Войти
Трансмембранный домен обычно обозначает трансмембранный сегмент одиночной альфа-спирали трансмембранного белка. В более широком смысле, трансмембранный домен представляет собой любой охватывающий мембрану домен белка.
Трансмембранные спирали видны в структурах мембранных белков, определяемых с помощью дифракции рентгеновских лучей. Их также можно предсказать на основе шкал гидрофобности. Поскольку внутренняя часть бислоя и внутренняя часть большинства белков известной структуры являются гидрофобными, предполагается, что аминокислоты, которые покрывают мембрану, должны быть гидрофобными, поскольку Что ж. Однако мембранные насосы и ионные каналы также содержат многочисленные заряженные и полярные остатки в пределах обычно неполярных трансмембранных сегментов.
Использование анализа гидрофобности для предсказания трансмембранных спиралей позволяет, в свою очередь, предсказывать «трансмембранную топологию» белка; то есть предсказание того, какие ее части выступают в клетку, какие выступают наружу и сколько раз белковая цепь пересекает мембрану.
