Фактор транскрипции, связанный с микрофтальмией

редактировать

MITF
Доступные структуры
PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы MITF, CMM8, MI, WS2, WS2A, bHLHe32, фактор транскрипции, связанный с микрофтальмией, транскрипция, связанная с меланогенезом фактор, COMMAD, фактор транскрипции, индуцирующий меланоциты
Внешние идентификаторыOMIM: 156845 MGI: 104554 HomoloGene: 4892 Генные карты: MITF
Местоположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr. Хромосома 3 (человек)
Хромосома 3 (человек) Местоположение генома для MITF Местоположение генома для MITF
Полоса 3p13Начало69,739,435 bp
Конец69,968,337 bp
Экспрессия РНК паттерн
PBB GE MITF 207233 s в fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

4286

17342

Ensembl

ENSG00000187098

ENSMUSG00000035158

UniProt

O75030

Q08874

RefSeq (мРНК)

NM_001113198. NM_001178049. NM_008601

RefSeq (белок)

NP_001106669. NP_40011715C>NP_001106669. NP_4001171520 3: 69,74 - 69,97 Мб

Chr 6: 97,81 - 98,02 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции, связанный с микрофтальмией, также известный как основной белок 32 спираль-петля-спираль класса E или bHLHe32, представляет собой белок tha t у человека кодируется геном MITF .

MITF представляет собой основная спираль-петля-спираль лейциновая застежка фактор транскрипции, участвующий в клонировании - регуляция специфического пути многих типов клеток, включая меланоциты, остеокласты и тучные клетки. Термин «клон-специфичный», поскольку он относится к MITF, означает гены или признаки, которые встречаются только в определенном типе клеток. Следовательно, MITF может участвовать в перестройке сигнальных каскадов, которые специфически необходимы для выживания и физиологической функции их нормальных клеточных предшественников.

MITF вместе с фактором транскрипции EB (TFEB ), TFE3 и TFEC принадлежат к подсемейству родственных белков bHLHZip, называемому семейством транскрипционных факторов MiT-TFE. Факторы способны образовывать стабильные ДНК-связывающие гомо- и гетеродимеры. Ген, кодирующий MITF, находится в локусе mi у мышей, и его протуморогенные мишени включают факторы, участвующие в гибели клеток, репликации ДНК, репарации, митозе, продукции микроРНК, мембранном переносе, митохондриальном метаболизме и многом другом.. Мутация этого гена приводит к глухоте, потере костной массы, маленьким глазам и плохо пигментированным глазам и коже. У людей, поскольку известно, что MITF контролирует экспрессию различных генов, которые необходимы для нормального синтеза меланина в меланоцитах, мутации MITF могут приводить к таким заболеваниям, как меланома, синдром Ваарденбурга и синдром Тиц. Его функция сохраняется у позвоночных, в том числе у рыб, таких как рыбок данио и Xiphophorus.

. Понимание MITF необходимо для понимания того, как прогрессируют определенные клоноспецифичные виды рака и другие заболевания. Кроме того, текущие и будущие исследования могут привести к потенциальным возможностям нацеливания на этот механизм фактора транскрипции для предотвращения рака.

Содержание
  • 1 Клиническая значимость
    • 1.1 Мутации
    • 1.2 Меланома
  • 2 Гены-мишени
  • 3 LysRS-Ap 4 Сигнальный путь A-MITF
  • 4 Фосфорилирование
  • 5 Взаимодействия
  • 6 Регуляция трансляции
  • 7 См. Также
  • 8 Ссылки
  • 9 Внешние ссылки
Клиническое значение

Мутации

Как упоминалось выше, изменения в MITF могут привести к серьезным заболеваниям. Например, мутации MITF были вовлечены как в синдром Ваарденбурга, так и в синдром Титца..

Синдром Ваарденбурга является редким генетическим заболеванием. Его симптомы включают глухоту, незначительные дефекты и аномалии пигментации. Мутации в гене MITF были обнаружены у некоторых пациентов с синдромом Ваарденбурга II типа. Обнаружены мутации, которые изменяют аминокислотную последовательность, что приводит к аномально маленькому MITF. Эти мутации нарушают образование димеров и, как следствие, вызывают недостаточное развитие меланоцитов. Нехватка меланоцитов вызывает некоторые характерные черты синдрома Ваарденбурга.

Синдром Тиц, впервые описанный в 1923 году, представляет собой врожденное заболевание, часто характеризующееся глухотой и лейцизмом. Тиц вызван мутацией в гене MITF. Мутация в MITF удаляет или изменяет одну пару аминокислотных оснований, в частности, в области основного мотива белка MITF. Новый белок MITF не может связываться с ДНК и развитием меланоцитов, и, следовательно, производство меланина изменяется. Уменьшение количества меланоцитов может привести к потере слуха, а снижение выработки меланина может объяснить светлый цвет кожи и волос, которые делают синдром Титца столь заметным.

Меланома

Меланоциты широко известны как клетки которые отвечают за выработку пигмента меланина, который окрашивает волосы, кожу и ногти. Точные механизмы того, как именно меланоциты становятся злокачественными, относительно неясны, но продолжаются исследования, чтобы получить больше информации об этом процессе. Например, было обнаружено, что ДНК определенных генов часто повреждается в клетках меланомы, скорее всего, в результате повреждения УФ-излучением, что, в свою очередь, увеличивает вероятность развития меланомы. В частности, было обнаружено, что большой процент меланом имеет мутации в гене B-RAF, который приводит к меланоме, вызывая каскад киназ MEK-ERK при активации. В дополнение к B-RAF, MITF, как известно, играет решающую роль в прогрессировании меланомы. Поскольку это фактор транскрипции, который участвует в регуляции генов, связанных с инвазивностью, миграцией и метастазированием, он может играть роль в прогрессировании меланомы. На рисунке 1 показаны специфические активаторы и мишени MITF, которые связаны с выживанием, миграцией, пролиферацией, инвазией и метастазированием клеток меланомы.

Гены-мишени

MITF распознает последовательности E-бокса (CAYRTG) и M-бокса (TCAYRTG или CAYRTGA) в промоторных областях генов-мишеней. Известные гены-мишени (подтвержденные по крайней мере двумя независимыми источниками) этого фактора транскрипции включают,

ACP5 BCL2 BEST1 BIRC7
CDK2 CLCN7 DCT EDNRB
GPNMB GPR143 MC1R MLANA
OSTM1 RAB27A SILV SLC45A2
TBX2 TRPM1 TYR TYRP1

Дополнительные гены, идентифицированные с помощью исследования микроматрицы (которое подтвердило указанные выше цели), включают следующие,

MBP TNFRSF14 IRF4
PLA1A APOLD1 KCNN2 INPP4B
CAPN3 LGALS3 GREB1 FRMD4B
SLC1A4 GMPR ASAH1
MICAL1 TMC6 ITPKB SLC7A8 Путь передачи сигналов LysRS-Ap 4 A-MITF

LysRS -Ap 4 Путь передачи сигналов A-MITF был впервые обнаружен в тучные клетки, в которых путь A митоген-активируемой протеинкиназы (MAPK) активируется при стимуляции аллергеном. Связывание иммуноглобулина E с высокоаффинным рецептором IgE (FcεRI ) дает стимул, с которого начинается е каскад.

Лизил- тРНК-синтетаза (LysRS) обычно находится в мультисинтетазном комплексе. Этот комплекс состоит из девяти различных аминоацил-тРНК-синтетаз и трех каркасных белков и был назван «сигнаносомой» из-за его некаталитических функций передачи сигналов. После активации LysRS фосфорилируется по серину 207 MAPK-зависимым образом. Это фосфорилирование заставляет LysRS изменять свою конформацию, отделяться от комплекса и перемещаться в ядро, где он связывается с кодирующим нуклеотид-связывающим белком 1 гистидиновой триады (HINT1), образуя таким образом ингибирующий комплекс MITF-HINT1. Конформационное изменение также переключает активность LysRS с аминоацилирования лизиновой тРНК на продукцию диаденозинтетрафосфата (Ap4A). Ap4A, который представляет собой аденозин, соединенный с другим аденозином через 5’-5’-тетрафосфатный мостик, связывается с HINT1, и это высвобождает MITF из ингибиторного комплекса, позволяя ему транскрибировать свои гены-мишени. В частности, Ap4A вызывает полимеризацию молекулы HINT1 в филаменты. Полимеризация блокирует интерфейс для MITF и, таким образом, предотвращает связывание двух белков. Этот механизм зависит от точной длины фосфатного мостика в молекуле Ap4A, поэтому другие нуклеотиды, такие как ATP или AMP, не будут влиять на него.

MITF также является неотъемлемой частью меланоцитов, где он регулирует экспрессию ряда белков с меланогенным потенциалом. Непрерывная экспрессия MITF на определенном уровне является одним из необходимых факторов для пролиферации клеток меланомы, их выживания и предотвращения обнаружения иммунными клетками хозяина посредством распознавания Т-клетками антигена, ассоциированного с меланомой (мелан-А). Было показано, что посттрансляционные модификации молекул HINT1 влияют на экспрессию гена MITF, а также на связывание Ap4A. Было показано, что мутации в самом HINT1 являются причиной аксональной невропатии. Регуляторный механизм основан на ферменте диаденозинтетрафосфатгидролазе, члене ферментативного семейства Nudix типа 2 (NUDT2), который расщепляет Ap4A, делает возможным связывание HINT1 с MITF и, таким образом, подавляет экспрессию транскрибируемого MITF. гены. Также было показано, что сам NUDT2 связан с карциномой груди человека, где он способствует клеточной пролиферации. Фермент имеет размер 17 кДа и может свободно диффундировать между ядром и цитозолем, что объясняет его присутствие в ядре. Также было показано, что он активно транспортируется в ядро ​​за счет прямого взаимодействия с N-концевым доменом импортина-β при иммунологической стимуляции тучных клеток. Все больше данных указывает на тот факт, что сигнальный путь LysRS-Ap4A-MITF фактически является неотъемлемым аспектом контроля транскрипционной активности MITF.

Активация сигнального пути LysRS-Ap4A-MITF с помощью изопротеренола подтверждено в кардиомиоцитах. Специфическая для сердца изоформа MITF является основным регулятором сердечного роста и гипертрофии, отвечающим за рост сердца и физиологический ответ кардиомиоцитов на бета-адренергическую стимуляцию.

Фосфорилирование

MITF фосфорилируется по нескольким остаткам серина и тирозина. Фосфорилирование серина регулируется несколькими сигнальными путями, включая MAPK / BRAF / ERK, рецепторную тирозинкиназу KIT, GSK-3 и mTOR. Кроме того, несколько киназ, включая PI3K, AKT, SRC и P38, также являются критическими активаторами фосфорилирования MITF.. Напротив, фосфорилирование тирозина индуцируется присутствием онкогенной мутации KIT D816V. Этот путь KIT зависит от передачи сигналов активации семейства белков SRC. Индукция фосфорилирования серина часто изменяемым путем MAPK / BRAF и путем GSK-3 в меланоме регулирует ядерный экспорт MITF и тем самым снижает активность MITF в ядре. Точно так же фосфорилирование тирозина, опосредованное наличием онкогенной мутации KIT D816V, также увеличивает присутствие MITF в цитоплазме.

Взаимодействия

Большинство факторов транскрипции действуют совместно с другие факторы посредством белок-белковых взаимодействий. Ассоциация MITF с другими белками является критическим шагом в регуляции транскрипционной активности, опосредованной MITF. Некоторые обычно изучаемые взаимодействия MITF включают взаимодействия с MAZR, PIAS3, hUBC9, PKC1 и LEF1. Изучение разнообразия структур дает представление о различных ролях MITF в клетке.

Связанный с Myc фактор, связанный с белком цинковых пальцев (MAZR), взаимодействует с Zip-доменом MITF. При совместной экспрессии как MAZR, так и MITF увеличивают промоторную активность гена mMCP-6. MAZR и MITF вместе трансактивируют ген mMCP-6. MAZR также играет роль в фенотипической экспрессии тучных клеток в ассоциации с MITF.

PIAS3 является ингибитором транскрипции, который действует, ингибируя активность связывания ДНК STAT3. PIAS3 напрямую взаимодействует с MITF, а STAT3 не мешает взаимодействию между PIAS3 и MITF. PIAS3 функционирует как ключевая молекула в подавлении транскрипционной активности MITF. Это важно при рассмотрении развития тучных клеток и меланоцитов.

MITF, TFE3 и TFEB являются частью основного семейства факторов транскрипции спираль-петля-спираль-лейциновая застежка-молния. Каждый белок, кодируемый семейством факторов транскрипции, может связывать ДНК. MITF необходим для развития меланоцитов и глаз, и новые исследования показывают, что TFE3 также необходим для развития остеокластов, функции, дублирующей MITF. Комбинированная потеря обоих генов приводит к тяжелому остеопетрозу, указывая на взаимодействие между MITF и другими членами его семейства факторов транскрипции. В свою очередь, TFEB был назван главным регулятором биогенеза лизосом и аутофагии. Интересно, что MITF, TFEB и TFE3 раздельные роли в модулировании аутофагии, вызванной голоданием, были описаны при меланоме. Более того, белки MITF и TFEB напрямую регулируют экспрессию мРНК и белка друг друга, в то время как их субклеточная локализация и транскрипционная активность подвержены аналогичной модуляции, например сигнальный путь mTOR.

представляет собой убиквитин. конъюгированный фермент, белки которого связываются с MITF. Хотя известно, что hUBC9 действует преимущественно с SENTRIN / SUMO1, анализ in vitro продемонстрировал большую фактическую связь с MITF. hUBC9 является важным регулятором дифференцировки меланоцитов. Для этого он нацелен на MITF для деградации протеасом.

Белок 1, взаимодействующий с протеинкиназой C (PKC1), ассоциируется с MITF. Их ассоциация снижается при активации клеток. Когда это происходит, MITF отключается от PKC1. PKC1 сам по себе, обнаруженный в цитозоле и ядре, не имеет известной физиологической функции. Однако он обладает способностью подавлять транскрипционную активность MITF и может действовать как in vivo негативный регулятор транскрипционной активности, индуцированной MITF.

Результатом функционального взаимодействия между MITF и лимфоидным увеличивающим фактором (LEF-1) является в синергической трансактивации промотора гена допахромтаутомеразы, который является ранним маркером меланобластов. LEF-1 участвует в процессе регуляции передачи сигналов Wnt. LEF-1 также взаимодействует с белками, родственными MITF, такими как TFE3. MITF является модулятором LEF-1, и эта регуляция обеспечивает эффективное распространение сигналов Wnt во многих клетках.

Регуляция трансляции

Регуляция трансляции MITF все еще остается неисследованной областью, где есть только два равноправных узла. рассмотрел документы (по состоянию на 2019 год), подчеркнув важность. Во время глутаминового голодания клеток меланомы увеличивается количество транскриптов ATF4, а также трансляция мРНК из-за фосфорилирования eIF2α. Эта цепочка молекулярных событий приводит к двум уровням подавления MITF: во-первых, белок ATF4 связывает и подавляет транскрипцию MITF, а во-вторых, eIF2α блокирует трансляцию MITF, возможно, за счет ингибирования eIF2B с помощью eIF2α.

MITF также может быть непосредственно трансляционно модифицирован с помощью РНК-геликазы DDX3X. 5 'UTR MITF содержит важные регуляторные элементы (IRES ), которые распознаются, связываются и активируются DDX3X. Хотя 5'-UTR MITF состоит только из 123 нуклеотидных участков, предполагается, что эта область сворачивается в энергетически выгодные вторичные структуры РНК, включая многоразветвленные петли и асимметричные выпуклости, которые характерны для элементов IRES. Активация этой цис-регуляторных последовательностей с помощью DDX3X способствует экспрессии MITF в клетках меланомы.

См. Также
Ссылки
Внешний ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-30 10:07:51
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru