Candidatus

редактировать

В номенклатуре прокариот , Candidatus (латинское название кандидата на римскую должность, названный в честь белого халата, который носили римские сенаторы) является составной частью таксономическое название бактерии или другого прокариота, которое не может содержаться в коллекции микробиологических культур. Это промежуточный таксономический статус для еще не культивируемых микроорганизмов. Примером может быть «Кандидатус». Это может быть сокращено до "Ca. Phytoplasma allocasuarinae". Статус Candidatus может использоваться, когда вид или род хорошо охарактеризованы, но еще не культивируются. С помощью современных технологий много информации получают с помощью 16S рибосомной РНК или даже почти полных геномов с помощью современных методов метагеномики.

Содержание

  • 1 История
  • 2 Использование
  • 3 См. Также
  • 4 Ссылки
    • 4.1 Дополнительная литература

История

Для достоверной публикации вида бактерии должны быть изолированы, культивированы, описаны и депонированы в коллекции бактериологических культур. Однако некоторые бактерии требуют особых условий культивирования и не могут содержаться в таких коллекциях. К ним относятся облигатно внутриклеточные патогены и эндосимбионты, симбионты насекомых и популяции из океанов или ила. В 1994 году Мюррей и Шлейфер опубликовали таксономическое примечание, в котором они рекомендовали установить новую категорию неопределенного ранга (Candidatus) для некоторых предполагаемых таксонов, которые не могли быть описаны достаточно подробно. для обоснования создания нового таксона . Было также рекомендовано составить список Candidatus в Международном журнале систематической бактериологии - IJSB (ныне Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии ).

Таксономическое примечание, предлагающее установить предварительный статус Candidatus для не полностью описанных прокариот, было опубликовано в январском выпуске IJSB за 1995 год. Согласно этому примечанию, категория Candidatus должна использоваться для описания прокариотических образований, для которых доступно более последовательности ДНК, но для которых отсутствуют характеристики, необходимые для описания в соответствии с Бактериологическим кодексом.. Помимо геномной информации, такой как последовательности, в описание должна быть включена вся информация, включая структурные, метаболические и репродуктивные особенности.

Новые предлагаемые культивируемые бактерии должны быть депонированы как минимум в двух общедоступных коллекциях культур в разных странах.

Использование

Согласно "Специальному комитету по повторной оценке" определения вида в бактериологии ", микробиологам рекомендуется использовать концепцию Candidatus для хорошо охарактеризованных, но еще не культивируемых организмов.

Имена, включенные в эту категорию, обычно записываются как: Candidatus (курсивом), последующее имя (имена) римским шрифтом (с начальной заглавной буквой для названия рода) и полное имя в кавычках.. Например, «Candidatus Phytoplasma », «Candidatus».

См. Также

Ссылки

Дополнительная литература

Последняя правка сделана 2021-05-14 05:15:18
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте