Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека

редактировать
Эта статья о гаплогруппе Y-ДНК человека. Для гаплогруппы мтДНК человека см гаплогруппу митохондриальной ДНК человека.

Филогения Y-ДНК человека и распределение гаплогрупп. * (а) Филогенетическое дерево. «кйа» означает «тысячу лет назад». * (b) Географическое распределение каждой гаплогруппы показано цветом. * (c) Географические обозначения цвета.

В области генетики человека, А человек У-хромосоме ДНК гаплогруппа является гаплогруппа определяется мутациями в не- рекомбинирующих участков ДНК от мужчину-специфической Y - хромосомы ( так называемой Y-ДНК). Многие люди внутри гаплогруппы имеют одинаковое количество коротких тандемных повторов (STR) и типов мутаций, называемых однонуклеотидными полиморфизмами (SNP).

Y-хромосома человека накапливает примерно две мутации на поколение. Гаплогруппы Y-ДНК представляют собой основные ветви филогенетического древа Y-хромосомы, которые имеют сотни или даже тысячи мутаций, уникальных для каждой гаплогруппы.

Самый недавний общий предок Y-хромосомы (Y-MRCA, неофициально известный как Y-хромосомный Адам ) является самым последним общим предком (MRCA), от которого все живущие в настоящее время люди произошли по отцовской линии. По оценкам, Адам с Y-хромосомой жил примерно 236 000 лет назад в Африке. Изучив другие узкие места, большинство евразийских мужчин (людей из популяций за пределами Африки) происходят от человека, который жил в Африке 69 000 лет назад ( E-M168 ). Другие основные узкие места возникли около 50 000 и 5 000 лет назад, и впоследствии происхождение большинства евразийских мужчин можно проследить до четырех предков, которые жили 50 000 лет назад и были потомками африканцев ( E-M168 ).

СОДЕРЖАНИЕ

  • 1 Соглашение об именах
  • 2 Филогенетическая структура
  • 3 основные гаплогруппы Y-ДНК
    • 3.1 Гаплогруппы A и B
    • 3.2 Гаплогруппа CT (P143)
    • 3.3 Гаплогруппа C (M130)
    • 3.4 Гаплогруппа D (CTS3946)
    • 3.5 Гаплогруппа E (M96)
    • 3.6 Гаплогруппа F (M89)
    • 3.7 Гаплогруппа G (M201)
    • 3.8 Гаплогруппа H (M69)
    • 3.9 Гаплогруппа I (M170)
    • 3.10 Гаплогруппа J (M304)
    • 3.11 Гаплогруппа K (M9)
    • 3.12 Гаплогруппы L и T (K1)
    • 3.13 Гаплогруппа K2 (K-M526)
    • 3.14 Гаплогруппы K2a, K2a1, NO и NO1
    • 3.15 Гаплогруппа N
    • 3.16 Гаплогруппа O
    • 3.17 Гаплогруппы K2b1, M amp; S
    • 3.18 Гаплогруппа P (K2b2)
    • 3.19 Гаплогруппа Q M242
    • 3.20 Гаплогруппа R (M207)
  • 4 Хронологическое развитие гаплогрупп
  • 5 См. Также
  • 6 Ссылки
  • 7 Дальнейшее чтение
  • 8 Внешние ссылки

Соглашение об именовании

Схематическая иллюстрация соглашения об именах гаплогрупп Y-ДНК. Гаплогруппы определяются через мутации (SNP).

Гаплогруппы Y-ДНК определяются наличием ряда маркеров SNP Y-ДНК. Субклады определяются терминальным SNP, самым нижним в филогенетическом дереве Y-хромосомы. Y Хромосома Консорциум (ККЙ) разработала систему именования основных гаплогрупп Y-ДНК с заглавными буквами от А до Т, с дальнейшими субкладами названных с использованием цифр и букв нижнего регистра (YCC от руки номенклатурного ). Сокращенная номенклатура YCC называет гаплогруппы Y-ДНК и их субклады с первой буквой основной гаплогруппы Y-ДНК, за которой следует тире и имя определяющего терминального SNP.

Номенклатура гаплогрупп Y-ДНК со временем меняется, чтобы соответствовать растущему количеству обнаруживаемых и тестируемых SNP и, как следствие, расширению филогенетического дерева Y-хромосомы. Это изменение номенклатуры привело к тому, что в разных источниках используется непоследовательная номенклатура. Эта непоследовательность и все более громоздкая условная номенклатура побудили перейти к использованию более простой сокращенной номенклатуры. В сентябре 2012 года Family Tree DNA предоставила следующее объяснение своего изменения номенклатуры гаплогрупп Y-ДНК отдельным клиентам на их страницах результатов Y-ДНК (обратите внимание, что гаплогруппа, упомянутая ниже, относится к конкретному человеку):

Давние клиенты ДНК Семейного древа видели, как YCC-дерево Homo Sapiens эволюционировало за последние несколько лет по мере открытия новых SNP. Иногда эти новые SNP вызывают существенные изменения в «длинном» объяснении вашей терминальной гаплогруппы. Из-за этой путаницы мы ввели сокращенную версию несколько лет назад, в которой перечислены ветвь дерева и ваш терминальный SNP, то есть J-L147, вместо J1c3d. Таким образом, в ближайшем будущем в Family Tree DNA больше не будет отображаться текущая «рука» на дереве, и мы сосредоточим все наши обсуждения на вашем терминале, определяющем SNP. Это не меняет науки - это просто обеспечивает более простой и менее запутанный способ общения для всех нас.

- 

Беннетт Гринспен, ДНК генеалогического древа д-р Майкл Ф. Хаммер, Университет Аризоны

Филогенетическая структура

Migraciones humanas en haplogrupos de ADN-Y.PNG

Филогенетическое дерево гаплогрупп Y-ДНК

Y-хромосомный Адам

Гаплогруппа А

BT

Гаплогруппа B

CT
DE

Гаплогруппа D

Гаплогруппа E

CF

Гаплогруппа C

F

Гаплогруппа G

HIJK

Гаплогруппа H

IJK
IJ

Гаплогруппа I

Гаплогруппа J

K
LT

Гаплогруппа L

Гаплогруппа T

MNOPS
НЕТ

Гаплогруппа N

Гаплогруппа O

MPS
РС

Гаплогруппа S

Гаплогруппа M

п

Гаплогруппа Q

Гаплогруппа R

Основные гаплогруппы Y-ДНК

Гаплогруппы A и B

Гаплогруппа A - это макрогаплогруппа NRY ( не рекомбинирующая Y ), от которой происходят все современные отцовские гаплогруппы. Он редко встречается в Африке и сосредоточен среди койсанских популяций на юго-западе и нилотских популяций на северо-востоке в долине Нила. BT является субкладом гаплогруппы A, точнее клады A1b (A2-T в Cruciani et al.2011), а именно:

Гаплогруппа CT (P143)

Основная статья: Гаплогруппа CT (Y-ДНК)

Определяющие мутации, разделяющие CT (все гаплогруппы, кроме A и B), - это M168 и M294. Место происхождения, вероятно, находится в Африке. Его возраст оценивается примерно в 88 000 лет, а в последнее время - примерно от 100 000 до 101 000 лет.

Гаплогруппа C (M130)

Основная статья: Гаплогруппа C (Y-ДНК)

Гаплогруппа D (CTS3946)

Основная статья: Гаплогруппа D (Y-ДНК)

Гаплогруппа E (M96)

Основная статья: Гаплогруппа E (Y-ДНК)

Гаплогруппа F (M89)

Основная статья: Гаплогруппа F (Y-ДНК)

Группы, происходящие от гаплогруппы F, встречаются примерно у 90% населения мира, но почти исключительно за пределами Африки к югу от Сахары.

F xG, H, I, J, K редко встречаются в современных популяциях и достигают пика в Южной Азии, особенно в Шри-Ланке. Похоже, что он также издавна присутствует в Юго-Восточной Азии ; Сообщалось о 4–5% в Сулавеси и Лембате. Одно исследование, которое не всесторонне экрана для других субкладов F-M89 (включая некоторые субклады GHIJK), обнаружил, что индонезийские мужчины с SNP P14 / PF2704 (что эквивалентно M89), составляют 1,8% мужчин в Западном Тиморе, 1,5% Флорес 5,4% Лембата 2,3% Сулавеси и 0,2% Суматра. F * (F xF1, F2, F3) был зарегистрирован среди 10% мужчин в Шри-Ланке и Южной Индии, 5% в Пакистане, а также более низкие уровни среди народа таманг (Непал) и в Иране. F1 (P91), F2 (M427) и F3 (M481; ранее F5) очень редки и практически исключительны для регионов / этнических меньшинств в Шри-Ланке, Индии, Непале, Южном Китае, Таиланде, Бирме и Вьетнаме. Однако в таких случаях вероятность ошибочной идентификации считается относительно высокой, и некоторые из них могут принадлежать к неправильно идентифицированным субкладам гаплогруппы GHIJK.

Гаплогруппа G (M201)

Основная статья: Гаплогруппа G (Y-ДНК)

Гаплогруппа G (M201) возникла около 48000 лет назад, а ее последний общий предок, вероятно, жил 26000 лет назад на Ближнем Востоке. Он распространился на Европу с неолитической революцией.

Встречается во многих этнических группах Евразии; наиболее распространен на Кавказе, в Иране, Анатолии и Леванте. Встречается почти во всех европейских странах, но наиболее распространен в Гагаузии, юго-восточной Румынии, Греции, Италии, Испании, Португалии, Тироле и Богемии с наибольшими концентрациями на некоторых средиземноморских островах; нечасто встречается в Северной Европе.

G-M201 также встречается в небольших количествах в северо-западном Китае и Индии, Бангладеш, Пакистане, Шри-Ланке, Малайзии и Северной Африке.

Гаплогруппа H (M69)

Основная статья: Гаплогруппа H (Y-ДНК)

Гаплогруппа H (M69), вероятно, возникла в Южной и Центральной Азии или Южной Азии примерно 48 000 лет назад, и остается в значительной степени преобладающей там в формах H1 (M69) и H3 (Z5857). Его подклассы также встречаются реже в Иране, Центральной Азии, на Ближнем Востоке и на Аравийском полуострове.

Однако H2 (P96) присутствует в Европе со времен неолита, а H1a1 (M82) распространился на запад в средневековую эпоху с миграцией рома.

Гаплогруппа I (M170)

Основная статья: Гаплогруппа I (Y-ДНК)

Гаплогруппа I (M170, M258) встречается в основном в Европе и на Кавказе.

  • Гаплогруппа I1 нордов / северных европидов (M253) Встречается в основном в северной Европе.
  • Гаплогруппа I2 Динариды / динарские европиды (P215) Встречаются в основном на Балканах, в юго-восточной Европе и на Сардинии, за исключением I2B1 (m223), который встречается с умеренной частотой в Западной, Центральной и Северной Европе.

Гаплогруппа J (M304)

Основная статья: Гаплогруппа J (Y-ДНК)

Гаплогруппа J (M304, S6, S34, S35) встречается в основном на Ближнем Востоке и в Юго-Восточной Европе.

Гаплогруппа K (M9)

Основная статья: Гаплогруппа K (Y-ДНК)

Гаплогруппа К (M9) распространена по всей Евразии, Океании и среди коренных американцев.

K (xLT, K2a, K2b) - то есть K *, K2c, K2d или K2e - встречается в основном в Меланезии, аборигенах Австралии, Индии, Полинезии и островах Юго-Восточной Азии.

Гаплогруппы L и T (K1)

Основная статья: Гаплогруппа LT

Гаплогруппа L (M20) встречается в Южной Азии, Центральной Азии, Юго-Западной Азии и Средиземноморье.

Гаплогруппа T (M184, M70, М193, M272) находится на высоких уровнях в районе Африканского Рога ( в основном Кушитские -speaking народов), части Южной Азии, на Ближнем Востоке и в Средиземноморье. Т-M184 также найден в существенных меньшинствах Sciaccensi, Stilfser, египтяне, оманцы, сефарды, Ibizans (Eivissencs) и тубы. Он также встречается на низких частотах в других частях Средиземноморья и Южной Азии.

Гаплогруппа K2 (K-M526)

Основная статья: Гаплогруппа K2

Сообщается, что единственные живые самцы, несущие базальную парагруппу K2 *, - это коренные австралийцы. Основные исследования, опубликованные в 2014 и 2015 годах, показывают, что до 27% самцов австралийских аборигенов несут K2 *, в то время как другие несут субклад K2.

Гаплогруппы K2a, K2a1, NO и NO1

Основная статья: Гаплогруппа K2a (Y-ДНК)

Гаплогруппа N

Основная статья: Гаплогруппа N (Y-ДНК)

Гаплогруппа N (M231) встречается в Северной Евразии, особенно среди носителей уральских языков.

Гаплогруппа N, возможно, возникла в Восточной Азии и распространилась как на север, так и на запад в Сибирь, являясь наиболее распространенной группой, встречающейся у некоторых уральско-говорящих народов.

Гаплогруппа O

Основная статья: Гаплогруппа O (Y-ДНК)

Гаплогруппа O (M175) наиболее часто встречается в Восточной Азии и Юго-Восточной Азии, с более низкой частотой в южной части Тихого океана, Центральной Азии, Южной Азии и на островах в Индийском океане ( например, Мадагаскар, Коморские Острова).

Гаплогруппы K2b1, M amp; S

Основная статья: Гаплогруппа K2b1 (Y-ДНК)

Примеры базальной парагруппы K2b1 * не идентифицированы. Самцы, несущие субклады K2b1, встречаются в основном среди папуасов, микронезийских народов, коренных австралийцев и полинезийцев.

Его основные субклады - это две основные гаплогруппы:

Гаплогруппа P (K2b2)

Основная статья: Гаплогруппа P (Y-ДНК)

Гаплогруппа P (P295) имеет две основные ветви: P1 (P-M45) и чрезвычайно редкую P2 (P-B253).

P *, P1 * и P2 встречаются вместе только на острове Лусон на Филиппинах. В частности, P * и P1 * значительно чаще встречаются среди представителей народа аэта (или агта) на Лусоне. Хотя в настоящее время P1 * чаще встречается среди живых людей в Восточной Сибири и Центральной Азии, он также обнаруживается в небольших количествах в континентальной части Юго-Восточной Азии и Южной Азии. Взятые вместе, эти распределения склонны предполагать, что P * произошел из K2b в Юго-Восточной Азии.

P1 также является родительским узлом двух основных клад:

Гаплогруппа Q (MEH2, M242, P36), найденная в Сибири и Америке Гаплогруппа R (M207, M306): найдена в Европе, Западной Азии, Центральной Азии и Южной Азии.

Гаплогруппа Q M242

Основная статья: Гаплогруппа Q (Y-ДНК)

Q определяется SNP M242. Считается, что он возник в Средней Азии примерно 32 000 лет назад. Подклады гаплогруппы Q с их определяющими мутациями в соответствии с деревом ISOGG 2008 года представлены ниже. ss4 bp, rs41352448, не представлен в дереве ISOGG 2008, потому что это значение для STR. Это низкое значение частоты было обнаружено как новая линия Q (Q5) в индийских популяциях.

Дерево ISOGG 2008 года

Гаплогруппа R (M207)

Основная статья: Гаплогруппа R (Y-ДНК) Гипотетическое расхождение гаплогруппы R и ее потомков.

Гаплогруппа R определяется SNP M207. Основная часть гаплогруппы R представлена ​​потомком субклада R1 (M173), который, вероятно, возник в евразийских степях. R1 имеет два дочерних субклада: R1a и R1b.

R1a связан с протоиндоиранскими и балто-славянскими народами и в настоящее время встречается в основном в Центральной Азии, Южной Азии и Восточной Европе.

Гаплогруппа R1b является доминирующей гаплогруппой в Западной Европе и также редко встречается среди различных народов Азии и Африки. Его субклад R1b1a2 (M269) представляет собой гаплогруппу, которая наиболее часто встречается среди современных западноевропейских популяций и была связана с итало-кельтскими и германскими народами.

Хронологическое развитие гаплогрупп

Гаплогруппа Возможное время происхождения Возможное место происхождения Возможный TMRCA
A00 235900 или 275000 лет назад Африке 235900 лет назад
BT 130700 лет назад Африке 88000 лет назад
CT 88000 или 101-100000 лет назад Африке 68500 лет назад
E 65 200, 69 000 или 73 000 лет назад Восточная Африка или Азия 53100 лет назад
F 65900 лет назад Евразия 48800 лет назад
грамм 48500 лет назад Средний Восток 26200 лет назад
IJ 47 200 лет назад Средний Восток 42900 лет назад
K 47 200 лет назад Азия 45400 лет назад
п 45400 лет назад Азия 31900 лет назад
J 42900 лет назад Средний Восток 31600 лет назад
я 42900 лет назад Европа 27500 лет назад
E-M215 (E1b1b) 42300 лет назад Восточная Африка 34800 лет назад
E-V38 (E1b1a) 42300 лет назад Восточная Африка 40100 лет назад
N 36800 лет назад Азия 22100 лет назад
E1b1b-M35 34800 лет назад Восточная Африка 24100 лет назад
р 31900 лет назад Азия 28200 лет назад
J-M267 (J1) 31600 лет назад Средний Восток 18500 лет назад
J-M172 (J2) 31600 лет назад Средний Восток 27800 лет назад
R-M173 (R1) 28200 лет назад Азия 22800 лет назад
I-M253 (I1) 27500 лет назад Европа 4600 лет назад
I-M438 (I2) 27500 лет назад Европа 21800 лет назад
R-M420 (R1a) 22800 лет назад Евразия 18300 лет назад
R-M343 (R1b) 22800 лет назад Евразия 20400 лет назад
I2-L460 (I2a) 21800 лет назад Европа 21100 лет назад
I2a-P37 21100 лет назад Европа 18500 лет назад
E1b1b-M78 19800 лет назад Северо-Восточная Африка 13400 лет назад
I2a-M423 18500 лет назад Европа 13500 лет назад
I2a-M223 17400 лет назад Европа 12100 лет назад
N1c-M178 14200 лет назад Азия 11900 лет назад
R1a-M17 14100 лет назад Восточная Европа 8500 лет назад
R1b-M269 13300 лет назад Восточная Европа 6400 лет назад
E1b1b-V12 11800 лет назад Северная Африка 9900 лет назад
E-U175 (E1b1a8) 9200 лет назад Восточная Африка 8500 лет назад
E1b1b-V13 8100 лет назад Южная Европа 4800 лет назад
E-M191 (E1b1a7) 7400 лет назад Восточная Африка 6400 лет назад
E-U174 (E1b1a-U174) 6400 лет назад Восточная Африка 5300 лет назад
R1b-L151 5800 лет назад Восточная Европа 4800 лет назад
R1a-Z280 5000 лет назад Восточная Европа 4600 лет назад
R1a-M458 4700 лет назад Восточная Европа 4700 лет назад

Смотрите также

Филогенетическое дерево гаплогрупп ДНК Y-хромосомы человека
" Y-хромосомный Адам "
A00 A0-T
A0 A1
A1a A1b
A1b1 BT
B CT
DE CF
D E C F
F1   F2   F3   GHIJK
грамм HIJK
IJK ЧАС
IJ K
я J     LT        K2
L    Т    K2a           K2b     K2c      K2d K2e  
K-M2313      K2b1 п
НЕТ S   M   P1    P2
N О Q р

использованная литература

дальнейшее чтение

внешние ссылки

Последняя правка сделана 2023-04-01 02:40:54
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте