ARID2

редактировать
ARID2
Идентификаторы
Псевдонимы ARID2, BAF200, p200, AT-богатый домен взаимодействия 2, CSS6
Внешние идентификаторыOMIM: 609539 MGI: 1924294 HomoloGene: 14601 GeneCards: ARID2
Местоположение гена (человек)
Chr. Хромосома 12 (человек)
Группа 12q12Начало45,729,706 bp
Конец45,908,040 bp
Экспрессия РНК шаблон


Подробнее справочные данные экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

196528

77044

Ensembl

ENSG00000189079

ENSMUSG00000033237

UniProt

Q68CP9

E9Q7E2

RefSeq (mRNA)

NM_152641>NM_152641 NM_175251

RefSeq (белок)

NP_001334768
NP_689854

NP_780460

Местоположение (UCSC)Chr 12: 45,73 - 45,91 Мб Chr 15: 96,29 - 96,4 Мб
PubMed поиск
Викидат a
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

AT-богатый интерактивный домен, содержащий белок 2(ARID2) - это белок, который в человека кодируется геном ARID2 .

Содержание
  • 1 Функция
  • 2 Структура
  • 3 Клиническая значимость
  • 4 Модельные организмы
  • 5 Ссылки
  • 6 Дополнительная литература
  • 7 Внешние ссылки
Функция

ARID2 - это субъединица комплекса ремоделирования хроматина PBAF, который способствует лиганд-зависимой транскрипционной активации ядерными рецепторами.

Структура

Белок ARID2 содержит два консервативных С-концевых C2H2мотива «цинковые пальцы», область, богатую аминокислотой остатков пролин и глутамин, крылатая спираль типа RFX (регуляторный фактор X) ДНК-связывающий домен и консервативный N- концевой A T -обогатый домен взаимодействия ДНК - последний домен, для которого назван белок.

Клиническая значимость

Исследования мутаций выявили ARID2 быть значительным супрессором опухоли при многих подтипах рака. Мутации ARID2 преобладают при гепатоцеллюлярной карциноме и меланоме. Мутации присутствуют в меньшей, но значительной фракции в широком диапазоне других опухолей. Мутации ARID2 обогащены гепатит C-ассоциированной гепатоцеллюлярной карциномой в популяциях пациентов в США и Европе по сравнению с общей частотой мутаций .

Модельные организмы

Ген ARID2, расположенный на хромосоме 12q у человека, состоит из 21 экзоны ; ортологи известны от мышей, крыс, крупного рогатого скота, кур и комаров. Модельные организмы использовались в исследовании функции ARID2. Условная линия нокаутных мышей, названная Arid2, была создана в рамках программы International Knockout Mouse Consortium, проекта высокопроизводительного мутагенеза с целью создания и распространения животных моделей болезней среди заинтересованных ученых.

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения эффектов делеции. Было проведено двадцать шесть тестов на мутантных взрослых мышах, и были обнаружены два значительных отклонения от нормы. В ходе рецессивного летального исследования было обнаружено меньше гомозиготных мутантных эмбрионов во время беременности, чем предсказывалось менделевским соотношением. Во втором исследовании гомозиготные мутантные животные не выжили до отъема. Остальные тесты были выполнены на гетерозиготных мутантных взрослых мышах; в них не было обнаружено отклонений.

Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, которая находится в общественном достоянии.

Последняя правка сделана 2021-06-09 02:01:46
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте