DSCAM

редактировать

DSCAM
Идентификаторы
Псевдонимы DSCAM, CHD2, CHD2-42, CHD2-52, DS молекула клеточной адгезии
Внешние идентификаторыOMIM: 602523 MGI: 1196281 HomoloGene: 74393 GeneCards : DSCAM
Расположение гена (человек)
Хромосома 21 (человек)
Chr. Хромосома 21 (человек)
Хромосома 21 (человек) Местоположение генома для DSCAM Местоположение генома для DSCAM
Полоса 21q22.2Начало40,010,999 bp
Конец40,847,158 bp
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

1826

13508

Ensembl

ENSG00000171587

ENSMUSG00000050272

UniProt

O60469ERC

Q9 289>RefSeq (мРНК)

NM_001271534. NM_001389

NM_031174

RefSeq (белок)

NP_001258463. NP_001380

NP_112451

Местоположение (UCSC)Chr 21: 40,01 - 40,85 Мб Chr 16: 96,59 - 97,17 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование Человека Просмотр / редактирование мыши
адгезия клеток при синдроме Дауна молекула, хордовые
Идентификаторы
СимволDSCAM_chordates
InterPro IPR033027

DSCAM и Dscam - оба аббревиатуры для Молекула клеточной адгезии синдрома Дауна . У людей DSCAM относится к гену, который кодирует одну из нескольких изоформ белка..

Синдром Дауна (DS), вызванный трисомией 21, является наиболее распространенным. общий врожденный дефект, связанный с умственной отсталостью. DSCAM играет решающую роль в развитии DS: он экспрессируется в развивающейся нервной системе, причем самый высокий уровень экспрессии наблюдается в мозге плода. Когда он чрезмерно экспрессируется в развивающейся центральной нервной системе плода, он приводит к синдрому Дауна.

Гомолог белка Dscam в Drosophila melanogaster имеет 38,016 изоформ, происходящих из четырех вариабельных кластеров экзона (12, 48, 33 и 2 альтернативы соответственно). Для сравнения, весь геном Drosophila melanogaster содержит только 15016 генов. Разнообразие изоформ от альтернативного сплайсинга гена Dscam1 в D. melanogaster позволяет каждому нейрону на лету отображать уникальный набор белков Dscam на своей клеточной поверхности. Взаимодействие с Dscam стимулирует, что необходимо для нормального развития нервной цепи.

Содержание
  • 1 История / открытие
  • 2 Ген
  • 3 Функции
    • 3.1 Иммунитет
    • 3.2 Регуляция синаптогенеза
  • 4 Взаимодействия
  • 5 Клиническая значимость
  • 6 См. Также
  • 7 Ссылки
  • 8 Дополнительные источники
История / открытие

Структура белка DSCAM консервативна, примерно более 20% аминокислот идентичность между дейтеростомами и протостомами и предположение о гомологичном гене предков указывает на происхождение гена DSCAM>600 миллионов лет назад. С тех пор ген DSCAM был продублирован по крайней мере один раз у позвоночных и насекомых.

DSCAM был впервые идентифицирован в попытке охарактеризовать белки, расположенные в полосе хромосомы человека 21q22, регион, который, как известно, играет решающую роль в синдроме Дауна. Название молекула клеточной адгезии с синдромом Дауна было выбрано по ряду причин, включая: 1) расположение в хромосоме, 2) ее подходящую (нормальную) экспрессию в развивающейся нервной ткани и 3) ее структуру как связанную с рецептором Ig к другим молекулам клеточной адгезии (CAM).

Ген

Ген DSCAM был идентифицирован в критической области DS. Предполагается, что Dscam является трансмембранным белком и членом суперсемейства иммуноглобулинов (Ig) молекул клеточной адгезии. Он экспрессируется в развивающейся нервной системе, причем самый высокий уровень экспрессии наблюдается в мозге плода. Когда этот ген чрезмерно экспрессируется в развивающейся центральной нервной системе плода, это приводит к синдрому Дауна. Разнообразные гликопротеины клеточных поверхностей и внеклеточных матриксов, которые на практике называют «молекулами адгезии», важны для спецификации клеточных взаимодействий во время развития, а также для поддержания и регенерации нервной системы.

Другой DSCAM-подобный ген, расположен на полосе хромосомы 11q23, локус, связанный с синдромами Жиля де ла Туретта и Якобсена.

Некоторые интригующие изменения в гене структура DSCAM возникла у членистоногих, где несколько дупликаций экзонов сгенерировали три больших тандемных массива, которые поочередно сращиваются. Этот альтернативный сплайсинг отдельных последовательностей экзонов внутри массива происходит взаимоисключающим и комбинаторным образом, позволяя экспрессировать десятки тысяч изоформ Dscam . В геномах членистоногих эти три больших массива экзонов кодируют N-концевые половины второго и третьего доменов Ig и полный домен Ig7. Различная структура этих изоформ приводит к различиям во взаимодействии связывания. Кристаллические структуры двух изоформ D. melanogaster (только с первыми четырьмя доменами Ig), D9.9 и D1.34 (PDB : 2V5R, 2V5S ) демонстрирует большие вариации в их связывающих эпитопах и интерфейсе димеризации и конформациях. Большая часть различий обнаруживается в петле домена Ig3.

Сравнение гомологии между генами и их продуктами является фундаментальным для понимания филогенетических взаимосвязей на эволюционном пути. В дополнение к тысячам изоформ, которые могут быть заселены из одной DSCAM одного вида, DSCAM также демонстрирует разнообразный набор гомологий между видами. Ниже приведены гены, транскрипты мРНК, и белки, идентифицированные как гомологи молекулы адгезии синдрома Дауна.

Гомологи
ВидыГенмРНКБелок
H. sapiensDSCAMNM_001389.3NP_001380.2
P. troglodytesDSCAMXM_001171538.1XP_001171538.1
M. mulattaDSCAMXM_002803124.1XP_002803170.1
C. волчанкаDSCAMXM_544893.3XP_544893.3
B. taurusDSCAMXM_002685111.2XP_002685157.1
M. musculusDscamNM_031174.4NP_112451.1
R. norvegicusDscamNM_133587.1NP_598271.1
G. gallusDSCAMXM_416734.3XP_416734.3
D. reriodscamNM_001030224.1NP_001025395.1
D. melanogasterCG42330NM_001043131.2NP_001036596.2
A. gambiaeAgaP_AGAP007092XM_308666.4XP_308666.4
Функции

Подобно многим нейронным рецепторам, белки Dscam выполняют множество функций с отталкивающими и привлекательными ролями, которые зависят от типа лиганда, с которым они взаимодействуют.

Иммунитет

У беспозвоночных нет иммунной системы, основанной на антителах. Вместо этого беспозвоночные полагаются на свою врожденную иммунную систему для устранения инфекционных объектов. Задача обнаружения разнообразного пула инфекционных агентов и реагирования на них выполняется кодируемыми зародышевой линией рецепторами распознавания паттернов (PRR), которые обнаруживают различные паттерны, связанные с молекулярными маркерами, для запуска иммунной ответ. Роль Dscam в иммунном ответе мух была продемонстрирована в эксперименте с опосредованным РНКи истощением DSCAM, в котором было обнаружено, что он связан с клетками, которые играют роль в иммунной системе мух.

Установлено, что Dscam играет роль в фагоцитозе у насекомых. Паттерн сплайсинга гена, сопровождающий фагоцитарную активность, специфичен для типа инфекционного патогена. У комаров подавление звука Anopheles gambiae Dscam (AgDscam) лишает его способности бороться с плазмодием. Специфичность механизма распознавания Dscam позволяет комарам этого вида различать инфекцию между бактериями и плазмодиями, а также между Plasmodium berghei и Plasmodium falciparum.

Регуляция синаптогенеза

Само-избегание - это механизм, при котором нейрональные отростки от клетки отталкиваются друг от друга во время ветвления и ветвления аксонов, чтобы избежать фасцикуляции и скопления. Само-избегание необходимо для предотвращения обширного наложения в паттернах ветвления и облегчения охвата нейронных процессов в различных областях нервной системы во время развития.

Установлено, что DSCAM участвует в этом процессе как у позвоночных, так и у беспозвоночных во время нервного развития. Анализы агрегации клеток показывают, что молекулы клеточной адгезии, такие как DSCAM, принадлежащие к суперсемейству иммуноглобулинов, связываются гомофильно и специфично. Эти молекулы также, по-видимому, играют роль в хемоаттракции и отталкивании.

Dscam1 дрозофилы может быть одной из молекул, участвующих в противодействии нетрин -зависимому хемоаттракциону между нейронными процессами на стадии нервного развития. Как упоминалось ранее, ген Dscam1 у дрозофилы может кодировать 19008 внеклеточных доменов, которые связываются гомофильно и со специфичностью изоформ. Связывающие свойства Dscam, специфичные для изоформ, во время гомофильного отталкивания являются основой самоуправления, которое является важным механизмом развития для равномерного распределения аксональных и дендритных процессов в формировании синаптических полей. Нейроны экспрессируют на своей клеточной поверхности стохастический массив изоформ Dscam1. Клетки, которые имеют одинаковые паттерны изоформ, смещенные на их поверхности, распознают друг друга как «я», что приводит к самопознанию, когда процессы нейронов одного и того же подтипа гомофильно отталкиваются друг от друга.

В дополнение к гомофильному отталкиванию, Dscam1 опосредует отталкивание между нейритами разных подтипов на основе специфических паттернов изоформ, отображаемых на поверхности клетки. Это называется избеганием, специфичным для определенного типа клеток. Концы фоторецептора у дрозофилы образуют синапсы с постсинаптическими инвариантными (тетрадными ) синапсами, которые соединяют пару постсинаптических элементов. Считается, что Dscam помогает этому процессу, регулируя синаптическую специфичность за счет исключения несоответствующей синаптической комбинации в месте контакта.

Кроме того, считается, что DSCAM играет роль в «укладке» во время нейронального развития дрозофилы. Тайлинг - это механизм, в котором процессы из клеток, которые разделяют одну и ту же функцию, работают, чтобы создать нервные пучки на определенной территории, чтобы создать структуру неперекрывающихся дендритных или аксональных полей. Dscam1 и Dscam2, по-видимому, участвуют в ветвлении и укладке аксонов у Drosophila. Тайлинг возникает, когда гомофильное отталкивание, опосредованное Dscam2, предотвращает перекрытие процессов одного и того же класса клеток. Хотя и Dscam1, и Dscam2 опосредуют гомофильное отталкивание, ген Dscam2 (в отличие от Dscam1) кодирует только две альтернативные изоформы и, таким образом, лишен возможного молекулярного разнообразия. Следовательно, роль Dscam2, как в само-избегании, так и в избегании, специфичном для клеточного типа, зависит от того, какую изоформу или соотношение изоформ экспрессирует нейрон.

Взаимодействия

Многие суперсемейства Ig молекулы связываются гомофильно и гетерофильно, и белки Dscam / DSCAM не являются исключением. DSCAM и DSCAML1 позвоночных, как было показано, не только связываются гомофильно (т.е. DSCAM – DSCAM или DSCAML1 – DSCAML1, но не DSCAM – DSCAML1), но также обладают специфичными для клеточного типа, взаимоисключающими паттернами экспрессии. Благодаря комбинаторному использованию альтернативных экзонов, специфичность гомофильного связывания Drosophila Dscam усиливается до десятков тысяч потенциальных гомодимеров., Биохимических анализов (от клетки к клетке и от бусинок). анализы связывания с клетками) были использованы для демонстрации того, что гомодимеризация, специфичная для изоформ, происходит с поразительной специфичностью связывания. Это показывает, что разнообразие Dscam может давать более 18 000 различных гомодимеров.

Клиническая значимость

Роль Ig-CAMs в развитии человека и болезнях только начинает выясняться. Это может представлять особый интерес в отношении DSCAM, поскольку DSCAM отображается на хромосоме 21 в области, критической для нейрокогнитивных и других дефектов синдрома Дауна, а DSCAML1 отображается на хромосоме 11 в области, делеция которой связана с делецией 11q. синдром. Это приводит к нейрокогнитивным дефектам и ряду других дефектов, аналогичных тем, которые наблюдаются при DS, включая психомоторную отсталость, косоглазие, эпикантус, Телекантус, карповидная верхняя губа, низко посаженные дисморфические уши и пороки сердца. Уровень экспрессии DSCAM повышен более чем на 20% в головном мозге DS. Учитывая его идентичность как потенциального нейрального морфогена и его экспрессию в мозговой и мозжечковой коре на самых ранних стадиях их развития, есть основания предположить, что этот уровень сверхэкспрессии DSCAM может вносить вклад в пре- и постнатальные дефекты DS, в частности, гипоплазию мозга и мозжечка и аномалии дендритного дерева. Кроме того, роль сверхэкспрессии DSCAM в содействии дефектам кортикального ламинирования, наблюдаемым при DS, подтверждается тем фактом, что нарушения в других генах, экспрессируемых клетками Кахаля-Ретциуса, такими как Рилин и LIS1, вызывают серьезные дефекты миграции нейробластов и кортикального ламинирования.

Исследование врожденного порока сердца (ВПС) исследовало полигенный эффект DSCAM с другими генами. В нормальных физиологических условиях DSCAM и COL6A2 работают совместно в дрозофиле, опосредуя адгезию клеточного матрикса. Однако сверхэкспрессия DSCAM и COL6A2 в сердце дрозофилы и мыши приводила к высокой смертности в дополнение к нескольким серьезным порокам сердца, включая дефекты перегородки предсердий и гипертрофию сердца. Взаимодействие между DSCAM и COL6A2 и их комбинированные эффекты также наблюдались в линии сердечных клеток H9c2 с частотой гипертрофии сердца. В то время как другие комбинации генов были проверены для проверки полигенного действия на сердечное заболевание, было обнаружено, что пара DSCAM - COL6A2 вызвала наиболее серьезный побочный эффект у дрозофилы. Перевод результата на человеческие случаи пороков сердца у пациентов с СД требует дополнительных исследований из-за видоспецифической изменчивости уровня экспрессии генов. Тем не менее, открытие, что DSCAM оказывает синергетический эффект на прогрессирование сердечного заболевания при нарушенном уровне экспрессии, позволяет в будущем исследовать его роль в некоторых других основных заболеваниях.

См. Также
Ссылки
Дополнительные источники
Последняя правка сделана 2021-05-16 09:30:40
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru