miRBase

miRBase

Содержание
Описание	база данных микроРНК
Связаться с нами
Исследовательский центр	Манчестерский университет
Авторы	Ана Козомара
Основное цитирование	Козомара и др. (2011)
Дата выпуска	2010 г.
Доступ
Веб-сайт	www.mirbase.org

В биоинформатики, miRBase является биологической базой данных, которая действует как архив микроРНК последовательностей и аннотации. По состоянию на сентябрь 2010 г. он содержал информацию о 15 172 микроРНК. К марту 2018 года это число выросло до 38 589. Реестр miRBase представляет собой централизованную систему для присвоения новых имен генам микроРНК.

miRBase выросла из ресурса реестра микроРНК, созданного Сэмом Гриффитс-Джонсом в 2003 году.

По словам Аны Козомары и Сэма Гриффитс-Джонса, miRBase преследует пять целей:

1. Обеспечить согласованную систему именования микроРНК
2. Обеспечить центральное место для сбора всех известных последовательностей микроРНК
3. Предоставлять информацию, читаемую человеком и компьютером, для каждой микроРНК.
4. Обеспечить первичные доказательства для каждой микроРНК
5. Для агрегирования и связи с целевой информацией о микроРНК

MiRBase содержит miRNA, принадлежащие различным видам, принадлежащим к Alveolata, Chromalveolata, Metazoa, Mycetozoa, Viridiplantae и вирусам. Для Viridiplantae в выпуске 21 (2014 г.) доступны данные по 73 видам. Это включает 4800 уникальных зрелых miRNA и 8480 последовательностей-предшественников.

Текущая версия MiRBase - выпуск 22 (март 2018 г.).

• miRBase