Войти
| Просмотр / редактирование человека | Просмотр / редактирование мыши |
| Регуляторный элемент стволовой петли II в POLB | |
|---|---|
 Прогнозируемая вторичная структура регуляторного элемента стволовой петли II (M2) в POLB | |
| Идентификаторы | |
| Символ | POLB |
| Rfam | RF01455 |
| Ген NCBI | 5423 |
| HGNC | 9174 |
| OMIM | 174760 |
| RefSeq | NM_002690 |
| Другие данные | |
| РНК тип | Cis-reg |
| Домен (ы) | Mammalia |
| Locus | Chr. 8 p11.2 |
| PDB структуры | PDBe |
ДНК-полимераза бета, также известная как POLB, представляет собой фермент присутствует у эукариот. У человека он кодируется геном POLB .
В эукариотических клетках бета-ДНК-полимераза (POLB) выполняет эксцизионную репарацию оснований ( BER), необходимые для поддержания ДНК, репликации, рекомбинации и устойчивости к лекарствам.
митохондриальная ДНК млекопитающих клетки постоянно подвергаются атаке кислородных радикалов, высвобождаемых во время продукции АТФ. Митохондрии клеток млекопитающих содержат эффективную систему эксцизионной репарации оснований, использующую POLB, которая устраняет некоторые частые окислительные повреждения ДНК. Таким образом, POLB играет ключевую роль в поддержании стабильности митохондриального генома.
Анализ точности репликации ДНК полимеразой бета в нейронах молодых и очень старые мыши показали, что старение не оказывает значительного влияния на точность синтеза ДНК полимеразой бета. Этот результат считался доказательством против ошибочной теории старения и катастрофы.
ДНК-полимераза бета поддерживает целостность генома, участвуя в эксцизионной репарации оснований. Сверхэкспрессия POLB мРНК коррелировала с рядом типов рака, тогда как дефицит POLB приводит к гиперчувствительности к алкилирующим агентам, индуцированному апоптозу и разрыву хромосом. Следовательно, важно, чтобы экспрессия POLB строго регулировалась.
Ген POLB активируется связыванием CREB1 фактора транскрипции с ответным элементом цАМФ (CRE) присутствует в промоторе гена POLB в ответ на воздействие алкилирующих агентов. Экспрессия гена POLB также регулируется на посттранскрипционном уровне, поскольку было показано, что 3 ’UTR мРНК POLB содержит три структуры стебель-петля, которые влияют на экспрессию гена. Эти трехстворчатые петлевые структуры известны как M1, M2 и M3, где M2 и M3 играют ключевую роль в регуляции генов. M3 способствует экспрессии гена, поскольку он содержит сигнал полиаденилирования, за которым следует сайт расщепления и полиаденилирования, тем самым внося вклад в процессинг пре-мРНК. Было показано, что M2 эволюционно консервативен, и посредством мутагенеза было показано, что эта структура петли стебля действует как дестабилизирующий элемент РНК.
Помимо этих цис-регуляторных элементов, присутствующих в 3'UTR, а транс-действующий белок, HAX1, как полагают, вносят вклад в регуляция экспрессии генов. Трехгибридные анализы дрожжей показали, что этот белок связывается со стволовыми петлями в пределах 3’UTR мРНК POLB, однако точный механизм регуляции экспрессии генов этим белком еще предстоит определить.
ДНК-полимераза бета взаимодействует с PNKP и XRCC1.
Модельные организмы использовались в исследовании функции POLB. Условная линия нокаутной мыши под названием Polb была создана в Wellcome Trust Sanger Institute. Самцы и самки животных подвергались стандартизированному фенотипическому скринингу для определения эффектов делеции. Проведены дополнительные скрининги: - Углубленное иммунологическое фенотипирование
| Характеристика | Фенотип |
|---|---|
| Все данные доступны на. { | |
| Лейкоциты периферической крови 6 недель | Нормально |
| Гематология 6 недель | Нормально |
| Гомозиготная жизнеспособность при P14 | Аномально |
| Рецессивное летальное исследование | Аномально |
| Масса тела | Нормальный |
| Неврологический осмотр | Нормальный |
| Сила захвата | Нормальный |
| Дисморфология | Нормальный |
| Косвенная калориметрия | Нормальный |
| Тест толерантности к глюкозе | Нормальный |
| Слуховой ответ ствола мозга | Нормальный |
| DEXA | Нормальный |
| Морфология глаза | Нормальный |
| Клинический химический состав | Нормальный |
| Гематология 16 недель | Нормально |
| Лейкоциты периферической крови 16 недель | Нормально |
| Масса сердца | Нормально |
| Salmonella инфекция | нормальная |
| функция цитотоксических Т-клеток | нормальная |
| иммунофенотипирование селезенки | ни mal |
| Иммунофенотипирование мезентериального лимфатического узла | Нормальное |
| Иммунофенотипирование костного мозга | Нормальное |
| Состав эпидермального иммунного ответа | Нормальное |
| Трихуризованное заражение | Нормальный |
