруппы C-M130, обнаруженная среди коренных американцев, среди которых она достигает своей максимальной частоты в популяциях на-дене.

Другие субклады специфичны для определенных групп населения в пределах ограниченного географического диапазона; даже там, где встречаются эти другие ветви, они, как правило, проявляются как очень низкочастотный второстепенный компонент палитры разнообразия Y-хромосомы на этих территориях:

C-M8 (C1a1), теперь встречается регулярно только с низкой частотой (приблизительно 5%; диапазон 3,3% - 10% всех образцов) в Японии. Он также был обнаружен в академическом исследовании у одного человека на острове Чеджу и в ходе коммерческого тестирования у одного человека, который сообщил о своем происхождении из провинции Ляонин в Китае, и одного человека, который сообщил о своем происхождении из Сеула. У древних людей Дзёмон частота встречаемости C1a1 составляла около 30%.
C-V20 (C1a2; ранее C6) встречается с низкой частотой среди южных европейцев. Останки 7000-летнего охотника-собирателя из Ла-Брана (современный Астурия, Испания) несли его, и C1a2 также присутствовал в Венгрии в примерно в то же время. В 2016 году 35000-летние останки охотника-собирателя из пещер Гойет (Намюр, Бельгия) и 30-тысячные останки охотника-собирателя из Долни Вестонице (Вестонице16, Моравия, Чешская Республика) были обнаружены с этой гаплогруппой.
C-B66 / Z16458 (C1b1a) встречается на низких частотах в юге Азия, Центральная Азия и Юго-Западная Азия.
C-M356 (C1b1a1; ранее C5) обнаруживался с низкой частотой в выборках из Индии, Непал, Пакистан, Афганистан, Аравия и северный Китай.
C-M38 (C1b2a; ранее C2), среди некоторых местных жителей в пределах Индонезии, Меланезии (особенно Новой Гвинеи ), Микронезии и некоторых островов Полинезия, C-M38 стала модальной гаплогруппой, вероятно, из-за серьезных эффектов основателя и генетического дрейфа.
C-P33 (C1b2a1a): встречается с высокой частотой среди Полинезийский мужчины.
C-P55 (C1b3) встречается с низкой частотой в Highlands Новой Гвинеи.
C-M93 (C2a) спорадически встречается у японцев.
C- L1373 / F1396 (C2b) был обнаружен в Центральной Азии.
C-P39 (C2b1a1a) встречается у нескольких коренных народов Северной Америки, в том числе у некоторых на-дене -, Алгонкинское и сиуанское население.
C-M48 (C2b1b; ранее C3c) часто встречается у северных тунгусских народов, казахов, ойратов, калмыков, монголов, юкагиры, нивхи, коряки, ительмены и удегеи, с умеренным распространением среди южных Тунгусские народы, буряты, тувинцы, якуты, чукчи, кыргызы, Уйгуры, узбеки, каракалпаки и таджики.
C-P53.1 (C2c) проживают примерно на 10% жителей Синьцзяна Сибе мужчин, с низкой частотой в Монголии и среди эвенков, Нинся хуэй, сизан тибетцев, синьцзян уйгур и Ганьсу Хан.
C-F2613 / Z1338 (C2e): и Центральная Азия, и Восточная Азия.
C-M407 (C2e1a1a) часто обнаруживается среди бурят, сойоты и хамниганы, умеренная частота среди прочих монголов и калмыков, и l Частота слов на армянском, бай, камбоджийском, ханьском китайском, японском, казахском, корейцы, маньчжуры, туцзя, уйгуры и якуты популяции.
C-P343 чаще встречается у мужчин из Lembata (17,4% из 92 выборок), с более низкой частотой в Flores, Pantar и Тимор. P343 находится за пределами C1a1 (M8), C1b2a (M38), C2 (ex-C3; M217), C1b2b (ранее C4; M347) или C1b1a1 (ранее C5; M356), но его связь с другими ветвями еще не проверена.
Неуказанные экземпляры C-M130, которые, возможно, могут принадлежать к одному из вышеуказанных субкладов, включают:
- Kayser et al. (2006) обнаружили C-M130 (xM38, 390.1del, M217) в 10,3% (4/39) образца из Филиппин, 10,0% (6/60) образца из Arnhem Land, 6,5% (2/31) образца из Nusa Tenggara, 5,3% (3/57) образца из Суматры, 3,0% (1/33) образца из побережья Папуа-Новой Гвинеи, 2,9% (1/34) образца из Молуккских островов, 1,9% (1/53) образца из Явы и 0,9% (1/107) образца из Фиджи.
- C-RPS4Y (теперь C-RPS4Y 711) (xM38) Y-ДНК довольно распространена среди населения индонезийской провинции Восточная Нуса-Тенггара и независимого Восточного Тимора. : 13/31 = 41,9% Лембата, 16/71 = 22,5% Флорес, 5/43 = 11,6% Солор, 10/96 = 10,4% Адонара, 3/39 = 7,7% Восточный Тимор, 1/26 = 3,8% Алор, 1/38 = 2,6% Пантар. Все индивидуумы C-RPS4Y (xM38), кроме синглтона из Алора, были описаны как австронезийские говорящие.
- C-RPS4Y (теперь C-RPS4Y 711) (xM38, M217) Y-ДНК встречается, согласно исследованию, опубликованному в 2010 году, с довольно высокой частотой в большинстве популяций центральной Индонезии (115/394 = 29,2% Флорес, 21/92 = 22,8% Lembata, 19 / 86 = 22,1% Борнео, 6/54 = 11,1% Мандар, 1/9 = 11,1% Тимора, но только 1/350 = 0,3% Сумба). C-RPS4Y (xM38, M217) Y-ДНК обычно становится редкостью на западе (2/61 = 3,3% Ява, 1/32 = 3,1% Малайзия, 9/641 = 1,4% балийцев, 0/38 Батак Тоба, 0 / 60 Ниас, но 10/74 = 13,5% Ментаваи) и к востоку (1/28 = 3,6% Алора, 0/30 Молуккских островов, 1/15 = 6,7% Побережье PNG, 0/33 Хайленд PNG, 0/10 Насиои, 0/44 Маэво (Вануату), 1/16 = 6,3% Микронезия, 0/64 Полинезия).
- C-RPS4Y 711 (xM8, M217) Y-ДНК была обнаружена в 17% (6/35) выборки Яо из Бама, Гуанси в южно-центральном Китае, 4/35 = 11% выборки Хуэй и 2/70 = 3% от пары выборок уйгуров из северо-западного Китая, и 3/45 = 7% выборки Хэчжэ и 1/26 = 4% выборки Ewenki из северо-восточного Китая.
- C-RPS4Y 711 (xM8, M38, M217) обнаружен в 48,5% (16/33) из выборки коренных австралийцев, 20% (12/60) из выборки яо, 6,1% (3/49) из выборки Туцзя, 5,9% (1/17) из выборки Микронезийцы, 5,5% (3/55) выборки восточных индонезийцев, 4,0% (1/25) выборки западных индонезийцев, 3,3% (3/91) выборки ланкийцы, 3,1% (1/32) из выборки малайцев, 2,5% (10/405) из выборки индейцев, 2,2% ( 1/46) выборки жителей Папуа-Новой Гвинеи, 1,7% (1/58) выборки мяо и 1,5% (1/67) выборки Уйгуры.
- Чжун и др. (2010) обнаружили Y-ДНК C-M130 (xM8, M38, M217, M347, M356, P55) в 9,09% (1/11) образца Мулао из Гуанси, 8,20% (5/61) образца. Хуэй из Нинся, 7,96% (9/113) образца Яо из Гуанси, 7,69% (2/26) образца Туцзя из Хубэй, 6,90% (2/29) образца Шуй из Гуйчжоу, 3,28% (2/61) образца Xibe из Синьцзяна, 1,45% (1/69) образца Zhuang из Гуанси, 0,92% (1/109) образца Buyi из Гуйчжоу, 0,87% (2 / 231) образца Хань из Гуйчжоу и 0,74% (1/136) образца Хань из Юньнани. Большинство этих людей имеют одинаковый гаплотип Y-STR из 8 локусов: DYS19 = 15, DYS389I = 12, DYS389b = 16, DYS388 = 13, DYS390 = 21, DYS391 = 10, DYS392 = 11, DYS393 = 12. <226.>
- Ди Кристофаро и др. (2013) обнаружили C-M130 (xC2-PK2 / M386, C1b1a1-M356) в 1,9% (1/53) выборки пуштунов из Кундуза, Афганистан и в 1,4% (1/69) выборки хазарейцев. из Бамиана, Афганистан.
- Wang et al. (2014) обнаружили C-M130 (xM105, M38, M217, M347, M356) в 5,6% (1/18) образца Хорпа Цян из округа Данба провинции Сычуань, Китай и в 2,2% (1/46) образец тибетцев кхамов из уезда Синьлун провинции Сычуань, Китай. Гаплотипы Y-STR этих двух индивидов соответствуют модальному гаплотипу C * из исследования Zhong et al. (2010) во всех сопоставимых локусах.
- «C-M216», SNP, который теперь считается синонимом C-M130 - (xM8, M38, M217, M210, M356), был обнаружен в 3,9% (3/77) из выборки населения Катманду, Непал. Другие примеры C-M216 были зарегистрированы среди монголов и тюркских народов, включая: джалары, татары, казахи., крымские татары, меркиты, джучиды и узбеки ;

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем именования Филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (Сокращение)	(α)	(β)	(γ)	(δ)	(ε)	(ζ)	( η)	YCC 2002 (от руки)	YCC 2005 (от руки)	YCC 2008 (от руки)	YCC 2010r (от руки)	ISOGG 2006	ISOGG 2007	ISOGG 2008	ISOGG 2009	ISOGG 2010	ISOGG 2011	ISOGG 2012
C-M216	10	V	1F	16	Eu6	H1	C	C*	C	C	C	C	C	C	C	C	C	C
C-M8	10	V	1F	19	Eu6	H1	C	C1	C1	C1	C1	C1	C1	C1	C1	C1	C1	C1
	10	V	1F	16	Eu6	H1	C	C2 *	C2	C2	C2	C2	C2	C2	C2	C2	C2	C2
	10	V	1F	18	Eu6	H1	C	C2a	C2a	C2a1	C2a1	C2a	C2a	C2a1	C2a1	C2a1	удалено	удалено
	10	V	1F	17	Eu6	H1	C	C3 *	C3	C3	C3	C3	C3	C3	C3	C3	C3	C3
	10	V	1F	17	Eu6	H1	C	C3a	C3a	C3a	C3a	C3a	C3a	C3a	C3a	C3a	C3a	C3a1
	10	V	1F	17	Eu6	H1	C	C3b	C2b	C2a	C2a	C2b	C2b	C2a	C2a	C2a	C2a	C2a
	36	V	1F	17	Eu6	H1	C	C3c	C2c	C4a	C4a	C4b	C4b	C4a	C4a	C4a	C4a	C4a

Research publ ications

Следующие исследовательские группы в своих публикациях были представлены в создании Дерева YCC.

αДжоблинг и Тайлер-Смит 2000 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFJobling_and_Tyler-Smitdiv class="ht"000 (help ) и Каладжиева 2001 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFKaladjieva2001 (help )
βUnderhill 2000 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFUnderhill2000 (help )
γHammer 2001 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFHammer2001 (help )
δKarafet 2001 harvnb ошибка: нет цели: CITEREFKarafet2001 (help )
εSemino 2000 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFSemino2000 (help )
ζSu 1999 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFSu1999 (help )
ηCapelli 2001 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFCapelli2001 (help )

Известные члены

Один конкретный гаплотип в гаплогруппе C-M217 получил отличную оценку Особое внимание уделяется возможности того, что он может представлять прямое отцовство происхождение от Чингисхана.

Исследовательская статья, опубликованная в 2017 г. - «Генетический след ранних миграций Айсин Гиоро, императорского дома ци династия нг "подтвердила, что клан Айсин Гиоро принадлежит к гаплогруппе C3b1a3a2-F8951, братской ветви C3 * -звездного скопления (в настоящее время называемого C3b1a3a1-F3796, когда-то связанного с Чингисханом ).

См. Также