Гаплогруппа E-M96

Гаплогруппа E
Возможное время происхождения	65 тыс. Лет, 69 тыс. Лет или около 73 тыс. Лет
Возможное место происхождения	Восточная Африка или Западная Азия
Предок	DE
Потомки	E-P147, E-M75
Определение мутаций	L339, L614, M40 / SRY4064 / SRY8299, M96, P29, P150, P152, P154, P155, P156, P162, P168, P169, P170, P171, P172, P173, P174, P175, P176

Гаплогруппа E-M96 представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы человека. Это одна из двух основных ветвей более старой и наследственной гаплогруппы DE, другой главной ветвью является гаплогруппа D. Класс E-M96 разделен на два основных субклада : более распространенный E-P147 и менее распространенный E-M75.

Содержание

• 1 Происхождение
• 2 Распространение
• 3 субклада
  • 3.1 E-M96 *
  • 3.2 E-P147
  • 3.3 E-M75
• 4 Филогенетика
  • 4.1 Филогенетическая история
    • 4.1.1 Исследования публикации
  • 4.2 Филогенетические деревья
• 5 См. также
  • 5.1 Генетика
  • 5.2 Субклады Y-ДНК E
  • 5.3 Древо остова Y-ДНК
• 6 Примечания
• 7 Дополнительная литература
• 8 Внешние ссылки
  • 8.1 Филогенетическое дерево и карты распространения гаплогруппы E Y-ДНК
  • 8.2 Проекты

Истоки

Андерхилл (2001) предположил, что гаплогруппа E могла возникнуть в Восточной Африке. Некоторые авторы, такие как Чандрасекар (2007), принимают более раннюю позицию Хаммера (1997) о том, что гаплогруппа E могла возникнуть в Азии, учитывая, что:

• E является кладой гаплогруппы DE, с другими основными клада, гаплогруппа D, распространенная исключительно в Азии.
• DE является кладой в пределах M168 с двумя другими основными кладами, C и F, которые, как считается, имеют Евразийское происхождение.

Однако считается, что несколько открытий, сделанных после статей Хаммера, делают азиатское происхождение менее вероятным:

1. Андерхилл и Кивисилд (2007) продемонстрировали, что C и F имеют общее значение предка у DE есть только один родной брат, не являющийся африканцем.
2. DE * встречается как в Азии, так и в Африке, что означает, что не только один, но и несколько братьев и сестер D находятся в Азии и Африке.
3. Карафет (2008), в котором Хаммер является соавтором, значительно изменил оценки времени, что привело к «новым интерпретациям географического происхождения древних подкладов». Помимо прочего, в этой статье предлагается гораздо более старый возраст для гаплогруппы E-M96, чем считалось ранее, что дает ей возраст, аналогичный возрасту гаплогруппы D и самой DE, а это означает, что больше нет веских оснований рассматривать ее как ответвление DE, который должен был произойти спустя много времени после того, как DE возник и вошел в Азию.

В 2015 году Позник и Андерхилл заявили, что гаплогруппа E возникла за пределами Африки, утверждая, что «для этой модели географической сегрегации в кладе CT требуется только одна континентальная группа. обмен гаплогруппами (E в Африку), а не три (D, C и F из Африки). Время этого предполагаемого возвращения в Африку, между появлением гаплогруппы E и ее дифференциацией в Африке на 58 тысяч лет назад, согласуется с предложения, основанные на данных о хромосомах, отличных от Y, об обильном потоке генов между Африкой и Аравией 50–80 тыс. лет назад ».

В 2015 г. Trobetta et al. предположил восточноафриканское происхождение гаплогруппы E, заявив: «наш филогеографический анализ, основанный на тысячах образцов по всему миру, предполагает, что излучение гаплогруппы E началось около 58 тыс. лет назад где-то в Африке к югу от Сахары, с более высокой апостериорной вероятностью (0,73). для восточноафриканского происхождения ».

Евразийский центр происхождения и расселения гаплогруппы E также был выдвинут Cabrera et al. (2018) на основании сходного возраста родительской гаплогруппы DE клады и гаплогруппы L3 мтДНК. Согласно этой гипотезе, после первоначальной миграции за пределы Африки ранних анатомически современных людей около 125 тыс. Лет назад предполагается, что самцы-носители E вернулись из места происхождения отцовской гаплогруппы в Евразии. около 70 тыс. лет назад вместе с женщинами, несущими материнскую гаплогруппу L3, которая, по предположению исследования, произошла из Евразии. Затем было высказано предположение, что эти новые евразийские линии в значительной степени заменили старые автохтонные мужские и женские африканские линии.

Исследование Haber et al. подтверждает африканское происхождение гаплогруппы E (на основе анализа филогенетической структуры Y-хромосомы, времени дивергенции гаплогруппы и недавно обнаруженной гаплогруппы D0, обнаруженной у трех нигерийцев, дополнительной ветви линии DE, рано расходящейся от ветви D). Авторы поддерживают африканское происхождение DE (родительской гаплогруппы E) с E и D0, также происходящими из Африки, наряду с миграцией из Африки трех линий (C, D и FT), которые в настоящее время составляют подавляющее большинство не- Африканские Y-хромосомы. Ранние даты расхождения, обнаруженные в исследовании для DE, E и D0 (все датируются примерно от 71 до 76 тыс. Лет назад), которые, как установлено, предшествуют миграции из Африки предков евразийцев (датируемых примерно 50 г. 60 тыс. Лет назад), авторы также считают, что они подтверждают африканское происхождение этих гаплогрупп.

Распространение

Большинство членов гаплогруппы E-M96 принадлежат к одному из ее идентифицированных субкладов, а E -M96 (xE-P147, E-M75) встречается редко. E1a и E-M75 встречаются почти исключительно в Африке. Глядя на основные частоты субклада, можно выделить пять обширных регионов Африки: Восток, Центральный, Север, Южный и Западный. Разделение можно различить по распространенности E-M2 в Восточной, Центральной, Южной и Западной Африке, E-M78 в Восточной Африке и E-M81 в Северной Африке. E-M2 - наиболее распространенный субклад E в Африке. Он наблюдается на высоких частотах во всех регионах Африки от умеренных до высоких. E-M243 (особенно его субклады M78 и M81) обнаруживается на высоких частотах в Северо-Восточной Африке и Северной Африке и является единственным субкладом, который находится в Европе и Азия на значительных частотах. E-M243 распространен среди афро-азиатских говорящих на Ближнем Востоке и Северной Африке, а также среди некоторых нило-сахарских и Нигер-Конго говорящие в Северо-Восточной Африке и Судане. E-M243 гораздо реже встречается в Западной, Центральной и Южной Африке, хотя он наблюдался среди некоторых койсанских носителей и среди нигерско-конголезских носителей в Сенегамбии, Гвинея-Бисау, Буркина-Фасо, Гана, Габон, Демократическая Республика Конго, Руанда, Намибия и Южная Африка.

Было обнаружено, что одна из различных докерамических неолитических окаменелостей B, которые были проанализированы на наличие древней ДНК, несли отцовская гаплогруппа E (xE2, E1a, E1b1a1a1c2c3b1, E1b1b1b1a1, E1b1b1b2b) (1/7; ~ 14%).

Субклады

E-M96 *

Парагруппа E -M96 * относится к линиям, принадлежащим к кладе E, но которые не могут быть отнесены к какой-либо известной ветви. E (xE1-P147, E2-M75) - то есть E, который дал отрицательный результат как на P147, так и на M75 - был зарегистрирован в 2 амхарах из Эфиопия, у 2 мужчин из Саудовская Аравия, и у одного говорящего на банту мужчины из Южной Африки. E (xE1a-M33, E1b1-P2, E2-M75) был зарегистрирован среди нескольких южноафриканских популяций и у одного египтянина; E (xE1a-M33, E1b1a1-M2, E1b1b-M215, E2-M75) наблюдался среди пигмеев и банту из Камеруна и Габона ; и E (xE1a-M33, E1b1a1-M2, E1b1b1-M35, E2-M75) был обнаружен у нескольких ливанцев в Буркина-Фасо, а также у человека фульбе из Нигера.

Недавно он было обнаружено, что 3 восточноафриканских мужчины, ранее классифицированные только как E * -M96, могут быть отнесены к новой ветви, E-V44, которая является сестринской ветвью E1-P147; E-P147 и E-V44 разделяют мутацию V3725, что делает E2-M75 и E-V3725 двумя известными первичными ветвями E. Неизвестно, упадут ли некоторые (или все) другие E * (xE1, E2). в V44.

E-P147

E-P147 (также известный как E1), безусловно, самая многочисленная и широко распространенная ветвь E-M96. Он имеет две основные ветви: E-M132 (E1a) и E-P177 (E1b).

Внутри гаплогруппы E-P177, гаплогруппа E-P2 (E1b1) - субклад E-P177 - не только наиболее частый вариант E-M96, но и самый распространенная линия Y-ДНК в Африке. Это также единственный субклад E-M96, обнаруженный в значительном количестве в Западной Азии и Европе.

Плодотворная первичная ветвь E-P2, гаплогруппа E-M215 (E1b1b) широко распространен от Восточной Африки, через Северной Африки до Западной Азии и Южной Европы. Он также встречается в значительных количествах среди населения, коренного в Южной Африке и по всей Западной Европе.

E-M75

E-M75, присутствует во всей субэкваториальной Африке, особенно в Великие африканские озера и Центральная Африка. Самая высокая концентрация гаплогруппы была обнаружена среди Alur (66,67%), Hema (38,89%), Rimaibe (27,03%), Мбути (25,00%), Даба (22,22%), Эвия (20,83%), Зулу (20,69%) и кенийец Bantus (17.24%).

Гаплогруппа E-M75 (xM41, M54) была обнаружена в 6% (1/18) из Dama из Намибия, 4% (1/26) из Ganda из Уганды, 3% (1/39) из Mandinka из Гамбии / Сенегала и 2% (1/49) из Шона из Зимбабве.

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе было по крайней мере семь систем именования для филогенетической Y-хромосомы. дерево. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

aa<216186>E3a5 216>E1b1a5E3b1a216>E1b1b1a3a<2161b E1b 186><2161b E1ab>III<2161>E1b1b1b1

YCC 2002/2008 (Сокращение)	(α)	(β)	(γ)	(δ)	(ε)	(ζ)	( η)	YCC 2002 (от руки)	YCC 2005 (от руки)	YCC 2008 (от руки)	YCC 2010r (от руки)	ISOGG 2006	ISOGG 2007	ISOGG 2008	ISOGG 2009	ISOGG 2010	ISOGG 2011	ISOGG 2012
E-P29	21	III	3A	13	Eu3	H2	B	E*	E	E	E	E	E	E	E	E	E	E
E-M33	21	III	3A	13	Eu3	H2	B	E1 *	E1	E1a	E1a	E1	E1	E1a	E1a	E1a	E1a	E1a
	21	III	3A	13	Eu3	H2	B	E1a	E1a	E1a1	E1a1	E1a	E1a	E1a1	E1a1	E1a1	E1a1	E1a1
E-M75	21	III	3A	13	Eu3	H2	B	E2a	E2	E2	E2	E2	E2	E2	E2	E2	E2	E2
	21	III	3A	13	Eu3	H2	B	E2b	E2b	E2b	E2b1	-	-	-	-	-	-	-
E-P2	25	III	4	14	Eu3	H2	B	E3 *	E3	E1b	E1b1	E3	E3	E1b1	E1b1	E1b1	E1b1	E1b1
E-M2	8	III	5	15	Eu2	H2	B	E3a*	E3a	E1b1	E1b1a	E3a	E3a	E1b1a	E1b1a	E1b1a	E1b1a1	E1b1a1
	8	III	5	15	Eu2	H2	B	E3a1	E3a1	E1b1a1	E1b1a1	E3a1	E3a1	E1b1a1	E1b1a1	E1b1a1	E1b1a1a1a	E1b1a1a1a
	8	III	5	15	Eu2	H2	B	E3a2	E1b1a2	E1b1a2	E3a2	E3a2	E1b1a2	E1b1a2	E1ba12	удалено	удалено
	8	III	5	15	Eu2	H2	B	E3a3	E3a3	E1b1a3	E1b1a3	E3a3	E3a3	E1b1a3	E1b1a3	E1b1a3	E1b1a1a1c	E1b1a1a1c 356>Eu2	H2	B	E3a4	E3a4	E1b1a4	E1b1a4	E3a4	E3a4	E1b1a4	E1b1a4	E1b1a4	E1b1a1a1g1c	E1b1a1a1g1c
	8	III	5	15	Eu2	H2	B	E3a5	E1b1a5	E3a5	E3a5	E1b1a5	E1b1a5	E1b1a5	E1b1a1a1d	E1b1a1a1d
	8	III	5	15	Eu2	H2	B	E3a6	E3a6	E1b1a6	E1b1a6	E3a6	E3a6	E1b1a6	E1b1a6	E1b1a6	E1b1a1a1e	E1b1a 418>E-M35	25	III	4	14	Eu4	H2	B	E3b *	E3b	E1b1b1	E1b1b1	E3b1	E3b1	E1b1b1	E1b1b1	E1b1b1	удалено	удалено
E-M78	25	III	4	14	Eu4	H2	B	E3b1 *	E3b1	E1b1b1a	E1b1b1a1	E3b1a	E3b1a	E1b1b1a 186>	E1b1b1a	E1b1b1a	E1b1b1a1	E1b1b1a1
	25	III	4	14	Eu4	H2	B	E3b1a	E3b1a	E1b1b1a1c1	E3b1a3a	E3b1a3a	E1b1b1a3a	E1b1b1a3a	E1b1b1a1a6a E1b1b1a2b6 E1b1b1a6a E1b1b1a1c1	E1b1b1a1c1
E-M81	25	III	4	14	Eu4	H2	B	E3b2*	E3b2	E1b1b1b	E3b1b	E3b1b	E1b1b1b	E1b1b1b	E1b1b1b	E1b1b1b1	4	14	Eu4	H2	B	E3b2a	E3b2a	E1b1b1b1	E1b1b1 b1a	E3b1b1	E3b1b1	E1b1b1b1	E1b1b1b1	E1b1b1b1	E1161b1b1b1a	E1b1b1b1b1a
	25	III	4	14	Eu4	H2	B	E3b2b	E3b2b	E1b1b1b2	E1b1b1b1b1	E3b1b2	E183b1b2	E1b1b1b2a	E1b1b1b2a	E1b1b1b2a	E1b1b1b2a	E1b1b1b1a2a
E3b	H2	B	E-M123 <35840>III *	E3b3	E1b1b1c	E1b1b1c	E3b1c	E3b1c	E1b1b1c	E1b1b1c	E1b1b1c	E1b1b1b2a
	25	III	4	14	Eu4	H2	B	E3b3a*	E3b3a	E1b1b1>	E1b1b1c1	E3b1c1	E3b1c1	E1b1b1c1	E1b1b1c1	E1b1b1c1	E1b1b1c1	E1b1b1c1		E1b1b1b2a1
	25	III	4	14	Eu4	H2	B	E3ba1	E3b3a1	E1b1b1c1a	E1b1b1c1a1	A186>	E3b1c E3b1c1a	E1b1b1c1a1	E1b1b1c1a1	E1b1b1c1a1	E1b1b1c1a1	E1b1b1b1a1	Публикации <1b1b1b420>Исследования Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании дерева YCC. αДжоблинг и Тайлер-Смит 2000 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFJobling_and_Tyler-Smith2000 (help ) и Каладжиева 2001 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFKaladjieva2001 (help ) βUnderhill 2000 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFUnderhill2000 (help ) γHammer 2001 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFHammer2001 (help ) δKarafet 2001 harvnb ошибка: нет цели: CITEREFKarafet2001 (help ) εSemino 2000 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFSemino2000 (help ) ζSu 1999 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFSu1999 (help ) ηCapelli 2001 harvnb error: нет цели: CITEREFCapelli2001 (help ) Филогенетические деревья Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано на дереве Консорциума Y-хромосомы (YCC), дерево гаплогруппы Y-ДНК ISOGG и последующие опубликованные исследования. E-M96 (L339, L614, M40 / SRY4064 / SRY8299, M96, P29, P150, P152, P154, P155, P156, P162, P168, P169, P170, P171, P172, P173, P174, P175, P176) E-P147 (P147) E-M33 (M33, M132) E-M44 (M44) E-P110 (P110) E-L94 (L94) E-L133 (L133 / PAGES00074) E-P177 (P177) E-P2 (DYS391p, P2 / PN2, P179, P180, P181) E-P75 (P75) E-M75 (M75, P68) E-M41 (M41) E-M54 (M54, M90, M98) E-M85 (M85) См. Также Викицитатник содержит цитаты, связанные кому: Гаплогруппа E-M96 Генетика Африканская примесь в Европе Генетическая генеалогия Гаплогруппа D Гаплогруппа DE Гаплогруппа Гаплотип Человек Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы Молекулярная филогенетика Парагруппа Субклада Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях мира Гаплогруппы Y-ДНК по этническим группам Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Африка к югу от Сахары субклады Y-ДНК E Гаплогруппа E-M123 Гаплогруппа E-M215 Гаплогруппа E-M33 Гаплогруппа E-M75 Гаплогруппа E-M96 Гаплогруппа E-P147 Гаплогруппа E-P177 Гаплогруппа E-P2 Гаплогруппа E-V12 Гаплогруппа E-V13 Гаплогруппа E-V22 Гаплогруппа E-M2 Гаплогруппа E-V68 Гаплогруппа E-Z827 Основное дерево Y-ДНК "Y-хромосома Адам " A00 A0-T A0 A1 A1a BT B CT DE CF D E C F GHIJK G HIJK IJK H IJ K I J LT K2 L T K2a K2b K-M2313 K2b1 P NO S M P1 N O Q R Примечания Дополнительная литература Arredi, B; Poloni, E; Paracchini, S; Зерджал, Т; Фатхаллах, D; Макрелуф, М; Паскали, V; Новеллетто, А; Тайлерсмит, С. (2004). «Преимущественно неолитическое происхождение вариации Y-хромосомы ДНК в Северной Африке». Американский журнал генетики человека. 75 (2): 338–45. doi : 10.1086 / 423147. PMC 1216069. PMID 15202071. Кручиани, Фульвио; Сантоламацца, Пьеро; Шен, Пейдун; Маколей, Винсент; Мораль, Педро; Олькерс, Антонель; Модиано, Дэвид; Холмс, Сьюзен; и другие. (2002). «Обратная миграция из Азии в Африку к югу от Сахары подтверждается анализом гаплотипов Y-хромосомы человека с высоким разрешением». Американский журнал генетики человека. 70 (5): 1197–214. doi : 10.1086 / 340257. PMC 447595. PMID 11910562. Cruciani, F; La Fratta, R.; Тромбетта, B; Santolamazza, P; Селлитто, Д; Colomb, EB; Dugoujon, JM; Crivellaro, F; и другие. (2007). «Прослеживание прошлых перемещений мужчин и мужчин в Северной / Восточной Африке и Западной Евразии: новые ключи к разгадке по гаплогруппам Y-хромосомы E-M78 и J-M12». Молекулярная биология и эволюция. 24 (6): 1300–11. doi : 10.1093 / molbev / msm049. PMID 17351267.См. Также Дополнительные данные. Hammer, MF; Блэкмер, Ф; Гарриган, Д; Нахман, МВт; Уайлдер, Дж. А. (2003). «Структура популяции человека и ее влияние на выборочную вариацию последовательности Y-хромосомы». Генетика. 164 (4): 1495–1509. PMC 1462677. PMID 12930755. Карафет, TM; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, SL; Хаммер, MF (май 2008 г.). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека». Геномные исследования. 18 (5): 830–8. doi : 10.1101 / gr.7172008. PMC 2336805. PMID 18385274.. Опубликовано в Интернете 2 апреля 2008 г. См. Также Дополнительные материалы. Понтикос Д. «Филогеографическое уточнение гаплогруппы E» http://dienekes.blogspot.ru/2015/07/phylogeographic-refinement-of.html Санчес, Джей Джей; Халленберг, К; Børsting, C; Эрнандес, А; Морлинг, Н. (2005). «Высокие частоты клонов Y-хромосомы, характеризующиеся E3b1, DYS19-11, DYS392-12 у сомалийских мужчин». Европейский журнал генетики человека. 13 (7): 856–866. doi : 10.1038 / sj.ejhg.5201390. PMID 15756297.. Опубликовано в Интернете 9 марта 2005 г. Тромбетта Б. «Филогеографические уточнения и крупномасштабное генотипирование гаплогруппы E Y-хромосомы человека позволяют по-новому взглянуть на рассредоточение ранних скотоводов на африканском континенте» http: // gbe. oxfordjournals.org/content/7/7/1940.long Wood ET (2005). «Контрастные модели вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: свидетельства предвзятых по полу демографических процессов». Европейский журнал генетики человека. 13 (7): 867–876. doi : 10.1038 / sj.ejhg.5201408. PMID 15856073. Внешние ссылки На Викискладе есть медиафайлы, связанные с гаплогруппой E Y-ДНК. Филогенетическое дерево и карты распределения гаплогруппы Y-ДНК E Гаплогруппа E Y-ДНК и ее субклады из ISOGG 2008 Карта распределения E1b1b1 в Европе Распределение E1b1a / E3a в Африке Распределение частот гаплогруппы E Y-ДНК и ее субкладов - с Видеоурок Проекты Проект Y-ДНК гаплогруппы E-V38 на FTDNA Проект Y-ДНК E-M243 на FTDNA Гаплозона :: Филогенетический проект E-M35 (бывший проект E3b) Еврейский проект E-M243 в FTDNA Последняя правка сделана 2021-05-22 13:08:58 Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное). Обратная связь: support@alphapedia.ru Соглашение О проекте