Полинуклеотид e фосфорилаза

редактировать
Класс ферментов
Полинуклеотидфосфорилаза
Кристаллическая структура 1E3P.jpg Структура тримера PNPase из Streptomyces antibioticus. PDB 1e3p.
Идентификаторы
Номер EC 2.7.7.8
Номер CAS 9014-12-4
Базы данных
IntEnz IntEnz view
BRENDA Запись BRENDA
ExPASy Просмотр NiceZyme
KEGG Запись KEGG
MetaCyc метаболический путь
PRIAM профиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Онтология генов AmiGO / QuickGO

Полинуклеотидфосфорилаза (PNPase ) представляет собой бифункциональный фермент с фосфоролитическим от 3 'до 5' активность экзорибонуклеазы и активность 3'-концевой олигонуклеотид полимеразы. То есть он разбирает цепь РНК, начиная с 3 'конца и продвигаясь к 5' концу. Он также синтезирует длинные гетерополимерные хвосты in vivo. Это объясняет все наблюдаемое остаточное полиаденилирование в штаммах Escherichia coli, в котором отсутствует нормальный фермент полиаденилирования. Обнаруженная Марианн Грюнберг-Манаго, работавшей в лаборатории Северо-Очоа в 1955 году, РНК-полимеризационная активность ПНФазы первоначально считалась ответственной за ДНК-зависимый синтез матричной РНК, и это мнение было опровергнуто позднее. 1950-е годы.

Он участвует в процессинге мРНК и деградации у бактерий, растений и людей.

У человека фермент кодируется PNPT1 ген. В своей активной форме белок образует кольцевую структуру, состоящую из трех молекул ПНФазы. Каждая молекула ПНФазы состоит из двух доменов РНКазы PH, домена связывания РНК S1 и домена K-гомологии. Белок присутствует в бактериях и в хлоропластах и митохондриях некоторых эукариотических клеток. У эукариот и архей существует структурно и эволюционно связанный комплекс, называемый экзосомным комплексом.

Такое же сокращение (PNPase) также используется для другого, не связанного с этим фермента, пуринового нуклеозида. фосфорилаза.

Модельные организмы

Модельных организмов были использованы при изучении функции PNPT1. Условная линия мышей с нокаутом, названная Pnpt1, была создана в рамках программы International Knockout Mouse Consortium - проекта высокопроизводительного мутагенеза для создания и распространения животных моделей болезней среди заинтересованных ученых.

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения эффектов делеции. Было проведено двадцать шесть тестов на мутантных мышах, и были обнаружены два значительных отклонения от нормы. Не было идентифицировано гомозиготных мутантных эмбрионов во время беременности, и поэтому ни один из них не выжил до отъема. Остальные тесты были проведены на гетерозиготных мутантных взрослых мышах; у этих животных не наблюдалось дополнительных значимых отклонений.

Человеческая PNPase I
Идентификаторы
СимволPNPASE
Alt. символыPNPase, OLD35, old-35
Ген NCBI 87178
HGNC 23166
OMIM 610316
PDB 1E3P
RefSeq NM_033109
UniProt Q8TCS8
Другие данные
Номер EC 2.7.7.8
Locus Chr. 2 p15
Ссылки
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-06-02 10:35:17
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте