Хромосома 14
редактировать
Хромосома 14 - одна из 23 пар хромосом у людей. Обычно у людей есть две копии этой хромосомы. Хромосома 14 охватывает около 107 миллионов пар оснований (строительный материал al из ДНК ) и составляет от 3 до 3,5% всей ДНК в клетках.
центромера хромосомы 14 расположена приблизительно в положении 17,2 Мбп.
Содержание
- 1 Гены
- 1.1 Количество генов
- 1.2 Список генов
- 2 Заболевания и расстройства
- 3 Цитогенетический диапазон
- 4 Ссылки
- 5 Внешние ссылки
Гены
Количество генов
Ниже приведены некоторые оценки количества генов на хромосоме 14 человека. Поскольку исследователи используют разные подходы к аннотации генома, их прогнозы количество генов на каждой хромосоме варьируется (технические подробности см. в разделе прогнозирование генов ). Среди различных проектов совместный проект согласованной последовательности кодирования (CCDS ) использует чрезвычайно консервативную стратегию. Таким образом, прогноз числа генов CCDS представляет собой нижнюю границу общего числа генов, кодирующих человеческий белок.
Список генов
Ниже приведен частичный список генов на хромосоме человека 14. Полный список см. По ссылке в информационном окне справа.
- ACIN1 : кодирует белок индуктор апоптотической конденсации хроматина в ядре
- ATXN3 : Атаксин-3 (болезнь Мачадо-Джозефа)
- BCL2L2 : кодирует анти- апоптотический белок Bcl-w семейства Bcl-2
- C14orf93 : кодирующий белок C14orf93
- CLBA1 : кодирует белок CLBA1
- CDC42BPB : кодирует белок CDC42-связывающая протеинкиназа бета
- CHMP4A : заряженный мультивезикулярный белок тела 4a
- CIDEB : DFFA-подобный эффектор, вызывающий гибель клеток b
- CMA1 : кодирующий фермент Химазу
- CNIH : кодирующий белок Гомолог белкового корнишона
- COCH : гомолог фактора свертывания крови C, кохлин (Limulus polyphemus)
- CRIP2 : богатый цистеином белок 2
- DDX24 : кодирующий фермент АТФ-зависимая РНК геликаза DDX24
- DEGS2 : кодирующий белок дельта (4) -десатуразу, сфинголипид 2
- DLGAP5 : большой ассоциированный белок 5 дисков
- DGLUCY : кодин g белок DGLUCY, митохондриальный
- EAPP : E2F-ассоциированный фосфопротеин
- EGLN3 : Egline гомолог 3
- ENTPD5 : эктонуклеозидтрифосфатдифосфогидролаза 5
- ERG28 : кодирует белок Вероятный белок биосинтеза эргостерина 28
- Fam158a : кодирует белок белок UPF0172 FAM158A
- FAM181A : кодирует белок Семейство со сходством последовательностей 181, член A
- FAM71D : Семейство со сходством последовательностей 71, член D
- FCF1 : гомолог белка, обрабатывающего рРНК, FCF1
- GALC : галактозилцерамидаза (Болезнь Краббе)
- GARNL1 : активирующий GTPase домен Rap / Ran-GAP 1
- GCH1 : GTP циклогидролаза 1 (допа-зависимая дистония)
- GPHB5 : гликопротеиновый гормон бета-5
- GSKIP, кодирующий белок GSK3B взаимодействующий белок
- HHIPL1 : кодирующий белок HHIP-подобный белок 1
- IFI27 : кодирующий белок Интерферон альфа-индуцируемый белок 27
- : интрафлагелл транспорт ar 43
- IGH @ : иммуноглобулин тяжелая цепь локус
- IRF2BPL : кодирующий белок белок, связывающий регуляторный фактор 2 интерферона
- ITPK1 : кодирует фермент инозитол-тетракисфосфат-1-киназу
- JKAMP : кодирует белок мембранный белок, ассоциированный с JNK1
- JPH4 : кодирует белок юнктофилин 4
- LINC00520 : длинную некодирующую РНК
- MAPK1IP1L : кодирует белок взаимодействующий с MAPK и веретено- стабилизирующий протеиноподобный
- MIA2 : кодирующий белок белок 2 с ингибирующей активностью меланомы
- MIR494 кодирующий белок MicroRNA 494
- MIR3173 : кодирует белок MicroRNA 3173
- MIS18BP1 : кодирует белок MIS18-связывающий белок 1
- MOAP1 : кодирует белок Модулятор апоптоза 1
- MYH7 : изоформа тяжелой цепи (MHC-β) миозина
- NPC2 : болезнь Ниманна-Пика, тип C2
- NUBPL : кодирование защита ein железо-серный белок NUBPL (IND1)
- OSGEP : кодирует фермент Вероятная эндопептидаза O-сиалогликопротеина
- PAPOLA : кодирует фермент Poly (A) полимераза альфа
- PCNX : кодирует белок Pecanex-подобный белок 1
- PELI2 : кодирует белок Гомолог 2 пеллино белка
- PSEN1 : пресенилин 1 (болезнь Альцгеймера 3)
- RIOX1 : кодирует белок RIOX1
- RTRAF : кодирует белок белок RTRAF
- RPL10L : кодирующий белок 60S рибосомный белок L10-подобный
- SERPINA1 : ингибитор серпин-пептидазы клады A (альфа-1 антипротеиназа, антитрипсин), член 1
- SIX6OS1 : кодирует белок SIX6OS1
- SGPP1 : кодирует фермент сфингозин-1-фосфатфосфатазу 1
- TC2N : кодирует белок тандем Ядерный белок C2-домена
- TCL1B : кодирующий белок Т-клеточный лейкоз / лимфомный белок 1B
- TIMM9 : кодирующий фермент Митохондриальный импор t субъединица транслоказы внутренней мембраны Tim9
- TMED10 : кодирует белок Трансмембранный белок, содержащий домен emp24 10
- TMEM260 : кодирующий белок TMEM260
- TRAJ56 кодирующий белок альфа-соединение Т-клеточного рецептора 56
- TSHR : рецептор тиреотропного гормона
- TUNAR : длинная некодирующая РНК
- VASH1 : кодирует белок вазохибин-1
- VIPAS39 : кодирует белок VIPAS39
- WARS : кодирует фермент триптофанил- тРНК-синтетаза, цитоплазматический
- YLPM1 : кодирующий белок содержащий мотив YLP белок 1
- ZBTB1 : кодирующий белок Цинковый палец и домен BTB, содержащий 1
- ZFHX2 : кодирует белок Zinc finger homeobox 2
- ZNF839 : кодирует белок Zinc finger protein 839
Болезни и расстройства
Следующие заболевания относятся к числу заболеваний, связанных с генами на хромосоме 14:
Цитогенетическая полоса
Идеограммы G-бэндинга хромосомы 14 человека
Идеограмма G-бэндинга хромосомы 14 человека с разрешением 850 бит в час. Длина полосы на этой диаграмме пропорциональна длине пары оснований. Этот тип идеограммы обычно используется в браузерах генома (например,
Ensembl,
UCSC Genome Browser ).
паттерны G-бэндинга хромосомы 14 человека в трех различных разрешениях (400, 550 и 850). Длина на этой диаграмме основана на идеограммах из ISCN (2013). Этот тип идеограммы представляет фактическую относительную длину полосы, наблюдаемую под микроскопом в разные моменты
митотического процесса.
G-полос человека хромосома 14 с разрешением 850 бит / сChr. | Arm | Band | ISCN. start | ISCN. stop | Basepair. start | Basepair. stop | Stain | Density |
---|
14 | p | 13 | 0 | 284 | 1 | 3,600,000 | гвар | |
14 | p | 12 | 284 | 624 | 3,600,001 | 8,000,000 | stalk | |
14 | p | 11.2 | 624 | 1249 | 8,000,001 | 16,100,000 | gvar | |
14 | p | 11.1 | 1249 | 1433 | 16,100,001 | 17 200 000 | acen | |
14 | q | 11.1 | 1433 | 1660 | 1 7,200,001 | 18,200,000 | acen | |
14 | q | 11.2 | 1660 | 2043 | 18,200,001 | 24,100,000 | gneg | |
14 | q | 12 | 2043 | 2313 | 24,100,001 | 32,900,000 | gpos | 100 |
14 | q | 13,1 | 2313 | 2469 | 32,900,001 | 34,800,000 | гнег | |
14 | q | 13.2 | 2469 | 2582 | 34,800,001 | 36,100,000 | gpos | 50 |
14 | q | 13.3 | 2582 | 2724 | 36,100,001 | 37,400,000 | gneg | |
14 | q | 21.1 | 2724 | 2923 | 37,400,001 | 43,000,000 | gpos | 100 |
14 | q | 21.2 | 2923 | 3008 | 43,000,001 | 46,700,000 | гнег | |
14 | q | 21,3 | 3008 | 3264 | 46,700,001 | 50,400,000 | гпо | 100 |
14 | q | 22,1 | 3264 | 3491 | 50,400,001 | 53,600,000 | гнег | |
14 | q | 22,2 | 3491 | 3604 | 53,600,001 | 55,000,000 | gpos | 25 |
14 | q | 22.3 | 3604 | 3718 | 55,000,001 | 57,600,000 | gneg | |
14 | q | 23,1 | 3718 | 3916 | 57,600,001 | 61,600,000 | gpos | 75 |
14 | q | 23,2 | 3916 | 4044 | 61,600,001 | 64,300,000 | гнег | |
14 | q | 23.3 | 4044 | 4186 | 64,300,001 | 67,400,000 | gpos | 50 |
14 | q | 24.1 | 4186 | 4484 | 67,400,001 | 69,800,000 | gneg | |
14 | q | 24.2 | 4484 | 4626 | 69,800,001 | 73,300,000 | gpos | 50 |
14 | q | 24.3 | 4626 | 4839 | 73,300,001 | 78,800,000 | гнег | |
14 | q | 31,1 | 4839 | 5051 | 78,800,001 | 83,100,000 | gpos | 100 |
14 | q | 31,2 | 5051 | 5094 | 83,100,001 | 84,400,000 | gneg | |
14 | q | 31,3 | 5094 | 5349 | 84,400,001 | 89,300,000 | gpos | 100 |
14 | q | 32,11 | 5349 | 5406 | 89,300,001 | 91,400,000 | гнег | |
14 | q | 32,12 | 5406 | 5505 | 91,400,001 | 94,200,000 | gpos | 25 |
14 | q | 32,13 | 5505 | 5619 | 94,200,001 | 95,800,000 | gneg | |
14 | q | 32.2 | 5619 | 5732 | 95,800,001 | 100,900,000 | gpos | 50 |
14 | q | 32.31 | 5732 | 5903 | 100,900,001 | 102,700,000 | gneg | |
14 | q | 32.32 | 5903 | 6016 | 102,700,001 | 103,500,000 | gpos | 50 |
14 | q | 32.33 | 6016 | 6300 | 103,500,001 | 107,043,718 | гнег | |
Литература
Внешние ссылки
| Викискладе есть медиафайлы, связанные с хромосомой 14 человека. |
- Национальными институтами здравоохранения. «Хромосома 14». Домашний справочник по генетике. Проверено 6 мая 2017 г.
- «Хромосома 14». Информационный архив проекта "Геном человека" 1990–2003 гг. Проверено 6 мая 2017 г.