miR-138

miR-138
Консервированная вторичная структура предшественника miR-138
Идентификаторы
Условное обозначение	miR-138
Рфам	RF00671
miRBase	MI0000476
Семейство miRBase	MIPF0000075
NCBI Gene	406929
HGNC	31524
Прочие данные
Тип РНК	миРНК
Домен (ы)	Animalia
Locus	Chr. 3 п.
Структуры PDB	PDBe

miR-138 - это семейство предшественников микроРНК, обнаруженных у животных, включая человека. МикроРНК обычно транскрибируются как предшественники ~ 70 нуклеотидов и впоследствии обрабатываются ферментом Dicer с образованием продукта ~ 22 нуклеотидов. Вырезанная область или зрелый продукт предшественника miR-138 представляет собой микроРНК mir-138.

miR-138 был использован в качестве примера посттранскрипционной регуляции miRNA из-за открытия, что хотя предшественник экспрессируется повсеместно, зрелый продукт обнаруживается только в определенных типах клеток.

• 1 Распространение видов
• 2 Геномное расположение
• 3 Образец выражения
• 4 Цели и функции
• 5 ссылки
• 6 Дальнейшее чтение
• 7 Внешние ссылки

Присутствие miR-138 было экспериментально обнаружено у людей ( Homo sapiens ) и у различных животных, включая домашнюю мышь ( Mus musculus), коричневую крысу ( Rattus norvegicus), утконос ( Ornithorhynchus anatinus), каролинский анол ( Anolis carolinensis), крупный рогатый скот ( Bos taurus), карп обыкновенный ( Cyprinus carpio), собака ( Canis familis), китайский хомяк ( Cricetulus griseus), рыба данио ( Danio rerio), красная джунглевая птица ( Gallus gallus), западная горилла ( Gorilla gorilla ), серый короткохвостый опоссум ( Monodelphis domestica), Oryzias latipes, морская минога ( Petromyzon marinus), тасманский дьявол ( Sarcophilus harrisii), кабан ( Sus scrofa) и зебровый зяблик ( Taeniopygia guttata).

Также расчетным путем предсказано, что ген miR-138 существует в геноме других животных, включая лошадь ( Equus caballus), макаку-резус ( Macaca mulatta), takifugu rubripes ( Fugu rubripes), борнейский орангутан ( Pongo pygmaeus ), шимпанзе ( Pan troglodytes). ), Tetraodon nigroviridis и западная когтистая лягушка ( Xenopus tropicalis).

В геноме человека есть два связанных с miR-138 гена, и они не расположены ни в каком кластере. Точнее, ген miR-138-1 находится в области 5 на участке 3p21.3, а miR-138-2 находится на хромосоме 16 (16q13).

У взрослых мышей miR-138 экспрессируется только в ткани мозга. Его экспрессия неоднородна по всему мозгу, а ограничивается отдельными популяциями нейронов. Напротив, его предшественник, pre-miR-138-2, повсеместно экспрессируется во всех тканях, что указывает на то, что экспрессия miRNAs может регулироваться на посттранскрипционном уровне.

У рыбок данио miR-138 экспрессируется в специфических доменах сердца и требуется для установления соответствующих паттернов экспрессии генов, специфичных для камер.

С момента идентификации miR-138 был обнаружен ряд мишеней, и некоторые из них были подтверждены экспериментально. Было доказано, что miR-138 участвует в разных путях. Кроме того, это связано с различными типами рака.

HIF-1a

Было показано, что индуцируемый гипоксией фактор -1альфа (HIF-1a), один из ключевых регуляторов раковых клеток, является одной из мишеней miR-138.

VIM, ZEB2, EZH2 и рак головы и шеи

Сообщалось о подавлении miR-138 при нескольких типах рака, включая HNSCC (плоскоклеточный рак головы и шеи). Предполагается, что miR-138 является многофункциональным молекулярным регулятором и играет главную роль в EMT ( эпителиально-мезенхимальный переход ) и в прогрессии HNSCC. Было идентифицировано несколько генов-мишеней miR-138, связанных с EMT, включая VIM ( виментин ), ZEB2 (цинковый палец E-box-связывающий гомеобокс 2) и EZH2 (энхансер гомолога zeste 2).

CCND1 и рак носоглотки

miR-138 обычно недоэкспрессируется в образцах карциномы носоглотки (NPC) и клеточных линиях NPC. Циклин D1 (CCND1), который широко активируется в опухолях NPC, обнаруживается как прямая мишень для miR-138. Следовательно, miR-138 может быть опухолевым супрессором в NPC, который частично действует за счет ингибирования экспрессии CCND1.

BCR-ABL и CCND3

BCR (область кластера точки разрыва) - ABL (онкоген 1 c-abl, нерецепторная тирозинкиназа) / GATA1 / miR-138 мини-схема способствует лейкемогенезу хронического миелоидного лейкоза (ХМЛ). ABL и BCR-ABL являются генами-мишенями для miR-138, которые связываются с кодирующей областью вместо трех первичных нетранслируемых областей (3'UTR). miR-138 может негативно регулировать другой ген CCND3 посредством связывания с его 3'-UTR. Экспрессия miR-138 активируется GATA1, который, в свою очередь, репрессируется BCR-ABL. Следовательно, miR-138, благодаря схеме BCR-ABL / GATA1 / miR-138, является miRNA-супрессором опухоли, участвующей в патогенезе CML и его клинической реакции на иматиниб.

H2AX и восстановление повреждений ДНК

mir-138 связан с репарацией повреждений ДНК. Он может напрямую нацеливаться на гистон H2AX 3'UTR, снижать экспрессию гистона H2AX и вызывать хромосомную нестабильность после повреждения ДНК.

ALDH1A2 и CSPG2

У рыбок данио зрелая форма miR-138 регулирует экспрессию генов, влияющих на развитие сердца. miR-138 помогает установить дискретные домены экспрессии генов во время морфогенеза сердца, нацеливаясь на несколько членов общего пути. Экспериментально подтверждено, что miR-138 может отрицательно регулировать aldh1a2, кодирующую дегидрогеназу ретиноевой кислоты (RA) (Ralddiv class="ht"), воздействуя на сайт связывания в 3'UTR его мРНК. Другой предполагаемой мишенью miR-138 является cspg2.

Регулирование сна

У крыс miR-138, let-7b и miR-125a экспрессируются в разное время и в разных структурах мозга и, вероятно, играют роль в регуляции сна.

Рак мозга

Было обнаружено, что miR-138 в значительной степени связан с образованием и ростом глиом из раковых стволовых клеток (CSC). Ингибирование in vitro miR-138 предотвращает образование опухолевых сфер. Кроме того, его высокая экспрессия в глиоме делает его потенциальным биомаркером для CSC.

Rhoc, ROCK2 и рак языка

Метастазирование опухоли, относящейся к плоскоклеточной карциноме языка (TSCC), можно регулировать посредством экспрессии 2 ключевых генов в пути передачи сигналов Rho GTPase: RhoC и ROCK2 ( Rho-ассоциированная протеинкиназа 2). Таким образом, воздействуя на 3'-нетранслируемую область этих генов, mir-138 может снижать их экспрессию и тем самым разрушать способность TSCC мигрировать и вторгаться.

• Pignot G, Cizeron-Clairac G, Vacher S, Susini A, Tozlu S, Vieillefond A, Zerbib M, Lidereau R, Debre B, Amsellem-Ouazana D, Bieche I (июнь 2013 г.). «Профиль экспрессии микроРНК в большой серии опухолей мочевого пузыря: идентификация сигнатуры 3-миРНК, связанной с агрессивностью мышечно-инвазивного рака мочевого пузыря». Международный журнал рака. 132 (11): 2479–91. DOI : 10.1002 / ijc.27949. PMID   23169479. S2CID   44558161.
• Е Д, Ван Г, Лю Й, Хуанг В., Ву М, Чжу С., Цзя В., Дэн А. М., Лю Х., Кан Дж. (Август 2012 г.). «MiR-138 способствует индуцированному образованию плюрипотентных стволовых клеток посредством регуляции передачи сигналов р53». Стволовые клетки. 30 (8): 1645–54. DOI : 10.1002 / stem.1149. PMID   22696098. S2CID   10924423.
• Цзинь И, Ван Ц., Лю X, Му В, Чен З, Ю Д, Ван А, Дай И, Чжоу X (ноябрь 2011 г.). «Молекулярная характеристика регуляторного модуля микроРНК-138-Fos-подобного антигена 1 (FOSL1) при плоскоклеточной карциноме». Журнал биологической химии. 286 (46): 40104–9. DOI : 10,1074 / jbc.c111.296707. PMC   3220531. PMID   21969367.
• Эскилдсен Т., Тайпалеенмяки Х., Стенванг Дж., Абдаллах Б.М., Дицель Н., Носсент А.Ю., Бак М., Кауппинен С., Кассем М. (апрель 2011 г.). «МикроРНК-138 регулирует остеогенную дифференцировку стромальных (мезенхимальных) стволовых клеток человека in vivo». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 108 (15): 6139–44. Bibcode : 2011PNAS..108.6139E. DOI : 10.1073 / pnas.1016758108. PMC   3076836. PMID   21444814.
• Muiños-Gimeno M, Espinosa-Parrilla Y, Guidi M, Kagerbauer B, Sipilä T, Maron E, Pettai K, Kananen L, Navinés R, Martín-Santos R, Gratacòs M, Metspalu A, Hovatta I, Estivill X (март 2011 г.)). «Человеческие микроРНК miR-22, miR-138-2, miR-148a и miR-488 связаны с паническим расстройством и регулируют несколько генов-кандидатов на тревогу и связанные с ними пути». Биологическая психиатрия. 69 (6): 526–33. DOI : 10.1016 / j.biopsych.2010.10.010. PMID   21168126. S2CID   206101163.
• Кислюк Т., Йосефи С., Мейри Н. (январь 2011 г.). «MiR-138 ингибирует экспрессию метилтрансферазы EZH2 и метилирование гистона H3 по лизину 27 и влияет на приобретение термотолерантности». Европейский журнал нейробиологии. 33 (2): 224–35. DOI : 10.1111 / j.1460-9568.2010.07493.x. PMID   21070394. S2CID   205516595.
• Ян З., Бянь С., Чжоу Х., Хуан С., Ван С., Ляо Л., Чжао Р.С. (февраль 2011 г.). «МикроРНК hsa-miR-138 ингибирует адипогенную дифференцировку мезенхимальных стволовых клеток, происходящих из жировой ткани человека, через аденовирус EID-1». Стволовые клетки и развитие. 20 (2): 259–67. DOI : 10,1089 / scd.2010.0072. PMID   20486779.

Категория: МикроРНК