Versican

редактировать
VCAN
Идентификаторы
Псевдонимы VCAN, CSPG2, ERVR, GHAP, PG-M, WGN, WGN1, Versican
Внешние идентификаторыOMIM: 118661 MGI: 102889 HomoloGene: 3228 Генные карты: VCAN
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человеческая)
Chr. Хромосома 5 (человек)
Хромосома 5 (человеческая) Геноми c расположение для VCAN Геноми c расположение для VCAN
Полоса 5q14.2-q14.3Начало83,471,618 bp
Конец83,582,303 bp
экспрессия РНК образец
PBB GE VCAN 204620 s на fs.png .. PBB GE VCAN 204619 s на fs.png .. PBB GE VCAN 211571 s at fs.png
Дополнительные справочные данные по экспрессии
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

1462

13003

Ensembl

ENSG00000038427

ENSMUSG00000021614

UniProt

P13611. Q86W61

Q62059

RefSeq (мРНК)

NM_004385. NM_001126336. NM_001164097. NM_001164098

NM_0060_40012003>NM_019389. NM_172955

RefSeq (белок)

NP_001119808. NP_001157569. NP_001157570. NP_004376. NP_001119808.1

н / д

<Местоположение (UCSC>Chr 5: 83,47 - 83,58 Мб Chr 13: 89,66 - 89,74 Мб
PubMed поиск
Wikidata
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Versican представляет собой большой внеклеточный матрикс протеогликан, который присутствует в различных тканях человека. Он кодируется геном VCAN ..

Версикан представляет собой большой хондроитинсульфат протеогликан с кажущейся молекулярной массой более 1000 кДа. В 1989 году Циммерманн и Руослахти клонировали и секвенировали основной белок протеогликана хондроитинсульфата фибробластов. Они назвали его универсальным за универсальную модульную структуру.

Версикан принадлежит к семейству белков лектикан с аггреканом (в изобилии в хряще ), бревиканом и нейрокан (протеогликаны нервной системы), как и другие члены. Версикан также известен как основной протеин 2 хондроитинсульфат протеогликана или хондроитинсульфат протеогликан 2 (CSPG2) и PG-M.

Содержание
  • 1 Структура
  • 2 Функция
    • 2.1 N-конец
    • 2.2 Область связывания гликозаминогликанов
    • 2.3 C-конец
  • 3 Клиническое значение
    • 3.1 Рак и метастазы
    • 3.2 Заболевания легких
    • 3.3 Кожные заболевания
  • 4 Взаимодействия
  • 5 Ссылки
  • 6 Дополнительная литература
  • 7 Внешние ссылки
Структура

Эти протеогликаны имеют гомологичный глобулярные N-концевые, C-концевые и области связывания гликозаминогликана (GAG).

N-концевой (G1) глобулярный домен состоит из Ig -подобной петли и двух связывающих модулей и обладает свойствами связывания гиалуроновой кислоты (HA).

Версикан встречается в 5 изоформ: V0, V1, V2, V3, V4. Центральный домен версикана V0 содержит домены как GAG-α, так и GAG-β. Изоформы V1 имеют домен GAG-β, V2 имеют домен GAG-α, V3 лишены каких-либо доменов присоединения GAG, а V4 имеет часть домена GAG-β. ГАГ, состоящие из повторяющихся дисахаридных единиц, вносят вклад в отрицательный заряд и многие другие свойства протеогликанов.

С-концевой (G3) глобулярный домен состоит из одного или двух повторов эпидермального фактора роста (EGF), лектинового домена С-типа и домена, подобного регуляторному белку комплемента (CRP).. С-концевой домен связывает множество лигандов в ЕСМ, которые вносят значительный вклад в функции лектиканов.

Функция

Роль версикана в адгезии, миграции и пролиферации клеток была тщательно изучена. Версикан часто считают антиадгезионной молекулой. Учитывая большой размер (>1000 кДа) и способность версикана к гидратации, возможно, что взаимодействие интегринов (большое семейство молекул клеточной адгезии) с их рецепторами на клеточной поверхности стерически затруднено.

Экспрессия версикана наблюдается в различных тканях взрослого человека, таких как кровеносные сосуды, кожа и развивающееся сердце. Гладкомышечные клетки кровеносных сосудов, эпителиальные клетки кожи, а также клетки центральной и периферической нервной системы представляют собой несколько примеров типов клеток, которые физиологически экспрессируют версикан. Версикан участвует в развитии, руководя миграцией эмбриональных клеток, важных для формирования сердца, и определяя путь миграции клеток нервного гребня.

N-конец

N-конец версикана играет важную роль в поддержании целостности ECM за счет взаимодействия с гиалуронаном. Его взаимодействие со связующим белком также было изучено.

Область связывания гликозаминогликанов

Центральный домен версикана украшен гликозаминогликанами. Структурное и функциональное разнообразие Версикана увеличивается за счет вариаций в паттернах сульфатирования GAG и типах цепей GAG, связанных с коровым белком. Существует единственный ген версикана, однако альтернативный сплайсинг его мРНК дает 4 различных изоформы версикана, которые различаются по своему потенциальному количеству цепей GAG. Все изоформы имеют гомологичные N-концевой (связывание HA) и C-концевой (лектин-подобный) домены. Центральный домен версикана V0 содержит домены как GAG-α, так и GAG-β. Изоформы V1 имеют домен GAG-β, V2 имеют домен GAG-α, а V3 лишен каких-либо доменов присоединения GAG и состоит только из N-концевых и C-концевых глобулярных доменов. Известно, что изоформы по-разному экспрессируются в разных типах тканей. Биологическое значение альтернативного сплайсинга еще предстоит определить.

Из-за своих отрицательно заряженных сульфатов или карбоксильных групп цепи хондроитинсульфата притягиваются к различным положительно заряженным молекулам, таким как определенные факторы роста, цитокины и хемокины. Это взаимодействие во внеклеточном матриксе или на поверхности клетки важно для формирования иммобилизованных градиентов этих факторов, их защиты от протеолитического расщепления и их представления специфическим рецепторам клеточной поверхности. Связывание версикана с молекулами адгезии лейкоцитов L-селектином, P-селектином и CD44 также опосредуется взаимодействием CS-цепей версикана с углеводсвязывающим доменом этих молекул. И CD44, и L-селектин участвуют в переносе лейкоцитов. Также изучалась способность версикана связывать большую группу хемокинов и биологические последствия такого связывания. Версикан может связывать определенные хемокины через свои CS-цепи, и это взаимодействие подавляет функцию хемокинов. Недавно, в свете результатов, что изоформы V1 и V2 версикана имеют противоположные эффекты на пролиферацию клеток, гликозаминогликановый домен GAG-β был вовлечен в усиленную версиканом пролиферацию клеток и вызванное версиканом снижение клеточного апоптоза.

С-конец

С-конец Версикана взаимодействует с множеством молекул в матрице. Одним из важных семейств лигандов является семейство тенасцинов. Например, домен C-лектина версикана взаимодействует с тенасцином R через домен 3-5 повторов фибронектина типа III (FnIII) ​​кальций-зависимым образом in vivo. Различные домены тенасцина взаимодействуют с широким спектром клеточных рецепторов, включая интегрины, молекулы клеточной адгезии и члены семейств протеогликанов синдекана и глипикана. С-концевой домен версикана взаимодействует с фибулином-2, белком, экспрессия которого связана с экспрессией версикана в развивающемся сердце. Домен EGF на С-конце версикана также связывает молекулу рецептора EGF in vivo.

Клиническое значение

Версикан является ключевым фактором воспаления за счет взаимодействия с молекулами адгезии на поверхности воспалительных лейкоцитов и взаимодействия с хемокинами, которые участвуют в рекрутировании воспалительных клеток.

В центральной нервной системе взрослого человека версикан обнаружен в перинейрональных сетях, где он может стабилизировать синаптические связи. Версикан также может подавлять регенерацию нервной системы и рост аксонов после травмы центральной нервной системы.

Рак и метастазы

Повышенная экспрессия версикана часто наблюдается при росте опухоли в таких тканях, как грудь, мозг, яичники, желудочно-кишечный тракт, простата и меланома, саркома и мезотелиома брюшины. Пятая изоформа версикана, V4, похожая на V1, но с укороченной областью бета-GAG, присутствует и активируется при раке груди человека.

Версикан необходим для Карцинома легких Льюиса у мышей с метастазами в легкие, печень и надпочечники, действуя через TLR2, чтобы активировать миелоидные клетки и продуцировать TNF-альфа.

Заболевания легких

Версикан увеличивается в изменяющейся ткани внеклеточного матрикса при воспалительных заболеваниях легких, таких как хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ), астма и бронхиолит облитерирующий синдром (БОС). Клетки (миофибробласты, макрофаги и другие воспалительные клетки) могут легче мигрировать через внеклеточный матрикс, имеющий более высокое содержание версикана.

Кожа заболевания

Отложения версикана не присутствуют в нормальной коже, но обнаруживаются в ретикулярной дерме во время келоида рубцевание, состояние, при котором образование рубца становится неконтролируемым и на месте раны.

Взаимодействия

Версикан происходит разрастание кожи ткани чтобы взаимодействовать с гиалуронаном и связывающим белком (гиалуронан и протеогликан связывают белок 1; HAPLN1 ).

Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-06-18 11:46:29
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте