Бегомовирус | |
---|---|
Вирус мозаики Abutilon | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга) : | Вирус |
Царство: | Моноднавирия |
Королевство: | Шотокувира |
Тип: | Cressdnaviricota |
Класс: | Repensiviricetes |
Порядок: | Geplafuvirales |
Семейство: | Geminiviridae |
Род: | Бегомовирус |
Типовой вид | |
. | |
Вид | |
См. Текст |
Бегомовирус - это род вирусов, в семействе Geminiviridae. Это вирусы растений, которые как группа имеют очень широкий круг хозяев, заражая двудольные растения. Во всем мире они несут значительный экономический ущерб многим важным культурам, таким как помидоры, бобы, кабачки, маниока и хлопок. В настоящее время в этом роде насчитывается 424 вида, включая типовые виды.
Частицы вируса не имеют оболочки. Нуклеокапсид имеет длину 38 нанометров (нм) и диаметр 15–22 нм. Хотя частицы обладают базовой симметрией икосаэдра, они состоят из двух неполных икосаэдров без одной вершины, соединенных вместе. На нуклеокапсид приходится 22 капсомера.
Одноцепочечная замкнутая кольцевая ДНК. Многие бегомовирусы имеют двудольный геном : это означает, что геном сегментирован на два сегмента (называемых ДНК A и ДНК B), которые упакованы в отдельные частицы. Оба сегмента обычно необходимы для успешной симптоматической инфекции в клетке-хозяине, но репликация ДНК B зависит от ДНК A, которая в некоторых бегомовирусах может вызывать нормальные инфекции сама по себе.
БегомовирусСегмент ДНК A обычно кодирует от пяти до шести белков, включая белок репликации Rep, белок оболочки и транспортные и / или регуляторные белки. Этот компонент гомологичен геномам всех других геминивирусов. Закодированные на нем белки необходимы для репликации (Rep), контроля экспрессии генов, преодоления защиты хозяина, инкапсидации (белок оболочки) и передачи насекомыми. Сегмент ДНК B кодирует два разных белка движения. Эти белки выполняют функции внутри- и межклеточного движения в растениях-хозяевах.
Компоненты A и B имеют небольшую идентичность последовательностей, за исключением ~ 200 нуклеотидной последовательности с типичной идентичностью>85%, известной как общая область. Эта область включает в себя абсолютно консервативную (среди геминивирусов) структуру шпильки и повторяющиеся последовательности (известные как «итероны»), которые являются последовательностями узнавания для связывания белка репликации (Rep). Внутри этой петли находится ненуклеотидная последовательность (TAATATTAC), которая действует как ориджин (ori) репликации ДНК цепи вириона.
Компонентный обмен (псевдорекомбинация) происходит у этого рода. Обычный механизм псевдорекомбинации - это процесс, известный как «прививка регулона»: компонент A отдает свою общую область путем рекомбинации захваченному компоненту B. Это приводит к новому зависимому взаимодействию между двумя компонентами.
Белки этого рода могут располагаться либо на смысловой цепи (положительная ориентация), либо на ее комплементе (отрицательная ориентация).
Компоненты вируса меньшей длины - делеционные мутанты - распространены при инфекциях. Они известны как дефектные интерферирующие (ди) ДНК из-за их способности вмешиваться в вирусную инфекцию. Они снижают уровень вирусной ДНК и тяжесть симптомов.
Два компонента генома имеют очень разные истории молекулярной эволюции и, вероятно, находятся под очень разными эволюционными давлениями. Геном ДНК B возник как спутник, который был захвачен одночастным предшественником всех существующих двудольных бегомовирусов и впоследствии превратился в важный компонент генома.
Известно более 133 видов бегомовирусов, имеющих одночастный геном: все они происходят из Старого Света. Односторонние бегомовирусы, обитающие в Новом Свете, еще не идентифицированы.
Филогенетический анализ основан на компоненте А. Компоненты B могут обмениваться между видами, что может привести к появлению новых видов.
Анализ рода выявляет ряд клад. Основное деление идет на сорта Старого и Нового Света. Штаммы Старого Света можно разделить на африканские, индийские, японские и другие азиатские породы с небольшим количеством штаммов, сгруппированных за их пределами. Штаммы Нового Света делятся на сорта Центральной и Южной Америки.
Наряду с этими основными группировками существует ряд более мелких клад. Одна группа, заражающая ряд бобовых культур, происходящих из Индии и Юго-Восточной Азии (неофициально «Legumovirus»), и набор вирусов, выделенных от видов Ipomoea, происходящих из Америки, Азии и Европы (неофициально «Sweepovirus»), по всей видимости, являются базальный ко всем остальным видам. Два вида, изолированные от Corchorus из Вьетнама (неофициально «Corchovirus») несколько неожиданно группируются с видами Нового Света.
Вирус обязательно передается насекомым-переносчиком, которым может быть белокрылка Bemisia tabaci или другие белокрылки. Этот вектор обеспечивает быстрое и эффективное распространение вируса, поскольку он является источником неизбирательной питательной среды. Вектор передает постоянным, циркулирующим, нераспространяющим образом.
В этом документе Министерства сельского хозяйства США описывается пятилетний план борьбы с белокрылками, начиная с 1992 года.
Некоторые бегомовирусы вызывают тяжелые заболевания во всем мире. Виды бегомовируса, инфицирующие томаты, такие как вирус желтого скручивания листьев томата (TYLCV) и (ToYMV), впервые идентифицированные в конце 1980-х годов, вызывают значительные экономические потери во всем мире. В странах, где эти вирусы получили широкое распространение, таких как Тринидад, Доминиканская Республика, Мексика и большая часть Центральной Америки, Израиль, as а также в Юго-Восточной Азии, включая Таиланд, Камбоджу, Индонезию и Индию, эти болезни у томатов и других культур, включая перец, и баклажаны, могут вызвать потерю урожая на 50–60%. Бегомовирусы, заражающие перец (Capsicum spp.), Такие как вирус скручивания листьев перца и вирус скручивания листьев перца, также вызывают значительные потери во всем мире. Заболевание обычно проявляется у инфицированного растения в виде хлороза, деформации листьев, абсцизии цветочных бутонов, сморщивания и задержки роста. В странах, где эти вирусы получили широкое распространение в Юго-Восточной Азии, включая Таиланд, Камбоджу, Индонезию, Шри-Ланка и Индию., эти болезни перца и других культур, включая помидоры, огурцы, тыкву, дыню и баклажаны, могут вызвать потерю урожая на 40–70%. (BGYMV) вызывает серьезное заболевание у видов фасоли в Центральной Америке, Карибском бассейне и южной части Флориды.
Mansoor S, Briddon RW, Зафар Ю., Стэнли Дж. (Март 2003 г.). «Комплексы геминивирусных заболеваний: новая угроза». Trends Plant Sci. 8 (3): 128–34. DOI : 10.1016 / S1360-1385 (03) 00007-4. PMID 12663223.
Бриддон Р.В., Стэнли Дж. (Январь 2006 г.). «Субвирусные агенты, связанные с вирусами одноцепочечной ДНК растений». Вирусология. 344 (1): 198–210. doi : 10.1016 / j.virol.2005.09.042. PMID 16364750.
Sinisterra XH, McKenzie CL, Hunter WB, Powell CA, Shatters RG (май 2005 г.). «Дифференциальная транскрипционная активность бегомовирусов, патогенных растениями, в их векторе белокрылки (Bemisia tabaci, Gennadius: Hemiptera Aleyrodidae)». J. Gen. Virol. 86 (Pt 5): 1525–32. doi : 10.1099 / vir.0.80665-0. PMID 15831966.
Хантер В.Б., Хиберт Э., Уэбб С.Е., Цай Дж. Х., Полстон Дж. Э. (1998). «Расположение геминивирусов в белокрылке Bemisia tabaci (Homoptera: Aleyrodidae». Болезни растений. 82 (10): 1147–51. doi : 10.1094 / PDIS.1998.82.10.1147. PMID 30856777.
Викискладе есть медиафайлы, связанные с бегомовирусом. |
Викивиды содержит информацию, относящуюся к бегомовирусу |