Войти
Эндогенный вирусный элемент (EVE ) - это Последовательность ДНК, происходящая от вируса и присутствующая в зародышевой линии невирусного организма. EVE могут быть целыми вирусными геномами (провирусы ) или фрагментами вирусных геномов. Они возникают, когда последовательность вирусной ДНК интегрируется в геном зародышевой клетки, которая продолжает производить жизнеспособный организм. Вновь установленный EVE может передаваться от одного поколения к другому как аллель у вида-хозяина и может даже достигать фиксации.
Эндогенные ретровирусы и другие EVE, которые возникают как провирусы. потенциально остаются способными продуцировать инфекционный вирус в своем эндогенном состоянии. Репликация таких «активных» эндогенных вирусов может привести к пролиферации вирусных вставок в зародышевой линии. Для большинства неретровирусных вирусов интеграция зародышевой линии представляется редким и аномальным явлением, и возникающие в результате EVE часто являются только фрагментами генома родительского вируса. Такие фрагменты обычно не способны продуцировать инфекционный вирус, но могут экспрессировать белок или РНК и даже рецепторы клеточной поверхности.
EVE были идентифицированы у животных, растения и грибы. У позвоночных ЭВЭ, происходящие от ретровирусов (эндогенных ретровирусов ), относительно распространены. Поскольку ретровирусы интегрируются в ядерный геном клетки хозяина как неотъемлемая часть их цикла репликации, они предрасположены к проникновению в зародышевую линию хозяина. Кроме того, в геномах позвоночных были идентифицированы EVE, относящиеся к парвовирусам, филовирусам, борнавирусам и цирковирусам. В геномах растений ЭВЭ, происходящие от параретровирусов, относительно распространены. EVE, происходящие от других семейств вирусов, не являющихся ретротранскрибирующими, таких как Geminiviridae, также были идентифицированы в растениях.
EVE - редкий источник ретроспективной информации о древних вирусах. Многие из них произошли от событий интеграции зародышевой линии, которые произошли миллионы лет назад, и могут рассматриваться как вирусные окаменелости. Такие древние EVE являются важным компонентом палеовирологических исследований, направленных на долгосрочную эволюцию вирусов. Идентификация ортологичных вставок EVE позволяет калибровку долгосрочных эволюционных графиков вирусов на основе расчетного времени с момента дивергенции групп видов-хозяев, содержащих ортолог. Этот подход обеспечил минимальный возраст от 30 до 93 миллионов лет для семейств вирусов Parvoviridae, Filoviridae, Bornaviridae и Circoviridae. и 12 миллионов лет для рода Lentivirus семейства Retroviridae. EVE также облегчают использование подходов на основе молекулярных часов для получения калибровок вирусной эволюции в глубоком времени.
EVE иногда могут обеспечить избирательное преимущество для лиц, которым они вставлены. Например, некоторые защищают от заражения родственными вирусами. В некоторых группах млекопитающих, включая высших приматов, белки ретровирусной оболочки были экстазированы с образованием белка, который экспрессируется в плаценте синцитиотрофобласт и участвует в слиянии клеток цитотрофобласта с образованием синцитиального слоя плаценты. У человека этот белок называется синцитин и кодируется эндогенным ретровирусом, называемым (ERVWE1 ), на седьмой хромосоме. Примечательно, что захват синцитина или синцитин-подобных генов происходил независимо от разных групп эндогенных ретровирусов в различных линиях млекопитающих. Отчетливые синцитин-подобные гены были идентифицированы у приматов, грызунов, зайцеобразных, плотоядных и копытных, с датами интеграции от 10 до 85 миллионов лет назад.
