Войти
| ДНК-связывающий домен основной спираль-петля-спираль | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Основная спираль-петля -спиральный структурный мотив ARNT. Две α-спирали (синие) соединены короткой петлей (red). | |||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | bHLH | ||||||||||
| Pfam | PF00010 | ||||||||||
| InterPro | IPR001092 | ||||||||||
| SMART | SM00353 | ||||||||||
| PROSITE | PDOC00038 | ||||||||||
| SCOPe | 1mdy / SUPFAM | ||||||||||
| CDD | cd00083 | ||||||||||
| |||||||||||
A основная спираль-петля-спираль (bHLH ) представляет собой белок структурный мотив, который характеризует одно из самых больших семейств димеризующихся факторов транскрипции..
Факторы транскрипции bHLH часто играют важную роль в развитии или клеточной активности. Во-первых, BMAL1-Clock является основным транскрипционным комплексом в молекулярных циркадных часах. Другие гены, такие как c-Myc и HIF-1, были связаны с раком из-за их влияния на рост клеток и метаболизм.
Мотив характеризуется двумя α-спиралями, соединенными петлей. В общем, факторы транскрипции, включающие этот домен, являются димерными, каждый из которых имеет одну спираль, содержащую основные аминокислотные остатки, которые способствуют связыванию ДНК. Как правило, одна спираль меньше по размеру и из-за гибкости петли позволяет димеризоваться за счет сворачивания и упаковки по отношению к другой спирали. Более крупная спираль обычно содержит ДНК-связывающие области. Белки bHLH обычно связываются с консенсусной последовательностью , называемой E-box, CANNTG. Канонический E-box - это CACGTG (палиндромный ), однако некоторые факторы транскрипции bHLH, особенно из семейства bHLH- PAS, связываются с родственными непалиндромными последовательности, похожие на E-box. ТФ bHLH могут гомодимеризоваться или гетеродимеризоваться с другими ТФ bHLH и образовывать большое разнообразие димеров, каждый из которых обладает определенными функциями.
Филогенетический анализ показал, что белки bHLH делятся на 6 основных групп, обозначены буквами от A до F. Примеры факторов транскрипции, содержащих bHLH, включают:
Эти белки содержат два дополнительных домена PAS после домена bHLH.
Эти белки содержат дополнительный домен COE
Поскольку многие факторы транскрипции bHLH являются гетеродимерными, их активность часто сильно регулируется димеризацией субъединиц. Экспрессия или доступность одной субъединицы часто контролируется, тогда как другая субъединица экспрессируется конститутивно. Многие из известных регуляторных белков, такие как белок Drosophila extramacrochaetae, имеют структуру спираль-петля-спираль, но не имеют основной области, что делает их неспособными связываться с ДНК. самостоятельно. Однако они способны образовывать гетеродимеры с белками, имеющими структуру bHLH, и инактивировать свои способности в качестве факторов транскрипции.
AHR ; AHRR ; ARNT ; ARNT2 ; ARNTL ; ARNTL2 ; ASCL1 ; ASCL2 ; ; ; ATOH1 ; ; ; BHLHB2 ; BHLHB3 ; ; ; BHLHB8 ; ЧАСЫ ; EPAS1 ; ; FIGLA ; HAND1 ; HAND2 ; HES1 ; HES2 ; HES3 ; ; HES5 ; HES6 ; ; HEY1 ; ЭЙ2 ; HIF1A ; ID1 ; ID2 ; ID3 ; ID4 ; ; LYL1 ; ; ; МАКС ; MESP1 ; MESP2 ; ; MITF ; MLX ; ; MLXIPL ; MNT ; MSC ; ; MXD1 ; MXD3 ; MXD4 ; MXI1 ; MYC ; MYCL1 ; ; MYCN ; MYF5 ; MYF6 ; MYOD1 ; МИОГ ; NCOA1 ; NCOA3 ; NEUROD1 ; NEUROD2 ; ; ; NEUROG1 ; NEUROG2 ; NEUROG3 ; NHLH1 ; ; НПАС1 ; НПАС2 ; НПАС3 ; НПАС4 ; ; OLIG1 ; OLIG2 ; ; PTF1A ; SCL ; ; SIM1 ; SIM2 ; ; ; SREBF1 ; SREBF2 ; TAL1 ; TAL2 ; TCF12 ; TCF15 ; TCF21 ; TCF3 ; TCF4 ; ; TFAP4 ; TFE3 ; TFEB ; TFEC ; TWIST1 ; TWIST2 ; USF1 ; USF2 ;
