Войти
Saccharomyces cerevisiae был первым эукариотическим организмом, у которого была определена полная последовательность генома. Этот список «секвенированных» эукариотических геномов содержит все эукариоты, которые, как известно, имеют общедоступные полные ядерные и органеллы последовательности генома, которые были секвенированы, собраны, аннотированы и опубликованы; проекты геномов не включены, как и последовательности, состоящие только из органелл.
ДНК была впервые секвенирована в 1977 году. Первым свободноживущим организмом, геном которого был полностью секвенирован, была бактерия Haemophilus influenzae в 1995 году. В 1996 году Saccharomyces cerevisiae (пекарские дрожжи) были первой последовательностью генома эукариот, которая была выпущена, а в 1998 году была выпущена первая последовательность генома многоклеточного эукариота Caenorhabditis elegans.
Ниже приведены шесть самых ранних секвенированных геномов протистов. Более полный список см. В Список секвенированных геномов протистов.
| Организм | Тип | Релевантность | Размер генома | Число прогнозируемых генов | Организация | Год завершения |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Guillardia theta | Cryptomonad | Модельный организм | 0,551 Mb. (нуклеоморф геном только) | 465, 513, 598 (UniProt) | Канадский институт перспективных исследований, Филиппский университет Марбург и Университет Британской Колумбии | 2001 |
| Plasmodium falciparum. Клон: 3D7 | Apicomplexan | Человеческий патоген (малярия ) | 22.9 Mb | 5,268 | Консорциум проекта генома малярии | 2002 |
| Plasmodium yoelii yoelii. Штамм: 17XNL | Apicomplexan | Патоген грызунов (малярия) | 23,1 Mb | 5,878 | TIGR и NMRC | 2002 |
| Cryptosporidium hominis. Штамм: TU502 | Apicomplexan | Патоген человека | 10,4 Mb | 3,994 | Вирджиния Содружество Университет | 2004 |
| Cryptosporidium parvum. C- или изолят генотипа 2 | Apicomplexan | Человеческий патоген | 16,5 Mb | 3,807 | UCSF и Университет Миннесоты | 2004 |
| Thalassiosira pseudonana. Штамм: CCMP 1335 | Diatom | Модельный организм | 34,5 Mb | 11,242 | Объединенный институт генома и Вашингтонский университет | 2004 |
Ниже приведены пять самых ранних секвенированных геномов растений. Для более полного списка см. Список секвенированных геномов растений.
| Организм | Тип | Релевантность | Размер генома | Число хромосом | Число прогнозируемых генов | Организация | Год завершения |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Arabidopsis thaliana. Экотип: Колумбия | Дикая горчица Thale Cress | Модель растение | 135 МБ | 5 | 25,498, 27,400, 31,670 (UniProt) | Инициатива по геному арабидопсиса | 2000 |
| Cyanidioschyzon merolae. Штамм: 10D | Красные водоросли | Простые эукариоты | 16,5 Mb | 20 | 5,331 | Университет Токио, Университет Рикке, Университет Сайтама и Университет Кумамото | 2004 |
| Oryza sativa. ssp indica | Рис | Культура и модель организма | 420 Mb | 12 | 32-50,000 | Пекинский институт геномики, Чжэцзянский университет и Китайская академия наук | 2002 |
| Ostreococcus tauri | Зеленые водоросли | Простой эукариот, малый геном | 12,6 Mb | 7,9 69 (UniProt) | Laboratoire Arago | 2006 | |
| Populus trichocarpa | Тополь бальзамический или Black Cottonwood | Секвестрация углерода, модельное дерево, коммерческое использование (древесина), и сравнение с A. thaliana | 550 Mb | 19 | 45,555 | Международный консорциум по геному тополя | 2006 |
Ниже приведены пять самых ранних секвенированных геномов грибов. Для более полного списка см. Список секвенированных геномов грибов.
| Организм | Тип | Релевантность | Размер генома | Количество прогнозируемых генов | Организация | Год завершения |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Saccharomyces cerevisiae. Штамм: S288C | Saccharomycetes | Пекарские дрожжи; Модельный эукариот | 12,1 Mb | 6,294 | Международное сотрудничество по секвенированию генома дрожжей | 1996 |
| Encephalitozoon cuniculi | Microsporidium | Человек патоген | 2,9 Mb | 1,997 | Genoscope и Université Blaise Pascal | 2001 |
| Schizosaccharomyces pombe. Штамм: 972h- | Schizosaccharomycetes | Модельный эукариот | 14 Mb | 4,824 | Институт Сэнгера и Лаборатория Колд-Спринг-Харбор | 2002 |
| Neurospora crassa | Сордариомицеты | Модель эукариота | 40 Mb | 10 082 | Институт Броуда, Орегонский университет здравоохранения и науки, Университет Кентукки, и Канзасский университет | 2003 |
| Phanerochaete chrysosporium. Штамм: RP78 Представьте! | Agaricomycetes | грибок древесной гнили, использование в микромедиации | 30 Mb | 11,777 | Объединенный институт генома | 2004 |
Далее это пять самых ранних секвенированных геномов животных. Более полный список см. В Список секвенированных геномов животных.
| Организм | Тип | Релевантность | Размер генома | Число прогнозируемых генов | Организация | Год завершения |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Caenorhabditis elegans. Штамм: Bristol N2 | Nematode | Модельное животное | 100 Mb | 19,000 | Вашингтонский университет и Институт Сэнгера | 1998 |
| Drosophila melanogaster | Плодовая муха | Модельное животное | 165 Mb | 13,600 | Celera, UC Berkeley, Baylor College of Medicine, European DGP | 2000 |
| Anopheles gambiae. Штамм: PEST | Mosquito | Переносчик малярии | 278 Mb | 13683 | Celera Genomics и Genoscope | 2002 |
| Takifugu rubripes | Рыба фугу | Позвоночные с небольшим геномом | 390 Mb | 22–29,000 | Международный консорциум генома Fugu | 2002 |
| Homo sapiens | Человек | 3,2 Gb | 18 826 (консорциум CCDS) | Консорциум проекта генома человека an d Celera Genomics | Проект 2001. Завершено 2006 |
