Войти
| 4-аминобутираттрансаминазы | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 2.6.1.19 | ||||||||
| Номер CAS | 9037-67-6 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | IntEnz view | ||||||||
| BRENDA | BRENDA entry | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme view | ||||||||
| KEGG | KEGG entry | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| PRIAM | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Онтология гена | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| 4-аминобутираттрансаминаза | |
|---|---|
| Идентификаторы | |
| Символ | ABAT |
| Ген NCBI | 18 |
| HGNC | 23 |
| OMIM | 137150 |
| RefSeq | NM_020686 |
| UniProt | P80404 |
| Прочие данные | |
| Locus | Chr. 16 p13.2 |
В энзимологии, 4-аминобутираттрансаминаза (EC 2.6.1.19 ), также называемая ГАМК трансаминаза или 4-аминобутират аминотрансфераза, или GABA-T, представляет собой фермент, который катализирует химическую реакцию :
сукцинатный полуальдегид + L-глутаматТаким образом, двумя субстратами этого фермента являются 4-аминобутаноат ( ГАМК ) и 2-оксоглутарат. Два продукта - это полуальдегид сукцината и L-глутамат.
Этот фермент принадлежит к семейству трансфераз, в частности, трансаминаз, переносящие азотистые группы. систематическое название этого класса ферментов - 4-аминобутаноат: 2-оксоглутарат аминотрансфераза . Этот фермент участвует в 5 метаболических путях: метаболизм аланина и аспартата , метаболизм глутамата, метаболизм бета-аланина, метаболизм пропаноата и метаболизм бутаноата. В нем используется один кофактор, пиридоксальфосфат.
Этот фермент содержится в прокариотах, растениях, грибах и животные (включая людей ). Свиньи часто использовали при изучении того, как этот белок может работать у людей.
GABA-T - Номер комиссии по ферментам 2,6.1.19. Это означает, что он относится к классу ферментов трансферазы, подклассу азотистых трансфераз и подклассу трансаминаз. Как азотистая трансфераза, ее роль заключается в переносе азотистых групп от одной молекулы к другой. Как трансаминаза, роль ГАМК-Т заключается в перемещении функциональных групп с аминокислоты и α-кетокислоты, и наоборот. В случае ГАМК-Т он берет азотную группу из ГАМК и использует ее для создания L-глутамата.
У животных, грибов и бактерий GABA-T помогает облегчить реакцию, которая перемещает аминную группу из GABA в 2-оксоглутарат, и кетон группа от 2-оксоглутарата до ГАМК. Это производит сукцинат полуальдегид и L-глутамат. В растениях пируват и глиоксилат могут использоваться вместо 2-оксоглутарата.
Основная роль ГАМК -T должен разрушить ГАМК как часть ГАМК-шунта. На следующем этапе шунта полуальдегид, продуцируемый ГАМК-Т, будет окислен до янтарной кислоты с помощью сукцинат-полуальдегиддегидрогеназы, в результате чего получится сукцинат. Затем этот сукцинат войдет в митохондрию и станет частью цикла лимонной кислоты. Цикл критической кислоты может затем производить 2-оксоглутарат, который можно использовать для производства глутамата, который, в свою очередь, может превращаться в ГАМК, продолжая цикл.
ГАМК является очень важным нейромедиатором мозг животных, а низкая концентрация ГАМК в мозге млекопитающих была связана с несколькими неврологическими расстройствами, включая болезнь Альцгеймера и болезнь Паркинсона. Поскольку ГАМК-Т разрушает ГАМК, ингибирование этого фермента было целью многих медицинских исследований. Цель этих исследований - найти способ подавить активность ГАМК-Т, который снизил бы скорость превращения ГАМК и 2-оксоглутарата в полуальдегид и L-глутамат, тем самым увеличивая концентрацию ГАМК в головном мозге. У людей также есть генетическое заболевание, которое может привести к дефициту ГАМК-Т. В крайних случаях это может привести к нарушению развития или смерти.
В растениях ГАМК может вырабатываться как реакция на стресс. Растения также используют ГАМК для внутренней передачи сигналов и для взаимодействия с другими организмами рядом с растением. Во всех этих внутрирастительных путях ГАМК-Т возьмет на себя роль деградирующей ГАМК. Также было продемонстрировано, что сукцинат, продуцируемый в шунте ГАМК, составляет значительную часть сукцината, необходимого митохондриям.
У грибов расщепление ГАМК в шунте ГАМК является ключевым в обеспечении поддержания высокого уровень активности в критическом кислотном цикле. Имеются также экспериментальные доказательства того, что расщепление ГАМК под действием ГАМК-Т играет роль в управлении окислительным стрессом у грибов.
Было решено несколько структур для этого класса ферментов, присвоены коды доступа PDB и опубликованы в рецензируемых журналах. По меньшей мере 4 такие структуры были решены с использованием ферментов свиней: 1OHV, 1OHW, 1OHY, 1SF2 и не менее 4 таких структур. были решены в Escherichia coli : 1SFF, 1SZK, 1SZS, 1SZU. На самом деле существуют некоторые различия в структуре ферментов этих организмов. Ферменты E. coli ГАМК-Т не имеют железо-серного кластера, который обнаружен в модели свиньи.
Аминокислотные остатки, обнаруженные в активном центре 4-аминобутираттрансаминазы включают Lys-329, которые обнаруживаются на каждой из двух субъединиц фермента. Этот сайт также будет связываться с коферментом пиридоксаль-5'-фосфат.
 | На Викискладе есть материалы, связанные с 4-аминобутираттрансаминаза. |
