Filoviridae

редактировать
Filoviridae
Ijms-20-04657-g004.webp
Эболавирус структура и геном
Marburg virus.jpg
Электронная микрофотография вируса Марбург
Классификация вируса e
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Negarnaviricota
Класс:Monjiviricetes
Порядок:Mononegavirales
Семейство:Filoviridae
Род

Семейство Filoviridae (), член отряда Mononegavirales, является таксономической родиной нескольких связанных вирусы (филовирусы или филовириды), которые образуют нитчатые инфекционные вирусные частицы (вирионы ) и кодируют свой геном в форме однонитевой РНК с отрицательным смыслом. Два широко известных члена этого семейства - это вирус Эбола и вирус Марбург. Оба вируса и некоторые из их менее известных родственников вызывают тяжелую болезнь у людей и нечеловеческих приматов в виде вирусных геморрагических лихорадок. Все филовирусы являются избранными агентами, Всемирной организацией здравоохранения патогенами группы риска 4 (требующими защиты, эквивалентной уровню 4 биобезопасности ), Национальными институтами здравоохранения / Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний Приоритетные патогены категории A, Центры по контролю и профилактике заболеваний Агенты биотерроризма категории A и внесены в список как биологические агенты для экспорта Под контролем Австралийской группы.

Содержание
  • 1 Использование термина
    • 1.1 Примечание
  • 2 Критерии включения в семью
  • 3 Семейная организация
    • 3.1 Номенклатура ниже уровня вида
  • 4 Филогенетика
  • 5 Жизненный цикл
  • 6 Палеовирология
  • 7 Вакцины и проблемы
  • 8 Ссылки
  • 9 Дополнительная литература
  • 10 Внешние ссылки
Использование термина

The семейство Filoviridae - это вирусологический таксон, который был определен в 1982 году и исправлен в 1991, 1998, 2000, 2005, 2010 и 2011 годах. В настоящее время семейство включает четыре вируса роды Cu evavirus, Dianlovirus, Ebolavirus и Marburgvirus и включен в порядок Mononegavirales. Члены семейства (то есть реальные физические лица) называются филовирусами или филовиридами. Название Filoviridae образовано от латинского существительного filum (ссылаясь на нитевидную морфологию филовирионов) и таксономического суффикса -viridae ( который обозначает семейство вирусов).

Примечание

В соответствии с правилами наименования таксонов, установленными Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV), название Filoviridae является всегда должно быть с заглавной буквы, курсивом, никогда не сокращаться, и перед ним должно стоять слово «семья». Имена его членов (филовирусы или филовириды) должны быть написаны строчными буквами, не выделяться курсивом и использоваться без статей.

Критерии включения в семейство
Схематическое изображение организации генома филовируса.

A вирус, который соответствует критериям принадлежности к отряду Mononegavirales, является членом семейства Filoviridae, если:

Семейная организация
Семейство Filoviridae: роды, виды и вирусы
Название рода Название вида Название вируса (аббревиатура)
Cuevavirus Lloviu cuevavirus *Lloviu virus (LLOV)
Дианловирус Вирус Менгла (MLAV)
Эболавирус Эболавирус Бомбали Вирус Бомбали
Эболавирус Bundibugyo Вирус Bundibugyo (ранее BDBV BEBOV)
Эболавирус Рестона Вирус Рестона (RESTV; ранее REBOV)
Суданский эболавирус Суданский вирус (SUDV; ранее SEBOV)
Эболавирус леса Таи Taï Лесной вирус (TAFV; ранее CIEBOV)
Заирский эболавирус *Вирус Эбола (EBOV; ранее ZEBOV)
Марбургвирус Марбургский вирус *Марбургский вирус (MARV)
Вирус Ravn (RAVV)

Обозначение таблицы: «*» обозначает типовой вид.

Номенклатура ниже видового уровня

Были сделаны рекомендации по идентификации этих вирусов ниже видового уровня. К ним относятся использование названия вируса / штамма / суффикса хозяина изоляции / страны отбора проб / года отбора / обозначения генетического варианта / обозначения изолята. Использование суффикса «rec» рекомендуется, если вирус был идентифицирован с помощью рекомбинантной ДНК.

Филогенетика

По оценкам, частота мутаций в этих геномах составляет от 0,46 × 10 до 8,21 × 10 замен нуклеотидов / сайт / год. Самым недавним общим предком секвенированных вариантов филовируса считается 1971 (1960–1976) для вируса Эбола, 1970 (1948–1987) для вируса Рестона и 1969 (1956–1976) для суданского вируса, с самым последним общим предком. среди четырех видов, включенных в анализ (вирус Эбола, вирус Тайского леса, вирус Судана и вирус Рестона), возраст которых оценивается в 1000–2100 лет. Самый недавний общий предок видов Марбург и Судан, по-видимому, эволюционировал за 700 и 850 лет до настоящего времени соответственно. Хотя мутационные часы показывают время дивергенции существующих филовирусов примерно на 10 000 лет раньше настоящего времени, датировка ортологичных эндогенных элементов (палеовирусов) в геномах хомяков и полевок указывает на то, что существующие роды филовиридов имели общего предка, по крайней мере, такого же возраста, как и нынешние. Миоцен (около 16–23 миллионов лет назад).

Жизненный цикл
Цикл репликации филовирусов

Жизненный цикл филовирусов начинается с прикрепления вириона к определенной клеточной поверхности рецепторов с последующим слиянием оболочки вириона с клеточными мембранами и сопутствующим высвобождением вируса нуклеокапсида в цитозоль. Вирусная РНК-зависимая РНК-полимераза (RdRp или РНК-репликаза) частично раскрывает нуклеокапсид и транскрибирует гены в мРНК с положительной цепью , которые затем транслируются в структурные и неструктурные белки. Филовирус RdRps связывается с одним промотором , расположенным на 3'-конце генома. Транскрипция либо завершается после гена, либо продолжается до следующего гена ниже по течению. Это означает, что гены, расположенные ближе к 3'-концу генома, транскрибируются в наибольшем количестве, тогда как гены, расположенные ближе к 5'-концу, транскрибируются с наименьшей вероятностью. Таким образом, порядок генов является простой, но эффективной формой регуляции транскрипции. Наиболее распространенным продуцируемым белком является нуклеопротеин, концентрация которого в клетке определяет, когда RdRp переключается с транскрипции гена на репликацию генома. Репликация приводит к получению полноразмерных антигеномов с положительной цепью, которые, в свою очередь, транскрибируются в копии генома потомства вируса с отрицательной цепью. Недавно синтезированные структурные белки и геномы самоорганизуются и накапливаются внутри клеточной мембраны. Вирионы отпочковываются от клетки, получая свои оболочки из клеточной мембраны, из которой они отрастают. Затем зрелые частицы потомства инфицируют другие клетки, чтобы повторить цикл.

Палеовирология

История филовирусов насчитывает несколько десятков миллионов лет. Эндогенные вирусные элементы (EVE), которые, по-видимому, происходят из филовирусоподобных вирусов, были идентифицированы в геномах летучих мышей, грызунов, землероек, тенреки, долгопяты и сумчатые. Хотя большинство филовирусоподобных EVE, по-видимому, являются псевдогенами, эволюционный анализ показывает, что ортологи, выделенные из нескольких видов рода Myotis, поддерживались селекцией.

Вакцины. и проблемы

В настоящее время существует очень ограниченное количество вакцин против известного филовируса. Эффективная вакцина против EBOV, разработанная в Канаде, была одобрена для использования в 2019 году в США и Европе. Точно так же предпринимаются попытки разработать вакцину против вируса Марбург. Возникла серьезная обеспокоенность по поводу того, что очень небольшая генетическая мутация филовируса, такая как EBOV, может привести к изменению системы передачи от прямой передачи жидкости организма к передаче воздушно-капельным путем, как это было замечено в вирусе Рестона (другой член рода Ebolavirus) между инфицированными макаками. Аналогичное изменение в циркулирующих в настоящее время штаммах EBOV может значительно увеличить количество инфекций и заболеваний, вызываемых EBOV. Однако нет никаких записей о том, что какой-либо штамм Эбола когда-либо совершал этот переход у людей.

Ссылки

.

Дополнительная литература
Внешние ссылки
На Викискладе есть материалы, связанные с Filoviridae.
Wikispecies содержит информацию, относящуюся к Filoviridae
Последняя правка сделана 2021-05-20 04:01:31
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте