Войти
Пример данных AFLP с прибора капиллярного электрофореза AFLP-PCR или просто AFLP - это на основе ПЦР инструмент, используемый в генетике исследованиях, снятии отпечатков пальцев и в практике генной инженерии. AFLP, разработанный в начале 1990-х годов, использует рестрикционные ферменты для переваривания геномной ДНК с последующим лигированием адаптеров с липкие концы из ограничительных фрагментов. Затем выбирают подмножество рестрикционных фрагментов для амплификации. Этот отбор достигается с использованием праймеров, комплементарных последовательности адаптера, последовательности сайта рестрикции и нескольких нуклеотидов внутри фрагментов сайта рестрикции (как подробно описано ниже). Амплифицированные фрагменты разделяют и визуализируют при денатурировании на электрофорезе в агарозном геле, либо с помощью методологий авторадиографии или флуоресценции, либо с помощью инструментов автоматического капиллярного секвенирования.
Хотя AFLP не следует использовать в качестве аббревиатуры, его обычно называют «полиморфизмом длины амплифицированного фрагмента». Однако полученные данные оцениваются не как полиморфизм длины, а как полиморфизм присутствия-отсутствия.
AFLP-PCR - высокочувствительный метод обнаружения полиморфизмов в ДНК. Этот метод был первоначально описан Восом и Забо в 1993 году. Подробно процедура этого метода разделена на три этапа:
Анализ филогении AFLP с использованием дендрограммы Технология AFLP позволяет одновременно обнаруживать различные полиморфизмы в разных областях генома. Он также очень чувствителен и воспроизводим. В результате AFLP стал широко использоваться для идентификации генетической изменчивости штаммов или близкородственных видов растений, грибов, животных и бактерий. Технология AFLP использовалась в криминальных тестах и тестах на отцовство, а также для определения незначительных различий внутри популяций и в исследованиях сцепления для создания карт для количественного анализа локуса признаков (QTL).
AFLP имеет много преимуществ по сравнению с другими маркерами, включая с использованием случайно амплифицированной полиморфной ДНК (RAPD ), полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (RFLP) и микросателлитов. AFLP не только обладает более высокой воспроизводимостью, разрешением и чувствительностью на уровне всего генома по сравнению с другими методами, но также имеет возможность амплифицировать от 50 до 100 фрагментов за один раз. Кроме того, для амплификации не требуется никакой предварительной информации о последовательности (Meudt Clarke 2007). В результате AFLP стал чрезвычайно полезным при изучении таксонов, включая бактерии, грибы и растения, где многое еще неизвестно о геномном составе различных организмов.
Технология AFLP защищена патентами и патентными заявками Keygene NV AFLP является зарегистрированным товарным знаком Keygene NV
Программное обеспечение для анализ данных AFLP
Бесплатное программное обеспечение для анализа данных AFLP
Онлайн-программы для моделирования AFLP-PCR
