C9orf152

C9orf152
Идентификаторы
Псевдонимы	C9orf152, bA470J20.2, открытая рамка считывания хромосомы 9 152
Внешние идентификаторы	MGI: 2442889 HomoloGene: 52276 Генные карты: C9orf152
Местоположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек) Полоса 9q31.3 Начало 110,190,048 bp Конец 110,208,189 bp
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Энтрез	401546	242484
Ensembl	ENSG00000188959	н / д
UniProt	Q5JTZ5	Q8K0M7
RefSeq (мРНК)	NM_001012993	NM_178727
RefSeq11 NP_00 (белок)	NP_00 272>NP_001013011.2	NP_848842
Местоположение (UCSC)	Chr 9: 110,19 - 110,21 Мб	нет данных
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Открытая рамка считывания хромосомы 9 152 представляет собой белок, который у человека кодируется геном C9orf152 . Точная функция белка полностью не изучена.

• 1 Ген
• 2 Эволюция
• 3 Белок
• 4 Экспрессия
• 5 Ссылки
• 6 Внешние ссылки

Ген C9orf152 человека расположен на длинном (q) плече хромосомы 9. Его цитогенетическое местоположение - 9q31.1. У него есть один известный псевдоним: bA470J20.2.

Последовательность ДНК, кодирующая C9orf152, содержит единственный интрон. Конечная мРНК состоит из 2698 пар оснований. Нуклеотиды 66-68 кодируют верхний стоп-кодон в рамке считывания.

Точное расположение C9orf152 рядом с ближайшими генетическими соседями.

C9orf152 имеет ортологи у млекопитающих, птиц, рептилий и земноводных. Ортологи не обнаружены у костистой рыбы или у каких-либо беспозвоночных. В следующей таблице перечислены подмножества сохраненных ортологов.

Научное название	Обычное название	Регистрационный номер	Длина последовательности (аа)	Процент идентичности	Процент сходства
Homo sapiens	Человек	NP_001013011.2	239	-	-
Пан троглодиты	Шимпанзе	XP_001145187	239	98	98
Tarsius syrichta	Филиппинский долгопят	XP_008064367	237	78	85
Ceratotherium simum simum	Rhinoceros	XP_004423784	239	78	82
Sus scrofa	Кабан	XP_003122117	239	74	83
Equus caballus	Horse	XP_001491697	239	74	80
Tursiops truncatus	Афалин	XP_004329084	234	73	81
Heterocephalus glaber	Голый землекоп	XP_004903816	239	74	84
Orcinus orca	Косатка	XP_004269444	231	72	79
Mus musculus	Мышь	NP_848842	236	62	72
Rattus norvegicus	Крыса	XP_003754080	234	62	70
Chelonia mydas	Зеленая морская черепаха	XP_0 07059491	267	33	49
Nestor notabilis	Kea	XP_010009525	265	34	49
Python bivittatus	Бирманский питон	XP_007428415	234	30	44
Meleagris gallopavo	Дикая индейка	XP_010710660	267	29	43
Pelodiscus sinensis	Китайская черепаха софтшелл	XP_006120615	268	29	43
Haliaeetus albicilla	Орлан-белохвост	XP_009911401	266	33	48
Xenopus tropicalis	Западная когтистая лягушка	XP_004915565	226	31	45

Различия среди представленных ортологов предполагают медленную скорость эволюции.

Открытая рамка считывания 152 хромосомы 9 содержит 239 аминокислот. Молекулярная масса составляет 26,3 килодальтон. Белок имеет высокую вероятность существования ядерной области клеток. Вероятно, отсутствуют трансмембранные области. Существует одна изоформа, содержащая 194 аминокислоты.

В кодирующей последовательности есть два сайта сумоилирования и один сайт фосфорилирования серина .

Существует три области, которые, как предсказано, образуют альфа-спирали на конечном белке.

Экспрессия C9orf152 в мозге мыши с помощью Allen Brain Atlas. Единственная область с высокой экспрессией - темно-пурпурный слева, который расположен в обонятельной луковице.

C9orf152 экспрессируется в мочевом пузыре, кишечнике, молочной железе. железа и трахея и в меньших количествах в легких, печени, простате, матке, и мозг. В головном мозге экспрессия C9orf152 ограничена обонятельной луковицей. Было обнаружено, что экспрессия генов увеличивается при наличии стресса, включая заболевание и тепловой стресс.

. Большое количество факторов транскрипции взаимодействуют с промотором из C9orf152, в первую очередь два обонятельных фактора (в частности, нейрон-специфический обонятельный фактор и обонятельно связанный белок цинковых пальцев) и отрицательный глюкокортикоидный ответный элемент.

• Местоположение генома человека C9orf152 и страница сведений о гене C9orf152 в Браузере генома UCSC.