Войти
| Saccharibacteria | |
|---|---|
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Infrakingdom: | Тип излучения кандидата |
| Тип: | Сахарибактерии |
| Синонимы | |
| |
Сахарибактерии, ранее известные как TM7, представляют собой крупную бактериальную линию. Это было обнаружено путем секвенирования 16S рРНК.
. TM7x из полости рта человека был культивирован и показал, что TM7x является чрезвычайно маленьким кокком (200-300 нм) и ведет особый образ жизни, ранее не наблюдавшийся у связанных с человеком микробов. Он является облигатным эпибионтом различных хозяев, включая штамм Actinomyces odontolyticus (XH001), но также имеет фазу паразита, убивая его хозяина. Полная последовательность генома выявила сильно восстановленный геном (705kB) и полное отсутствие способности к биосинтезу аминокислот. В 2014 г. сообщалось о аксенической культуре TM7 из полости рта, но не было представлено ни одной последовательности или культуры.
Наряду с Candidate Phylum она была названа в честь последовательностей, полученных в 1994 году в условиях окружающей среды. исследование образца почвы торфяного болота в Германии, где 262 амплифицированных ПЦР фрагмента 16S рДНК были клонированы в вектор плазмиды, названный клонами ТМ для Torf, Mittlere Schicht (лит. торф, средний слой). Он был обнаружен в нескольких средах, таких как активный ил, водоочистка растительный ил тропический лес почва, человеческая слюна, в ассоциации с губками, тараканами, золотыми приисками, ацетатом с поправками водоносным горизонтом и другими средами (bar термофильный ), что делает его многочисленным и широко распространенным типом. Недавно рДНК TM7 и целые клетки были обнаружены в активном иле с идентичностью>99,7% с TM7 кожи человека и 98,6% идентичности с TM7a орального применения человека, что позволяет предположить, что метаболически активные изоляты TM7 в местах окружающей среды могут служить модельными организмами для исследования роли Виды TM7 влияют на здоровье человека.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Связь между типом TM7 и его ближайшими родственниками, включая Chloroflexi как внешнюю группу |
, специфичную для TM7 Зонды FISH идентифицировали виды из ила биореактора и выявили наличие грамположительных клеточных оболочек и нескольких морфотипов : нити в оболочке (в большом количестве), стержень в виде коротких цепочек, толстой нити и кокков ; первое может быть причиной Eikelboom типа 0041 (проблемы набухания активированного ила). Большинство бактериальных типов являются грамотрицательными diderms, тогда как только Firmicutes, Actinobacteria и Chloroflexi представляют собой монодермы. Кандидат филума TM7 на самом деле является близким родственником Chloroflexi.
Использование поликарбонатной мембраны в качестве поддержки роста и почвенного экстракта в качестве субстрата микроколоний этой клады были выращены, состоящие из длинных нитевидных стержней длиной до 15 мкм с менее чем 50 клетками или коротких стержней с несколькими сотнями клеток на колонию после 10 дней инкубации.
Благодаря микрофлюидному чипу, позволяющему выделение и амплификация генома одной клетки, геном 3 клеток морфологии длинных нитей с идентичной 16S рРНК был секвенирован для создания черновой последовательности генома, подтверждающей некоторые ранее установленные свойства, выясняя некоторые из его метаболических возможностей, обнаруживая новые гены и намек на потенциальные патогенные способности.
Было идентифицировано более 50 различных филотипов, и у него есть относительно скромная дивергенция последовательности 16S рДНК внутри деления, составляющая 17%, которая колеблется от 13 до 33%. Интерактивное филогенетическое дерево TM7, построенное с использованием jsPhyloSVG, обеспечивает быстрый доступ к последовательностям GenBank и расчетам матриц расстояний между ветвями дерева.
Исследования стабильных изотопов показали, что некоторые представители этого типа могут разлагать толуол.
Филогенетическое дерево-кандидат TM7, соединяющееся по соседству 