Полимераза

A полимеразы представляет собой фермент (EC 2.7.7.6/7/19/ 48/49), который синтезирует длинные цепи полимеров или нуклеиновых кислот. ДНК-полимераза и РНК-полимераза используются для сборки молекул ДНК и РНК соответственно путем копирования цепи ДНК-матрицы с использованием спаривание оснований взаимодействий или РНК посредством полустестничной репликации.

ДНК-полимераза из термофильной бактерии, Thermus aquaticus (Taq) (PDB 1BGX, EC 2.7.7.7) используется в полимеразной цепной реакции, важном методе молекулярной биологии.

. Полимераза может быть зависимой от матрицы или независимой от матрицы. Поли-А-полимераза представляет собой пример независимой от матрицы полимеразы. Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза, также известная как обладающая независимой от матрицы и зависимой от матрицы активностью.

Содержание

• 1 Типы
• 2 См. Также
• 3 Ссылки
• 4 Внешние ссылки

Типы

• ДНК-полимераза
  • Семейство A: ДНК-полимераза I ; Pol γ, θ, ν
  • Семейство B: ДНК-полимераза II ; Pol α, δ, ε, ζ
  • Семейство C: Холофермент ДНК-полимеразы III
  • Семейство X: ДНК-полимераза IV (DinB) - SOS репарационная полимераза; Pol β, λ, μ
    • Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза (TDT), которая придает разнообразие тяжелым цепям антител.
  • Семейство Y: ДНК-полимераза V (UmuD'2C) - полимераза репарации SOS; Pol η, ι, κ
• обратная транскриптаза, фермент, используемый РНК ретровирусами, такими как ВИЧ, который используется для создания комплементарной цепи к ранее существовавшей цепи вирусная РНК перед тем, как она может быть интегрирована в ДНК клетки host . Он также является основной мишенью для противовирусных препаратов.
• РНК-полимераза
  • Многосубъединичная ДНК-направленная: РНК-полимераза I, РНК-полимераза II, РНК полимераза III
  • Односубъединичная, ДНК-направленная: РНК-полимераза Т7, POLRMT
  • РНК-репликаза
  • Примаза, PrimPol

В общем, вирусные односубъединичные РНК-полимеразы / репликазы / обратная транскриптаза имеют общее происхождение с ДНК-полимеразой. У них есть законсервированный домен «ладонь». Мультисубъединичная РНК-полимераза образует неродственную группу. У примазов более сложная история: бактериальные примазы с доменом Toprim связаны с топоизомеразой и митохрондриальной геликазой, в то время как археи и эукариотические примазы образуют неродственное семейство, возможно, связанное с полимеразной пальмой. Тем не менее оба семейства связаны с одним и тем же набором геликаз.

См. Также

• Центральная догма молекулярной биологии
• Экзонуклеаза
• Лигаза
• Нуклеаза
• ПЦР
• PARP
• Цепная реакция полимеразы с обратной транскрипцией
• РНК-лигаза (АТФ)

Ссылки

1. ^Loc'h, Jérôme (2016). «Структурная основа для новой шаблонной активности терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы: последствия для рекомбинации V (D) J». Состав. 24 (9): 1452–1463. doi : 10.1016 / j.str.2016.06.014. PMID 27499438.
2. ^Hansen JL, Long AM, Schultz SC (август 1997 г.). «Структура РНК-зависимой РНК-полимеразы полиовируса». Состав. 5 (8): 1109–22. DOI : 10.1016 / S0969-2126 (97) 00261-X. PMID 9309225.
3. ^Крамер, П. (февраль 2002 г.). «Многосубъединичные РНК-полимеразы». Текущее мнение в структурной биологии. 12 (1): 89–97. DOI : 10.1016 / S0959-440X (02) 00294-4. PMID 11839495.
4. ^Аравинд, L; Лейпе, DD; Кунин Е.В. (15 сентября 1998 г.). «Топрим - консервативный каталитический домен в топоизомеразах типа IA и II, примазах типа DnaG, нуклеазах семейства OLD и белках RecR». Исследования нуклеиновых кислот. 26 (18): 4205–13. doi : 10.1093 / nar / 26.18.4205. PMC 147817. PMID 9722641.
5. ^Айер, LM; Кунин, Э.В. Лейпе, DD; Аравинд, L (2005). «Происхождение и эволюция надсемейства архео-эукариотических примаз и родственных белков пальмового домена: структурные открытия и новые члены». Исследования нуклеиновых кислот. 33 (12): 3875–96. doi : 10.1093 / nar / gki702. PMC 1176014. PMID 16027112.

Внешние ссылки