Cochlin

редактировать
Белок в большом количестве присутствует в улитке и преддверии внутреннего уха
COCH
Белок COCH PDB 1jbi.png
Доступные структуры
PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы COCH, COCH-5B2, COCH5B2, DFNA9, cochlin, DFNB110
Внешние идентификаторыOMIM: 603196 MGI: 1278313 HomoloGene: 20868 GeneCards : COCH
Расположение гена (человек)
Хромосома 14 (человек)
Chr. Хромосома 14 (человек)
Хромосома 14 (человек) Геномное местоположение COCH Геномное местоположение COCH
Полоса 14q12Начало30 874 514 bp
Конец30 895 065 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE COCH 205229 s at fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
SpeciesHumanMouse
Entrez

1690

12810

Ensembl

ENSG00000100473

ENSMUSG00000020953

UniProt

O43405

Q62507

RefSeq (мРНК)

NM_001135058. NM_00408617009352>24>NM_007728

RefSeq (белок)

NP_001128530. NP_001334649. NP_004077

NP_001185764. NP_031754

Местоположение (UCSC)Chr 14: 30,87 - 30,9 Мб 12: 51,59 - 51,61 Мб
PubMed поиск
Wikidata
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Cochlin - это белок, человека кодируется геном COCH . Это белок внеклеточного матрикса (ЕСМ), в большом количестве присутствующий в улитке и преддверии внутреннего уха, составляющий основной неколлагеновый компонент внеклеточного матрикса внутреннего уха. Белок является высококонсервативным у человека, мыши и курицы, показывая 94% и 79% аминокислотную идентичность последовательностей человека и мыши и курицы, соответственно.

Содержание
  • 1 Структура
  • 2 Функция
  • 3 Ссылки
  • 4 Дополнительная литература
Структура

Кохлин содержит три белковых домена: N-концевой домен LCCL и две копии доменов фактора фон Виллебранда типа A.

Функция

Ген экспрессируется в веретенообразных клетках, расположенных вдоль нервных волокон между слуховым ганглием и сенсорным эпителием. Эти клетки сопровождают нейриты в отверстии, через которое проходят нейриты для иннервации волосковых клеток. Это и характер экспрессии этого гена во внутреннем ухе курицы соответствовали гистологическим находкам ацидофильных отложений, соответствующих основному веществу мукополисахарида, в височных костях из DFNA9 (аутосомно-доминантная несиндромальная сенсоневральная глухота 9) пациентов. Сообщалось о мутациях, вызывающих DFNA9 в этом гене.

Кохлин был идентифицирован в трабекулярной сети (TM) пациентов глаукомой, но не у здоровых людей. TM представляет собой подобный фильтру участок ткани глаза; кохлин может играть роль в адгезии клеток, механочувствительности и модуляции фильтра TM.

Он также экспрессируется в фолликулярных дендритных клетках селезенки и лимфатических узлах. Здесь кохлин расщепляется аггреканазой и секретируется в кровоток во время воспаления, способствуя антибактериальному врожденному иммунному ответу.

Ссылки
Дополнительная литература
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR030743
Последняя правка сделана 2021-05-15 13:25:49
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте