Цитидиндезаминаза, индуцированная активацией

Создает мутации в ДНК [6] путем дезаминирования основания цитозина, которое превращает его в урацил (который распознается как тимин).

AICDA
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список кодов идентификаторов PDB 5JJ4
Идентификаторы
Псевдонимы	AICDA, AID, ARP2, CDA2, HEL-S-284, HIGM2, цитидиндезаминаза, индуцированная активацией, цитидиндезаминаза, индуцированная активацией
Внешние идентификаторы	OMIM: 605257 MGI: 1342279 HomoloGene: 7623 Генные карты: AICDA
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек) Полоса 12p13.31 Начало 8,602,170 bp Конец 8,612,867 bp
Расположение гена (мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь) Полоса 6 | 6 F1 Начало 122,553,801 bp Конец 122,564,180 bp
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонной экспрессии
Ген o ntology Молекулярная функция •активность гидролазы, действующая на связи углерод-азот (но не пептид), в циклических амидинах. •связывание ионов цинка. •GO: 0001948 связывание с белками. •каталитическая активность. •гидролаза активность. •связывание убиквитин-протеин-лигазы. •связывание иона металла. •активность цитидиндезаминазы. •идентичное связывание с белком. •связывание РНК. Клеточный компонент •экзосома (комплекс РНКазы). •ядро ​​клетки. •цитоплазма. •Р-тельца. •макромолекулярный комплекс. Биологический процесс •соматическая гипермутация генов иммуноглобулинов. •Деметилирование ДНК. •обработка мРНК. •дифференцировка В-клеток. •соматическая диверсификация иммуноглобулинов. •отрицательная регуляция зависимого от метилирования замалчивания хроматина. •дезаминирование цитидина. •клеточный ответ на липополисахарид. •переключение изотипа. •защитный ответ на бактерию. •регуляция стабильности ДНК. •негативная регуляция транспозиции. •изменение цитидина на уридин. •регуляция ядерной клетки c репликация нуклеарной ДНК. •отрицательная регуляция репликации одноцепочечной вирусной РНК посредством промежуточного звена двухцепочечной ДНК. •защитный ответ на вирус. •дезаминирование цитозина ДНК. Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Энтрез	57379	11628
Энсембл	ENSG00000111732	ENSMUSG00000040627
UniProt	Q8GZX7 Q9WVE0
RefSeq (мРНК)	NM_020661. NM_001330343	NM_009645
RefSeq (белок)	NP_001317272. NP_065712	NP_033775
Местоположение (U 12: 8.6 - 8.61 Mb	Chr 6: 122.55 - 122.56 Mb
PubMed поиск
Wikidata
View / Edit Human View / Edit Mouse

Цитидиндезаминаза, индуцированная активацией, также известный как AICDA, AIDи одноцепочечная ДНК-цитозиндезаминаза, представляет собой фермент 24 кДа , который у человека кодируется геном AICDA . Он создает мутации в ДНК путем дезаминирования основания цитозина, что превращает его в урацил (который распознается как тимин ). Другими словами, он изменяет базовую пару C: G на несоответствие U: G. Механизм репликации ДНК клетки распознает U как T, и, следовательно, C: G преобразуется в пару оснований T: A. Во время развития зародышевого центра B-лимфоцитов AID также генерирует другие типы мутаций, такие как C: G - A: T. Механизм, с помощью которого создаются эти другие мутации, не совсем понятен. Это член семейства APOBEC.

В B-клетках в лимфатических узлах AID вызывает мутации, которые вызывают разнообразие антител, но тот же процесс мутации приводит к B-клеточной лимфоме.

• 1 Функция
• 2 Механизм
• 3 Клиническая значимость
• 4 Ссылки
• 5 Дополнительная литература
• 6 Внешние ссылки

Этот ген кодирует редактирующую ДНК дезаминазу, которая является членом семейства цитидиндезаминаз. Белок участвует в соматической гипермутации, конверсии генов и рекомбинации генов иммуноглобулинов с переключением классов в В-клетках иммунной системы.

В настоящее время считается, что AID является главным регулятором вторичного антитела диверсификация. Он участвует в инициации трех отдельных процессов диверсификации иммуноглобулинов (Ig):

1. Соматическая гипермутация (SHM), при которой гены антител подвергаются минимальной мутации для создания библиотеки вариантов антител, некоторые из которых имеют более высокую аффинность. для конкретного антигена, чем любой из его близких вариантов
2. Рекомбинация переключения класса (CSR), при которой B-клетки изменяют свою экспрессию с IgM на IgG или другие типы иммунитета
3. Конверсия гена (GC) a процесс, который вызывает мутации в генах антител кур, свиней и некоторых других позвоночных.

Было показано, что AID in vitro активен в отношении однонитевой ДНК, и было показано, что он требует активного транскрипция для проявления дезаминирующей активности. Подозревается участие цис -регуляторных факторов, поскольку активность AID на несколько порядков выше в «вариабельной» области иммуноглобулина, чем в других областях генома, которые, как известно, подвержены активности AID. Это также верно для искусственных репортерных конструкций и трансгенов, которые были интегрированы в геном. Недавняя публикация предполагает, что высокая активность AID по нескольким неиммуноглобулиновым мишеням достигается, когда транскрипция на противоположных цепях ДНК сходится из-за активности супер-энхансера.

Недавно AICDA была задействована в активное деметилирование ДНК. AICDA может дезаминировать 5-метилцитозин, который затем можно заменить цитозином путем эксцизионной репарации оснований.

Считается, что AID инициирует SHM по многоступенчатому механизму. AID дезаминирует цитозин в целевой ДНК. Цитозины, расположенные внутри мотивов горячих точек, предпочтительно дезаминируются (мотивы WRCY W = аденин или тимин, R = пурин, C = цитозин, Y = пиримидин или обратный RGYW G = гуанин). Получающееся в результате несоответствие U: G (U = урацил) может быть подвержено одной из нескольких судьб.

1. Несоответствие U: G реплицируется при создании двух дочерних видов: один остается неизмененным, а другой претерпевает мутацию перехода C =>T. (U аналогичен Т в ДНК и рассматривается как таковой при репликации).
2. Урацил может быть вырезан урацил-ДНК-гликозилазой (UNG), что приводит к образованию базового сайта. Этот базовый сайт (или AP, апуриновый / апиримидиновый ) может быть скопирован ДНК-полимеразой синтеза трансфузии, такой как ДНК-полимераза эта, что приводит к случайному включению любого из четырех нуклеотидов, то есть A, G, C или T. Кроме того, этот базовый сайт может быть расщеплен апуриновой эндонуклеазой (APE), создавая разрыв в дезоксирибоза фосфат остов. Этот разрыв может затем привести к нормальной репарации ДНК или, если происходят два таких разрыва, по одному на любой цепи может образоваться ступенчатый двухцепочечный разрыв (DSB). Считается, что образование этих DSB либо в областях переключения, либо в вариабельной области Ig может приводить к CSR или GC соответственно.
3. Несоответствие U: G также может быть распознано по несоответствию ДНК ремонтировать механизм (MMR), а именно комплексом MutSα (альфа). MutSα представляет собой гетеродимер, состоящий из MSH2 и MSH6. Этот гетеродимер способен распознавать в основном одноосновные искажения в основной цепи ДНК, что согласуется с несоответствиями ДНК U: G. Считается, что распознавание ошибочных совпадений U: G белками MMR приводит к процессингу ДНК за счет экзонуклеолитической активности для экспонирования одноцепочечной области ДНК, за которой следует активность склонной к ошибкам ДНК-полимеразы для заполнения пробела. Считается, что эти подверженные ошибкам полимеразы случайным образом вносят дополнительные мутации в пробелы в ДНК. Это позволяет генерировать мутации в парах оснований AT.

Уровень активности AID в B-клетках строго контролируется путем модуляции экспрессии AID. AID индуцируется факторами транскрипции E47, HoxC4, Irf8 и Pax5 и ингибируется Blimp1 и Id2. На посттранскрипционном уровне регуляции экспрессия AID подавляется mir-155, небольшой некодирующей микроРНК, контролируемой передачей сигналов цитокина В-клеток IL-10.

Дефекты в этот ген связан с синдромом гипер-IgM типа 2. При определенных гематологических злокачественных новообразованиях, таких как фолликулярная лимфома стойкая экспрессия AID была связана с лимфомагенезом.

• AICDA + белок в Национальной медицинской библиотеке США Медицинские предметные заголовки (MeSH)
• Местоположение генома человека AICDA и подробные сведения о гене AICDA страница в Браузере генома UCSC.