Geminiviridae

редактировать

Geminiviridae
Хорошо msv 3.jpg
Очищенные частицы вируса полосатости кукурузы (MSV), окрашенные уранилацетатом. Полоса размера указывает 50 нм.
Классификация вируса e
(без рейтинга):Вирус
Область:Моноднавирия
Королевство:Шотокувира
Тип:Cressdnaviricota
Класс:Repensiviricetes
Отряд:Geplafuvirales
Семейство:Geminiviridae
Род

См. Текст

Geminiviridae - это семейство вирусов растений. В настоящее время это семейство насчитывает 485 видов, разделенных на 9 родов. Заболевания, связанные с этим семейством, включают: ярко-желтую мозаику, желтую мозаику, желтую крапинку, скручивание листьев, задержку роста, полосы, снижение урожайности. У них есть однонитевые кольцевые геномы ДНК, кодирующие гены, которые расходятся в обоих направлениях от начала репликации нити вириона (т.е. геномы геминивирусов амбисенс ). Согласно классификации Балтимора они считаются вирусами класса II. Это самое большое из известных семейств одноцепочечных ДНК-вирусов.

Мастревирус и куртовирус Передача осуществляется через различные виды цикадок (например, вирус полосатости кукурузы и другие передаются через Cicadulina mbila ), единственный известный вид топокувируса, вирус псевдокурчавой вершины томатов, передается цикадой, а бегомовирусы передаются видами белокрылки, Bemisia tabaci.

Эти вирусы несут ответственность за значительный ущерб урожаю во всем мире. Эпидемии геминивирусных заболеваний возникли из-за ряда факторов, включая рекомбинацию различных геминивирусов, коинфекцию растений, что позволяет разрабатывать новые, возможно, вирулентные вирусы. Другие способствующие факторы включают транспортировку инфицированного растительного материала в новые места, расширение сельского хозяйства в новые районы выращивания, а также распространение и миграцию векторов, которые могут передавать вирус от одного растения к другому.

Содержание
  • 1 Вирусология
  • 2 Таксономия
  • 3 Репликация
  • 4 Эволюция
  • 5 Ссылки
  • 6 Внешние ссылки
Вирусология

Геном может быть отдельным компонентом между 2500–3100 нуклеотидов или, в случае некоторых бегомовирусов, два компонента одинакового размера, каждый между 2600 и 2800 нуклеотидами. У них есть удлиненные, близнецы капсиды с двумя неполными T = 1 икосаэдрами, соединенными в недостающей вершине. Капсиды имеют размер от 18 до 20 нм, диаметр , диаметр и длину около 30 нм. Бегомовирусы с двухкомпонентными (т.е. двудольными) геномами имеют эти компоненты, разделенные на две разные частицы, обе из которых обычно должны передаваться вместе, чтобы инициировать новую инфекцию в подходящей клетке-хозяине .

РодТип ВидСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
БекуртовирусВирус курчавости верхушки свеклыДвойник икосаэдраНеполный T = 1Без оболочкиКруглыйОдночастный
БегомовирусВирус золотисто-желтой мозаики фасолиДвойник икосаэдраНеполный T = 1Без оболочкиКруговойСегментированный
КапулавирусЛатентный вирус молочай caput-medusaeДвойник икосаэдрического типаНеполный T = 1Без оболочкиЦиркулярОдночастный
КуртовирусВирус курчавости свеклыДвойной икосаэдрНеполный T = 1Никто nvelopedCircularMonopartite
EragrovirusВирус полоски Eragrostis curvulaДвойник икосаэдраНеполный T = 1НеоболочечныйЦиркулярныйОдночастный
ГрабловирусВирус красной пятнистости виноградной лозыДвойник икосаэдраНеполный T = 1Без оболочкиЦиркулярныйМонораспространенный
МастревирусВирус кукурузной полосыДвойник икосаэдраНеполный T = 1Без оболочкиЦиркулярОдночастный
Topocuvirusвирус псевдокурчавой вершины томатовДвойник икосаэдрической формыНеполный T = 1Без оболочкиКруговойОдночастный
TurncurtovirusВирус курчавости репыДвойниковидный икосаэдрНеполный T = 1Без оболочкиЦиркулярОдночастный
Таксономия

Известны следующие роды:

Кроме того, два вида не отнесены к роду:

Было предложено несколько дополнительных родов: баминивирус, нимивирус и ниминивирус.

Репликация
Рисунок геминивирусов

Геномы геминивирусов кодируют только несколько белков; таким образом, они зависят от факторов клетки-хозяина для репликации: к ним относятся такие факторы, как ДНК-полимераза - и, вероятно, репарационные полимеразы - для амплификации их геномов, а также факторы транскрипции. Геминивирусы реплицируются с помощью механизма катящегося круга, как бактериофаги, такие как M13, и многие плазмиды. Репликация происходит в ядре инфицированной растительной клетки. Сначала одноцепочечная кольцевая ДНК превращается в двухцепочечный кольцевой интермедиат. Этот этап включает использование ферментов репарации клеточной ДНК для получения комплементарной отрицательно-смысловой цепи с использованием вирусной геномной или положительно-смысловой цепи ДНК в качестве матрицы. Следующим этапом является фаза катящегося круга, когда вирусная цепь расщепляется в конкретном сайте, расположенном в пределах точки начала репликации вирусным белком Rep, чтобы инициировать репликацию. Этот процесс в эукариотическом ядре может привести к конкатемерным двухцепочечным формам репликативных промежуточных геномов, хотя двухцепочечные единичные круги можно выделить из инфицированных растений и клеток. Новые одноцепочечные формы ДНК вирусного генома (плюс-смысл), вероятно, образуются в результате взаимодействия белка оболочки с реплицирующимися промежуточными продуктами ДНК, поскольку геномы без гена CP не образуют оцДНК. ОцДНК упакована в зародышевые частицы в ядре. Неясно, могут ли эти частицы затем покидать ядро ​​и передаваться в окружающие клетки в виде вирионов, или оцДНК, связанная с белком оболочки и белком движения, является формой генома, который передается от клетки к клетке через Plasmodesmata.

Эти вирусы имеют тенденцию проникать в дифференцированные растительные клетки и первоначально инфицировать их через пронзительный ротовой аппарат насекомого-переносчика: однако в этих клетках обычно отсутствуют ферменты-хозяева, необходимые для репликации ДНК, что затрудняет репликацию вируса. Чтобы преодолеть этот блок, геминивирусы могут побуждать клетки растений повторно входить в клеточный цикл из состояния покоя, чтобы могла произойти репликация вируса.

РодСведения о хозяинеТкань tropismСведения о записиСведения о выпускеСайт репликацииСайт сборкиПередача
Бекуртовирус ШпинатФлоэма; сито; ограниченное флоэмойВирусное движение; механическая инокуляцияРасцветкаЯдроЯдроВирусное движение; контакт
бегомовирус двудольные растенияФлоэма; сито; ограниченное флоэмойВирусное движение; механическая инокуляцияпочкованиеядро ​​ядро ​​белокрылки Bemisia tabaci
капулавирус двудольные растениянетВирусное движение; механическая инокуляцияпочкованиеядро ​​ядро ​​тля
куртовирус двудольные растенияограниченные флоэмамиВирусное движение; механическая инокуляцияпочкованиеядро ​​ядро ​​свекловичка
эрагровирус растениянетВирусное движение; механическая инокуляцияпочкованиеядро ​​ядро ​​древесная прыгуна; цикадка
Грабловирус Vitis vinifera (виноградная лоза)НетВирусное движение; механическая инокуляцияПочкованиеЯдроЯдроTreehopper
Мастревирус ОднодольныеНетВирусное движение; механическая инокуляцияпочкованиеядро ​​ядро ​​цикадка
топокувирус двудольные растениянетЭндоцитоз клеточного рецептораПочкованиеЯдроЯдроЦедра
Турокуртовирус ТурнепНетЭндоцитоз клеточного рецептораПочкованиеЯдроЯдроЦыкадка
Эволюция

Эти вирусы могли развиться из плазмиды phytoplasma . Геминивирусы способны горизонтально передавать ген генетической информации растению-хозяину.

Ссылки
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-21 14:10:06
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте