Каталитический домен лимонен-1,2-эпоксидгидролазы | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
лимонен-1,2-эпоксидгидролаза | |||||||||
Идентификаторы | |||||||||
Символ | LEH | ||||||||
Pfam | PF07858 | ||||||||
Pfam клан | CL0051 | ||||||||
InterPro | IPR013100 | ||||||||
SCOPe | 1nww / SUPFAM | ||||||||
надсемейство OPM | 133 | ||||||||
Белок OPM | 2bng | ||||||||
|
лимонен-1,2-эпоксидгидролаза | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
номер ЕС | 3.3.2.8 | ||||||||
Базы данных | |||||||||
IntEnz | Представление IntEnz | ||||||||
BRENDA | Запись BRENDA | ||||||||
ExPASy | Представление NiceZyme | ||||||||
KEGG | Запись KEGG | ||||||||
MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
PRIAM | профиль | ||||||||
PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
Онтология генов | AmiGO / QuickGO | ||||||||
|
В энзимологии, лимонен-1,2-эпоксидгидролаза (EC 3.3.2.8 ) представляет собой фермент, который катализирует химическую реакцию
Таким образом, два субстрата этого фермента представляют собой и H2O, тогда как его продукт представляет собой.
Этот фермент принадлежит к семейству гидролаз, в частности ферментов, действующих на простые эфирные связи (эфирные гидролазы). систематическое название этого класса ферментов - лимонен-1,2-эпоксидгидролаза . Этот фермент также называется гидролазой оксида лимонена . Этот фермент участвует в разложении лимонена и пинена.
Эпоксид гидролазы катализируют гидролиз эпоксидов до соответствующих диолов, что важно для детоксикации, синтеза сигнала молекул, или метаболизм. Лимонен-1,2-эпоксидгидролаза (LEH) отличается от многих других эпоксидгидролаз своей структурой и новым одностадийным каталитическим механизмом. Его основная складка состоит из шести нитей смешанного бета-листа, с тремя N-концевыми альфа-спиралями, упакованными с одной стороны, чтобы создать карман, который простирается в ядро белка. Четвертая спираль расположена таким образом, что действует как край этого кармана. Хотя в основном этот карман выстлан гидрофобными остатками, этот карман имеет кластер полярных групп, которые лежат в его самой глубокой точке и составляют ферменты активный сайт.
.