Войти
| Candida auris | |
|---|---|
 | |
| Научный класс ification | |
| Царство: | Грибы |
| Подразделение: | Ascomycota |
| Класс: | Saccharomycetes |
| Порядок: | Saccharomycetales |
| Семейство: | Debaryomycetaceae |
| Род : | Candida |
| Виды: | C. auris |
| Биномиальное название | |
| Candida auris . | |
| Типовой штамм | |
| DSM 21092 | |
Предлагаемая схема появления C. auris. Candida auris является видом грибка, который растет как дрожжи. Это один из немногих видов рода Candida, вызывающих кандидоз у людей. Часто кандидоз заражается в больницах пациентами с ослабленной иммунной системой. C. auris может вызывать инвазивный кандидоз (фунгемию ), при котором кровоток, центральная нервная система и внутренние органы инфицированы. Он привлек широкое внимание из-за его множественной лекарственной устойчивости. Лечение также осложняется тем, что его легко ошибочно идентифицировать с другими видами Candida.
С. auris был впервые описан в 2009 году после того, как он был изолирован из слухового прохода 70-летней японки в Токийской столичной гериатрической больнице в Японии в 2009 году. В 2011 году в Южной Корее были зарегистрированы первые случаи заболевания C. auris, вызывающего заболевание.. Сообщается, что это распространилось по Азии и Европе и впервые появилось в США в 2013 году.
Анализ ДНК четырех различных, но устойчивых к лекарствам штаммов Candida auris указывает на эволюционное расхождение, имеющее место в не менее 4000 лет назад, с общим скачком среди четырех разновидностей к лекарственной устойчивости, возможно, связанным с широким распространением противогрибковых средств азольного типа в сельском хозяйстве.
Впервые идентифицированный в 2009 г. Candida auris является видом аскомицетного гриба рода Candida, который растет как дрожжи. Его название происходит от латинского слова «ухо», auris. Он образует гладкие, блестящие, беловато-серые вязкие колонии на питательной среде. Микроскопически клетки имеют форму эллипса.
Candida auris - один из немногих видов Candida, которые могут вызывать кандидоз у людей. Кандидоз чаще всего передается в больницах у пациентов с ослабленной иммунной системой. Это может вызвать инвазивный кандидоз, при котором кровоток (фунгемия ), центральная нервная система, почки, печень, поражены кости, мышцы, суставы, селезенка или глаза. Обычно он проявляется другими сопутствующими заболеваниями, такими как диабет, сепсис, заболевания легких и заболевания почек.
C. auris привлек повышенное клиническое внимание из-за его множественной лекарственной устойчивости.
In vitro более 90% изолятов C. auris устойчивы к флуконазолу и диапазону 3–73% C. Изоляты.auris устойчивы к вориконазолу, тогда как другие триазолы (позаконазол, итраконазол и изавуконазол) проявляют лучшую активность. Изолятов от 13% до 35% были устойчивы к амфотерицину B; однако большинство изолятов чувствительны к эхинокандинам.
Лечение затруднено, потому что C. auris легко ошибочно идентифицировать как различные другие виды Candida. Краткое описание его клинической значимости по состоянию на 2016 год, понятное широкой аудитории, было опубликовано Центром исследований и политики в области инфекционных заболеваний при Университете Миннесоты.
Согласно Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC), 30–60% людей с инфекциями кровотока, вызванными C. auris, умерли. Однако у многих из этих людей были другие серьезные заболевания и состояния, которые также увеличивали риск смерти.
Несколько черновиков геномов из секвенирования полного генома были опубликованы. Размер генома C. auris составляет 12,3–12,5 МБ с GC-содержанием 44,5–44,8%. Было обнаружено, что геном C. auris кодирует несколько генов для семейства транспортеров ABC, суперсемейства основных фасилитаторов, что помогает объяснить его множественную лекарственную устойчивость. Его геном также кодирует семейства генов, связанных с вирулентностью, такие как липазы, переносчики олигопептидов, маннозилтрансферазы и факторы транскрипции, которые способствуют колонизации, инвазии., и приобретение железа. Другим фактором, способствующим устойчивости к противогрибковым, является наличие набора генов, которые, как известно, участвуют в формировании биопленки.
Необходимы дополнительные исследования, чтобы определить, существует ли филогенетическая дивергенция. клонов C. auris демонстрируют регионально-специфические образцы инвазивности, вирулентности и / или устойчивости к лекарствам.
Филогенетика C. auris предполагают, что различные генотипы существуют в разных географических регионах со значительным геномным разнообразием. Для подтверждения этого вывода использовались различные аналитические методы, основанные на последовательностях.
Секвенирование всего генома и анализ изолятов из Пакистана, Индии, Южной Африки, Венесуэлы, Японии, а также ранее секвенированные геномы C. auris, депонированные в Национальном центре биотехнологической информации '' Sequence Read Архив выявил четкое географическое распределение генотипов. Были идентифицированы четыре различных клады, разделенных десятками тысяч однонуклеотидных полиморфизмов. Распространение этих клад разделено географически на Южную Азию (Индия и Пакистан), Южную Африку, Венесуэлу и Японию с минимальным наблюдаемым внутрирегиональным генетическим разнообразием.
Полиморфизм длины амплифицированных фрагментов анализ изолятов C. auris из Соединенного Королевства, Индия, Япония, Южная Африка, Южная Корея и Венесуэла предположили, что лондонские изоляты образуют отдельный кластер по сравнению с другими.
Сравнение рибосомных ДНК последовательностей изолятов C. auris из Израиль, Азия, Южная Африка и Кувейт обнаружили, что штаммы из Израиля филогенетически отличаются от штаммов из других регионов. Чаттерджи и др. в 2015 г. писал: «Фактическое глобальное распространение этого вируса остается неясным, поскольку современные коммерческие методы клинической диагностики ошибочно идентифицируют его как C. haemulonii».
Инфекции Candida auris, мировое распространение по состоянию на 2019 год 
Карта инфекций Candida auris в США по состоянию на 2019 г. C. auris был впервые описан после его выделения из слухового прохода 70-летней японки в Токийской столичной гериатрической больнице в Японии. Его выделяли на основании его способности расти в присутствии фунгицида микафунгин, фунгицида класса эхинокандин. Фенотипический, хемотаксономический и филогенетический анализы позволили установить C. auris как новый штамм рода Candida.
Первые три случая вызывающего заболевание C. auris были зарегистрированы в Южной Корее в 2011 году. Два изолята были получены во время исследование 2009 года, а третье было обнаружено в образце, хранящемся в 1996 году. Все три случая имели стойкую фунгемию, то есть инфекцию кровотока, и двое пациентов впоследствии умерли из-за осложнений. Примечательно, что изначально изоляты были ошибочно идентифицированы как Candida haemulonii и Rhodotorula glutinis с использованием стандартных методов, пока анализ последовательности правильно не идентифицировал их как C. auris. Эти первые случаи подчеркивают важность точной идентификации видов и своевременного применения правильного противогрибкового средства для эффективного лечения кандидоза, вызванного C. auris.
В течение 2009–2011 гг. 12 изолятов C. auris были получены от пациентов через два года. больницы в Дели, Индия. Один и тот же генотип был обнаружен в разных учреждениях: интенсивной терапии, хирургических, медицинских, онкологических, неонатальных и педиатрических отделениях, которые были взаимоисключающими в отношении медицинского персонала. У большинства из них была стойкая кандидемия, и наблюдалась высокая смертность. Однако все изоляты принадлежали к одному и тому же клональному штамму и были идентифицированы только положительно с помощью анализа последовательности ДНК. Как и ранее, штамм был неправильно идентифицирован с помощью установленных диагностических лабораторных тестов. В 2013 году индийские исследователи писали, что C. auris был гораздо более распространен, чем указывают опубликованные отчеты, поскольку большинство диагностических лабораторий не используют методы на основе последовательностей для идентификации штаммов.
Грибок распространился на другие континенты и, в конечном итоге, -резистентный к лекарствам штамм был обнаружен в странах Юго-Восточной Азии в начале 2016 года.
Первое сообщение о вспышке C. auris в Европе было в октябре 2016 года в Royal Brompton Hospital, лондонский кардио-торакальный госпиталь. В апреле 2017 года CDC директор Энн Шухат назвала это «катастрофической угрозой». По состоянию на май 2017 года CDC зарегистрировал 77 случаев в США. Из них 69 были взяты из образцов, собранных в Нью-Йорке и Нью-Джерси.
По состоянию на 31 августа 2019 года количество случаев заражения C. auris в Соединенных Штатах возросло до 806, из которых 388 были зарегистрированы в США. Нью-Йорк, 137 в Нью-Джерси и 227 в Иллинойсе, согласно CDC.
С момента первого наблюдения в Соединенном Королевстве, он распространился на более чем 20 NHS Trust больниц и заразили 200 человек.
По состоянию на апрель 2019 года CDC задокументировал случаи C. auris из следующих стран: Австралия, Австрия, Бельгия, Канада, Китай, Колумбия, Франция, Германия, Индия, Иран, Израиль., Япония, Кения, Кувейт, Малайзия, Нидерланды, Норвегия, Оман, Пакистан, Панама, Россия, Саудовская Аравия, Сингапур, Южная Африка, Южная Корея, Испания, Швейцария, Тайвань, Таиланд, Объединенные Арабские Эмираты, Великобритания, США и Венесуэла.
Грибок Candida auris (C. auris) - грибковая инфекция с множественной лекарственной устойчивостью, которая распространяется в больницах и является чрезвычайно смертельной. у - убить каждого третьего, кто его получит.
Артуро Касадеваль, доктор медицинских наук, председатель молекулярной микробиологии и иммунологии в школе общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса заявил:
Это исследование предполагает следующее: это начало адаптации грибов к более высоким температурам, и в течение столетия у нас будет все больше и больше проблем. Глобальное потепление приведет к отбору грибковых линий, которые будут более термостойкими.
Устойчивость к противомикробным препаратам в целом становится все более распространенным явлением. В 2010 году сообщалось, что в США два миллиона человек заразились устойчивыми инфекциями - 23 000 со смертельным исходом. "[M] o Согласно недавним оценкам исследователей из Медицинской школы Вашингтонского университета число погибших составляет 162 000 человек. Во всем мире число смертей от устойчивых инфекций оценивается в 700 000 в год. C. auris является одним из многих других микробов. участники этой глобальной оценки УПП. Большинство этих устойчивых инфекций вызывается другими организмами, кроме C. auris.
Портал грибов  | Викискладе есть носители, относящиеся к Candida auris. |
